กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 2 นาที

ตัวประมาณค่าของวัตเตอร์สัน

ใน พันธุศาสตร์ประชากร ตัวประมาณค่า Watterson เป็นวิธีการอธิบาย ความหลากหลายทางพันธุกรรม ในประชากร พัฒนาโดย Margaret Wu และ GA Watterson ในช่วงทศวรรษ 1970 [ 1 ] [ 2 ]...

ตัวประมาณค่าของวัตเตอร์สัน

ในพันธุศาสตร์ประชากรตัวประมาณค่า Wattersonเป็นวิธีการอธิบายความหลากหลายทางพันธุกรรมในประชากร พัฒนาโดยMargaret WuและGA Wattersonในช่วงทศวรรษ 1970 [ 1 ] [ 2 ]ประมาณค่าโดยการนับจำนวนไซต์ที่มีความหลากหลาย เป็นการวัด "อัตราการกลายพันธุ์ของประชากร" (ผลคูณของขนาดประชากรที่มีประสิทธิภาพและอัตราการกลายพันธุ์ที่เป็นกลาง) จากความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์ที่สังเกตได้ของประชากร[ 3 ]โดยที่คือขนาดประชากรที่มีประสิทธิภาพและ คือ อัตราการกลายพันธุ์ต่อรุ่นของประชากรที่สนใจ ( Watterson (1975) ) ข้อสมมติฐานคือ มีตัวอย่างของ บุคคล แฮพลอยด์จากประชากรที่สนใจที่มีขนาดที่มีประสิทธิภาพ และมีไซต์ที่สามารถเปลี่ยนแปลงได้ไม่จำกัดจำนวน ( ดังนั้นการกลายพันธุ์จะไม่ทับซ้อนหรือกลับกัน) เนื่องจากจำนวนไซต์ที่แยกตัวที่นับได้จะเพิ่มขึ้นตามจำนวนลำดับที่พิจารณา จึงใช้ ปัจจัยการแก้ไข

ค่าประมาณของซึ่งมักใช้สัญลักษณ์ แทนด้วยคือ

จำนวนของตำแหน่งที่ทำให้เกิดการแยกตัว (ตัวอย่างของตำแหน่งที่ทำให้เกิดการแยกตัวคือโพลีมอร์ฟิซึมของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว ) ในตัวอย่างนั้น อยู่ที่ใด และ

คือเลขฮาร์มอนิกที่ th

การประมาณค่านี้อิงตามทฤษฎีการรวมตัว (coalescent theory ) ตัวประมาณค่าของวัตเตอร์สัน (Watterson estimator) นิยมใช้เนื่องจากมีความเรียบง่าย เมื่อเงื่อนไขต่างๆ เป็นไปตามที่กำหนด ตัวประมาณค่าจะไม่เอนเอียงและความแปรปรวนของตัวประมาณค่าจะลดลงเมื่อขนาดตัวอย่างหรืออัตราการเกิดการรวมตัวใหม่เพิ่มขึ้น อย่างไรก็ตาม ตัวประมาณค่าอาจเอนเอียงได้เนื่องจากโครงสร้างประชากร ตัวอย่างเช่นจะมีค่าต่ำกว่าความเป็นจริงใน ประชากร ที่เติบโตแบบทวีคูณ นอกจากนี้ยังอาจเอนเอียงได้จากการละเมิดแบบจำลองการกลายพันธุ์แบบอนันต์ไซต์ (infinite-sites mutational model) การกลายพันธุ์แบบจุดหลายจุดที่ไซต์เดียวจะทำให้ค่าประมาณเอนเอียงลง

การเปรียบเทียบค่าประมาณของ Watterson กับความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์ ( ) เป็นพื้นฐานของTajima's Dซึ่งใช้ในการพิจารณาว่าลำดับ DNA กำลังวิวัฒนาการแบบเป็นกลางหรือภายใต้กระบวนการที่ไม่สุ่ม (เช่น การคัดเลือก)

ดูเพิ่มเติม

ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Watterson_estimator&oldid=1348656776 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ตัวประมาณค่าของวัตเตอร์สัน

ใน พันธุศาสตร์ประชากร ตัวประมาณค่า Watterson เป็นวิธีการอธิบาย ความหลากหลายทางพันธุกรรม ในประชากร พัฒนาโดย Margaret Wu และ GA Watterson ในช่วงทศวรรษ 1970 [ 1 ] [ 2 ]...

ดูเพิ่มเติม

ปัญหาของนักสะสมคูปอง สูตรการสุ่มตัวอย่างของอีเวนส์ ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Watterson_estimator&oldid=1348656776 "