Metagenomics software

ซอฟต์แวร์เมทาโนมิกส์

อ่าน 1 นาที

เมแกน

Metagenomics software

MEGAN ( MEtaGenome ANalyzer ) เป็นโปรแกรมคอมพิวเตอร์ที่ช่วยให้สามารถวิเคราะห์ชุดข้อมูลเมตาจีโนมิก ขนาดใหญ่ได้อย่างเหมาะสม

ยูนิแฟรกอ่าน 1 นาที

ยูนิแฟรก

Bioinformatics

UniFracซึ่งเป็นชื่อย่อของunique fraction metricคือเมตริกวัดระยะทางที่ใช้ในการเปรียบเทียบกลุ่มสิ่งมีชีวิตทางชีวภาพมันแตกต่างจากมาตรวัดความไม่เหมือนกัน เช่นความไม่เหมือนกันแบบ

อ่าน 1 นาที

ยีนมาร์ค

Bioinformatics software

GeneMarkเป็นชื่อเรียกทั่วไปของกลุ่ม อัลก อริทึมและโปรแกรมซอฟต์แวร์สำหรับการทำนายยีนแบบ ab initio ที่พัฒนาขึ้นที่ สถาบันเทคโนโลยีจอร์เจียในแอตแลนตา GeneMark...

อ่าน 1 นาที

คิวไอเอ็มอี

Bioinformatics software

QIIME ( ภาษาอังกฤษ: / tʃ aɪ m / ch-eye-m ) เป็นแพลตฟอร์มวิทยาศาสตร์ข้อมูลชีวสารสนเทศ ซึ่งเดิมพัฒนาขึ้นเพื่อวิเคราะห์ข้อมูลลำดับ แอม พลิคอนของ ยีนเครื่องหมายไมโครไบโอม...

อ่าน 1 นาที

แอมโฟรา

Free bioinformatics software

AMPHORA (“AutoMated Phylogenomic infeRence Application”) เป็นเวิร์กโฟลว์ชีวสารสนเทศแบบโอเพนซอร์ส AMPHORA2 ใช้ ยีนเครื่องหมาย ทางวิวัฒนาการ ของแบคทีเรีย 31 ยีนและอาร์เคีย 104 ยีน...

อ่าน 1 นาที

โปรแกรมประกอบลำดับดีเอ็นเอแบบ de novo

Bioinformatics algorithms

โปรแกรม ประกอบลำดับนิวคลีโอไทด์แบบ de novoเป็นโปรแกรมประเภทหนึ่งที่ประกอบ ลำดับนิ วคลีโอไท ด์สั้นๆ เข้าด้วยกันให้เป็นลำดับที่ยาวขึ้น โดยไม่ต้องใช้จีโนม อ้างอิง...

อ่าน 1 นาที

โปรแกรมค้นหาไวรัสขนาดใหญ่

Free bioinformatics software

Giant Virus Finderเป็นซอฟต์แวร์ชีวสารสนเทศฟรีสำหรับค้นหาไวรัสขนาดใหญ่ในเมตาจีโนม

ตัวประกอบกำมะหยี่อ่าน 1 นาที

ตัวประกอบกำมะหยี่

Bioinformatics algorithms

Velvetเป็นชุดอัลกอริทึมที่ได้รับการออกแบบมาเพื่อจัดการกับการประกอบจีโนมแบบ de novo และการจัดเรียงลำดับการ อ่านสั้น ซึ่งทำได้โดยการจัดการกราฟ de