ทีเอฟเอพี2เอ
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	TFAP2A , AP-2, AP-2alpha, AP2TF, BOFS, TFAP2, ปัจจัยการถอดรหัส AP-2 อัลฟา
รหัสภายนอก	โอมิม : 107580 ; เอ็มจีไอ : 104671 ; โฮโมโลยีน : 2421 ; การ์ดยีน : TFAP2A ; OMA : TFAP2A - ออโธล็อก
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ ) คริส. โครโมโซม 6 (มนุษย์) [ 1 ] วงดนตรี 6p24.3 เริ่ม 10,393,186 bp [ 1 ] จบ 10,419,659 bp [ 1 ]
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ ) คริส. โครโมโซม 13 (เมาส์) [ 2 ] วงดนตรี 13 A3.3|13 20.01 cM เริ่ม 40,868,778 bp [ 2 ] จบ 40,891,852 bp [ 2 ]
รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก) สูงสุดที่แสดงใน ผิวหนังต้นขา เยื่อบุผิวเหงือก ผิวหนังบริเวณแขน ช่องคลอด ผิวหนังบริเวณสะโพก ผิวหนังบริเวณหน้าท้อง รูขุมขน เนื้อเยื่อบุผิวของต่อมน้ำนม ท่อน้ำนม หัวนม สูงสุดที่แสดงใน รูขุมขน เนื้อเยื่อบุผิวของเลนส์ ร่องเยื่อบุตา ริมฝีปาก กระจกตา กลีบของต่อมลูกหมาก ผิวหนังบริเวณหน้าท้อง ต่อมน้ำลายพาโรติด ผิวหนังบริเวณหูชั้นนอก ความนูนของขากรรไกรบน ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม ไบโอจีพีเอส ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับกับ DNA กิจกรรมการสร้างไดเมอร์ของโปรตีน กิจกรรมการสร้างโฮโมไดเมอร์ของโปรตีน กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA กิจกรรมตัวกระตุ้นการถอดรหัสร่วม กิจกรรมกระตุ้นการถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II การจับโครมาติน การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับในบริเวณควบคุมซิส การจับกับบริเวณควบคุมการถอดรหัสแบบซิส การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับของบริเวณควบคุมซิสของ RNA polymerase II กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัส, การจับจำเพาะของลำดับบริเวณใกล้เคียงโปรโมเตอร์หลักของ RNA polymerase II กิจกรรมยับยั้งการถอดรหัสโดยการจับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II การจับโปรตีน การจับกับ DNA ที่จำเพาะต่อลำดับของโปรโมเตอร์หลักของ RNA polymerase II การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับ กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับในบริเวณควบคุมการถอดรหัสของ RNA polymerase II ส่วนประกอบของเซลล์ เซนโทรโซม เครื่องมือของกอลจิ ออร์แกเนลล์ที่มีเยื่อหุ้มภายในเซลล์ นิวเคลียส นิวคลีโอพลาสม์ ไซโตซอล กระบวนการทางชีวภาพ การพัฒนาของเพดานปาก การตอบสนองของเซลล์ต่อไอออนเหล็ก การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การก่อตัวของชั้นเรตินา การพัฒนาไต การควบคุมการสร้างแร่ธาตุในกระดูกในเชิงบวก การพัฒนาของเส้นประสาทไตรเจมินัล การควบคุมการถอดรหัสเชิงลบโดยการจับกับโปรโมเตอร์แบบแข่งขัน การสร้างรูปร่างของถุงตา การสร้างรูปร่างของกระดูก การควบคุมเชิงลบของกระบวนการอะพอพโทซิส การได้ยิน การพัฒนาเปลือกตาในดวงตาแบบกล้องถ่ายรูป การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การควบคุมการถอดรหัสเชิงบวกโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การควบคุมเชิงบวกของกระบวนการอะพอพโทซิสของเซลล์ประสาท การควบคุมการแสดงออกของยีนในเชิงบวก การเจริญเติบโตของหูชั้นใน โครงสร้างการจัดระเบียบของถ้วยตา การควบคุมการแบ่งเซลล์ การสร้างโครงกระดูกกะโหลกศีรษะในระยะตัวอ่อน การควบคุมเชิงลบของกระบวนการเผาผลาญสารออกซิเจนที่ว่องไว การควบคุมการถอดรหัสเชิงลบโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การสร้างรูปร่างแขนขาหน้าของตัวอ่อน การก่อตัวของเส้นประสาทโอคูโลมอเตอร์ การควบคุมเชิงลบของการเพิ่มจำนวนประชากรเซลล์ การควบคุมการสร้างแร่ธาตุในฟันในเชิงบวก การถอดรหัสโดย RNA polymerase II การควบคุมเชิงลบของการถอดรหัสโดย RNA polymerase II การควบคุมการถอดรหัสโดย RNA polymerase II การควบคุมการถอดรหัสในเชิงบวกโดย RNA polymerase II การควบคุมเชิงบวกของการถอดรหัสโดยใช้กรดนิวคลีอิกเป็นแม่แบบ แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ 7020 21418 วงดนตรี ENSG00000137203 ENSMUSG00000021359 ยูนิโปรท พี05549 พี34056 RefSeq (mRNA) NM_001032280 NM_001042425 NM_003220 NM_001372066 NM_001122948 NM_001301674 NM_011547 RefSeq (โปรตีน) NP_001027451 NP_001035890 NP_003211 NP_001358995 NP_001116420 NP_001288603 NP_035677 สถานที่ตั้ง (UCSC) บทที่ 6: 10.39 – 10.42 เมกะไบต์ Chr 13: 40.87 – 40.89 Mb การค้นหาใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ ดู/แก้ไขเมาส์

ปัจจัยการถอดรหัส AP-2 อัลฟา ( Activating enhancer binding Protein 2 alpha ) หรือที่รู้จักกันในชื่อ^TFAP2Aเป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนTFAP2A [ ^{5 ]}

ปัจจัยการถอดรหัส AP-2 อัลฟาเป็น โปรตีนจับกับลำดับ DNAเฉพาะที่มีขนาด 52 กิโลดาลตันซึ่งช่วยเพิ่มการถอดรหัสของยีนเฉพาะโดยการจับกับลำดับ DNA ที่อุดมไปด้วย GC ซึ่งระบุครั้งแรกในบริเวณควบคุมซิสของ DNA ไวรัส SV40 และใน บริเวณ ควบคุมซิสของยีนเซลล์ต่างๆ^{[ 6 ]}

ยีน TFAP2-alpha ถูกแยกและพบว่าสามารถ ถูกกระตุ้นด้วย กรดเรติโนอิกในเซลล์เทราโตคาร์ซิโนมา NT2 ซึ่งบ่งชี้ถึงบทบาทที่เป็นไปได้ของ AP-2 alpha ในการสร้างความแตกต่างของเซลล์^{[ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]}

ในระหว่างการพัฒนาของตัวอ่อน AP-2 alpha จะถูกแสดงออกใน เซลล์ ยอดประสาทที่อพยพมาจากรอยพับประสาทกะโหลกศีรษะในระหว่างการปิดท่อประสาท และยังแสดงออกในเอกโตเดิร์ม ส่วนต่างๆ ของระบบประสาทส่วนกลาง หน่อแขนขา และระบบเมโซเนฟริก ซึ่งบ่งชี้ว่า AP-2 alpha มีบทบาทสำคัญในการกำหนดและการพัฒนาของเนื้อเยื่อเหล่านี้^{[ 10 ]}เซลล์ยอดประสาทกะโหลกศีรษะจะกระจายตัวอยู่ในใบหน้าที่กำลังพัฒนาและให้ ข้อมูล รูปแบบสำหรับการสร้างรูปร่าง ของกะโหลก ศีรษะและใบหน้า และสร้างกระดูกกะโหลกส่วนใหญ่และปมประสาทกะโหลกศีรษะ^{[ 11 ]}

หนูที่ยีน AP-2 alpha ถูกตัดออก จะตายในช่วงก่อนและหลังคลอดเนื่องจากมีอาการ cranio- abdominoschisisและความผิดปกติอย่างรุนแรงของใบหน้า กะโหลกศีรษะ อวัยวะรับความรู้สึก และปมประสาทในกะโหลกศีรษะ^{[ 12 ]} หนูที่ ยีนถูกตัดออกแบบโฮโมไซกัสยังมีข้อบกพร่องของท่อประสาทตามมาด้วยความผิดปกติของกะโหลกศีรษะและผนังลำตัว^{[ 13 ]}การส่งยีน AP-2 alpha ในร่างกายสามารถยับยั้งการเกิดติ่งเนื้อในลำไส้โดยธรรมชาติในหนู Apc(Min/+) ได้^{[ 14 ]} AP-2 alpha ยังทำหน้าที่เป็นตัวควบคุมหลักของปัจจัยการถอดรหัสหลายตัวในตับของหนู^{[ 15 ]}

ใน เซลล์ เมลาโนไซต์ การแสดงออก ^ของยีน TFAP2A อาจถูกควบคุมโดยMITF [ ^{16 ]}

การกลายพันธุ์ในยีน TFAP2A ทำให้เกิดกลุ่มอาการ Branchio-oculo-facial ซึ่งมักมีริมฝีปากแหว่งตรง กลาง ^{[ 17 ]}ในครอบครัวที่มีกลุ่มอาการ Branchio-oculo-facial (BOFS) ^{[ 18 ]}ตรวจพบการลบ 3.2 Mb ที่โครโมโซม 6p24.3 ^{[ 19 ]}การจัดลำดับยีนเป้าหมายในบริเวณนั้นในผู้ป่วย BOFS ที่ไม่เกี่ยวข้องอีก 4 ราย พบการกลายพันธุ์แบบ missense de novo ที่แตกต่างกัน 4 แบบในเอ็กซอน 4 และ 5 ของยีน TFAP2A

การหยุดชะงักของตำแหน่งการจับ AP-2 alpha ในตัว เร่ง IRF6เกี่ยวข้องกับริมฝีปากแหว่ง [ ^{20 ] การ} กลายพันธุ์ในยีน IRF6 ทำให้เกิดกลุ่มอาการ Van der Woude (VWS) ^{[ 21 ]}ซึ่งเป็นโรคทางพันธุกรรมแบบเมนเดลที่หายากที่ทำให้เกิดรอยแหว่ง โดยมีรอยบุ๋มที่ริมฝีปากล่างใน 85% ของผู้ป่วย^{[ 22 ]}อีก 15% ของผู้ป่วยที่เป็นกลุ่มอาการ Van der Woude จะมีเพียงริมฝีปากแหว่งและ/หรือเพดานแหว่ง (CL/P) และไม่สามารถแยกแยะทางคลินิกได้จาก CL/P ทั่วไปที่ไม่ใช่กลุ่มอาการ NSCL/P เกิดขึ้นประมาณ 1 ใน 700 ของการเกิดมีชีวิต และเป็นหนึ่งในรูปแบบที่พบบ่อยที่สุดของความผิดปกติแต่กำเนิด การศึกษาความสัมพันธ์ก่อนหน้านี้ระหว่าง SNP ในและรอบๆ IRF6 และ NSCL/P ได้แสดงผลลัพธ์ที่สำคัญในประชากรที่แตกต่างกัน^{[ 23 ]}และได้รับการทำซ้ำอย่างอิสระ^{[ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] [ 27 ]}

มีการค้นหากรณี NSCL/P เพื่อหาองค์ประกอบควบคุมที่เป็นไปได้สำหรับยีน IRF6 โดยการจัดเรียงลำดับจีโนมกับบริเวณ 500 Kb ที่ครอบคลุม IRF6 จากสัตว์มีกระดูกสันหลัง 17 ชนิด ใช้ลำดับของมนุษย์เป็นข้อมูลอ้างอิงและค้นหาลำดับอนุรักษ์หลายสายพันธุ์ (MCSs) บริเวณที่อยู่ในอินทรอน 5' และ 3' ที่อยู่รอบ IRF6 ได้รับการตรวจสอบโดยการจัดลำดับโดยตรงเพื่อหาตัวแปรที่อาจก่อให้เกิดโรคในกรณี NSCL/P จำนวน 184 ราย อัลลีลที่หายากของ SNP rs642961 แสดงให้เห็นความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญกับกรณีปากแหว่ง การวิเคราะห์ตำแหน่งการจับของปัจจัยการถอดรหัสแสดงให้เห็นว่าอัลลีลที่มีความเสี่ยงขัดขวางตำแหน่งการจับของ AP-2 alpha ^{[ 20 ]}

การกลายพันธุ์ในยีน AP-2 alpha ยังทำให้เกิดกลุ่มอาการ branchio-oculo-facial ^{[ 19 ]}ซึ่งมีลักษณะที่ทับซ้อนกับกลุ่มอาการ Van der Woude เช่น รอยแยกของใบหน้าและปาก และบางครั้งริมฝีปากบุ๋ม ทำให้ rs642961 เป็นตัวเลือกที่ดีสำหรับตัวแปรที่เป็นสาเหตุ การค้นพบเหล่านี้แสดงให้เห็นว่า IRF6 และ AP-2 alpha อยู่ในเส้นทางการพัฒนาเดียวกัน และระบุตัวแปรในบริเวณควบคุมที่ก่อให้เกิดความผิดปกติที่ซับซ้อนร่วมกันอย่างมีนัยสำคัญ

มีการแสดงให้เห็นว่า TFAP2A มีปฏิสัมพันธ์กับ:

• เอพีซี^{[ 28 ]}
• อ้างอิง2 ^{[ 29 ] [ 30 ]}
• เดค^{[ 31 ]}
• EP300 ^{[ 29 ]}
• ไมค^{[ 32 ]}และ
• ป53 . ^{[ 33 ]}

• โปรตีนกระตุ้น 2
• กลุ่มอาการแบรนชิโอ-โอคูโล-เฟเชียล

• ข้อมูลเกี่ยวกับกลุ่มอาการ Branchiooculofacial จาก GeneReviews/NCBI/NIH/UW
• TFAP2A+โปรตีน+มนุษย์ ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
• แฟคเตอร์บุ๊คเอพี-2อัลฟา
• ตำแหน่งของยีน TFAP2Aในมนุษย์บน UCSC Genome Browser
• รายละเอียดเกี่ยวกับยีน TFAP2Aในมนุษย์ สามารถดูได้ที่ UCSC Genome Browser

บทความนี้ได้นำข้อความจากหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกาด้านการแพทย์ มา ใช้ซึ่งเป็นข้อมูลสาธารณะ