อันโตนิโอ เด โอเตร์มินผู้ว่าการชาวสเปน ได้แต่งตั้งฟราย ฟรานซิสโก เด อายเอตาเป็นผู้ดูแลค่ายผู้ลี้ภัยของผู้ที่หลบหนีจากการกบฏของโปป ในปี ค.ศ. 1680 ^{[ 1 ]}ค่ายผู้ลี้ภัยและสถานีมิชชันตั้งอยู่ห่างจาก แม่น้ำ ริโอแกรนด์ ไปทางใต้ประมาณ 3 ไมล์ ในขณะนั้น แม่น้ำริโอแกรนด์มีแนวโน้มที่จะเกิดน้ำท่วมและการสะสมของตะกอน^{[ 1 ]}

ชุมชนและสถานีเผยแพร่ศาสนาที่เกี่ยวข้องได้ย้ายที่ตั้งหลายครั้งในช่วงหลายร้อยปีต่อมา ในปี 1691 สถานีเผยแพร่ศาสนาสำหรับผู้ลี้ภัยเดิมถูกแทนที่ด้วยโครงสร้างดินเหนียว น้ำท่วมในปี 1740 ได้พัดพาสถานีเผยแพร่ศาสนานั้นไป สี่ปีต่อมา สถานีเผยแพร่ศาสนานั้นถูกสร้างขึ้นใหม่บนพื้นที่สูงขึ้น ชาวทิกัว (หรือชาวทิวา ) แห่งอิสเลตาเป็นหนึ่งในผู้ที่เปลี่ยนมานับถือศาสนาคริสต์ที่ศรัทธามากที่สุดในพื้นที่ และชาวสเปนก็กระตือรือร้นที่จะรักษาชุมชนให้เจริญรุ่งเรืองและมีชีวิตชีวา ในช่วงระหว่างปี 1829 ถึง 1831 แม่น้ำได้ไหลไปทางใต้มากกว่าปกติมาก ในปี 1836 ประเทศเท็กซัสที่เพิ่งก่อตั้งใหม่ได้อ้างสิทธิ์ในช่องทางใหม่ของแม่น้ำริโอแกรนด์เป็นเขตแดน ในปี 1848 ด้วยการให้สัตยาบันสนธิสัญญากัวดาลูปฮิดัลโกอิสเลตาจึงถูกยกให้แก่สหรัฐอเมริกา^{[ 1 ]} สถานีเผยแพร่ศาสนานี้เป็นจุดแวะพักบน เส้นทาง Butterfield Overland Mailตั้งแต่ปี 1858 ถึง 1861

ชุมชนใกล้เคียงและศูนย์กลางการปกครองของเทศมณฑลซานเอลิซาริโอเป็นศูนย์กลางอิทธิพลของชาว ฮิสแปนิกในช่วงหลัง สงครามกลางเมืองที่ชาวแองโกลมีบทบาทมากขึ้นในปี 1873 ยิสเลตาได้เสนอตัวเป็นศูนย์กลางการปกครองของเทศมณฑล แต่การเลือกตั้งถูกเพิกเฉยหรือไม่มีผลสรุปจนกระทั่งปี 1878 หลัง ช่วง สงครามเกลือ ในที่สุดชาวยิสเลตาจึงได้จัดตั้งเป็นเมืองในรัฐเท็กซัสในปี 1880 มีข้อพิพาทภายในว่าภาระภาษีคุ้มค่ากับสถานะเมืองหรือไม่ นอกจากนี้ยังมีการต่อต้านอย่างมากจากชุมชนที่กำลังเติบโตของเอลปาโซเกี่ยวกับว่าเมือง "อินเดียน" ควรเป็นศูนย์กลางการปกครองของเทศมณฑลหรือไม่ ทางรถไฟไม่ได้มาถึงยิสเลตา และในการเลือกตั้งที่มีการโต้แย้งอย่างรุนแรงซึ่งคะแนนเสียงที่นับได้เกือบสามเท่าของจำนวนผู้มีสิทธิเลือกตั้ง ศูนย์กลางการปกครองของเทศมณฑลจึงถูกย้ายไปที่เอลปาโซในปี 1883 รัฐบาลเมืองยุบตัวลงในปี 1895

เหตุเพลิงไหม้สารเคมีในปี พ.ศ. 2450 ทำให้มิชชั่น Ysleta ได้รับความเสียหาย ^{[ 2 ]} ในปี พ.ศ. 2459 มีการสร้างเขื่อนกั้นแม่น้ำริโอแกรนด์และมีการชลประทานพื้นที่อย่างหนัก ส่งผล ให้ระดับน้ำใต้ดินสูงขึ้น ทำให้เกลือขึ้นมาบนผิวดิน และที่ดินจึงเหมาะสำหรับปลูกพืชที่ทนต่อเกลือได้เท่านั้น เช่น ฝ้าย

ในปี พ.ศ. 2498 เอลพาโซได้ผนวกยิสเลตา^{[ 3 ]}แม้ว่าผู้อยู่อาศัยจะลงคะแนนเสียงคัดค้านการเปลี่ยนแปลงดังกล่าว ยิสเลตาได้รับอนุญาตให้คงเขตโรงเรียนของตนเองไว้ ( เขตโรงเรียนอิสระยิสเลตาซึ่งขยายจากหุบเขาตอนล่างไปยังบางส่วนของเอลพาโซตะวันออกเฉียงเหนือ ) แม้ว่าจะต้องมีการอุทธรณ์ต่อศาลฎีกา

ในช่วงทศวรรษ 1960 ทอม ไดมอนด์ฟ้องร้องในนามของชาวทิวา (หรือที่รู้จักในภาษาสเปนว่าเผ่าทิกัว) รัฐเท็กซัสไม่เต็มใจที่จะรับรองชนเผ่าพื้นเมืองอเมริกันใดๆ แต่ในปี 1967 ชาวทิกัวได้รับการจัดตั้งอย่างถูกกฎหมายในชื่อYsleta Del Sur Puebloปีต่อมารัฐสภาสหรัฐอเมริกาก็รับรองชนเผ่านี้เช่นกัน^{[ 3 ]}