กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 3 นาที

ตัวยุติการจำลองแบบตระกูล Tus

Tus ( terminus utilization substance ) หรือที่รู้จักกันในชื่อโปรตีนจับเทอร์มิเนเตอร์เป็นโปรตีนที่จับกับลำดับเทอร์มิเนเตอร์และทำหน้าที่เป็นเฮลิเคส ตัวต้าน...

ตัวยุติการจำลองแบบตระกูล Tus

เทอร์
การศึกษา NMR ของลำดับซ้ำของโพรลีนจาก tus
ตัวระบุ
เครื่องหมายเทอร์
พีแฟมPF05472
อินเตอร์โปรIPR008865
สโคป25eau / SCOPe / SUPFAM
โครงสร้างโปรตีนที่มีอยู่:
พีดีบี  IPR008865 PF05472 ( ECOD ; PDBsum )  
อัลฟาโฟลด์
  • IPR008865
  • PF05472
ภาพแสดงโครงสร้างผลึกเอกซ์เรย์ของโปรตีน Tus-Ter คอมเพล็กซ์-ดีเอ็นเอ (การแสดงผลพิกัด Jmol จาก[ 1 ]สายดีเอ็นเอแสดงด้วยสีชมพูและสีเขียว)

Tus ( terminus utilization substance ) หรือที่รู้จักกันในชื่อโปรตีนจับเทอร์มิเนเตอร์เป็นโปรตีนที่จับกับลำดับเทอร์มิเนเตอร์และทำหน้าที่เป็นเฮลิเคส ตัวต้าน เมื่อสัมผัสกับเฮลิเคสที่กำลังเคลื่อนที่[ 2 ] โปรตีน Tus ที่จับอยู่จะหยุด การเคลื่อนที่ของดีเอ็นเอพอลิเมอเรสได้อย่างมีประสิทธิภาพ[ 2 ] Tus ช่วยยุติการจำลองดีเอ็นเอในโปรคาริโอต [ 2 ] พวกมันทำงานโดยการจับ กับลำดับเทอร์ มิเน เตอร์ของ การจำลองดีเอ็นเอจึงป้องกันการผ่านของฟอร์กการจำลอง[ 3 ]ประสิทธิภาพการยุติได้รับผลกระทบจากความสัมพันธ์ของโปรตีนเฉพาะกับลำดับ เทอร์มิเน เตอร์

ในE. coli ( P16525 ) Tus จะจับกับไซต์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด 10 ไซต์ที่เข้ารหัสอยู่ในโครโมโซมแม้ว่าจะมีเพียง 6 ไซต์เท่านั้นที่น่าจะเกี่ยวข้องกับการยุติการจำลองแบบ แต่ละไซต์มี 23 คู่เบส ไซต์เหล่านี้เรียกว่าไซต์ Terและกำหนดให้เป็นTerA , TerB , ..., TerGไซต์การจับเหล่านี้ไม่สมมาตร กล่าวคือ เมื่อคอมเพล็กซ์ Tus-Ter (โปรตีน Tus ที่จับกับไซต์ Ter) พบกับส้อมการจำลองแบบจากทิศทางหนึ่ง คอมเพล็กซ์จะแยกตัวออกและการจำลองแบบจะดำเนินต่อไป (อนุญาต) แต่เมื่อพบจากอีกทิศทางหนึ่ง คอมเพล็กซ์ Tus-Ter จะสร้างอุปสรรคทางจลนศาสตร์ที่ใหญ่กว่ามากและหยุดการจำลองแบบ (ไม่อนุญาต) ไซต์Ter หลาย ไซต์ในโครโมโซมมีการวางแนวเพื่อให้ส้อมการจำลองแบบที่เคลื่อนที่ไปในทิศทางตรงกันข้ามทั้งสองหยุดชะงักในบริเวณการยุติที่ต้องการ[ 4 ]

แบคทีเรีย Bacillus subtilisใช้โปรตีนหยุดการจำลองแบบ (RTP) แทน Tus ซึ่งเป็นโปรตีนคนละตระกูลที่มีโครงสร้างแตกต่างกันในการจับกับ DNA: InterPro IPR003432

โครงสร้าง

โปรตีน Ter ประกอบด้วยสองโดเมน โดเมน N-terminal ประกอบด้วยอัลฟาเฮลิกซ์เบต้าชีท และลูปสามลูป โดเมน C-terminal ประกอบด้วยอัลฟาเฮลิกซ์ สองอัน และเบต้าชีทหนึ่ง อัน [ 5 ]หรืออีกทางหนึ่งCATHแบ่งโครงสร้างออกเป็นโดเมนขนาดใหญ่ที่ครอบคลุมลำดับทั้งหมดและส่วนแทรกขนาดเล็กที่โผล่ออกมาและพับเป็นโดเมนแยกต่างหาก[ 6 ]

การทำงาน

ปลายการจำลองดีเอ็นเอ (Ter) มีบทบาทในการป้องกันความคืบหน้าของส้อมการจำลองดีเอ็นเอ[ 7 ] ดังนั้น โปรตีนที่จับกับไซต์ปลายการจำลองดีเอ็นเอจะจับกับไซต์นี้เพื่อช่วยปิดกั้นส้อมการจำลองดีเอ็นเอ มีสองยีนที่ ควบคุมกิจกรรมการจับ Ter ซึ่งมีชื่อว่า tau และTus [ 3 ]

อ่านเพิ่มเติม

  • "ปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนเทอร์มิเนเตอร์การจำลองแบบของ Escherichia coli (Tus) กับ DNA: แบบจำลองที่ได้มาจากการศึกษาการจับ DNA ของโปรตีนกลายพันธุ์โดยใช้เรโซแนนซ์พลาสมอนพื้นผิว" [ 8 ]
  • "การยุติการจำลองแบบใน Escherichia coli: โครงสร้างและกิจกรรมต้านเฮลิเคสของคอมเพล็กซ์ Tus-Ter" [ 9 ]
  • "กับดักหนูระดับโมเลกุลกำหนดขั้วของการยุติการจำลองดีเอ็นเอใน E. coli" [ 4 ]
  • "การแยกและลักษณะเฉพาะของกลายพันธุ์ของ Tus ซึ่งเป็นโปรตีนที่ยับยั้งการจำลองแบบของ Escherichia coli" [ 10 ]
  • "ลักษณะทางชีวฟิสิกส์ของ Tus ซึ่งเป็นโปรตีนที่ยับยั้งการจำลองแบบของ Escherichia coli" [ 11 ]
  • "โครงสร้างของโปรตีนตัวยุติการจำลองแบบที่ซับซ้อนกับ DNA" [ 1 ]
    • โครงสร้างในฐานข้อมูลโปรตีน
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Replication_terminator_Tus_family&oldid=1301190250 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ตัวยุติการจำลองแบบตระกูล Tus

Tus ( terminus utilization substance ) หรือที่รู้จักกันในชื่อโปรตีนจับเทอร์มิเนเตอร์เป็นโปรตีนที่จับกับลำดับเทอร์มิเนเตอร์และทำหน้าที่เป็นเฮลิเคส ตัวต้าน...

โครงสร้าง

โปรตีน Ter ประกอบด้วยสองโดเมน โดเมน N-terminal ประกอบด้วย อัลฟาเฮลิกซ์ เบต้าชีท และลูปสามลูป โดเมน C-terminal ประกอบด้วย อัลฟาเฮลิกซ์ สองอัน และ เบต้าชีท หนึ่ง อัน [ 5 ] หรืออีกทางหนึ่ง CATH...

การทำงาน

ปลายการจำลองดีเอ็นเอ (Ter) มีบทบาทในการป้องกันความคืบหน้าของ ส้อมการจำลอง ดีเอ็นเอ [ 7 ] ดังนั้น โปรตีนที่จับกับไซต์ปลายการจำลองดีเอ็นเอจะจับกับไซต์นี้เพื่อช่วยปิดกั้นส้อมการจำลองดีเอ็นเอ มีสองยีนที่ ควบคุม กิจกรรมการจับ Ter ซึ่งมีชื่อว่า tau และ Tus [ 3 ]

อ่านเพิ่มเติม

"ปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนเทอร์มิเนเตอร์การจำลองแบบของ Escherichia coli (Tus) กับ DNA: แบบจำลองที่ได้มาจากการศึกษาการจับ DNA ของโปรตีนกลายพันธุ์โดยใช้เรโซแนนซ์พลาสมอนพื้นผิว" [ 8 ] "การยุติการจำลองแบบใน Escherichia coli: โครงสร้างและกิจกรรมต้านเฮลิเคสของคอมเพล็กซ์...