เมื่อวันที่ 8 มกราคม ค.ศ. 1613 ค็อกเคน ผู้ดำรงตำแหน่งผู้ว่าการคนแรกของสมาคมไอริชได้รับการแต่งตั้งให้เป็นผู้ว่าการคนแรกของลอนดอนเดอร์รีเนื่องจากการพัฒนาที่ดำเนินการโดยสมาคมไอริชเพื่อฟื้นฟูและขยายเมือง ทำให้เมืองนี้ได้รับการเปลี่ยนชื่อเป็นลอนดอนเดอร์รี เพื่อเป็นเกียรติแก่เมืองหลวงและการตั้งอาณานิคมจากลอนดอน^{[ 2 ]}เมื่อวันที่ 8 มิถุนายน ค.ศ. 1616 เขาได้รับพระราชทานบรรดาศักดิ์อัศวินจากพระเจ้าเจมส์ที่ 1

ในช่วงที่ค็อกเคนดำรงตำแหน่งนายกเทศมนตรี (ค.ศ. 1619–1620) พระเจ้าเจมส์ที่ 1 เสด็จเยือนมหาวิหารเซนต์ปอลเพื่อระดมทุนสร้างยอดแหลมให้เสร็จสมบูรณ์ และทรงได้รับการต้อนรับอย่างยิ่งใหญ่จากค็อกเคน มีการแสดงละครเวทีเรื่อง "ชัยชนะแห่งความรักและความเก่าแก่" ในพิธีเข้ารับตำแหน่งนายกเทศมนตรีของค็อกเคนเมื่อวันที่ 29 ตุลาคม ค.ศ. 1619 ซึ่งประพันธ์โดยโทมัส มิดเดิลตัน ในปี ค.ศ. 1620 มีการจัดงานแต่งงานระหว่างชาร์ลส์ ฮาวาร์ดและแมรี ธิดาของค็อกเคน ในช่วงเวลานี้ พระเจ้าเจมส์ที่ 1 ทรงปรึกษาหารือกับเขาบ่อยครั้ง ทั้งในสภาองคมนตรีและเป็นการส่วนตัว

ในปี ค.ศ. 1614 ขณะดำรงตำแหน่งผู้ว่าการบริษัทอีสต์แลนด์ซึ่งเป็นบริษัทพ่อค้าชาวอังกฤษ ค็อกเคนได้วางแผนที่จะย้อมสีและตกแต่งผ้าของอังกฤษ ซึ่งเป็นสินค้าส่งออกหลักของอังกฤษในขณะนั้น ก่อนที่จะส่งออกไปต่างประเทศ ค็อกเคนโน้มน้าวให้พระเจ้าเจมส์ที่ 1 พระราชทานสิทธิผูกขาดการส่งออกผ้าแก่เขา ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของแผนการนี้ โดยมีจุดประสงค์เพื่อเพิ่มผลกำไรให้กับพ่อค้าชาวอังกฤษ ขณะเดียวกันก็เพิ่มภาษีศุลกากรของราชวงศ์โดยการหลีกเลี่ยงพ่อค้าชาวดัตช์ แผนการนี้ล้มเหลว เนื่องจากชาวดัตช์ปฏิเสธที่จะซื้อผ้าสำเร็จรูปจากกลุ่มผูกขาด และกลับทำสงครามการค้ากับอังกฤษแทน ส่งผลให้การค้าผ้าของอังกฤษซบเซาไปนานหลายทศวรรษ

วิลเลียม แบฟฟินได้รับอุปกรณ์สำหรับการเดินทางไปทางเหนือครั้งหนึ่งจากค็อกเคนและคนอื่นๆ จากบริษัท Merchant Adventurers' Companyและท่าเรือแห่งหนึ่งในกรีนแลนด์ได้รับการตั้งชื่อเพื่อเป็นเกียรติแก่เขา โดยเรียกว่า 'Cockin's Sound' บนแผนที่เดินเรือของกองทัพเรือ

เขาซื้อที่ดินในเดนช์เวิร์ธ เบิร์กเชียร์ (ปัจจุบันคือออกซ์ฟอร์ดเชียร์ ); เอลเมสธอร์ปเลสเตอร์เชียร์ และรัชตันฮอลล์ในรัชตัน นอร์ทแธมป์ ตันเชียร์ ซึ่งต่อมาเป็นบ้านของลูกหลานของเขา เขาให้เงินลูกสาวทั้งหกคนคนละ 10,000 ปอนด์เมื่อแต่งงาน และทิ้งมรดกค่าเช่ารายปีไว้ให้ลูกชายมากกว่า 12,000 ปอนด์

^{เขาเสียชีวิตเมื่อวันที่ 20 ตุลาคม ค.ศ. 1626 ใน วัย} 66 ปี ณ คฤหาสน์ของเขาที่ Comb Nevill ในคิงส์ตัน เซอร์เรย์และถูกฝังไว้ในมหาวิหารเซนต์ปอลเก่า [ ^{3 ]} ซึ่ง จอห์น ดอนน์ได้เทศนาในงานศพของเขาและมีการสร้างอนุสาวรีย์เพื่อเป็นเกียรติแก่เขา หลุมฝังศพและอนุสาวรีย์ถูกทำลายในเหตุการณ์ไฟไหม้ครั้งใหญ่ในลอนดอนในปี ค.ศ. 1666 ชื่อของเขาปรากฏอยู่บนอนุสาวรีย์สมัยใหม่ในห้องใต้ดิน ซึ่งระบุรายชื่อหลุมฝังศพสำคัญที่สูญหายไปในเหตุการณ์ไฟไหม้