เทร็กซ์2

Q: ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เทร็กซ์2

เอนไซม์ Three prime repair exonuclease 2 เป็น เอนไซม์ ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน TREX2 [ 5 ] [ 6 ]

Q: อ่านเพิ่มเติม

Shevelev IV, Hübscher U (2002). "เอ็กโซนิวคลีเอส 3' 5'" Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 3 (5): 364– 76. doi : 10.1038/nrm804 . PMID 11988770 . S2CID 31605786 . Esposito T, Ciccodicola A, Flagiello L และคณะ (1997).

Q: ลิงก์ภายนอก

บทความเกี่ยวกับ โปรตีน นี้ ยัง ไม่สมบูรณ์คุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป

เทร็กซ์2
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบี	การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
รายชื่อรหัส PDB
	1Y97
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	TREX2 , เอ็กโซนิวคลีเอสซ่อมแซมสามไพรม์ 2
รหัสภายนอก	โอมิม : 300370 ; เอ็มจีไอ : 1346343 ; โฮโมโลยีน : 8046 ; การ์ดยีน : TREX2 ; OMA : TREX2 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ )
คริส.	โครโมโซม X (มนุษย์)
จบ	153,470,587 bp
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ )
คริส.	โครโมโซม X (เมาส์)
จบ	72,478,950 bp
รูปแบบการแสดงออกของ RNA
	สูงสุดที่แสดงใน
	ผิวหนังบริเวณหน้าท้อง; ผิวหนังบริเวณขา; หลอดเลือดแดงใหญ่ส่วนขึ้น; หลอดเลือดแดงใหญ่ทรวงอกส่วนล่าง; หลอดเลือดแดงโคโรนารีด้านขวา; หลอดเลือดแดงทิเบียล; เม็ดเลือดขาวชนิดแกรนูโลไซต์; หลอดเลือดแดงโคโรนารีซ้าย; ปากมดลูกส่วนนอก; ม้าม;
	สูงสุดที่แสดงใน
	หลอดอาหาร; ริมฝีปาก; ตัวอ่อน; ตัวอ่อน; ผิวหนังบริเวณหูชั้นนอก; ผิวหนังบริเวณหน้าท้อง; ต่อมใต้ขากรรไกร; ผิวหนังบริเวณหลัง; ท้อง; สายสะดือ;
	ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
	ไม่มีข้อมูล
ออนโทโลยีของยีน
หน้าที่ระดับโมเลกุล	กิจกรรมนิวคลีเอส; กิจกรรมของเอ็กโซดีออกซีไรโบนิวคลีเอส III; กิจกรรมเอ็กโซนิวคลีเอส; กิจกรรมไฮโดรเลส; กิจกรรมการสร้างโฮโมไดเมอร์ของโปรตีน; การจับไอออนแมกนีเซียม; กิจกรรม 3'-5'-เอ็กโซดีออกซีไรโบนิวคลีเอส; การจับไอออนโลหะ; การจับกรดนิวคลีอิก; กิจกรรมเอ็กโซนิวคลีเอส 3'-5';
ส่วนประกอบของเซลล์	นิวเคลียส;
กระบวนการทางชีวภาพ	การซ่อมแซมดีเอ็นเอ; การตอบสนองของเซลล์ต่อสิ่งกระตุ้นที่ทำให้เกิดความเสียหายต่อดีเอ็นเอ; การไฮโดรไลซิสพันธะฟอสโฟไดเอสเทอร์ของกรดนิวคลีอิก; กระบวนการเผาผลาญดีเอ็นเอ;
	แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก
	11219
	24102
	ENSG00000183479
	ENSMUSG00000031372
	Q9BQ50
	Q9R1A9
	NM_080701 NM_080699 NM_080700
	NM_011907
	NP_542432
	NP_036037
	วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์	ดู/แก้ไขเมาส์

เอนไซม์ Three prime repair exonuclease 2เป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนTREX2 ^[⁵^]^[⁶^]

ยีนนี้เข้ารหัสโปรตีนที่มี กิจกรรม 3' เอ็กโซนิวคลีเอสเอนไซม์ที่มีกิจกรรมนี้เกี่ยวข้องกับการจำลองแบบ DNAการซ่อมแซม และการรวมตัวใหม่ ความคล้ายคลึงกับ โปรตีน ของ E. coliชี้ให้เห็นว่าเอนไซม์นี้อาจเป็นหน่วยย่อยของDNA polymerase IIIซึ่งไม่มีกิจกรรมเอ็กโซนิวคลีเอสในตัว^{[ 6 ]}

งาน วิจัยล่าสุดระบุว่าTREX2ยังมีส่วนเกี่ยวข้องกับ กิจกรรม ของแฟลปเอนโดนิวคลีเอสดังที่ตรวจพบในบริบทของการยับยั้งนิกเคสการแก้ไขยีนที่สร้างแฟลปส่วนขยาย เช่น ไพรม์เอดิเตอร์ ซึ่งโดยปกติจะไม่สร้างการแตกของสายคู่ ฟังก์ชันนี้ได้รับการสาธิตครั้งแรกในวิทยานิพนธ์ของ Lung ในปี 2021 ^{[ 7 ]}และได้รับการทำซ้ำโดย Koeppel et al. ในปี 2023 ^{[ 8 ]}ต่อมาTREX2ได้ถูกรวมเข้ากับเอนไซม์ฟิวชั่นสำหรับการวิศวกรรมพันธุกรรมโดยกลุ่มวิจัยหลายกลุ่มเพื่อวัตถุประสงค์ในการลดการแก้ไขนอกเป้าหมาย ซึ่งรวมถึงการย้ายตำแหน่งของโครโมโซมและการแทรกที่ไม่ตรงกัน^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

การกลายพันธุ์ในยีนนี้อาจนำไปสู่โรค Aicardi-Goutieresได้

อ่านเพิ่มเติม

Shevelev IV, Hübscher U (2002). "เอ็กโซนิวคลีเอส 3' 5'" Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 3 (5): 364– 76. doi : 10.1038/nrm804 . PMID 11988770 . S2CID 31605786 .
Esposito T, Ciccodicola A, Flagiello L และคณะ (1997). "STS ที่แสดงออกและการถอดรหัสของ Xq28 ในมนุษย์" Gene . 187 (2): 185– 91. doi : 10.1016/S0378-1119(96)00772-X . PMID 9099879 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "การโคลน DNA โดยใช้การรวมตัวใหม่เฉพาะตำแหน่งในหลอดทดลอง" . Genome Res . 10 (11): 1788– 95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Li T, Duan W, Yang H และคณะ (2001). "การระบุโปรตีนสองชนิด S14 และ UIP1 ที่มีปฏิสัมพันธ์กับ UCH37" FEBS Lett . 488 (3): 201– 5. Bibcode : 2001FEBSL.488..201L . doi : 10.1016/S0014-5793(00)02436-4 . hdl : 10536/DRO / DU:30009147 . PMID 11163772. S2CID 40717095 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A และคณะ (2001). "การระบุตำแหน่งย่อยของเซลล์อย่างเป็นระบบของโปรตีนใหม่ที่ระบุโดยการ จัดลำดับ cDNA ขนาดใหญ่" EMBO Rep . 1 (3): 287– 92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732. PMID 11256614 .
Mazur DJ, Perrino FW (2001). "โครงสร้างและการแสดงออกของยีนเอ็กโซนิวคลีเอส 3' --> 5' ของ TREX1 และ TREX2" . J. Biol. Chem . 276 (18): 14718– 27. doi : 10.1074/jbc.M010051200 . PMID 11278605 .
Mazur DJ, Perrino FW (2001). "การตัดปลาย 3' โดยเอ็กโซนิวคลีเอส Trex1 และ TREX2 3'-->5' การกำหนดลักษณะของโปรตีนรีคอมบิแนนท์" . J. Biol. Chem . 276 (20): 17022– 9. doi : 10.1074/jbc.M100623200 . PMID 11279105 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH และคณะ (2003). "การสร้างและการวิเคราะห์เบื้องต้นของลำดับ cDNA ของมนุษย์และหนูที่มีความยาวเต็มมากกว่า 15,000 ลำดับ" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Shevelev IV, Beliakova NV, Kravetskaia TP, Krutiakov VM (2003). "[บทบาทการแก้ไขของเอ็กโซนิวคลีเอส 3'-->5' อิสระในคอมเพล็กซ์เอนไซม์ดีเอ็นเอพอลิเมอเรสหลายตัวของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม]". Mol. Biol. (Mosk.) . 36 (6): 1055– 61. PMID 12500544 .
Shevelev IV, Ramadan K, Hübscher U (2004). "เอนไซม์ TREX2 3'-->5' exonuclease มีปฏิสัมพันธ์ทางกายภาพกับ DNA polymerase delta และเพิ่มความแม่นยำ" ScientificWorldJournal . 2 : 275–81 . doi : 10.1100 / tsw.2002.99 . PMC 6009725. PMID 12806015 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA และคณะ (2004). "สถานะ คุณภาพ และการขยายตัวของโครงการ cDNA ความยาวเต็มของ NIH: ชุดสะสมยีนสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W และคณะ (2004). "จาก ORFeome สู่ชีววิทยา: ท่อส่งข้อมูลจีโนมิกส์เชิงฟังก์ชัน" . Genome Res . 14 (10B): 2136– 44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Perrino FW, Krol A, Harvey S และคณะ (2005). "รูปแบบลำดับในดีออกซีไรโบนิวคลีเอส 3'-->5' TREX2: การระบุในการคัดกรองทางพันธุกรรมและผลกระทบต่อการเร่งปฏิกิริยาโดยโปรตีนรีคอมบิแนนท์" Adv. Enzyme Regul . 44 : 37–49 . doi : 10.1016/j.advenzreg.2003.11.010 . PMID 15581481 .
Perrino FW, Harvey S, McMillin S, Hollis T (2005). "โครงสร้าง 3' -> 5'-exonuclease ของมนุษย์ TREX2 ชี้ให้เห็นถึงกลไกสำหรับการเร่งปฏิกิริยา DNA แบบไม่ต่อเนื่องที่มีประสิทธิภาพ" . J. Biol. Chem . 280 (15): 15212– 8. doi : 10.1074/jbc.M500108200 . PMID 15661738 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T และคณะ (2005). "มุ่งสู่แผนที่ระดับโปรตีโอมของเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนของมนุษย์" Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I และคณะ (2006). "ฐานข้อมูล LIFEdb ในปี 2006" . Nucleic Acids Res . 34 (ฉบับฐานข้อมูล): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
Hahn Y, Lee B (2007). " การกลายพันธุ์แบบไร้ความหมายเฉพาะในมนุษย์ที่ระบุโดยการเปรียบเทียบลำดับจีโนม" Hum . Genet . 119 ( 1– 2): 169– 78. doi : 10.1007/s00439-005-0125-6 . PMID 16395595. S2CID 21059468 .
Chen MJ, Ma SM, Dumitrache LC, Hasty P (2007). "ลักษณะทางชีวเคมีและเซลล์ของเอ็กโซนิวคลีเอส 3' -> 5' TREX2" . Nucleic Acids Res . 35 (8): 2682– 94. doi : 10.1093/nar/gkm151 . PMC 1885668 . PMID 17426129 .
Parra D, Manils J, Castellana B, Viña-Vilaseca A, Morán-Salvador E, Vázquez-Villoldo N, Tarancón G, Borràs M, Sancho S, Benito C, Ortega S และ Soler C (2009) "เพิ่มความไวต่อการเกิดมะเร็งผิวหนังในหนู TREX2 Knockout " การวิจัยโรคมะเร็ง . 69 (16): 6676– 84. ดอย : 10.1158/0008-5472.CAN-09-1208 . PMID 19654293 .

ลิงก์ภายนอก

ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ในPDBสำหรับUniProt : Q9BQ50 (Human Three prime repair exonuclease 2) ที่PDBe -KB
ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ในPDBสำหรับUniProt : Q9R1A9 (Mouse Three prime repair exonuclease 2) ที่PDBe -KB

บทความเกี่ยวกับโปรตีนนี้ ยัง ไม่สมบูรณ์คุณสามารถช่วยวิกิพีเดียได้โดยการเพิ่มข้อมูลที่ขาดหายไป

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[

[

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

เทร็กซ์2

อ่านเพิ่มเติม

ลิงก์ภายนอก

ข้อมูลสำคัญจากบทความ