สโมสรแห่งนี้ก่อตั้งขึ้นในเดือนกุมภาพันธ์ ปี 2003 ในชื่อ The Dragons AFC โดยอดีตเลขานุการ บิล มอร์ลีย์ ในฐานะสโมสรฟุตบอลเยาวชนระดับท้องถิ่น ในปี 2008 สโมสรได้รับรางวัล FA Charter Standard Development Award สำหรับการพัฒนาฟุตบอลระดับรากหญ้าอย่างต่อเนื่อง

ในเดือนมีนาคม 2012 สโมสร Widnes Dragons ได้เริ่มกระบวนการปรึกษาหารือกับสโมสร Widnes Vikings RLFCเพื่อเข้าร่วมเป็นส่วนหนึ่งของแบรนด์ Vikings Sports ซึ่งเป็นความร่วมมือที่ตกลงกันเพื่อยกระดับสถานะของสโมสรในชุมชน

เมื่อวันที่ 10 กรกฎาคม 2555 ในการประชุมใหญ่สามัญประจำปีของสโมสร สมาชิกของสโมสรได้ลงมติเป็นเอกฉันท์เห็นชอบที่จะเข้าร่วมเป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มกีฬา Widnes Sports Group และตกลงกันในระยะเวลาเปลี่ยนผ่าน 12 เดือน จนถึงสิ้นสุดฤดูกาลปัจจุบัน (2012–13) ขั้นตอนต่อไปในการพัฒนาของสโมสรเกิดขึ้นในฤดูกาล 2013–14 เมื่อ Widnes Vikings FC ได้รับการยอมรับเข้าสู่ระบบฟุตบอลระดับอาชีพ และถูกจัดให้อยู่ในลีกNorth West Counties Football League Division One

ในเดือนมีนาคม 2014 คณะกรรมการของสโมสรได้เรียกประชุมวิสามัญผู้ถือหุ้นเพื่อตัดสินใจเกี่ยวกับอนาคตของสโมสร ผลการลงมติเป็นเอกฉันท์คือ สโมสรจะต้องเลิกใช้ชื่อแบรนด์ไวกิ้งส์ และปรับโครงสร้างสโมสรใหม่เพื่อสร้างเอกลักษณ์และอนาคตที่ยั่งยืนในระยะยาว ต่อมา สโมสรได้แยกทางกับแบรนด์ไวกิ้งส์และเปลี่ยนชื่อเป็น วิทเนส ฟุตบอล คลับ ซึ่งเป็นสัญลักษณ์ที่แสดงถึงถิ่นกำเนิดของทีมและแฟนบอล ในขณะเดียวกันก็ตระหนักว่าจำเป็นต้องสร้างสโมสรใหม่เพื่อสร้างความเชื่อมั่นในชุมชนท้องถิ่นและสนับสนุนนักเตะเยาวชนที่มีพรสวรรค์ในวิทเนส

ในปี 2016 การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างคณะกรรมการนำไปสู่การแต่งตั้งเอียน รอสส์เป็นประธาน โดยมีการจัดตั้งคณะกรรมการบริหารขึ้น^{[ 2 ]}แดนนี่ เมโดว์ครอฟต์และไบรอัน พริตชาร์ดได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้จัดการร่วม แทนที่สตีฟ ฮิลล์ ผู้จัดการคนก่อนที่ออกจากสโมสรหลังจากสิ้นสุดฤดูกาล 2015–16 ^{[ 3 ]}อย่างไรก็ตาม หลังจากเริ่มต้นฤดูกาลได้ไม่ดี เมโดว์ครอฟต์และพริตชาร์ดก็ออกจากสโมสร และถูกแทนที่โดยโจอี ดันน์ ซึ่งได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้จัดการในเวลาต่อมา^{[ 4 ]}

ฤดูกาลจบลงด้วยความสำเร็จอย่างสูงภายใต้การบริหารของดันน์ วิดเนสได้รับการประกาศให้เป็น แชมป์ ดิวิชั่นหนึ่งของนอร์ทเวสต์เคาน์ตีส์ฟุตบอลลีกโดยเหลือการแข่งขันอีกหนึ่งนัดหลังจากเอาชนะเอเอฟซีแบล็คพูล 5–1 ^{[ 5 ]}

ในช่วงฤดูร้อนปี 2017 สโมสรได้เริ่มจัดตั้งแผนกเยาวชนขึ้นใหม่ โดยมีการแนะนำทีมพัฒนา^{[ 6 ]}และทีมเยาวชน 2 ทีมในกลุ่มอายุต่ำกว่า 7 ปี และต่ำกว่า 9 ปี^{[ 7 ]}

แม้ว่า Dunn จะลาออกในช่วงต้นฤดูกาล 2017–18 ^{[ 8 ]}สโมสรก็ยังคงประสบความสำเร็จอย่างสูงอีกครั้ง ผู้เล่นอาวุโส Steve Akrigg และ Kevin Towey ได้รับการแต่งตั้งให้เป็นผู้จัดการทีมร่วมกัน^{[ 9 ]}ซึ่งนำสโมสรไปสู่การเลื่อนชั้นสู่Northern Premier League และ คว้าชัยชนะในรอบชิงชนะเลิศของNorth West Counties Challenge CupกับBurscough

ฤดูกาลแรกของวิทเนสในลีกระดับ 4 ประสบความสำเร็จบ้างไม่สำเร็จบ้าง การตกรอบแรกในเอฟเอคัพเอฟเอโทรฟี่และลีกคัพ ทำให้เดอะไวท์ส์เหลือเพียงการแข่งขันในลีกเท่านั้นให้มุ่งเน้น ผู้จัดการทีมร่วมอย่างโทวีและอัคริกก์นำพาวิทเนสจบฤดูกาลด้วยอันดับกลางตารางอย่างมั่นคง แม้ว่าจะจบฤดูกาลในฐานะหนึ่งในทีมฟอร์มดีของลีกก็ตาม

สองฤดูกาลถัดมาได้รับผลกระทบจากความวุ่นวายที่เกิดจากการระบาดใหญ่ของไวรัสโคโรนา วิทเนสจบฤดูกาล 2019–20 ที่ถูกยกเลิกไปในอันดับที่ 12 และจบฤดูกาล 2020–21 ที่ถูกตัดให้สั้นลงในอันดับเดียวกัน

เมื่อฟุตบอลกลับมาแข่งขันตามปกติในฤดูกาล 2021–22 วิทเนสเริ่มต้นฤดูกาลได้อย่างย่ำแย่ ส่งผลให้สโมสรต้องแยกทางกับผู้จัดการทีม เควิน โทวี และ สตีฟ อัคริกก์ เดวิด เดมป์ซีย์ อดีต ผู้จัดการ ทีมแอชตันทาวน์ ได้รับการแต่งตั้งเข้ามาคุมทีม และไม่เพียงแต่พาทีมวิทเนสรอดพ้นจากการตกชั้นเท่านั้น แต่ยังเปลี่ยนทีมให้กลายเป็นหนึ่งในทีมฟอร์มดีที่สุดในช่วงครึ่งหลังของฤดูกาล โดยทำผลงานไร้พ่ายในบ้านได้อย่างน่าประทับใจ เดมป์ซีย์ยังพาทีมเข้าสู่รอบคัดเลือกที่สามของเอฟเอ โทรฟี ซึ่งพวกเขาพ่ายแพ้ในการดวลจุดโทษให้กับบูเทิลซึ่งนับเป็นผลงานที่ดีที่สุดของสโมสรจนถึงปัจจุบัน แต่ความสำเร็จภายใต้การนำของเดมป์ซีย์นั้นอยู่ได้ไม่นาน เพราะวิทเนสเริ่มต้นฤดูกาล 2022–23 ด้วยฟอร์มที่ย่ำแย่มาก โดยไม่ชนะเลยในห้าเกมลีกแรก และตกรอบเอฟเอ คัพ ด้วยฝีมือของทีมเบอร์รี จาก นอร์ทเวสต์เคาน์ตีส์หลังจากนั้น วิทเนสและเดมป์ซีย์ก็แยกทางกันไป Widnes รีบดำเนินการจ้าง Michael Ellison ^{[ 10 ]}ซึ่งเริ่มต้นฤดูกาลกับCity of Liverpoolผลงานภายใต้ 'Ello' ดีขึ้นอย่างรวดเร็ว และ Widnes สามารถคว้าชัยชนะในลีกนัดแรกของฤดูกาลได้ในการไปเยือนHanley ทีม ที่เพิ่งเลื่อนชั้นขึ้นมา แม้ว่าจะใช้เวลาส่วนใหญ่ของฤดูกาลอยู่ท้ายตาราง แต่ Ellison และ Widnes ก็คว้าชัยชนะที่สำคัญหลายครั้งในช่วงท้ายฤดูกาล และจบฤดูกาลในอันดับที่ 17 ในที่สุด เนื่องจากSkelmersdaleไม่ผ่านเกณฑ์การจัดระดับสนามของ Northern Premier League Widnes จึงได้รับการผ่อนผันในการแข่งขันเพลย์ออฟระหว่างระดับ 4/5 ทำให้รักษาสถานะ Northern Premier League สำหรับฤดูกาล 2023–24 ได้เนื่องจากอัตราส่วนคะแนนต่อเกมที่เหนือกว่าเมื่อเทียบกับทีมอื่นๆ ทั่วประเทศ ฤดูกาล2024–25สโมสรได้รับการเลื่อนชั้นสู่ระดับสามเป็นครั้งแรก (และปัจจุบันเป็นครั้งเดียว) ในฐานะแชมป์ Division One West ^{[ 11 ]}

เมื่อวันที่ 29 มิถุนายน พ.ศ. 2568 สโมสรได้ประกาศว่าได้ถอนตัวออกจากนอร์เทิร์นพรีเมียร์ลีกพรีเมียร์ดิวิชั่น^{[ 12 ]}

• สถิติชนะในลีกด้วย 8 ประตู:
  • ชนะเซนต์เฮเลนส์ ทาวน์ 8-0 , 8 เมษายน 2560
• ชัยชนะในบ้านด้วยสกอร์ 8 ประตู:
  • ชนะเซนต์เฮเลนส์ ทาวน์ 8-0 , 8 เมษายน 2560
• สถิติแพ้ในลีกด้วยสกอร์ 9 ประตู:
  • แมนเชสเตอร์ วิลล่าพบกับ นอร์ทวิช 10-1 , 13 ธันวาคม 2014
• สถิติผู้เข้าชมในบ้านสูงสุด :
  • 882 พบกับแทรฟฟอร์ด เอฟซีดิวิชั่นวัน เวสต์, 26 เมษายน 2025 ( สถิติสโมสร )
• จำนวนผู้ชมในบ้านต่ำที่สุด :
  • 24 พบกับวีแกน โรบิน พาร์ค , ลีกฟุตบอลนอร์ทเวสต์เคาน์ตีส์ดิวิชั่น 1, 18 เมษายน 2558
• สถิติไม่แพ้ใครในลีกยาวนานที่สุด :
  • 16 เกม ระหว่างวันที่ 25 พฤศจิกายน 2017 ถึง 31 มีนาคม 2018
• สถิติชนะเกมลีกติดต่อกันมากที่สุด :
  • 14 เกม ระหว่างวันที่ 4 มีนาคม 2560 ถึง 12 สิงหาคม 2560
• สถิติแพ้เกมลีกติดต่อกันมากที่สุด :
  • 6 เกม ระหว่างวันที่ 14 มีนาคม 2558 ถึง 18 เมษายน 2558
• จำนวนเกมลีกที่ไม่มีชัยชนะมากที่สุด :
  • 12 เกม ระหว่างวันที่ 21 กันยายน 2019 ถึง 1 มกราคม 2020
• ผลงานที่ดีที่สุดในลีก :
  • 1st Northern Premier League Division One West 2024–25
• ผลงานที่ดีที่สุดในเอฟเอ คัพ :
  • รอบคัดเลือก รอบแรกฤดูกาล 2019–20 , 2023–24และ2025–26
• ผลงานที่ดีที่สุดใน FA Trophy :
  • รอบคัดเลือก รอบที่ 3 ฤดูกาล2021–22และ2025–26
• ผลงานที่ดีที่สุดใน FA Vase :
  • รอบคัดเลือก รอบที่ 2 ฤดูกาล2014–15
• ผลงานที่ดีที่สุดของลิเวอร์พูลในศึกซีเนียร์ คัพ :
  • รอบรองชนะเลิศ (3 ครั้ง) ^{[ 13 ]}