ทริม28
| ทริม28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | TRIM28 , KAP1, PPP1R157, RNF96, TF1B, TIF1B, ลวดลายสามส่วนที่มี 28, TIF1beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 601742 ; เอ็มจีไอ : 109274 ; โฮโมโลยีน : 21175 ; GeneCards : TRIM28 ; OMA : TRIM28 - ออโธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
โปรตีนที่มีโมทีฟไตรพาร์ไทต์ 28 ( TRIM28 ) หรือที่รู้จักกันในชื่อปัจจัยตัวกลางการถอดรหัส 1β ( TIF1β ) และโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับ KRAB-1 ( KAP1 ) เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนTRIM28 [ 5 ] [ 6 ]
การทำงาน
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้ทำหน้าที่ควบคุมการถอดรหัสโดยการโต้ตอบกับ โดเมนการยับยั้ง Krüppel -associated box ( KRAB ) ที่พบในปัจจัยการถอดรหัส หลายชนิด โปรตีนนี้จะอยู่ภายในนิวเคลียสและเชื่อว่าจะเชื่อมโยงกับ บริเวณ โครมาติน ที่เฉพาะเจาะจง TRIM28 เป็นสมาชิกของตระกูลโมทีฟสามส่วน โม ทีฟ สามส่วนนี้ประกอบด้วยโดเมนที่จับกับสังกะสีสามโดเมนโดเมนนิ้ว RINGโดเมน B-box ชนิด 1 และโดเมน B-box ชนิด 2 และบริเวณขดเกลียว[ 7 ]นอกจากนี้ TRIM28 ยังมีโดเมนที่โต้ตอบกับโปรตีนเฮเทอโรโครมาติน 1 (HP1) และโบรโมโดเมนที่สามารถจดจำ สารตกค้าง ไลซีนที่ถูกอะเซทิลเลตในโปรตีนอื่นๆ ได้
TRIM28/KAP1 เป็นโปรตีนที่แสดงออกอย่างแพร่หลายซึ่งเกี่ยวข้องกับหน้าที่สำคัญหลายอย่าง ได้แก่ การควบคุมการถอดรหัส การแยกแยะและการแพร่กระจายของเซลล์ การซ่อมแซมความเสียหายของ DNA การยับยั้งไวรัส และอะพอพโทซิส การทำงานของมันขึ้นอยู่กับการดัดแปลงหลังการแปลโปรตีน TRIM28 ที่ถูกซูโมอิเลตสามารถประกอบกลไกเอพิเจเนติกส์เพื่อปิดการทำงานของยีน ในขณะที่โปรตีน TRIM28 ที่ถูกฟอสโฟรีเลตมีส่วนเกี่ยวข้องกับการซ่อมแซม DNA [ 8 ]
การแบ่งแยกและการเพิ่มจำนวนของเซลล์
การศึกษาแสดงให้เห็นว่าการลบ TRIM28/KAP1 ในหนูก่อนการเกิดแกสตรูเลชันส่งผลให้หนูตาย (ซึ่งบ่งชี้ว่าเป็นโปรตีนที่จำเป็นต่อการพัฒนาในระยะเริ่มต้น) ในขณะที่การลบในหนูโตเต็มวัยส่งผลให้เกิดความวิตกกังวลเพิ่มขึ้นและการเปลี่ยนแปลงในการเรียนรู้และความจำที่เกิดจากความเครียด KAP1 ได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีส่วนร่วมในการรักษาความสามารถในการเปลี่ยนแปลงเป็นเซลล์ชนิดต่างๆ ของเซลล์ต้นกำเนิดตัวอ่อน และส่งเสริมและยับยั้งการแบ่งตัวของเซลล์ในสายเซลล์ของผู้ใหญ่ นอกจากนี้ยังพบระดับ KAP1 ที่เพิ่มขึ้นในมะเร็งตับ กระเพาะอาหาร เต้านม ปอด และต่อมลูกหมาก ซึ่งบ่งชี้ว่าอาจมีบทบาทสำคัญในการแพร่กระจายของเซลล์มะเร็ง (อาจโดยการยับยั้งอะพอพโทซิส) [ 8 ]
การควบคุมการถอดรหัส
KAP1 สามารถควบคุมการถอดรหัสจีโนมผ่านกลไกต่างๆ มากมาย ซึ่งหลายอย่างยังไม่ชัดเจนนัก การศึกษาแสดงให้เห็นว่า KAP1 สามารถยับยั้งการถอดรหัสได้โดยการจับกับจีโนมโดยตรง (ซึ่งอาจเพียงพอในตัวมันเอง) หรือผ่านการเหนี่ยวนำการก่อตัวของเฮเทอโรโครมาตินผ่านทางคอมเพล็กซ์โมเลกุลขนาดใหญ่ Mi2α- SETDB1 -HP1 [ 9 ] [ 10 ] KAP1 ดึงดูดและโต้ตอบโดยตรงกับฮิสโตนเมทิลทรานสเฟอ เรส SETDB1 และกับฮิสโตนดีอะเซทิเลสผ่าน ทางนิ้ว PHDที่ปลาย C และโบรโมโดเมน[ 8 ]ดังนั้นจึงทำหน้าที่เป็นสะพานเชื่อมระหว่างปัจจัยการถอดรหัส KRAB-ZFP ที่จับกับ DNA เฉพาะลำดับและโปรตีนปรับเปลี่ยนฮิสโตนต่างๆ ที่รับผิดชอบในการยับยั้งการถอดรหัสผ่านการปรับโครงสร้างนิวคลีโอโซม ทำให้สามารถทำการเปลี่ยนแปลงทางเอพิเจเนติกส์ที่แม่นยำในตำแหน่งเฉพาะทั่วทั้งจีโนมได้
การตอบสนองต่อการซ่อมแซมความเสียหายของ DNA
มีการแสดงให้เห็นว่าไคเนสATMฟอสโฟรีเลต KAP1 เมื่อตรวจพบ DNA ที่เสียหายหรือแตกหัก KAP1 ที่ถูกฟอสโฟรีเลตพร้อมกับโปรตีนที่เสียหายของ DNA อื่นๆ อีกมากมาย จะเคลื่อนที่ไปยังบริเวณที่ DNA เสียหายอย่างรวดเร็ว การมีส่วนร่วมที่แน่นอนในเส้นทางนี้ยังไม่ชัดเจนนัก แต่มีส่วนเกี่ยวข้องกับการกระตุ้นให้เกิดการหยุดเซลล์ ทำให้สามารถซ่อมแซม DNA ที่เสียหายได้[ 8 ]
อะพอพโทซิส
KAP1 สร้างคอมเพล็กซ์กับMDM2 (ยูบิควิตินE3 ไลเกส ) ที่จับกับp53คอมเพล็กซ์นี้ทำเครื่องหมาย p53 ที่จับอยู่เพื่อการย่อยสลายโดยโปรตีเอโซม p53 เป็นสารตั้งต้นของอะพอพโทซิส ที่รู้จักกันดี ซึ่งอำนวยความสะดวกในการสังเคราะห์โปรตีนที่จำเป็นสำหรับการตายของเซลล์ ดังนั้นการย่อยสลายของมันจึงส่งผลให้เกิดการยับยั้งอะพอพโทซิส[ 8 ]
ความสำคัญทางคลินิก
บทบาทในการก่อให้เกิดภาวะแฝงของไวรัส
KAP1 ช่วยให้เกิดภาวะแฝงของไวรัสในเซลล์บางชนิดสำหรับไวรัสไซโตเมกา ของมนุษย์ (HCMV) และเรโทรไวรัสเอนโดจีนัสอื่น ๆ [ 8 ] [ 9 ] KAP1 ทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้ง การ ถอดรหัสของจีโนมไวรัส โปรตีนนี้จับกับฮิสโตนของโครมาตินไวรัส จากนั้นจึงดึงดูด Mi2α และ SETDB1 SETDB1 เป็นฮิสโตนเมทิลทรานสเฟอเรสที่ดึงดูด HP1 จึงเหนี่ยวนำให้เกิด การสร้าง เฮเทอโรโครมาตินและป้องกันการถอดรหัสของจีโนมไวรัสmTOR มีส่วนเกี่ยวข้องกับการฟอสโฟรี เลชันของ KAP1 ส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนจากภาวะแฝงไปสู่รอบการสลายตัว[ 9 ]
การจัดการและศักยภาพในการรักษาในอนาคต
Ataxia telangiectasia mutated (ATM) เป็นไคเนสที่ (คล้ายกับ mTOR) สามารถฟอสโฟรีเลต KAP1 ส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนจากระยะแฝงของไวรัสไปสู่รอบไลติก คลอโรควินซึ่งเป็นตัวกระตุ้น ATM ได้แสดงให้เห็นว่าส่งผลให้มีการเพิ่มขึ้นของการถอดรหัสจีโนม HCMV ผลกระทบนี้เพิ่มขึ้นเมื่อใช้ปัจจัยเนื้องอกเนโครซิสมีการเสนอว่าการรักษานี้ (ควบคู่กับการรักษาด้วยยาต้านไวรัส) มีศักยภาพในการกำจัดไวรัสออกจากผู้ติดเชื้อ[ 9 ]
ปฏิสัมพันธ์
จากการศึกษาพบว่า TRIM28/KAP1 มีปฏิสัมพันธ์กับ:
ดูเพิ่มเติม
อ่านเพิ่มเติม
- Maruyama K, Sugano S (มกราคม 1994). "Oligo-capping: วิธีง่ายๆ ในการแทนที่โครงสร้าง cap ของ mRNA ยูคาริโอตด้วยโอลิโกไรโบนิวคลีโอไทด์" Gene . 138 ( 1– 2): 171– 174. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- Friedman JR, Fredericks WJ, Jensen DE, Speicher DW, Huang XP, Neilson EG และ คณะ (สิงหาคม 1996) "KAP-1 ตัวยับยั้งร่วมตัวใหม่สำหรับโดเมนการยับยั้ง KRAB ที่มีการอนุรักษ์สูง" Genes & Development 10 ( 16): 2067– 2078. doi : 10.1101/gad.10.16.2067 . PMID 8769649 .
- Kim SS, Chen YM, O'Leary E, Witzgall R, Vidal M, Bonventre JV (ธันวาคม 1996). "สมาชิกใหม่ของตระกูล RING finger, KRIP-1, เชื่อมโยงกับโดเมนตัวยับยั้งการถอดรหัส KRAB-A ของโปรตีน zinc finger" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 93 (26): 15299– 15304. Bibcode : 1996PNAS...9315299K . doi : 10.1073 / pnas.93.26.15299 . PMC 26399. PMID 8986806 .
- Moosmann P, Georgiev O, Le Douarin B, Bourquin JP, Schaffner W (ธันวาคม 1996). "การยับยั้งการถอดรหัสโดยโปรตีน RING finger TIF1 beta ที่มีปฏิสัมพันธ์กับโดเมนยับยั้ง KRAB ของ KOX1" . Nucleic Acids Research . 24 (24): 4859– 4867. doi : 10.1093/nar/24.24.4859 . PMC 146346 . PMID 9016654 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (ตุลาคม 1997). "การสร้างและลักษณะเฉพาะของไลบรารี cDNA ที่อุดมด้วยความยาวเต็มและอุดมด้วยปลาย 5'" Gene . 200 ( 1– 2): 149– 156. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- Chang CJ, Chen YL, Lee SC (ตุลาคม 1998). "Coactivator TIF1beta ทำปฏิกิริยากับ transcription factor C/EBPbeta และ glucocorticoid receptor เพื่อเหนี่ยวนำการแสดงออกของยีน alpha1-acid glycoprotein" . Molecular and Cellular Biology . 18 (10): 5880– 5887. doi : 10.1128/mcb.18.10.5880 . PMC 109174 . PMID 9742105 .
- Eng FC, Barsalou A, Akutsu N, Mercier I, Zechel C, Mader S และ คณะ (ตุลาคม 1998). "โคแอคติเวเตอร์ประเภทต่างๆ จดจำตำแหน่งการจับที่แตกต่างกันแต่ทับซ้อนกันบนโดเมนการจับลิแกนด์ของตัวรับเอสโตรเจน"วารสารเคมีชีวภาพ273 (43): 28371– 28377. doi : 10.1074/jbc.273.43.28371 . PMID 9774463 .
- Ryan RF, Schultz DC, Ayyanathan K, Singh PB, Friedman JR, Fredericks WJ และ คณะ (มิถุนายน 1999) "โปรตีน KAP-1 corepressor มีปฏิสัมพันธ์และอยู่ร่วมกับโปรตีน HP1 ในเฮเทอโรโครมาตินและยูโครมาติน: บทบาทที่เป็นไปได้ของโปรตีน Krüppel-associated box-zinc finger ในการปิดกั้นยีนโดยเฮเทอโรโครมาติน" Molecular and Cellular Biology . 19 (6): 4366– 4378. doi : 10.1128/mcb.19.6.4366 . PMC 104396 . PMID 10330177 .
- Agata Y, Matsuda E, Shimizu A (มิถุนายน 1999). "โปรตีนซิงค์ฟิงเกอร์ที่มีกล่อง Krüppel-associated สองชนิดใหม่ KRAZ1 และ KRAZ2 ยับยั้งการถอดรหัสผ่านปฏิสัมพันธ์เชิงฟังก์ชันกับตัวยับยั้งร่วม KAP-1 (TIF1beta/KRIP-1)" วารสารชีวเคมี 274 ( 23 ) : 16412– 16422. doi : 10.1074/jbc.274.23.16412 . PMID 10347202 .
- Nielsen AL, Ortiz JA, You J, Oulad-Abdelghani M, Khechumian R, Gansmuller A และ คณะ (พฤศจิกายน 1999) "ปฏิสัมพันธ์กับสมาชิกของตระกูลโปรตีนเฮเทอโรโครมาติน 1 (HP1) และการดีอะเซทิเลชันของฮิสโตนมีส่วนเกี่ยวข้องที่แตกต่างกันในการยับยั้งการถอดรหัสโดยสมาชิกของตระกูล TIF1"วารสารEMBO 18 ( 22): 6385– 6395. doi : 10.1093/emboj/18.22.6385 . PMC 1171701 . PMID 10562550 .
- Peng H, Begg GE, Harper SL, Friedman JR, Speicher DW, Rauscher FJ (มิถุนายน 2000). "การวิเคราะห์ทางชีวเคมีของโดเมนการยับยั้งการถอดรหัสของ Kruppel-associated box (KRAB)"วารสารชีวเคมี275 ( 24): 18000– 18010. doi : 10.1074/jbc.M001499200 . PMID 10748030 .
- Lechner MS, Begg GE, Speicher DW, Rauscher FJ (กันยายน 2000). "ปัจจัยกำหนดระดับโมเลกุลสำหรับการกำหนดเป้าหมายการปิดกั้นยีนโดยโปรตีนเฮเทอโรโครมาติน 1: ปฏิสัมพันธ์โดยตรงระหว่างโดเมนโครโมแชโดว์และตัวยับยั้งร่วม KAP-1 เป็นสิ่งจำเป็น" . Molecular and Cellular Biology . 20 (17): 6449– 6465. doi : 10.1128/MCB.20.17.6449-6465.2000 . PMC 86120 . PMID 10938122 .
- Underhill C, Qutob MS, Yee SP, Torchia J (ธันวาคม 2000). "คอมเพล็กซ์ตัวยับยั้งร่วมของตัวรับนิวเคลียร์ชนิดใหม่ N-CoR ประกอบด้วยส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์ SWI/SNF ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมและตัวยับยั้งร่วม KAP-1"วารสารเคมีชีวภาพ 275 ( 51): 40463– 40470. doi : 10.1074/jbc.M007864200 . PMID 11013263 .
- Gebelein B, Urrutia R (กุมภาพันธ์ 2544). "การยับยั้งการถอดรหัสแบบจำเพาะลำดับโดย KS1 โปรตีนกล่องที่เกี่ยวข้องกับ Krüppel ที่มีนิ้วสังกะสีหลายนิ้ว" . ชีววิทยาโมเลกุลและเซลล์ . 21 (3): 928– 939. doi : 10.1128/MCB.21.3.928-939.2001 . PMC 86683 . PMID 11154279 .
- Capili AD, Schultz DC, RauscherIII FJ, Borden KL (มกราคม 2544). "โครงสร้างสารละลายของโดเมน PHD จากตัวยับยั้งร่วม KAP-1: ตัวกำหนดโครงสร้างสำหรับโดเมนการจับสังกะสี PHD, RING และ LIM"วารสารEMBO . 20 ( 1– 2): 165– 177. doi : 10.1093/emboj/20.1.165 . PMC 140198 . PMID 11226167 .
- Schultz DC, Friedman JR, Rauscher FJ (กุมภาพันธ์ 2544). "การกำหนดเป้าหมายคอมเพล็กซ์ฮิสโตนดีอะเซทิเลสผ่านโปรตีน KRAB-ซิงค์ฟิงเกอร์: โดเมน PHD และโบรโมของ KAP-1 สร้างหน่วยร่วมมือที่ดึงดูดไอโซฟอร์มใหม่ของหน่วยย่อย Mi-2alpha ของ NuRD" Genes & Development . 15 (4): 428– 443. doi : 10.1101/gad.869501 . PMC 312636 . PMID 11230151 .
- Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L และ คณะ (พฤษภาคม 2544). "ตระกูลโมทีฟสามส่วนระบุส่วนประกอบของเซลล์"วารสารEMBO 20 ( 9): 2140– 2151. doi : 10.1093/emboj/20.9.2140 . PMC 125245 . PMID 11331580 .
- Hsu SI, Yang CM, Sim KG, Hentschel DM, O'Leary E, Bonventre JV (พฤษภาคม 2544). "TRIP-Br: ตระกูลใหม่ของโปรตีนที่มีปฏิสัมพันธ์กับนิ้วสังกะสี PHD และโบรโมโดเมน ซึ่งควบคุมกิจกรรมการถอดรหัสของ E2F-1/DP-1"วารสารEMBO . 20 (9): 2273– 2285. doi : 10.1093/emboj/20.9.2273 . PMC 125435 . PMID 11331592 .
- Nielsen AL, Oulad-Abdelghani M, Ortiz JA, Remboutsika E, Chambon P, Losson R (เมษายน 2544) "การสร้างเฮเทอโรโครมาตินในเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม: ปฏิสัมพันธ์ระหว่างฮิสโตนกับโปรตีน HP1 " เซลล์โมเลกุล . 7 (4): 729– 739. ดอย : 10.1016/S1097-2765(01)00218-0 . hdl : 10261/308369 . PMID11336697 .
ลิงก์ภายนอก
- โปรตีน TRIM28 ของมนุษย์ จากฐานข้อมูล Medical Subject Headings (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
- พยาบาลC153
- แฟคทอรีบุ๊คKAP1
- ตำแหน่งของยีน TRIM28ในมนุษย์บนUCSC Genome Browser
- รายละเอียดเกี่ยวกับยีน TRIM28ในมนุษย์ สามารถดูได้ที่UCSC Genome Browser
บทความนี้ได้นำข้อความจากหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกาด้านการแพทย์ มา ใช้ ซึ่งเป็นข้อมูลสาธารณะ