อีโลบ

Q: ปฏิสัมพันธ์

มีการแสดงให้เห็นว่า TCEB2 มีปฏิสัมพันธ์ กับ:

อีโลบ
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบี	ค้นหาข้อมูลมนุษย์ใน UniProt: PDBe RCSB
รายชื่อรหัส PDB
	1LM8 , 1LQB , 1VCB , 2C9W , 2IZV , 2JZ3 , 2MA9 , 3DCG , 3ZKJ , 3ZNG , 3ZRC , 3ZRF , 3ZTC , 3ZTD , 3ZUN , 4AJY , 4AWJ , 4B95 , 4B9K , 4BKS , 4BKT , 4N9F , 4W9C , 4W9D , 4W9E , 4W9F , 4W9G , 4W9H , 4W9I , 4W9J , 4W9K , 4W9L , 4WQO , 5BO4
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	ELOB , SIII, TCEB2, ปัจจัยการยืดตัวของการถอดรหัสย่อย B หน่วยที่ 2, อีลองกิน บี
รหัสภายนอก	โอมิม : 600787 ; โฮโมโลยีน : 134544 ; GeneCards : ELOB ; OMA : ELOB - ออร์โธล็อก
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ )
คริส.	โครโมโซม 16 (มนุษย์)
จบ	2,777,289 bp
รูปแบบการแสดงออกของ RNA
	สูงสุดที่แสดงใน
	อัณฑะซ้าย; อัณฑะข้างขวา; ยอดหัวใจ; กล้ามเนื้อต้นขา; เซลล์สโตรมัลของเยื่อบุโพรงมดลูก; ต่อมใต้สมองส่วนหน้า; นิวเคลียสแอคคัมเบนส์; บริเวณรับกลิ่นของเยื่อบุจมูก; เปลือกสมองส่วนหน้า; ส่วนนูนของปมประสาท;
	ไม่มีข้อมูล
	ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
	ไม่มีข้อมูล
ออนโทโลยีของยีน
หน้าที่ระดับโมเลกุล	การจับโปรตีน; การจับกันของยูบิควิตินกับโปรตีนไลเกส;
ส่วนประกอบของเซลล์	คอมเพล็กซ์ Cul2-RING ยูบิควิตินไลเกส; ไซโตซอล; คอมเพล็กซ์ Cul5-RING ยูบิควิตินไลเกส; คอมเพล็กซ์ VCB; นิวเคลียส; คอมเพล็กซ์อีลองกิน; นิวคลีโอพลาสม์;
กระบวนการทางชีวภาพ	การยืดสายการถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ของ RNA polymerase II; การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การถอดรหัสโดย RNA polymerase II; การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การควบคุมการถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ของ RNA polymerase II เพื่อตอบสนองต่อภาวะขาดออกซิเจน; การยูบิควิตินไนเซชันของโปรตีน; การดัดแปลงโปรตีนหลังการแปล; การประกอบเชิงซ้อนที่มีโปรตีน;
	แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก
	6923
	ไม่มีข้อมูล
	ENSG00000103363
	ไม่มีข้อมูล
	Q15370
	ไม่มีข้อมูล
	NM_207013 NM_007108
	ไม่มีข้อมูล
	NP_009039 NP_996896
	ไม่มีข้อมูล
	วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์

Elongin Bเป็นโปรตีน ที่ ^ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนELOB [ ³^]

การทำงาน

Elongin B เป็นหน่วยย่อยของคอมเพล็กซ์ปัจจัยการถอดรหัส B (SIII) คอมเพล็กซ์ SIII ประกอบด้วย elongin A/A2, B และ C โดยจะกระตุ้นการยืดตัวของRNA polymerase IIด้วยการยับยั้งการหยุดชั่วคราวของ polymerase ในหลายตำแหน่งภายในหน่วยการถอดรหัส Elongin A ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบที่ออกฤทธิ์ในการถอดรหัสของคอมเพล็กซ์ SIII ในขณะที่ elongin B และ C เป็นหน่วยย่อยควบคุม Elongin A2 ถูกแสดงออกอย่างจำเพาะในอัณฑะ และสามารถสร้างคอมเพล็กซ์ที่เสถียรกับ elongin B และ C ได้ โปรตีน ยับยั้งเนื้องอก von Hippel-Lindauจับกับ elongin B และ C และยับยั้งการยืดตัวของการถอดรหัส มีการอธิบายตัวแปรการถอดรหัสแบบสลับกันสองแบบที่เข้ารหัสไอโซฟอร์มที่แตกต่างกันสำหรับยีนนี้^{[ 4 ]}

ปฏิสัมพันธ์

มีการแสดงให้เห็นว่า TCEB2 มีปฏิสัมพันธ์กับ:

CUL2 , ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}
TCEB1 , ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} และ
ยีนยับยั้งเนื้องอก Von Hippel-Lindau ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}

อ่านเพิ่มเติม

Duan DR, Pause A, Burgess WH, Aso T, Chen DY, Garrett KP, Conaway RC, Conaway JW, Linehan WM, Klausner RD (1995). "การยับยั้งการยืดตัวของการถอดรหัสโดยโปรตีนยับยั้งเนื้องอก VHL" . Science . 269 (5229): 1402– 6. Bibcode : 1995Sci...269.1402D . doi : 10.1126/science.7660122 . PMID 7660122 . S2CID 22334719 .
Aso T, Lane WS, Conaway JW, Conaway RC (1995). "Elongin (SIII): ตัวควบคุมการยืดตัวแบบหลายหน่วยย่อยโดย RNA polymerase II" Science . 269 (5229): 1439– 43. Bibcode : 1995Sci...269.1439A . doi : 10.1126/science.7660129 . PMID 7660129 . S2CID 37649908 .
Kibel A, Iliopoulos O, DeCaprio JA, Kaelin WG (1995). "การจับกันของโปรตีนยับยั้งเนื้องอก von Hippel-Lindau กับ Elongin B และ C" Science . 269 (5229): 1444– 6. Bibcode : 1995Sci...269.1444K . doi : 10.1126/science.7660130 . PMID 7660130 . S2CID 25410108 .
Bradsher JN, Jackson KW, Conaway RC, Conaway JW (1994). "ปัจจัยการถอดรหัส RNA polymerase II SIII. I. การระบุ การทำให้บริสุทธิ์ และคุณสมบัติ" . J. Biol. Chem . 268 (34): 25587– 93. doi : 10.1016/S0021-9258(19)74431-7 . PMID 8244996 .
Pause A, Lee S, Worrell RA, Chen DY, Burgess WH, Linehan WM, Klausner RD (1997). "ผลิตภัณฑ์ยีนยับยั้งเนื้องอก von Hippel-Lindau สร้างคอมเพล็กซ์ที่เสถียรกับ CUL-2 ของมนุษย์ ซึ่งเป็นสมาชิกของโปรตีนตระกูล Cdc53" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 94 (6): 2156– 61. Bibcode : 1997PNAS...94.2156P . doi : 10.1073/pnas.94.6.2156 . PMC 20057 . PMID 9122164 .
Li XY, Green MR (1998). "ตัวกระตุ้นร่วมเซลล์ของ HIV-1 Tat Tat-SF1 เป็นปัจจัยการยืดตัวของการถอดรหัสทั่วไป" Genes Dev . 12 (19): 2992– 6. doi : 10.1101/gad.12.19.2992 . PMC 317190 . PMID 9765201 .
Zhang JG, Farley A, Nicholson SE, Willson TA, Zugaro LM, Simpson RJ, Moritz RL, Cary D, Richardson R, Hausmann G, Kile BJ, Kent SB, Alexander WS, Metcalf D, Hilton DJ, Nicola NA, Baca M (1999). "โมทีฟ SOCS box ที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ในสารยับยั้งการส่งสัญญาณไซโตไคน์จะจับกับอีลองกินส์ B และ C และอาจเชื่อมโยงโปรตีนที่จับกับกระบวนการย่อยสลายโดยโปรตีเอโซม" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 96 (5): 2071– 6. Bibcode : 1999PNAS...96.2071Z . doi : 10.1073/pnas.96.5.2071 . PMC 26738 . PMID 10051596 .
Stebbins CE, Kaelin WG, Pavletich NP (1999). "โครงสร้างของคอมเพล็กซ์ VHL-ElonginC-ElonginB: นัยสำคัญต่อหน้าที่ยับยั้งเนื้องอกของ VHL" Science . 284 (5413): 455– 61. Bibcode : 1999Sci...284..455S . doi : 10.1126/science.284.5413.455 . PMID 10205047 .
Pause A, Peterson B, Schaffar G, Stearman R, Klausner RD (1999). "การศึกษาปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนสี่ชนิดในระบบยีสต์ทูไฮบริด: ความคล้ายคลึงเชิงโครงสร้างของคอมเพล็กซ์ pVHL/elongin BC/hCUL-2 กับคอมเพล็กซ์ยูบิควิตินไลเกส SKP1/cullin/F-box protein" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 96 (17): 9533– 8. Bibcode : 1999PNAS...96.9533P . doi : 10.1073/pnas.96.17.9533 . PMC 22243 . PMID 10449727 .
Iwai K, Yamanaka K, Kamura T, Minato N, Conaway RC, Conaway JW, Klausner RD, Pause A (1999). "การระบุโปรตีนยับยั้งเนื้องอก von Hippel-lindau ว่าเป็นส่วนหนึ่งของคอมเพล็กซ์ยูบิควิตินไลเกส E3 ที่ทำงานอยู่" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 96 (22): 12436– 41. Bibcode : 1999PNAS...9612436I . doi : 10.1073/pnas.96.22.12436 . PMC 22941 . PMID 10535940 .
Ohh M, Takagi Y, Aso T, Stebbins CE, Pavletich NP, Zbar B, Conaway RC, Conaway JW, Kaelin WG (2000). "เปปไทด์สังเคราะห์กำหนดจุดสัมผัสที่สำคัญระหว่างอีลองกิน C, อีลองกิน B และโปรตีน von Hippel-Lindau" . J. Clin. Invest . 104 (11): 1583– 91. doi : 10.1172/JCI8161 . PMC 481054 . PMID 10587522 .
Aso T, Yamazaki K, Amimoto K, Kuroiwa A, Higashi H, Matsuda Y, Kitajima S, Hatakeyama M (2000). "การระบุและลักษณะเฉพาะของ Elongin A2 สมาชิกใหม่ของตระกูล Elongin ของปัจจัยการยืดตัวของการถอดรหัส ซึ่งแสดงออกเฉพาะในอัณฑะ" J. Biol. Chem . 275 (9): 6546– 52. doi : 10.1074/jbc.275.9.6546 . PMID 10692460 .
Kamura T, Sato S, Iwai K, Czyzyk-Krzeska M, Conaway RC, Conaway JW (2000). "การกระตุ้นการยูบิควิตินของ HIF1alpha โดยคอมเพล็กซ์ยับยั้งเนื้องอก von Hippel-Lindau (VHL) ที่สร้างขึ้นใหม่" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 97 (19): 10430– 5. Bibcode : 2000PNAS...9710430K . doi : 10.1073/pnas.190332597 . PMC 27041 . PMID 10973499 .
Aso T, Yamazaki K, Aigaki T, Kitajima S (2000). "คอมเพล็กซ์ยับยั้งเนื้องอก von Hippel-Lindau ของ Drosophila มีกิจกรรม E3 ubiquitin ligase" Biochem. Biophys. Res. Commun . 276 (1): 355– 61. doi : 10.1006/bbrc.2000.3451 . PMID 11006129 .
Kamura T, Burian D, Yan Q, Schmidt SL, Lane WS, Querido E, Branton PE, Shilatifard A, Conaway RC, Conaway JW (2001). "Muf1 โปรตีนที่มีลิวซีนซ้ำๆ ที่มีปฏิสัมพันธ์กับ Elongin BC และสามารถประกอบกับ Cul5 และ Rbx1 เพื่อสร้างยูบิควิตินไลเกสขึ้นใหม่" . J. Biol. Chem . 276 (32): 29748– 53. doi : 10.1074/jbc.M103093200 . PMID 11384984 .
Li Z, Na X, Wang D, Schoen SR, Messing EM, Wu G (2002). "การยูบิควิตินของเอนไซม์ดีบูบิควิตินเนตติ้งชนิดใหม่ต้องอาศัยการจับโดยตรงกับโปรตีนยับยั้งเนื้องอก von Hippel-Lindau" J. Biol. Chem . 277 (7): 4656– 62. doi : 10.1074/jbc.M108269200 . PMID 11739384 .
ยามาซากิ เค, กัว แอล, ซูกาฮาระ เค, จาง ซี, เอนซาน เอช, นากาเบปปุ วาย, คิตาจิมะ เอส, อาโซ ที (2002) "การระบุและลักษณะทางชีวเคมีของปัจจัยการยืดตัวของการถอดรหัสแบบใหม่ Elongin A3 " เจ. ไบโอล. เคมี . 277 (29): 26444– 51. ดอย : 10.1074/jbc.M202859200 . PMID11994304 .
Min JH, Yang H, Ivan M, Gertler F, Kaelin WG, Pavletich NP (2002). "โครงสร้างของคอมเพล็กซ์ HIF-1alpha -pVHL: การรับรู้ไฮดรอกซีโพรลีนในการส่งสัญญาณ" . Science . 296 (5574): 1886– 9. Bibcode : 2002Sci...296.1886M . doi : 10.1126/science.1073440 . PMID 12004076 . S2CID 19641938 .
Hon WC, Wilson MI, Harlos K, Claridge TD, Schofield CJ, Pugh CW, Maxwell PH, Ratcliffe PJ, Stuart DI, Jones EY (2002). "โครงสร้างพื้นฐานสำหรับการจดจำไฮดรอกซีโพรลีนใน HIF-1 อัลฟาโดย pVHL" Nature . 417 (6892): 975– 8. Bibcode : 2002Natur.417..975H . doi : 10.1038/nature00767 . PMID 12050673 . S2CID 4388644 .

ลิงก์ภายนอก

PDBe-KBนำเสนอภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ใน PDB สำหรับ Human Elongin-B

[ 1 ]

[ 2 ]

ใน

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

อีโลบ

การทำงาน

ปฏิสัมพันธ์

อ่านเพิ่มเติม

ลิงก์ภายนอก

ข้อมูลสำคัญจากบทความ