องค์กรนี้เป็นหนึ่งในทีมผู้ก่อตั้งในFederal Hockey League (FHL) และมี Nicole Kirnan ลูกสาวของ Don Kirnan ผู้บริหารลีกเป็นเจ้าของส่วนใหญ่^{[ 2 ]}เดิมทีทีมนี้รู้จักกันในชื่อ1000 Islands Privateersและเล่นที่Bonnie Castle Recreation CenterในAlexandria Bay รัฐนิวยอร์กเป็นเวลาสองฤดูกาลก่อนที่จะย้ายไปที่ Watertown ในฤดูกาล 2012–13 ^{[ 3 ]}เมื่อวันที่ 1 มีนาคม 2013 Nicole Kirnan เจ้าของและประธานของ Privateers ได้ทำหน้าที่เป็นโค้ชของทีมในห้าเกมสุดท้ายของฤดูกาล ทำให้เธอเป็นผู้หญิงคนแรกที่เป็นหัวหน้าโค้ชทีมฮอกกี้อาชีพในสหรัฐอเมริกา เมื่อโค้ช Paul Kelly กลับมาเล่นให้กับทีม^{[ 4 ] [ 5 ]}

ก่อนฤดูกาล 2013–14 ทีม Privateers ได้ปรับปรุงเอกลักษณ์ของตนใหม่โดยเปลี่ยนชื่อเป็นWatertown Privateersและออกแบบเสื้อและโลโก้ใหม่ Brad Zangs ได้รับการแต่งตั้งเป็นหัวหน้าโค้ชคนใหม่^{[ 6 ]}

ทีม FHL ของวอเตอร์ทาวน์กลับมาอีกครั้งในฤดูกาล 2014–15 ภายใต้เจ้าของใหม่ หลังจากที่เจ้าของเดิมตัดสินใจไม่ดำเนินการต่อ ทีมได้เปลี่ยนชื่อเป็นวอเตอร์ทาวน์ วูล์ฟส์ในฤดูกาลนี้ ในฤดูกาลแรก วูล์ฟส์คว้าแชมป์ทั้งในฤดูกาลปกติและรอบเพลย์ออฟ เบรนต์ คลาร์ก หัวหน้าโค้ชปีแรก ได้รับรางวัลโค้ชแห่งปีของ FHL แต่ลาออกหลังจากจบฤดูกาล^{[ 7 ]}

ทีมวูล์ฟส์ระงับการแข่งขันในฤดูกาล 2015–16 เพื่อทำการปรับปรุงสนามวอเตอร์ทาวน์ มูนิซิปัล อารีน่า ทีมพยายามหาสนามอื่นในนิวยอร์กตอนเหนือ แต่ไม่สามารถหาสถานที่ว่างได้ การปรับปรุงเสร็จสิ้นตามกำหนด และทีมวูล์ฟส์ได้ลงนามในสัญญาเช่าใหม่กับเมืองวอเตอร์ทาวน์เป็นเวลาหนึ่งปี เพื่อกลับมาแข่งขันอีกครั้งหลังจากหยุดพักไปหนึ่งฤดูกาล^{[ 8 ] [ 9 ]}

ทีมวูล์ฟส์กลับมาลงแข่งในฤดูกาล 2016–17และได้จ้างฟิล เอสโปซิโตเป็นหัวหน้าโค้ช^{[ 10 ]}

ก่อนฤดูกาล 2017–18 แฟรนไชส์ถูกซื้อโดย IDHL, LLC. ซึ่งเป็นบริษัทในเครือของ FHL และเป็นองค์กรที่ประกาศว่าจะดำเนินการลีกพัฒนาเป็นระบบป้อนผู้เล่นให้กับ FHL ^{[ 11 ] [ 12 ]}ที่เรียกว่า International Developmental Hockey League ^{[ 13 ]} IDHL เลื่อนการเปิดตัวลีกใหม่เพื่อมุ่งเน้นไปที่การดำเนินงานของทีม Wolves เพียงอย่างเดียว ผู้ถือหุ้นใน Top Shelf Hockey ในที่สุดก็ออกจากองค์กร Wolves ไปโดยสิ้นเชิงในช่วงนอกฤดูกาล โดยระบุว่าพวกเขารู้สึกเหนื่อยล้าจากการลงทุนทางการเงินและอารมณ์จำนวนมากที่พวกเขาทำกับแฟรนไชส์^{​​[ 14 ]}

เจ้าของใหม่ไม่ได้ให้ Esposito เป็นโค้ชต่อ แต่ได้จ้าง Trevor Karasiewicz มาเป็นโค้ชแทนในฤดูกาล 2017–18 ^{[ 15 ]}ซึ่งเขาพาทีมคว้าแชมป์ลีกได้ในฤดูกาลแรก หลังจากฤดูกาลที่สอง เขาได้ย้ายไปรับตำแหน่งหัวหน้าโค้ชของทีมFresno Monstersซึ่งเป็นทีมเยาวชนในWestern States Hockey League Paul MacLean อดีต โค้ชของ Danville Dashersได้รับการแต่งตั้งให้เป็นผู้แทนของเขาในฤดูกาล 2019–20 ^{[ 16 ]}นอกจากนี้ ในช่วงนอกฤดูกาล 2019 ลีกได้เปลี่ยนชื่ออย่างเป็นทางการเป็นFederal Prospects Hockey League (FPHL) เนื่องจากการระบาดของโรคโควิด-19ในฤดูกาล 2019–20 ฤดูกาลปกติจึงถูกตัดทอนและรอบเพลย์ออฟถูกยกเลิก

แฟรนไชส์ถูกขายอีกครั้งในปี 2020 โดยมีผู้ประกอบการ Andreas Johansson เป็นเจ้าของส่วนใหญ่ และ Don Kirnan ผู้บัญชาการลีกยังคงดำรงตำแหน่งในบทบาทส่วนน้อย^{[ 17 ]}จากนั้นทีมได้นำ Brent Clarke กลับมาเป็นหัวหน้าโค้ชสำหรับฤดูกาล 2020–21 ด้วยข้อจำกัดที่ยังคงมีอยู่ท่ามกลางการระบาดใหญ่ FPHL ได้ประกาศว่าElmira Enforcersและ Watertown จะเป็นเพียงสองทีมที่จะเริ่มฤดูกาลในวันที่ 3 กุมภาพันธ์ 2021 ^{[ 18 ]}ทั้งสองทีมเล่นเกมอุ่นเครื่องสามเกมในช่วงปลายเดือนมกราคมก่อนที่จะเดินทางไปยัง Watertown เพื่อเริ่มต้น Summit Series อย่างไรก็ตาม เกมถูกยกเลิกโดย Wolves ได้รับชัยชนะโดยการยอมแพ้เนื่องจากการทะเลาะวิวาทก่อนเกมหลังจากผู้เล่น Elmira พยายามเข้าไปในห้องล็อกเกอร์ของ Wolves ทำให้ตำรวจถูกเรียกไปยังสนาม^{[ 19 ]}การทะเลาะวิวาทดังกล่าวทำให้ซีรีส์ 16 เกมในเดือนกุมภาพันธ์ระหว่างทั้งสองทีมถูกยกเลิกทั้งหมด^{[ 20 ]}เมื่อ FPHL เริ่มฤดูกาลที่เหลือของปี 2020–21 ในวันที่ 19 กุมภาพันธ์ ทีม Wolves เลือกที่จะไม่เข้าร่วมในฤดูกาลนี้เนื่องจากไม่มีน้ำแข็งในสนามกีฬาของพวกเขาในช่วงฤดูใบไม้ผลิ

ทีมกลับมาลงเล่นในฤดูกาล 2021–22 และคว้าแชมป์สมัยที่สองได้สำเร็จ โดยเอาชนะโคลัมบัสไปได้ 3 เกม ในซีรีส์ที่ดีที่สุดใน 3 เกม โดยเลน คิงเป็นผู้ทำประตูชัยในช่วงต่อเวลาพิเศษครั้งที่สองของเกมตัดสิน

หลังจบฤดูกาล Andreas Johansson ขายทีมให้กับนักลงทุน 4 รายเพื่อให้ทีมมีเจ้าของท้องถิ่น^{[ 21 ]}ทีม Wolves เปิดตัวเสื้อแข่งใหม่และโทนสีใหม่สำหรับโลโก้ก่อนฤดูกาล 2022–23 ในเดือนสิงหาคม 2022 Brent Clarke ได้รับการแต่งตั้งเป็นหัวหน้าโค้ชของKnoxville Ice Bearsประธานทีม Curtis Moseley จะเข้ารับตำแหน่งผู้จัดการทั่วไป ในขณะที่อดีตผู้เล่นกองหลัง Justin Coachman ซึ่งเป็นสมาชิกของทีมแชมป์ปี 2018 และ 2022 จะเป็นหัวหน้าโค้ชคนต่อไปของทีม^{[ 22 ]} Moseley ลาออกในปี 2023 และกัปตันทีม Charlie Pens Jr. จะเข้ามาแทนที่ในตำแหน่งผู้จัดการทั่วไป

เมื่อวันที่ 19 ธันวาคม พ.ศ. 2567 ทีมวูล์ฟส์ประกาศว่าได้ปลดชาร์ลี เพนส์ จูเนียร์ ออกจากตำแหน่งหัวหน้าโค้ช จัสติน โค้ชแมน จะรับหน้าที่ทั้งหมดทันที^{[ 23 ]}