โครงการ ความร่วมมือต่อต้านการก่อการร้ายในแอฟริกาเหนือทะเลทรายซาฮารา (Trans-Saharan Counterterrorism Partnership หรือ TSCTI) เป็นแผนงานระหว่างหน่วยงานของรัฐบาลสหรัฐฯ ที่รวมความพยายามของทั้งหน่วยงานพลเรือนและทหาร "เพื่อต่อสู้กับการก่อการร้ายในแอฟริกาเหนือทะเลทรายซาฮารา ส่วนประกอบทางทหารของ TSCTI ประกอบด้วยความพยายามของสหรัฐฯ ในปฏิบัติการEnduring Freedom - Trans Saharaเป้าหมายของ TSCTI คือการต่อต้านอิทธิพลของผู้ก่อการร้ายในภูมิภาค และช่วยเหลือรัฐบาลในการควบคุมดินแดนของตนให้ดียิ่งขึ้น และป้องกันไม่ให้พื้นที่ขนาดใหญ่ในแอฟริกาที่ส่วนใหญ่เป็นทะเลทรายกลายเป็นที่หลบภัยของกลุ่มก่อการร้าย" ประเทศพันธมิตรกลุ่มแรกในโครงการ ได้แก่แอลจีเรียชาดมาลีมอริเตเนียโมร็อกโกไนเจอร์เซเนกัลไนจีเรียและตูนิเซียปัจจุบันมีประเทศสมาชิก 11 ประเทศในแอฟริกา ได้แก่ แอลจีเรียบูร์กินาฟาโซลิเบียโมร็อกโก ตูนิเซีย ชาด มาลี มอริเตเนีย ไนเจอร์ ไนจีเรีย และเซเนกัลเป้าหมายของพันธมิตรนี้ไม่ใช่การต่อสู้ในพื้นที่ที่มีความขัดแย้ง แต่เป็นการฝึกอบรมเชิงป้องกันและการมีส่วนร่วมกับรัฐบาลเพื่อช่วยป้องกันการเติบโตขององค์กรก่อการร้ายในประเทศพันธมิตร^{[ 1 ]}การฝึกซ้อม Flintlock 2005 ซึ่งเป็นการฝึกซ้อมทางทหารร่วมครั้งแรกที่จัดขึ้นในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2548 ^{[ 2 ]}เป็นผลลัพธ์แรกของโครงการใหม่นี้^{[ 3 ]}

รัฐสภา อนุมัติเงิน 500 ล้านดอลลาร์ สหรัฐสำหรับ TSCTI ในระยะเวลา 6 ปี เพื่อสนับสนุนประเทศต่างๆ ที่เกี่ยวข้องกับการต่อต้านการก่อการร้ายจากภัยคุกคามของอัลเคด้าที่ปฏิบัติการอยู่ในประเทศแถบแอฟริกากลาง ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2550 ประธานาธิบดี จอร์จ ดับเบิลยู . บุชยังได้อนุมัติ ให้จัดตั้ง กองบัญชาการแอฟริกา ขึ้นใหม่ ภายในเดือนกันยายน พ.ศ. 2550 ซึ่งจะดำเนินการปฏิบัติการระดับทวีปแอฟริกาในอนาคต^{[ 4 ]} TSCTI ดำเนินรอยตามโครงการPan Sahel Initiative (PSI) ซึ่งเริ่มต้นในปี พ.ศ. 2545 โดยการฝึกทหารจากมาลีมอริเตเนียไนเจอร์และชาดและสิ้นสุดปฏิบัติการในเดือนธันวาคม พ.ศ. 2547 ^{[ 1 ]}

นักวิจารณ์ของโครงการริเริ่มนี้ได้ตั้งคำถามถึงขอบเขตและการมีอยู่ของการก่อการร้ายสุดโต่งทางศาสนาอิสลามในภูมิภาค และการกระทำและพฤติกรรมในอดีตของรัฐบาลพันธมิตรบางประเทศ ซึ่งอาจใช้โครงการนี้เพื่อรับการฝึกอบรม อุปกรณ์ และเงินทุน เพื่อควบคุมและปราบปรามการเคลื่อนไหวประชาธิปไตยที่ถูกต้องตามกฎหมายในรัฐสมาชิก หรือเพื่อจุดชนวนสงครามระหว่างประเทศเพื่อนบ้านในแอฟริกา^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]} คำถามที่คล้ายกันนี้ถูกยกขึ้นเกี่ยวกับ โครงการริเริ่มแพนซาเฮลซึ่งเป็นโครงการก่อนหน้าของ TSCTI ^{[ 8 ] [ 9 ]}

เมื่อวันที่ 1 ตุลาคม พ.ศ. 2551 ความรับผิดชอบได้ถูกโอนจากกองบัญชาการกลางสหรัฐฯ (CENTCOM) และกองบัญชาการยุโรปสหรัฐฯ (EUCOM) ไปยังกองบัญชาการแอฟริกาสหรัฐฯ (AFRICOM) เนื่องจากได้รับอำนาจเหนือเขตปฏิบัติการในแอฟริกา^{[ 10 ]}

• รีฟ, ริชาร์ด (14 สิงหาคม 2552). "เติมเต็มช่องว่าง - ปริศนาของ AQIM ในทะเลทรายซาฮาราตอนใต้". เจนส์ อินเทลลิเจนท์ รีวิว .(14 สิงหาคม 2552)