ตัวยุติการจำลองแบบตระกูล Tus
| เทอร์ | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
การศึกษา NMR ของลำดับซ้ำของโพรลีนจาก tus | |||||||
| ตัวระบุ | |||||||
| เครื่องหมาย | เทอร์ | ||||||
| พีแฟม | PF05472 | ||||||
| อินเตอร์โปร | IPR008865 | ||||||
| สโคป2 | 5eau / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| |||||||

Tus ( terminus utilization substance ) หรือที่รู้จักกันในชื่อโปรตีนจับเทอร์มิเนเตอร์เป็นโปรตีนที่จับกับลำดับเทอร์มิเนเตอร์และทำหน้าที่เป็นเฮลิเคส ตัวต้าน เมื่อสัมผัสกับเฮลิเคสที่กำลังเคลื่อนที่[ 2 ] โปรตีน Tus ที่จับอยู่จะหยุด การเคลื่อนที่ของดีเอ็นเอพอลิเมอเรสได้อย่างมีประสิทธิภาพ[ 2 ] Tus ช่วยยุติการจำลองดีเอ็นเอในโปรคาริโอต [ 2 ] พวกมันทำงานโดยการจับ กับลำดับเทอร์ มิเน เตอร์ของ การจำลองดีเอ็นเอจึงป้องกันการผ่านของฟอร์กการจำลอง[ 3 ]ประสิทธิภาพการยุติได้รับผลกระทบจากความสัมพันธ์ของโปรตีนเฉพาะกับลำดับ เทอร์มิเน เตอร์
ในE. coli ( P16525 ) Tus จะจับกับไซต์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด 10 ไซต์ที่เข้ารหัสอยู่ในโครโมโซมแม้ว่าจะมีเพียง 6 ไซต์เท่านั้นที่น่าจะเกี่ยวข้องกับการยุติการจำลองแบบ แต่ละไซต์มี 23 คู่เบส ไซต์เหล่านี้เรียกว่าไซต์ Terและกำหนดให้เป็นTerA , TerB , ..., TerGไซต์การจับเหล่านี้ไม่สมมาตร กล่าวคือ เมื่อคอมเพล็กซ์ Tus-Ter (โปรตีน Tus ที่จับกับไซต์ Ter) พบกับส้อมการจำลองแบบจากทิศทางหนึ่ง คอมเพล็กซ์จะแยกตัวออกและการจำลองแบบจะดำเนินต่อไป (อนุญาต) แต่เมื่อพบจากอีกทิศทางหนึ่ง คอมเพล็กซ์ Tus-Ter จะสร้างอุปสรรคทางจลนศาสตร์ที่ใหญ่กว่ามากและหยุดการจำลองแบบ (ไม่อนุญาต) ไซต์Ter หลาย ไซต์ในโครโมโซมมีการวางแนวเพื่อให้ส้อมการจำลองแบบที่เคลื่อนที่ไปในทิศทางตรงกันข้ามทั้งสองหยุดชะงักในบริเวณการยุติที่ต้องการ[ 4 ]
แบคทีเรีย Bacillus subtilisใช้โปรตีนหยุดการจำลองแบบ (RTP) แทน Tus ซึ่งเป็นโปรตีนคนละตระกูลที่มีโครงสร้างแตกต่างกันในการจับกับ DNA: InterPro : IPR003432
โครงสร้าง
โปรตีน Ter ประกอบด้วยสองโดเมน โดเมน N-terminal ประกอบด้วยอัลฟาเฮลิกซ์เบต้าชีท และลูปสามลูป โดเมน C-terminal ประกอบด้วยอัลฟาเฮลิกซ์ สองอัน และเบต้าชีทหนึ่ง อัน [ 5 ]หรืออีกทางหนึ่งCATHแบ่งโครงสร้างออกเป็นโดเมนขนาดใหญ่ที่ครอบคลุมลำดับทั้งหมดและส่วนแทรกขนาดเล็กที่โผล่ออกมาและพับเป็นโดเมนแยกต่างหาก[ 6 ]
การทำงาน
ปลายการจำลองดีเอ็นเอ (Ter) มีบทบาทในการป้องกันความคืบหน้าของส้อมการจำลองดีเอ็นเอ[ 7 ] ดังนั้น โปรตีนที่จับกับไซต์ปลายการจำลองดีเอ็นเอจะจับกับไซต์นี้เพื่อช่วยปิดกั้นส้อมการจำลองดีเอ็นเอ มีสองยีนที่ ควบคุมกิจกรรมการจับ Ter ซึ่งมีชื่อว่า tau และTus [ 3 ]
อ่านเพิ่มเติม
- "ปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนเทอร์มิเนเตอร์การจำลองแบบของ Escherichia coli (Tus) กับ DNA: แบบจำลองที่ได้มาจากการศึกษาการจับ DNA ของโปรตีนกลายพันธุ์โดยใช้เรโซแนนซ์พลาสมอนพื้นผิว" [ 8 ]
- "การยุติการจำลองแบบใน Escherichia coli: โครงสร้างและกิจกรรมต้านเฮลิเคสของคอมเพล็กซ์ Tus-Ter" [ 9 ]
- "กับดักหนูระดับโมเลกุลกำหนดขั้วของการยุติการจำลองดีเอ็นเอใน E. coli" [ 4 ]
- "การแยกและลักษณะเฉพาะของกลายพันธุ์ของ Tus ซึ่งเป็นโปรตีนที่ยับยั้งการจำลองแบบของ Escherichia coli" [ 10 ]
- "ลักษณะทางชีวฟิสิกส์ของ Tus ซึ่งเป็นโปรตีนที่ยับยั้งการจำลองแบบของ Escherichia coli" [ 11 ]
- "โครงสร้างของโปรตีนตัวยุติการจำลองแบบที่ซับซ้อนกับ DNA" [ 1 ]
- โครงสร้างในฐานข้อมูลโปรตีน