ก่อตั้งขึ้นครั้งแรกเมื่อวันที่ 15 เมษายน พ.ศ. 2487 โดยมีพลเรือโท แฟรงค์ เจ. เฟลตเชอร์เป็นผู้บัญชาการ ซึ่งดำรงตำแหน่งดังกล่าวตลอดช่วงสงครามในฐานะกองกำลังเฉพาะกิจที่ 91ตั้งแต่วันที่ 1 มกราคม พ.ศ. 2490 เมื่อมีการจัดตั้งกองบัญชาการแปซิฟิกของสหรัฐอเมริกากองกำลังเฉพาะกิจที่ 95กองบัญชาการทางทะเลอะแลสกาของพลเรือตรีฟรีแลนด์ เอ. ดาบินจะปฏิบัติการภายใต้ผู้บัญชาการสูงสุดของกองบัญชาการอะแลสกาพลตรี เครก^{[ 3 ]}

ในเดือนมีนาคม ค.ศ. 1950 พลเรือตรีคลิฟตัน สปรากถูกย้ายไปประจำการที่อะแลสกา โดยดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการเขตนาวิกโยธินที่ 17 และผู้บัญชาการเขตชายฝั่งทะเลอะแลสกาบนเกาะโคดิแอค

ในที่สุดก็ถูกยุบเลิกในปี 1971 ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของการลดกำลังทหารหลังสงครามเวียดนาม (jber.af.mil/library/factsheets, ALCOM)

เขตแดนทะเลแคริบเบียน^{[ 4 ]} – เขตแดนทะเลแคริบเบียน (CARIBSEAFRON) อยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของพลเรือโทจอห์น เอช. ฮูเวอร์ผู้บัญชาการเขตแดนทะเลแคริบเบียน หรือ COMCARIBSEAFRON และความรับผิดชอบของเขตแดนนี้คือการปกป้องเรือของฝ่ายสัมพันธมิตรในทะเลแคริบเบียนและตามแนวชายฝั่งมหาสมุทรแอตแลนติกของอเมริกาใต้ในช่วงสงครามโลกครั้งที่ 2 เรือดำน้ำ เยอรมัน ได้ต่อสู้ครั้งสุดท้ายอย่างดุเดือดใน พื้นที่ ตรินิแดดในฤดูใบไม้ร่วงปี 1942 นับตั้งแต่นั้นมา น่านน้ำชายฝั่งก็ค่อนข้างปลอดภัยจากภัยคุกคามจากเรือดำน้ำ พลเรือเอกสี่คนดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการเขตแดนนี้ในช่วงสงครามโลกครั้งที่ 2:

• พลเรือโทจอห์น เอช. ฮูเวอร์ : 7 ธันวาคม 1941 - 12 สิงหาคม 1943
• พลเรือโท อาเธอร์ บี. คุก : 12 สิงหาคม 1943 - 14 พฤษภาคม 1944
• พลเรือโทโรเบิร์ต ซี. กิฟเฟน : 14 พฤษภาคม 1944 - 20 สิงหาคม 1945
• พลเรือโทวิลเลียม อาร์. มันโร : 20 สิงหาคม 1945 - 2 กันยายน 1945

แนวชายแดนทะเลตะวันออก^{[ 4 ]} – พิสูจน์แล้วว่าเป็น “แหล่งล่าเหยื่ออันอุดมสมบูรณ์” สำหรับเรือดำน้ำ เยอรมัน ในช่วงต้นสงคราม ดูSecond Happy Timeพลเรือเอกต่อไปนี้ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการแนวชายแดนในช่วงสงครามโลกครั้งที่ 2:

• พลเรือโท อดอลฟัส แอนดรูว์ส : 7 ธันวาคม 1941 - 1 พฤศจิกายน 1943
• พลเรือโทเฮอร์เบิร์ต เอฟ. เลียรี : 1 พฤศจิกายน 1943 - 2 กันยายน 1945

แนวชายแดนทะเลอ่าว^{[ 4 ]} – แนวชายแดนทะเลอ่าว (GULFSEAFRON) ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 6 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2485 โดยมีสำนักงานใหญ่อยู่ที่คีย์เวสต์ รัฐฟลอริดาและต่อมาได้ย้ายไปที่ไมอามี รัฐฟลอริดาเมื่อวันที่ 17 มิถุนายน พ.ศ. 2485 ^{[ 5 ]}มีหน้าที่รับผิดชอบในการปกป้องน่านน้ำของฟลอริดาและบาฮามาสรวมถึงอ่าวเม็กซิโก ช่องแคบยู คาตันและพื้นที่ใกล้คิวบาพลเรือเอกต่อไปนี้ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการแนวชายแดนในช่วงสงครามโลกครั้งที่ 2:

• พลเรือตรีวิลเลียม เอช. อัลเลน : 7 ธันวาคม 1941 - 3 กุมภาพันธ์ 1942
• กัปตันรัสเซล เอส. เครนชอว์ (รักษาการ): 3 กุมภาพันธ์ 1942 - 3 มิถุนายน 1942
• พลเรือตรีเจมส์ แอล. คอฟฟ์แมน : 3 มิถุนายน 1942 - 3 กุมภาพันธ์ 1943
• กัปตันโฮเวิร์ด เอช.เจ. เบนสัน (รักษาการ): 3 กุมภาพันธ์ 1943 - 1 เมษายน 1943
• พลเรือตรี วิลเลียม อาร์. มันโร : 1 เมษายน 1943 - 25 มีนาคม 1944
• กัปตันโฮเวิร์ด เอช.เจ. เบนสัน (รักษาการ): 25 มีนาคม 1944 - 17 กรกฎาคม 1944
• พลเรือตรี วอลเตอร์ เอส. แอนเดอร์สัน : 17 กรกฎาคม 1944 - 2 กันยายน 1945

กองกำลังป้องกันทางทะเลฮาวาย (HawSeaFron) เป็นหน่วยของกองทัพเรือสหรัฐฯที่จัดตั้งขึ้นในช่วงสงครามโลกครั้งที่ 2 ^{[ 6 ]}จัดตั้งขึ้นเพื่อป้องกันเกาะโออาฮูพลเรือโทเดวิด ดับเบิลยู. แบกลีย์ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการกองกำลังป้องกันทางทะเลฮาวาย (COMHAWSEAFRON) ตั้งแต่วันที่ 4 เมษายน พ.ศ. 2485 จนถึงเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2486 กองกำลังป้องกันทางทะเลฮาวายไม่ได้มีรูปแบบที่แน่นอนจนกระทั่งเดือนกันยายน พ.ศ. 2485 ผู้ช่วยเสนาธิการ (HawSeaFron) พยายามปรับโครงสร้างองค์กรให้คล้ายคลึงกับกองกำลังป้องกันทางทะเลตะวันตกความยากลำบากในการเลือกสถานที่สำหรับศูนย์ปฏิบัติการร่วมทำให้แผนของเขาต้องล่าช้า เดิมทีวางแผนที่จะมีสำนักงานใหญ่ประจำเขตในโฮโนลูลูโดยมีส่วนหนึ่งของอาคารอุทิศให้กับสำนักงานใหญ่ของกองกำลังป้องกันทางทะเล เมื่อแผนดังกล่าวไม่สามารถทำได้ จึงตัดสินใจใช้สองอุโมงค์ครึ่งที่ปล่องภูเขาไฟอาลิอามานูเนื่องจากข้อจำกัดด้านพื้นที่และระยะทางจากสำนักงานใหญ่ของผู้บัญชาการ สถานที่ดังกล่าวจึงไม่ได้พัฒนาไปมากกว่าศูนย์ปฏิบัติการ เนื่องจากพื้นที่ของ Crater อยู่ใน เขต ของกองทัพบกสหรัฐฯการก่อสร้างศูนย์ปฏิบัติการร่วมที่มีพื้นที่ขนาดใหญ่จึงไม่เคยสำเร็จลุล่วงไปได้ เพราะความผันผวนของสงครามและความยากลำบากในการจัดสรรงบประมาณ หน่วยงานหนึ่งไม่ต้องการสร้างและจ่ายค่าใช้จ่ายมากกว่าส่วนแบ่งของตนจากงบประมาณที่จำกัดเพื่อประโยชน์ของอีกหน่วยงานหนึ่ง กองเรือ Frontier จึงได้รับผลกระทบเนื่องจากที่ตั้งที่เป็นเอกลักษณ์ใกล้กับหน่วยสนับสนุนขนาดใหญ่ของกองเรือแปซิฟิกComServPacหน่วยงานทั้งสองระดับนี้เป็นตัวกำหนดจำนวนเรือภายใต้การควบคุม รวมถึงกำลังพล ในกรณีฉุกเฉิน หน่วยต่างๆ ของกองเรือจะเข้ามารับหน้าที่คุ้มกันขบวนเรือและ ลาดตระเวน ต่อต้านเรือดำน้ำเช่นเดียวกับหน่วยเรือผิวน้ำที่ถูกควบคุมโดยหน่วยงานระดับสูงกว่า หน่วยบินก็ถูกควบคุมโดยกองทัพอากาศกองเรือแปซิฟิก เช่นกัน หน้าที่หลักของกองเรือ Hawaiian Sea Frontier คือ การดูแลเรือลาดตระเวนอยู่นอกท่าเรือเพิร์ลฮาร์เบอร์และท่าเรือโฮโนลูลูการคุ้มกันการขนส่งระหว่างเกาะ และการจัดตั้งสิ่งอำนวยความสะดวก ด้าน การกู้ภัยทางอากาศและทางทะเล^{[ 4 ]}พลเรือเอกต่อไปนี้ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการแนวหน้าในช่วงสงครามโลกครั้งที่ 2:

• พลเรือตรีโคล้ด ซี. บล็อก : 7 ธันวาคม 1941 - 2 เมษายน 1942
• พลเรือตรีเดวิด ดับเบิลยู. แบกลีย์ : 2 เมษายน 1942 - 17 กุมภาพันธ์ 1943
• พลเรือโท โรเบิร์ต แอล. กอร์มลีย์ : 17 กุมภาพันธ์ 1943 - 25 ตุลาคม 1944
• พลเรือตรีมาริออน ซี. โรเบิร์ตสัน (รักษาการ): 25 ตุลาคม 1944 - 28 พฤศจิกายน 1944
• พลเรือโทเดวิด ดับเบิลยู. แบกลีย์ : 28 พฤศจิกายน 1944 - 25 กรกฎาคม 1945
• พลเรือโท เชอร์วูด เอ. แทฟฟินเดอร์ : 25 กรกฎาคม 1945 - 2 กันยายน 1945

แนวชายแดนทางทะเลโมร็อกโก หรือบางครั้งเรียกว่า แนวชายแดนทางทะเลแอฟริกาเหนือ เป็นหน่วยทหารเรือของสหรัฐฯ ที่ประจำการอยู่บนชายฝั่งตะวันออกของโมร็อกโกภายใต้การปกครองของฝรั่งเศสในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง หน่วยนี้ก่อตั้งขึ้นภายใต้การบัญชาการของพลเรือตรีจอห์น แอล. ฮอลล์ จูเนียร์ พลเรือเอกต่อไปนี้ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการแนวชายแดนนี้ในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง:

• พลเรือตรีจอห์น แอล. ฮอลล์ จูเนียร์ : 19 พฤศจิกายน 1942 - 9 กุมภาพันธ์ 1943
• กัปตันเชสเตอร์ แอล. นิโคลส์ (รักษาการ): 9 กุมภาพันธ์ 1943 - 19 กุมภาพันธ์ 1943
• พลเรือตรีแฟรงค์ เจ. โลว์รี : 19 กุมภาพันธ์ 1943 - 20 กันยายน 1943
• กัปตันเชสเตอร์ แอล. นิโคลส์ (รักษาการ): 20 กันยายน 1943 - 13 ตุลาคม 1943
• พลเรือตรีเบนจามิน วี. แมคแคนด์ลิช : 13 ตุลาคม 1943 - 1 สิงหาคม 1945

เขตทะเลตะวันตกเฉียงเหนือ^{[ 4 ]} – ก่อตั้งขึ้นในชื่อเขตชายฝั่งทางทะเลแปซิฟิกเหนือ และเปลี่ยนชื่อเป็นเขตทะเลตะวันตกเฉียงเหนือในปี พ.ศ. 2485 โดยมีสำนักงานใหญ่อยู่ที่ซีแอตเทิล^{[ 1 ]}ผู้บัญชาการของเขตนี้ยังดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการของเขตนาวิกโยธินที่ 13 ด้วย และพื้นที่ของเขตนี้ตรงกับพื้นที่ของเขตนาวิกโยธิน ซึ่งจนถึงเดือนเมษายน พ.ศ. 2487 ครอบคลุมอะแลสกา วอชิงตัน โอเรกอน มอนแทนา ไอดาโฮ และไวโอมิง เพื่อวัตถุประสงค์ด้านการบริหารและการปฏิบัติการ เขตนี้จึงถูกแบ่งออกเป็นเขตตะวันตกเฉียงเหนือและเขตอะแลสกา ร่วมกับกองทัพบก เขตนี้ได้จัดตั้งศูนย์ปฏิบัติการร่วมที่ซีแอตเทิล เมื่อวันที่ 15 เมษายน พ.ศ. 2487 เขตนาวิกโยธินที่ 17ซึ่งประกอบด้วยอะแลสกาและหมู่เกาะอะลูเชียน ได้ถูกจัดตั้งขึ้น และเขตทะเลตะวันตกเฉียงเหนือก็ถูกยกเลิก พลเรือเอกต่อไปนี้ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการเขตนี้ในช่วงสงครามโลกครั้งที่ 2:

• พลเรือโท ชาร์ลส์ เอส. ฟรีแมน : 7 ธันวาคม 1941 - 21 พฤศจิกายน 1942
• พลเรือโท แฟรงค์ เจ. เฟลตเชอร์ : 21 พฤศจิกายน 1942 - 15 เมษายน 1944

กองบัญชาการทะเลปานามามีหน้าที่รับผิดชอบในการป้องกันเส้นทางเดินเรือจากมหาสมุทรแปซิฟิกและมหาสมุทรแอตแลนติกไปยังคลองปานามาและสิ่งอำนวยความสะดวกทางทะเลชายฝั่งในภูมิภาคอเมริกากลางในช่วงสงครามโลกครั้งที่ 2 สำนักงานใหญ่ของกองบัญชาการทะเลตั้งอยู่ที่ บัลโบอา ประเทศปานามา^{[ 4 ]}พลเรือเอกต่อไปนี้ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการกองบัญชาการในช่วงสงครามโลกครั้งที่ 2:

• พลเรือตรีแฟรงค์ เอช. แซดเลอร์ : 7 ธันวาคม 1941 - 15 เมษายน 1942
• พลเรือตรีคลิฟฟอร์ด อี. แวน ฮุก : 15 เมษายน 1942 - 14 ตุลาคม 1943
• พลเรือตรีฮาโรลด์ ซี. เทรน : 14 ตุลาคม 1943 - 10 มิถุนายน 1944
• กัปตัน เอลลิส เอส. สโตน (รักษาการ): 11 มิถุนายน 1944 - 3 พฤศจิกายน 1944
• พลเรือตรีโฮเวิร์ด เอฟ. คิงแมน : 3 พฤศจิกายน 1944 - 9 กรกฎาคม 1945
• กัปตันสกายเลอร์ มิลส์ (รักษาการ): 9 กรกฎาคม 1945 - 23 สิงหาคม 1945
• พลเรือตรีจอห์น อาร์. เบียร์ดอลล์ : 23 สิงหาคม 1945 - 2 กันยายน 1945

เขตแดนทางทะเลฟิลิปปินส์ – จัดตั้งขึ้นหลังสหรัฐอเมริกากลับเข้ายึดครองฟิลิปปินส์ในปี 1944 พลเรือเอกต่อไปนี้ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการเขตแดนนี้ในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง:

• พลเรือตรี ฟรานซิส ดับเบิลยู. ร็อคเวลล์ : 7 ธันวาคม 1941 - 18 มีนาคม 1942
• กัปตันเคนเนธ เอ็ม. โฮฟเฟล: 18 มีนาคม 1942 - 6 พฤษภาคม 1942
• พลเรือโทเจมส์ แอล. คอฟฟ์แมน : 13 พฤศจิกายน 1944 - 2 กันยายน 1945

แนวชายแดนทะเลตะวันตก^{[ 4 ]} – แนวชายแดนทะเลตะวันตก (WESTSEAFRON) ซึ่งมีสำนักงานใหญ่อยู่ที่ซานฟรานซิสโก มีหน้าที่รับผิดชอบการป้องกันทางทะเลของชายฝั่งแปซิฟิกของสหรัฐอเมริกาและเม็กซิโกในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง ผู้บัญชาการแนวชายแดนได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้บัญชาการแนวชายแดนทะเลตะวันตก (COMWESTSEAFRON) แนวชายแดนทะเลตะวันตกประกอบด้วยกองกำลังและหน่วยบัญชาการหลายแห่ง รวมถึง เขตนาวิกโยธิน ที่สิบเอ็ดที่สิบสองและที่สิบสาม แนวชายแดนทะเลตะวันตกประกอบด้วยภูมิภาคชายฝั่งแปซิฟิกที่อยู่ทางตะวันตกของเทือกเขาแคสเคดและเซียร์ราเนวาดารวมถึงอะแลสกาผู้บัญชาการแนวชายแดนทะเลตะวันตกยังดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการกองเรือสำรองแปซิฟิกตั้งแต่ปี 1937–38 ^{[ 7 ]}พลเรือเอกต่อไปนี้ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการแนวชายแดนในช่วงสงครามโลกครั้งที่สอง:

• พลเรือเอกจอห์น ดับเบิลยู กรีนสเลด : 7 ธันวาคม 2484 - 1 กุมภาพันธ์ 2487
• พลเรือโทเดวิด ดับเบิลยู. แบกลีย์ : 1 กุมภาพันธ์ 1944 - 17 พฤศจิกายน 1944
• พลเรือเอกรอยัล อี. อิงเกอร์โซล : 17 พฤศจิกายน 1944 - 2 กันยายน 1945