ปราสาทโยโคเตะสร้างขึ้นโดยตระกูลโอโนเดระในปี ค.ศ. 1550 ในจังหวัดอะคิตะ^{[ 1 ]}

แม้ว่าจะสร้างขึ้นในช่วงทศวรรษ 1500 แต่เชื่อกันว่ามีป้อมปราการอยู่ในบริเวณนั้นก่อนหน้านั้น ปราสาทมีขนาดพอเหมาะ ประกอบด้วยสิ่งก่อสร้างหลักสองส่วน ได้แก่ กำแพงล้อมรอบหลักและกำแพงล้อมรอบรอง นิโนมารุ^{[ 2 ]}

มันถูกเผาทำลายลงในระหว่างสงครามโบชิน

มีการสร้างป้อมปราการขึ้นใหม่ในปี 1965 บนพื้นที่ปัจจุบัน ภายในบริเวณป้อมปราการหลัก