โบสถ์แห่งนี้ตั้งอยู่ในทำเลที่ค่อนข้างห่างไกลจากชายฝั่งเพียงไม่กี่เมตร พื้นโบสถ์หลักอยู่สูงจากระดับพื้นดินภายนอกประมาณ 5 เมตร เนื่องจากส่วนกลางของโบสถ์และทางเดินด้านข้างทั้งสองข้างสร้างอยู่เหนือห้องใต้ดินซึ่งเป็นส่วนดั้งเดิมของโบสถ์

ด้านหน้าโบสถ์เข้าถึงได้ผ่านบันไดคู่ที่อยู่ทั้งสองด้านของประตูทางเข้าสไตล์โรมาเนสก์ ซึ่งนำไปสู่ระเบียง ประตูทางเข้าซึ่งอยู่ภายในซุ้มโค้งตันมีการตกแต่งที่ได้รับอิทธิพลจากศิลปะอิสลามประตูทองสัมฤทธิ์ตรงกลางสร้างโดยบาริซาโน ดา ตรานีในปี 1175 ชิ้นส่วนดั้งเดิมปัจจุบันอยู่ภายในโบสถ์ ในขณะที่ชิ้นส่วนภายนอกเป็นแบบจำลองที่สร้างขึ้นในปี 2012

ด้านหน้าโบสถ์ประกอบด้วยหน้าต่างสามบานและหน้าต่างทรงกลมขนาด เล็ก เหนือบริเวณโถงกลาง ซึ่งประดับด้วยรูปสัตว์

ส่วนปีกโบสถ์ที่หันหน้าไปทางทะเลมีมุขโค้ง สามแห่ง และยังมีซุ้มโค้งปิดทึบในสไตล์โรมาเนสก์ ด้านข้างของโบสถ์ก็ตกแต่งด้วยซุ้มโค้งปิดทึบเช่นกัน และด้านทิศใต้มีหน้าต่างบานเกล็ด สองบาน และหน้าต่างทรงกลมหนึ่งบาน ในขณะที่ด้านทิศเหนือมีหน้าต่างบานเกล็ดคู่สองบานและหน้าต่างบานเกล็ดสี่บานหนึ่งบาน

หอระฆังซึ่งสูง 59  เมตร ส่วนใหญ่สร้างขึ้นในช่วงปี 1230–1239 แม้ว่าชั้นบนของหอระฆังจะสร้างเสร็จสมบูรณ์ในศตวรรษที่ 14 ภายใต้การดูแลของบิชอปจาโคโม ตูรา สก็อตตินี^{[ 1 ]}ตามแบบฉบับของโครงสร้างโรมาเนสก์ ช่องเปิด (ในรูปทรงของหน้าต่างบานเกล็ด) จะกว้างขึ้นในชั้นบน

ชั้นล่างของหอระฆังมีซุ้มโค้งภายในที่โค้งมน สร้างทางเดินลอดใต้หอระฆัง หอระฆังถูกรื้อถอนและสร้างใหม่ทั้งหมดในช่วงทศวรรษ 1950 เพื่อป้องกันไม่ให้พังลงมา^{[ 2 ]}

ผังโบสถ์ประกอบด้วยส่วนกลางโบสถ์และทางเดินด้านข้างสองทาง คั่นด้วยเสาคู่ที่รองรับรูปปั้นหญิง สองรูปอยู่ด้าน ข้าง ทางเดินด้านข้างมีเพดานโค้งแบบ กากบาท ในขณะที่ส่วนกลางโบสถ์มี โครงสร้าง คานเปลือย ส่วนปีกโบสถ์ก็มีโครงสร้างคานคล้ายกันด้วย

ภายในสูญเสียการตกแต่งไปมาก ส่งผลให้ปัจจุบันมีลักษณะโล่งเตียนเป็นส่วนใหญ่ โดยเฉพาะอย่างยิ่ง การบูรณะในช่วงปี 1939-1942 ส่วนใหญ่เหลือไว้เพียงองค์ประกอบยุคกลางเท่านั้น โดยได้นำส่วนเพิ่มเติมในภายหลังออกไป เช่น เพดานไม้ทาสีของบริเวณทางเดินกลางและส่วนปีกโบสถ์^{[ 3 ]}

มีเพียงส่วนหนึ่งของโมเสก ดั้งเดิม ของพื้นปูทางเดิน ซึ่งได้รับแรงบันดาลใจจากโมเสกของมหาวิหารโอตรันโตเท่านั้นที่ยังคงอยู่ใน บริเวณ แท่นบูชาซึ่งรวมถึงฉากต่างๆ เช่น อุปมาเรื่องอเล็กซานเดอร์มหาราชบินสู่สวรรค์ (ดูด้านล่าง) และ เหตุการณ์ บาปดั้งเดิมของอาดัมและอีฟ^{[ 4 ]}

โบสถ์ด้านล่างซึ่งตั้งอยู่ใต้พื้นปูหลัก แบ่งออกเป็นสองส่วนหลัก ได้แก่ ห้องใต้ดินของนักบุญนิโคลัส ซึ่งเป็นที่เก็บรักษาพระธาตุของนักบุญ และห้องใต้ดินของนักบุญแมรี่ โบสถ์ด้านล่างมีผังคล้ายกับโบสถ์ด้านบนและมีหัวเสา แบบโรมาเนสก์ บันไดเล็กๆ นำไปสู่ห้องใต้ดินของนักบุญลิวเซียส ซึ่งตั้งอยู่ต่ำกว่าระดับน้ำทะเลและตกแต่งด้วยภาพจิตรกรรมฝาผนังที่อยู่ในสภาพทรุดโทรม