ในวันศุกร์ที่ 6 กันยายน บริษัท A, B, C, D, E, F, G, H และ I ถูกส่งไปยังMacon, MOเพื่อรักษาความปลอดภัยทางรถไฟ North Missouri Railroad (NMR) บริษัท K ถูกทิ้งไว้ในค่ายทหารที่ St. Louis พร้อมกับอุปกรณ์และเสบียงของกรมทหาร^{[ 5 ]}หลังจากเดินทางถึง Macon ไม่นาน บริษัท A, B, E และ I ได้รับคำสั่งให้ไปที่St. Josephเพื่อปฏิบัติหน้าที่รักษาความปลอดภัยตามแนว NMR จนถึงวันที่ 1 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2405 เมื่อพวกเขาได้รับคำสั่งให้กลับไปยัง St. Louis บริษัทอีกห้าแห่งใน Macon (C, D, F, G และ H) ได้เดินทัพภายใต้การนำของพันเอกSamuel D. Sturgisเพื่อช่วยเหลือเมือง Lexington ที่ถูกปิดล้อมในรัฐมิสซูรี^{[ 5 ] [ 6 ]}ก่อนที่พวกเขาจะไปถึงที่นั่น กองทหารได้ยอมจำนนในวันที่ 20 กันยายน ดังนั้นสเตอร์จิสจึงไปที่แคนซัสซิตี้โดยมาถึงในวันอาทิตย์ที่ 22 กันยายน^{[หมายเหตุ 2 ]}กองทหารได้รวมตัวกันอีกครั้งในวันที่ 19 กุมภาพันธ์ ที่เซนต์หลุยส์ ณค่ายทหารเบนตัน^{[ 7 ]}

ในวันเสาร์ที่ 22 กุมภาพันธ์ กองทหารได้ขึ้นเรือไปยังเมืองคอมเมิร์ซ รัฐมิสซูรี และมาถึงในวันจันทร์ กองทหารนี้อยู่ในกองพลน้อยที่ 1 กองพลที่ 1 ของ กองทัพแห่งมิสซิสซิปปี (AoM)ของพลตรีจอห์น โป๊ปและได้เดินทัพในปฏิบัติการจู่โจมเมืองนิวมาดริด รัฐมิสซูรีโดยมาถึงในวันจันทร์ที่ 3 มีนาคม^{[ 8 ]}โป๊ปได้ทำการปิดล้อม และกองทหารโอไฮโอที่ 39 ได้ปฏิบัติการสนับสนุน ส่งผลให้สามารถยึดเมืองนิวมาดริดได้ในวันศุกร์ที่ 14 มีนาคม และเกาะหมายเลข 10ได้ในอีกสามสัปดาห์ครึ่งต่อมาในวันที่ 7 เมษายน ทำให้สามารถเคลียร์พื้นที่แม่น้ำมิสซิสซิปปีได้ไกลถึงเมืองเมมฟิส [ ^{9 ] [ หมายเหตุ 3 ]}

วันอาทิตย์ถัดมาคือวันที่ 13 เมษายน กองพันที่ 39 ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของ AoM ได้ขึ้นเรือกลไฟอีกครั้งและเคลื่อนทัพลงไปตามแม่น้ำมิสซิสซิปปีจนอยู่ห่างจากป้อมพิลโลว์ เพียงไม่กี่ไมล์ ^{[ 7 ]} หลังจากนั้น ได้พักอยู่สี่วันจนถึงวันพฤหัสบดีที่ 17 เมษายน จากนั้นจึงล่องเรือขึ้นไปตามแม่น้ำเทนเนสซีและขึ้นฝั่งที่แฮมเบิร์กแลนดิ้ง^{[ 11 ]}กองทัพแห่งมิสซิสซิปปีได้เข้าร่วมกับอีกสองกองพันภายใต้การบัญชาการโดยรวมของพลตรีฮัลเล็คจากนั้นกองพันที่ 39 ก็ได้เข้าร่วมในการล้อมเมืองโครินธ์ [ ^{หมายเหตุ 4 ]}ในระหว่างการล้อม กองพันที่ 39 ได้ทำการลาดตระเวนหลายครั้งและมีการปะทะกันจำนวนมาก ทำให้สูญเสียกำลังพลไปเป็นจำนวนมาก ในวันศุกร์ที่ 30 พฤษภาคม กองพันนี้ได้นำกองทัพของโปปเข้าสู่เมืองโครินธ์ และเป็นหนึ่งในกองพันแรกที่เข้ายึดครองเมือง^{[ 7 ]}หลังจากไล่ตามกบฏที่ถอยร่นไปจนถึงบูนวิลล์ กองทหารก็กลับมาอยู่ห่างจากโครินธ์เพียงห้าไมล์และตั้งค่ายพักแรมที่เคลียร์ครีก

ตลอดเดือนมิถุนายน กรกฎาคม และสิงหาคม กองพันที่ 39 ยังคงฝึกฝนอย่างต่อเนื่องด้วยการฝึกโรงเรียนนายทหาร การฝึกกองร้อย และการฝึกกองพันที่จัดขึ้นทุกวัน ในวันที่ 25 กรกฎาคม กองพันได้ส่งมอบปืนไรเฟิล Greenwood ^{[หมายเหตุ 5 ]}ซึ่งเคยได้รับมาก่อนหน้านี้ และได้รับ ปืนไรเฟิล Springfield Model 1861 ที่ผลิตโดย Eli Whitney และดาบปลายปืนแทน^{[ 7 ]}ในวันถัดมา กองพันทหารราบได้รับผู้บัญชาการคนใหม่คือ พลตรีWilliam S. Rosecrans

ในวันอาทิตย์ที่ 24 สิงหาคม กองทหารได้รับทหารเกณฑ์ใหม่ 44 นายจากโอไฮโอ ในวันศุกร์ถัดมา กองทหารได้เคลื่อนพลไปยังเมืองไอวกา ซึ่งกองทหารถูกส่งออกไปเป็นหน่วยย่อยเพื่อรักษาความปลอดภัยทาง รถไฟเมมฟิสและชาร์ลสตัน (M&CRR) อีกครั้ง ในวันพฤหัสบดีที่ 11 กันยายน กองทหารได้รวมตัวกันและเดินทางกลับไปยังเมืองโครินธ์ และเก็บอุปกรณ์ส่วนเกินทั้งหมดไว้ที่ค่าย^{[ 7 ]}

กองทัพ AoM เคลื่อนพลไปยัง Iuka พร้อมกับกองทัพแห่งเทนเนสซี (AoT)ซึ่งขณะนั้นอยู่ภายใต้การบังคับบัญชาของพลตรีเอ็ดเวิร์ด ออร์ดโดยมีพลตรีแกรนต์เป็นผู้บัญชาการโดยรวม แกรนต์วางแผนโอบล้อมกองทัพฝ่ายใต้แห่งตะวันตกซึ่งบัญชาการโดยพลตรีสเตอร์ลิง ไพรซ์จากสองด้าน โดยให้กองทัพ AoM (รวมถึงกองพันที่ 39) โจมตีจากทางตะวันตกเฉียงใต้ และสามกองพลของ AoT จากทางตะวันตกเฉียงเหนือ^{[ 13 ]}ออกจากคอรินธ์ในวันที่ 11 กันยายน และภายในวันที่ 18 กันยายน กองทัพ AoM อยู่ห่างจาก Iuka 20 ไมล์ โรสแครนส์ส่งข่าวไปยังแกรนต์ว่าเขาจะถึง Iuka ในช่วงบ่ายของวันศุกร์^{[ 7 ]}เมื่อพิจารณาถึงความล่าช้านี้ แกรนต์จึงสั่งให้ออร์ดเคลื่อนพลไปยังเมือง แต่ห้ามโจมตีจนกว่าจะได้ยินเสียงการต่อสู้ของกองทัพ AoM ทางใต้ของเมือง^{[ 13 ]}

กองพันที่ 39 แห่งโอไฮโออยู่ห่างจากเมือง ไม่เกิน 2 ไมล์ (3.2 กม.) ในวันที่ 19 กันยายน เมื่อมีการติดต่อเข้ามา ^{[ 14 ]}ไม่นานนัก กองพันที่ 39 ก็ได้เข้าสู่การต่อสู้อย่างดุเดือด โดยอยู่ใน กองพล น้อยโอไฮโอของ พันเอกฟูลเลอ ร์แห่ง กองพลที่ 2 ของพลตรีสแตนลีย์ ขณะที่ต่อสู้อย่างดุเดือดทางด้านขวาของโรสแครนส์ ขับไล่ฝ่ายกบฏทางด้านซ้ายออกจากเมือง^{[ 7 ]}ลมเหนือที่พัดมาจากตำแหน่งของออร์ดในทิศทางของไอวกา ทำให้เกิดเงาเสียงที่ป้องกันไม่ให้กองทหารของออร์ดอยู่นิ่งเฉยในขณะที่การต่อสู้กำลังดุเดือดอยู่ห่างออกไปเพียงไม่กี่ไมล์^{[ 15 ]} 

แม้จะขาดการสนับสนุน กองพันที่ 39 และสหายของพวกเขาก็เอาชนะศัตรูได้^{[ 7 ]}และไล่ล่าพวกเขาเป็นเวลาสองวันก่อนที่จะกลับไปยังโครินธ์ในวันพฤหัสบดีที่ 2 ตุลาคม เช้าวันรุ่งขึ้น กองพันอยู่ในกองกำลังสำรองของสแตนลีย์ทางตะวันตกเฉียงใต้ของจุดเชื่อมต่อทางรถไฟ ขณะที่ฝ่ายสัมพันธมิตรซึ่งขณะนี้อยู่ภายใต้การนำของพลตรีเอิร์ล แวน ดอร์นกำลังเข้าใกล้จากทางตะวันตกเฉียงเหนือ^{[ 7 ]} เพื่อตอบโต้ ในเช้าวันศุกร์ โรสแครนส์ได้ผลักดันกองพลสามกองของเขาเข้าไปในหลุมปืนเก่าของฝ่ายสัมพันธมิตรทางเหนือและตะวันตกเฉียงเหนือของเมือง กองพันที่ 39 อยู่ในกองกำลังสำรองทางใต้ของเมือง^{[ 16 ]}แวน ดอร์นเริ่มการโจมตีเวลา 10.00 น. และกองทหารของเขาฝ่าแนวรบได้ประมาณ 13.30  น. บังคับให้แนวรบของฝ่ายสหภาพทั้งหมดถอยกลับ^{[ 17 ]}ความมืดทำให้การต่อสู้ยุติลง ฝ่ายสัมพันธมิตรได้ผลักดัน AoM กลับไปทุกจุด แต่ทั้งสองฝ่ายต่างเหนื่อยล้าจากการต่อสู้ในสภาพอากาศร้อน (อุณหภูมิสูงสุด94 °F (34 °C) ) ^{[ 7 ]}กองพันที่ 39 และสหายร่วมรบต่างมั่นใจว่าพร้อมสำหรับวันรุ่งขึ้น^{[ 18 ]}  

ก่อนรุ่งสางเช้าวันเสาร์ที่ 4 ตุลาคม ฝ่ายสัมพันธมิตรได้เริ่มระดมยิงอย่างต่อเนื่องจนกระทั่งหลังพระอาทิตย์ขึ้น เมื่อเสียงปืนเงียบลง การโจมตีที่คาดการณ์ไว้ก็ไม่ได้เกิดขึ้นจนกระทั่งเวลา 9:00  น. กองพันที่ 39 แห่งโอไฮโออยู่ในกองพลของสแตนลีย์ในใจกลางของกองทัพฝ่ายสัมพันธมิตร ซึ่งแม้ว่าฝ่ายกบฏจะประสบความสำเร็จในช่วงแรก แต่กองพันและสหายของพวกเขาก็สามารถขับไล่การโจมตีของฝ่ายสัมพันธมิตรได้ทั้งหมด^{[ 19 ]}เวลา 13:00  น. การโจมตีทั้งหมดของแวนดอร์นล้มเหลว และเขาสั่งให้ถอยทัพ^{[ 20 ]}กำลังเสริมจากแกรนท์ในเวลา 16:00  น. ทำให้โรสแครนส์และกองทัพฝ่ายสัมพันธมิตรได้รับชัยชนะ^{[ 21 ]}

กองทหารเข้าร่วมการไล่ล่ากบฏไปจนถึงบัลด์วิน หลังจากนั้นจึงกลับไปยังโครินธ์^{[ 7 ]}และทำงานที่แนวป้องกันด้านใน

กรมทหารนี้สังกัดกองทัพภาคตะวันตกและกรมทหารมิสซูรีจนถึงเดือนกุมภาพันธ์ ค.ศ. 1862 กองพลน้อยที่ 1 กองทัพมิสซิสซิปปีจนถึงเดือนเมษายน ค.ศ. 1862 กองพลน้อยที่ 1 กองทัพมิสซิสซิปปี จนถึงเดือนพฤศจิกายน ค.ศ. 1862 กองพลน้อยที่ 1 กองทัพที่ 8 ปีกซ้าย กองทัพน้อยที่ 13 กรมทหารเทนเนสซีจนถึงเดือนธันวาคม ค.ศ. 1862 กองพลน้อยที่ 1 กองทัพที่ 8 กองทัพน้อยที่ 16 จนถึงเดือนมีนาคม ค.ศ. 1863 กองพลน้อยที่ 4 เขตคอรินธ์ มิสซิสซิปปี กองทัพที่ 2 กองทัพน้อยที่ 16 จนถึงเดือนพฤษภาคม ค.ศ. 1863 กองพลน้อยที่ 3 เขตเมมฟิส เทนเนสซี กองทัพที่ 5 กองทัพน้อยที่ 16 จนถึงเดือนพฤศจิกายน ค.ศ. 1863 กองพลน้อยฟูลเลอร์ กองทัพที่ 2 กองทัพน้อยที่ 16 จนถึงเดือนมกราคม ค.ศ. 1864 กองพลน้อยที่ 1 กองพลที่ 4 กองทัพน้อยที่ 16 จนถึงเดือนกันยายน พ.ศ. 2407 กองพลน้อยที่ 1 กองพลที่ 1 กองทัพน้อยที่ 17จนถึงเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2408

กองทหารราบที่ 39 แห่งโอไฮโอปลดประจำการที่เมืองลุยส์วิลล์ รัฐเคนตัก กี้ เมื่อวันที่ 9 กรกฎาคม ค.ศ. 1865

แนบมากับ: ^{[ 4 ] [ 1 ] [ 2 ]}

• กองทัพภาคตะวันตกและกรมมิสซูรี ถึงเดือนกุมภาพันธ์ ค.ศ. 1862
• กองพลน้อยที่ 1 กองทัพที่ 1 แห่งมิสซิสซิปปี (AoM) จนถึงเดือนเมษายน ค.ศ. 1862
• กองพลน้อยที่ 1 กองทัพที่ 2 แห่งจักรวรรดิโรมันอันศักดิ์สิทธิ์ (AoM) จนถึงเดือนพฤศจิกายน ปี 1862
• กองพลน้อยที่ 1 กองพลที่ 8 ปีกซ้ายกองทัพน้อยที่ 13กรมเทนเนสซี จนถึงเดือนธันวาคม ค.ศ. 1862
• กองพลน้อยที่ 1 กองทัพที่ 8 กองทัพน้อยที่ 16 กองทัพบกสหรัฐฯจนถึงเดือนมีนาคม ค.ศ. 1863
• กองพลน้อยที่ 4 เขตคอรินธ์ กองพลที่ 2 กองทัพที่ 16 จนถึงเดือนพฤษภาคม ค.ศ. 1863
• กองพลน้อยที่ 3 เขตเมมฟิส กองทัพที่ 5 กองทัพน้อยที่ 16 แห่งกองทัพบกสหรัฐฯ จนถึงเดือนพฤศจิกายน ค.ศ. 1863
• กองพลน้อยที่ 1 กองทัพที่ 2 กองทัพน้อยที่ 16 แห่งกองทัพบกสหรัฐฯ จนถึงเดือนมกราคม ค.ศ. 1864
• กองพลน้อยที่ 1 กองทัพที่ 4 กองทัพน้อยที่ 16 กองทัพบก จนถึงเดือนกันยายน ค.ศ. 1864
• กองพลน้อยที่ 1 กองทัพที่17จนถึงเดือนกรกฎาคม ค.ศ. 1865

รายชื่ออย่างเป็นทางการของการรบที่กรมทหารนี้มีส่วนร่วม: ^{[ 4 ] [ 3 ] [ 1 ] [ 2 ]}

รายละเอียดการให้บริการของกองพันที่ 39 แห่งโอไฮโอมีดังนี้: ^{[ 22 ]}