การทดสอบการตอบสนองเชิงโครงสร้างไดนามิก (SDR) เป็นการทดสอบ ทางชีวฟิสิกส์ชนิดหนึ่งที่ใช้ในการวัดการจับตัวของลิแกนด์กับโปรตีน เป้าหมาย การทดสอบนี้ออกแบบมาในรูปแบบผสมและอ่านค่าอย่างง่าย ซึ่งสามารถดำเนินการได้ในปริมาณน้อยมาก จึงเหมาะสำหรับ การประยุกต์ใช้ ในการค้นหายาเช่นการคัดกรองแบบความเร็วสูง (HTS) หรือในการพัฒนาตัวยาในระหว่างวงจรการปรับปรุง ทางเคมีทางการแพทย์

การทดสอบการจับลิแกนด์ SDR อาศัยการสังเกตว่าการจับลิแกนด์กับโปรตีนเป้าหมายที่สนใจ (TOI) สามารถส่งผลต่อความเข้มของเอาต์พุตของเอนไซม์เซนเซอร์ที่เชื่อมต่อกัน (รูปที่ 1) การศึกษาเบื้องต้นชี้ให้เห็นว่าการทดสอบ SDR สามารถเป็นประโยชน์สำหรับโปรตีนหลากหลายชนิด ซึ่งอาจรวมถึงเป้าหมายยาและสารเคมีทางการเกษตร^{[ 1 ] [ 2 ]}

การทดสอบ SDR ดูเหมือนจะใช้ประโยชน์จาก การเปลี่ยนแปลงที่เอนเอียงไป ทางลิแกนด์ในพลวัตเชิงโครงสร้างหรือโครงสร้างของโปรตีนเป้าหมาย ( พลวัตของโปรตีน ) เพื่อปรับการเรืองแสงของเอนไซม์เซนเซอร์ที่เชื่อมต่อกับปลาย N หรือ C ของโปรตีนเป้าหมาย การทดสอบ SDR ไม่จำเป็นต้องใช้ลิแกนด์แข่งขันเหมือนที่จำเป็นในเทคนิคต่างๆ เช่นการตรวจวิเคราะห์ภูมิคุ้มกันแบบโพลาไรเซชันของฟลูออเรสเซนซ์ (FP) ^{[ 3 ]}หรือการทดสอบการจับแบบแข่งขันอื่นๆ ที่เกี่ยวข้อง นอกจากนี้ การทดสอบ SDR ยังไม่ขึ้นอยู่กับหน้าที่ของโปรตีนเป้าหมาย ซึ่งมีความสำคัญอย่างยิ่งสำหรับเอนไซม์เป้าหมายที่เร่งปฏิกิริยาซึ่งสารตั้งต้นนั้นหาไม่ได้ ไม่เสถียร หรือไม่เป็นที่รู้จัก เป็นต้น

วิธีการนี้ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าสามารถตรวจจับการจับตัวของแอสซิ มินิบ ที่ตำแหน่งการจับกรดไมริสติกของ โดเมน ไทโรซีนไคเนส ของอะเบลสันได้ ซึ่งมีความสำคัญเนื่องจากแอสซิมินิบไม่ยับยั้งกิจกรรมเร่งปฏิกิริยาของไทโรซีนไคเนส ในการทดสอบทางชีวเคมีที่วัดการฟอสโฟรีเลชันของสารตั้งต้นหรือการหมุนเวียนของโคแฟคเตอร์ATPซึ่งบ่งชี้ว่าการทดสอบ SDR สามารถเป็นประโยชน์ในการตรวจจับลิแกนด์ที่จับกับตำแหน่ง อัลโลสเตอริก ได้

ความทั่วไปของวิธีการนี้ได้รับการพิสูจน์แล้วด้วยเอนไซม์หลายประเภทโดยใช้ Nanoluc luciferase (NLuc) ที่สมบูรณ์หรือลำดับกรดอะมิโน 11 ตัวของ HiBiT ที่ช่วยให้เกิดการเสริมอัลฟา^{[ 4 ]}ความไวที่สูงมากของวิธีการนี้ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าช่วยให้สามารถประเมิน TOI ที่ทดสอบเป็นไลเซตของเซลล์ที่ได้จากการแก้ไขยีนเป้าหมาย โดยใช้ CRISPR/Cas9 ได้

การทดสอบ SDR ได้รับการสาธิตในการคัดกรองปริมาณสูง (qHTS) ^{[ 5 ]}ในรูปแบบไมโครไทเตอร์เพลท 1536 หลุม โดยใช้ เอนไซม์จาก กลุ่ม เอนไซม์ ต่อไปนี้: โมโนออกซิเจเนสที่ขึ้นอยู่กับโคแฟคเตอร์ ATP โดยใช้ลูซิเฟอเรสจากหิ่งห้อย (FLuc); ^{[ 6 ]}ออกซิโดรีดักเทสโดยใช้ไดไฮโดรโฟเลตเรดักเทส (DHFR); ^{[ 7 ]} ไทโรซีนไคเนสโดยใช้โดเมน ไทโรซีนไคเนสของ Abelson (ABL1); ^{[ 8 ]}เซรีน/ทรีโอนีนโปรตีนไคเนสโดยใช้โปรตีนไคเนส A (PKA); ^{[ 9 ]}ไอโซเมอเรสโดยใช้ฟอสโฟกลีเซอเรตมิวเทส ที่ไม่ขึ้นกับโคแฟคเตอร์ (iPGM); ^{[ 10 ]}ดีเอ็นเอไลเกสที่ขึ้นกับ NAD+ และ ATP โดยใช้ดีเอ็นเอไลเกสของ E. coli ^{[ 11 ]}และดีเอ็นเอไลเกสของแบคทีริโอเฟจ T7 ^{[ 12 ]}ตามลำดับ