เทรย์ ไอเดเกอร์
เทรย์ ไอเดเกอร์เป็นผู้อำนวยการสถาบันบิ๊กดาต้าแห่งมหาวิทยาลัยออกซ์ฟอร์ดและศาสตราจารย์ด้านการแพทย์แห่งมหาวิทยาลัยแคลิฟอร์เนีย ซานดิเอโกนอกจากนี้ เขายังดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโครงการ ARPA-H ADAPT Dynamic Digital Tumors for Precision Oncology Project , ผู้อำนวยการโครงการBridge2AI Cell Maps for AI (CM4AI)และผู้อำนวยการร่วมของโครงการNCI Cancer Cell Map Initiative (CCMI) อีก ด้วย
ชีวประวัติ
Ideker ได้รับปริญญาตรีและปริญญาโทสาขาวิทยาการคอมพิวเตอร์จากMITและปริญญาเอกสาขาวิทยาศาสตร์จีโนมจากมหาวิทยาลัยวอชิงตันภายใต้การดูแลของ ดร. Leroy Hood [ 1 ]และดร. Dick Karpหลังจากได้รับปริญญาเอกแล้ว Ideker ก็ได้เป็น David Baltimore Fellow ที่Whitehead Institute for Biomedical Research ในเมืองเคมบริดจ์ รัฐแมสซาชูเซตส์ ตั้งแต่ปี 2001 ถึง 2003
ในปี 2546 Ideker เข้าร่วมภาควิชาวิศวกรรมชีวภาพของ Jacobs School ที่UC San Diegoในตำแหน่งผู้ช่วยศาสตราจารย์ด้านวิศวกรรมชีวภาพ ในปี 2549 เขาได้เป็นรองศาสตราจารย์ด้านวิศวกรรมชีวภาพและศาสตราจารย์พิเศษด้านวิทยาการคอมพิวเตอร์ เขาดำรงตำแหน่งหัวหน้าแผนกพันธุศาสตร์การแพทย์ตั้งแต่ปี 2552 – 2559 [ 2 ]ตั้งแต่ปี 2553 เขาเป็นศาสตราจารย์ด้านการแพทย์และศาสตราจารย์พิเศษด้านวิศวกรรมชีวภาพและวิทยาการคอมพิวเตอร์ และยังดำรงตำแหน่งเป็นสมาชิกของMoores Cancer Center อีก ด้วย
ในปี 2026 Ideker ได้รับการ แต่งตั้ง ให้เป็นผู้อำนวยการคนใหม่ของสถาบันข้อมูลขนาดใหญ่ (BDI) แห่งมหาวิทยาลัยอ็อกซ์ฟอร์ด[ 3 ]
ในช่วงต้นปี 2026 เขายังได้รับการแต่งตั้งเป็นสมาชิกผู้เยี่ยมชมของสถาบันการแพทย์เอลลิสัน (EMI) อีกด้วย [ 4 ]
ก่อนหน้านี้ Ideker เคยดำรงตำแหน่งเป็นสมาชิกคณะที่ปรึกษาทางวิทยาศาสตร์ของสถาบันมะเร็งแห่งชาติ (NIH National Cancer Institute ) และสถาบันวิจัยจีโนมมนุษย์แห่งชาติ (National Human Genome Research Institute ) เขายังดำรงตำแหน่งในคณะบรรณาธิการของ วารสาร Cell , Cell Systems , PLoS Computational BiologyและMolecular Systems Biologyนอกจากนี้ Ideker ยังเคยเป็นที่ปรึกษาให้กับบริษัทต่างๆ เช่น Data4Cure, Ideaya Biosciences, Serinus Biosciences, Eikon Therapeutics, Motiv Health, Plexium และ LightHorse Therapeutics
เกียรติยศและรางวัล
ในปี พ.ศ. 2547 Ideker ได้รับ รางวัลPackard Fellowships for Science and Engineering จากมูลนิธิ David and Lucile Packard [ 5 ]
ในปี 2548 Ideker ได้รับการเสนอชื่อให้เป็นหนึ่งในนักประดิษฐ์ชั้นนำของโลกที่มีอายุต่ำกว่า 35 ปีโดยMIT Technology Review TR35 [ 2 ] [ 6 ]ในปีต่อมาTechnology Review ได้เสนอชื่อเขาให้ เป็นหนึ่งใน 10 นักประดิษฐ์ชั้นนำของปี2549 [ 7 ]
ในปี 2009 เขาได้รับรางวัลโอเวอร์ตันจากสมาคมชีววิทยาเชิงคำนวณระหว่างประเทศเพื่อเป็นการยกย่องผลงานอันสำคัญของเขาในสาขาชีววิทยาเชิงคำนวณ[ 8 ] [ 9 ]
ตั้งแต่ปี 2019 เขาได้รับการยอมรับเป็นประจำทุกปีในฐานะนักวิจัยที่มีการอ้างอิงสูงใน Clarivate Web of Science (อยู่ในกลุ่ม 1% แรกตามจำนวนการอ้างอิง) [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ]
ในปี 2022 เขาได้รับเลือกให้เป็นFellowของInternational Society for Computational Biology [ 13 ]
นอกจากนี้ เขายังเป็นสมาชิกกิตติมศักดิ์ขององค์กรAAASและAIMBE อีกด้วย
อาชีพและการวิจัย
Ideker เป็นผู้นำในการศึกษาที่สำคัญซึ่งวางรากฐานทฤษฎีและการปฏิบัติของชีววิทยาระบบ รวมถึงเทคนิคที่เป็นระบบสำหรับการอธิบายโครงสร้างเซลล์มนุษย์และเครือข่ายโมเลกุลของเซลล์เหล่านั้น
ในช่วงเริ่มต้นอาชีพการงานของเขาขณะทำงานร่วมกับLeroy Hoodนั้น Ideker เป็นหนึ่งในนักวิจัยกลุ่มแรกๆ ที่เผยแพร่แบบจำลองการคำนวณแบบบูรณาการของเครือข่ายการเผาผลาญ[ 14 ] [ 8 ] เขาและ Hood ได้ตีพิมพ์บทความสำคัญในวารสาร Scienceซึ่งพวกเขาสร้างแบบจำลองการคำนวณของการเผาผลาญของยีสต์และช่วยกำหนดขอบเขตของสาขาชีววิทยาระบบ
ห้องปฏิบัติการ Ideker ได้สร้างแผนที่เครือข่ายโปรตีน-โปรตีน เครือข่ายการถอดรหัส และเครือข่ายทางพันธุกรรมจำนวนมากในสิ่งมีชีวิตต้นแบบและมนุษย์ (โดยความร่วมมือกับผู้ฝึกงานและผู้ร่วมวิจัย) รวมถึงซอฟต์แวร์วิเคราะห์เครือข่าย Cytoscape ที่ใช้กันอย่างแพร่หลาย (ร่วมกับ Gary Bader และคนอื่นๆ)
งานวิจัยของเขาได้สร้างระเบียบวิธีที่ปัจจุบันกลายเป็นแนวคิดหลักในสาขาชีวสารสนเทศศาสตร์ ซึ่งรวมถึงการสร้างเครือข่ายการถอดรหัสเพื่ออธิบายรูปแบบการแสดงออกทั่วทั้งจีโนม (ร่วมกับ Leroy Hood) การจัดเรียงเครือข่ายและการเปรียบเทียบเชิงวิวัฒนาการ (ร่วมกับ Richard Karp และ Roded Sharan) และตัวบ่งชี้ทางชีวภาพของเครือข่าย ซึ่งช่วยให้สามารถกำหนดนิยามแบบหลายยีนของชนิดย่อยของผู้ป่วยและการตอบสนองต่อการรักษาได้
เขายังได้แนะนำเทคนิคการทำแผนที่เชิงทดลอง ซึ่งรวมถึงการทำแผนที่ปฏิสัมพันธ์แบบสังเคราะห์ที่ทำให้เกิดการตายด้วย CRISPR/Cas9 (ร่วมกับ Prashant Mali) และการระบุลักษณะปฏิสัมพันธ์ที่แตกต่างกันภายใต้เงื่อนไขและช่วงเวลาต่างๆ (ร่วมกับ Nevan Krogan) เทคโนโลยีเหล่านี้ได้ให้ข้อมูลอย่างกว้างขวางเกี่ยวกับกลไกที่การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่หลากหลายนำไปสู่โรคมะเร็ง โรคทางระบบประสาท และการดื้อยา
เมื่อไม่นานมานี้ เขาได้สาธิตกระบวนการแบบครบวงจรสำหรับการสร้างแผนที่โครงสร้างของเซลล์มนุษย์ในช่วงขนาดที่กว้าง โดยอาศัยการผสานรวมเครือข่ายโปรตีนเข้ากับการถ่ายภาพด้วยอิมมูโนฟลูออเรสเซนส์ (ร่วมกับ Emma Lundberg และ Steve Gygi)
นอกจากนี้ Ideker ยังได้แสดงให้เห็นเมื่อเร็ว ๆ นี้ว่า แผนที่เครือข่ายเป็นพื้นฐานสำหรับแบบจำลองการเรียนรู้เชิงลึกของโครงสร้างและหน้าที่ของเซลล์ ซึ่งมีนัยสำคัญพื้นฐานสำหรับการสร้างระบบอัจฉริยะในด้านมะเร็งวิทยาแบบแม่นยำ (ร่วมกับ Jianzhu Ma และผู้ร่วมวิจัย)
ในที่สุด Ideker และผู้ร่วมงานได้แสดงให้เห็นว่าส่วนใหญ่ของเมทิลโลมมีการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างตามอายุ ซึ่งนำไปสู่นาฬิกาเอพิเจเนติกส์ตัวแรกและสาขาการแก่ชราทางเอพิเจเนติกส์ที่กำลังขยายตัวอย่างรวดเร็ว ในปี 2013 Ideker ร่วมกับKang Zhangได้ระบุว่านาฬิกาการแก่ชราระดับโมเลกุลสามารถวัดได้จากเลือดและเนื้อเยื่อ และได้ใช้เครื่องหมายเอพิเจเนติกส์[ 15 ]