Metagenomics software
ซอฟต์แวร์เมทาโนมิกส์
เมแกน
Metagenomics softwareMEGAN ( MEtaGenome ANalyzer ) เป็นโปรแกรมคอมพิวเตอร์ที่ช่วยให้สามารถวิเคราะห์ชุดข้อมูลเมตาจีโนมิก ขนาดใหญ่ได้อย่างเหมาะสม
ยูนิแฟรก
BioinformaticsUniFracซึ่งเป็นชื่อย่อของunique fraction metricคือเมตริกวัดระยะทางที่ใช้ในการเปรียบเทียบกลุ่มสิ่งมีชีวิตทางชีวภาพมันแตกต่างจากมาตรวัดความไม่เหมือนกัน เช่นความไม่เหมือนกันแบบ
อ่าน 1 นาทียีนมาร์ค
Bioinformatics softwareGeneMarkเป็นชื่อเรียกทั่วไปของกลุ่ม อัลก อริทึมและโปรแกรมซอฟต์แวร์สำหรับการทำนายยีนแบบ ab initio ที่พัฒนาขึ้นที่ สถาบันเทคโนโลยีจอร์เจียในแอตแลนตา GeneMark...
คิวไอเอ็มอี
Bioinformatics softwareQIIME ( ภาษาอังกฤษ: / tʃ aɪ m / ch-eye-m ) เป็นแพลตฟอร์มวิทยาศาสตร์ข้อมูลชีวสารสนเทศ ซึ่งเดิมพัฒนาขึ้นเพื่อวิเคราะห์ข้อมูลลำดับ แอม พลิคอนของ ยีนเครื่องหมายไมโครไบโอม...
อ่าน 1 นาทีแอมโฟรา
Free bioinformatics softwareAMPHORA (“AutoMated Phylogenomic infeRence Application”) เป็นเวิร์กโฟลว์ชีวสารสนเทศแบบโอเพนซอร์ส AMPHORA2 ใช้ ยีนเครื่องหมาย ทางวิวัฒนาการ ของแบคทีเรีย 31 ยีนและอาร์เคีย 104 ยีน...
อ่าน 1 นาทีโปรแกรมประกอบลำดับดีเอ็นเอแบบ de novo
Bioinformatics algorithmsโปรแกรม ประกอบลำดับนิวคลีโอไทด์แบบ de novoเป็นโปรแกรมประเภทหนึ่งที่ประกอบ ลำดับนิ วคลีโอไท ด์สั้นๆ เข้าด้วยกันให้เป็นลำดับที่ยาวขึ้น โดยไม่ต้องใช้จีโนม อ้างอิง...
โปรแกรมค้นหาไวรัสขนาดใหญ่
Free bioinformatics softwareGiant Virus Finderเป็นซอฟต์แวร์ชีวสารสนเทศฟรีสำหรับค้นหาไวรัสขนาดใหญ่ในเมตาจีโนม
ตัวประกอบกำมะหยี่
Bioinformatics algorithmsVelvetเป็นชุดอัลกอริทึมที่ได้รับการออกแบบมาเพื่อจัดการกับการประกอบจีโนมแบบ de novo และการจัดเรียงลำดับการ อ่านสั้น ซึ่งทำได้โดยการจัดการกราฟ de