กองบินขับไล่ที่ 3 ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 1 มกราคม 1944 โดยเป็นส่วนหนึ่งของกองทัพอากาศฝรั่งเศสเสรีภายใต้การบังคับบัญชาของผู้บัญชาการมงราอิส หน่วยนี้ประกอบด้วยกลุ่มขับไล่ (GC) I/4 นาวาร์, GC I/5 แชมเปญ และ GC III/6 รูซียง และใช้เครื่องบินขับไล่P-39 แอร์ราโคบรา กลุ่ม ขับไล่ I/5 แชมเปญได้รับการเยี่ยมเยือนจากนายพลชาร์ลส์ เดอ โกลล์ที่ออรอง-ลา เซเนีย เมื่อวันที่ 13 เมษายน 1944 ในเดือนพฤษภาคม 1944 กองบินได้เปลี่ยนมาใช้เครื่องบินขับไล่ P-39Q

ฝูงบิน I/4 Navarre ถูกส่งไปประจำการชั่วคราวกับกองบิน EC 4เมื่อวันที่ 1 มิถุนายน 1944 ระหว่างวันที่ 17 กรกฎาคม 1944 ถึงสิ้นเดือนตุลาคม 1944 กองบินได้รับการเสริมกำลังด้วย ฝูงบินขับไล่ GC III/3 Ardennesซึ่งใช้เครื่องบิน P-47 เช่นกัน ฝูงบิน GC I/4 Navarre เข้าร่วมกับกองบินขับไล่ที่ 3 เมื่อวันที่ 7 ธันวาคม 1944 ในขณะเดียวกัน กองบินที่ 3 ก็ได้รับการติดตั้งเครื่องบินP-47 Thunderboltแทน

หลังจากขึ้นฝั่งที่โพรวองซ์ ฝูงบินได้ลงจอดที่ซาลอน-เดอ-โพรวองซ์ในวันที่ 30 กันยายน 1944 จากนั้นไม่นานฝูงบินก็เคลื่อนไปยังวาลลอน ซึ่งอยู่ห่างออกไปประมาณสิบกว่ากิโลเมตร

กองทัพอากาศฝรั่งเศสที่ 1 ซึ่งประกอบด้วย กองบินขับไล่ ที่ 1 , 3 และ4ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 1 ธันวาคม 1944 ฝูงบินนาวาร์และแชมเปญประจำการอยู่ที่ฐานทัพอากาศที่ 278 อัมเบริเยอ-ออง-บูเจย์กองบินเดินทางมาถึงโดลในช่วงปลายเดือนธันวาคม 1944 ฝูงบิน "แชมเปญ" สูญเสียผู้บัญชาการมาริน ลา เมสเลเมื่อวันที่ 4 กุมภาพันธ์ 1945

กองบินเดินทางมาถึงบอร์โดซ์เมื่อวันที่ 12 เมษายน 1945 เพื่อเข้าร่วมปฏิบัติการกวาดล้างพื้นที่รอยองพ็อกเก็ตและปวงต์เดอกราฟ ( ภาษาฝรั่งเศส: poche de Royan ) ส่วนปวงต์เดอกราฟได้เดินทางกลับไปทางตะวันออกเมื่อวันที่ 23 เมษายน 1945 เพื่อประจำการที่สนามบินสตราสบูร์ก-เอ็นต์ ซไฮม์ ใกล้กับสตราสบูร์ ก

ฝูงบินได้ปฏิบัติภารกิจทางสงครามครั้งสุดท้ายเมื่อวันที่ 1 พฤษภาคม 1945 สภาพอากาศเลวร้ายในขณะนั้นทำให้เครื่องบิน P-47 ไม่สามารถขึ้นบินได้จนกระทั่งมีการลงนามในข้อตกลงหยุดยิงเมื่อวันที่ 8 พฤษภาคม 1945 ฝูงบินได้บินผ่านเหนือถนนช็องเซลิเซ่เมื่อวันที่ 9 พฤษภาคม 1945

หลังจากประจำการอยู่ที่แคว้นอัลซาสเป็นเวลาสองสามเดือน กองบินก็ย้ายไปประจำการที่สนามบินเทรียร์ในเยอรมนีโดยประจำการอยู่ที่นั่นเป็นเวลา 21 เดือน ก่อนจะกลับไปรวมกับฐานทัพอากาศที่ 136 ฟรีดริชส์ฮาเฟน ในปลายเดือนพฤษภาคม ปี 1947

ฝูงบินทั้งสองได้เปลี่ยนชื่อเมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม 1947 โดยเปลี่ยนเป็น GC.1/3 Navarre และ GC.2/3 Champagne

ในเดือนมิถุนายน ปี 1948 นักบินได้รับการฝึกบินด้วยเครื่องบิน Spitfire Mk.IXที่ฐานทัพอากาศ 141 Oran la Sénia ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของฝูงบินขับไล่ที่ 1 ( 1 ^er Escadre de Chasse ) เมื่อวันที่ 1 สิงหาคม ปี 1948 ได้มีการจัดพิธีประลองอาวุธ ( ภาษาฝรั่งเศส: prise d'armes ) เพื่อเฉลิมฉลองการออกเดินทางของฝูงบินไปยังอินโดจีน

นาวาร์ขึ้นเรือ ปาสเตอร์เมื่อวันที่ 3 กันยายน 1948 และเดินทาง ถึง อินโดจีนที่ เมืองไฮฟองในปลายเดือนนั้นเครื่องบินสปิตไฟร์ที่นั่นเพิ่งได้รับการซ่อมแซมจากนักบินของกองบินขับไล่ที่ 4 ฝูงบินที่1 ( SPA95 ) ประจำการอยู่ที่สนามบินฮานอยเกียลัม ส่วนฝูงบินที่ 2 ( ^{2e Escadrille} ) ประจำการอยู่ที่ฐานทัพอากาศไซ่ง่อน 191 ตันซอนนัท ตามลำดับ

ฝูงบิน "แชมเปญ" ขึ้นฝั่งที่อินโดจีนเมื่อวันที่ 28 ธันวาคม 1948 โดยกองบัญชาการของฝูงบินดังกล่าวตั้งอยู่ที่ญาตรัง ฝูงบินที่ 1 ประจำการอยู่ที่ตูรานและฝูงบินที่ 2 ประจำการอยู่ที่ตันเซินเญอต

กองบินขับไล่ที่ 5เดินทางมาถึงอินโดจีนเมื่อปลายเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2492 เพื่อผลัดเปลี่ยนกำลังกับกองบินที่ 3 ส่วนฝูงบินที่ 1/3 ขึ้นเรือแชมโปลียงเมื่อปลายเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2492 เพื่อเดินทางกลับฝรั่งเศส ตามด้วยฝูงบินที่ 2/3 ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2493

หลังจากกลับจากอินโดจีน ฝูงบินได้รับการจัดตั้งขึ้นใหม่ที่ฐานทัพอากาศที่ 11 แร็งส์-แชมเปญ นักบินเดินทางไปยังฐานทัพอากาศที่ 118 มงต์-เดอ-มาร์ซอง เพื่อทำการฝึกอบรมการใช้งาน เครื่องบินแวมไพร์

เมื่อวันที่ 1 กันยายน 1950 กลุ่มเครื่องบินขับไล่ ( ภาษาฝรั่งเศส: groupes de chasse ) ได้เปลี่ยนมาใช้ชื่อเรียกอย่างเป็นทางการว่า ฝูงบินขับไล่ ( ภาษาฝรั่งเศส: escadron de chasse ) ในเดือนกุมภาพันธ์ 1951 ฝูงบิน "  la 3 " ได้รับเครื่องบินขับไล่ Republic F-84E Thunderjet มาใช้ และเครื่องบินขับไล่ Vampire ลำสุดท้ายเข้าประจำการเมื่อวันที่ 29 มีนาคม 1951 ฝูงบินนี้ยังใช้เครื่องบิน F-84G อีกด้วย

เมื่อวันที่ 1 มกราคม 1953 ฝูงบิน Escadre ได้รับฝูงบินเพิ่มเติมอีกหนึ่งฝูงบินด้วยการจัดตั้งฝูงบินEscadron the Chasse 3/3 Ardennes เครื่องบิน Republic F-84F Thunderstreakลำแรกบินประจำการกับฝูงบิน "3" เมื่อวันที่ 4 พฤษภาคม 1955 และทั้งสามฝูงบินได้รับการติดตั้งอาวุธครบครันเมื่อปลายเดือนพฤษภาคม 1956

• 
  F-84G du 1/3 Navarre
• 
  F-84E du 2/3 Champagne
• 
  F-84G du 3/3 Ardennes

^{ฝูงบิน}ที่3มีบทบาทสำคัญในช่วงวิกฤตการณ์คลองสุเอซในช่วงปลายเดือนกันยายน ปี 1956 เครื่องบิน F-84F บางลำจากฝูงบินที่ 3 ถูกส่งไปประจำการที่ฐานทัพอากาศอังกฤษRAF Akrotiriบนเกาะไซปรัส

นักบินขับไล่ ( ภาษาฝรั่งเศส: chasseurs ) จากฝูงบินที่ 3 ^เข้า ร่วม ปฏิบัติการเหนือประเทศ อียิปต์ ร่วมกับเครื่องบิน F-84F จากฝูงบิน^ที่ 1และพันธมิตรของกองทัพอากาศสหราชอาณาจักรโดยมีเป้าหมายคือฐานทัพอากาศ

ขบวนรถไฟแชมเปญส่วนที่ 2/3 กลับมาประจำการที่ฐานทัพเรือนองซีในเดือนพฤศจิกายน ปี 1956 ตามด้วยขบวนส่วนที่ 1/3 ในเดือนธันวาคม ปี 1956 และขบวนส่วนที่3/3 อาร์เดนส์ในเดือนมีนาคม ปี 1957

ในช่วงสงครามแอลจีเรียกองบินที่ 3  ให้การสนับสนุนฝูงบินสองฝูง ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2499 ถึงมิถุนายน พ.ศ. 2490 นักบินได้บินด้วยเครื่องบิน SIPA S.111 และ EALA 1/71 เมื่อเปลี่ยนมาใช้เครื่องบิน T-6 ฝูงบินดังกล่าวจึงเปลี่ยนชื่อเป็น EALA 19/72 ซึ่งได้รับการสนับสนุนจากกองบินที่ 3  จนกระทั่งฝูงบิน^ที่ 13 เข้ามาแทนที่ ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2491

หน่วย EALA 4/72 ได้รับการสนับสนุนและเป็นพันธมิตรกับหน่วย9 ^e Escadreตั้งแต่เดือนกรกฎาคม 1956 จนถึงเดือนกันยายน 1958

ฝูงบินทั้งสองฝูงดำเนินการภารกิจสนับสนุนภาคพื้นดินจากฐานทัพTébessaและฐานทัพอากาศ 211 Telergma โดยมีหน่วยย่อยจาก Steif, Tiaret, Aflou และ Bir El Alter เข้าร่วมด้วย

หลังจากการยุบหน่วยEC 3/3 Ardennesเมื่อวันที่ 15 พฤศจิกายน 1957 ฝูงบินของสองฝูงบินนี้ได้เริ่มเปลี่ยนไปใช้เครื่องบินF-100 Super Sabre โดยเครื่องบิน Super Sabre ลำแรกได้ลงจอดที่ฐานทัพในเมืองแร็งส์เมื่อต้นปี 1959 ฝูงบินดังกล่าวถูกผนวกเข้ากับกองกำลังทางอากาศยุทธวิธีที่ 4ของนาโต

กองบิน ที่3 ^แห่ง ECออกจากแร็งส์ในเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2504 และเข้ามาแทนที่กองบินที่ 13 ^{แห่ง EC}ซึ่งเพิ่งออกจากฐานทัพอากาศที่ 139 ลาห์รในเยอรมนีตะวันตก โดยกองบินที่ 13 แห่ง EC จะทำหน้าที่ปฏิบัติภารกิจโจมตีทางยุทธวิธีด้วยอาวุธนิวเคลียร์

นับตั้งแต่เดือนตุลาคม พ.ศ. 2508 ฝูงบินแชมเปญเริ่มเปลี่ยนไปใช้เครื่องบินดัสโซลต์ มิราจ IIIEตามมาด้วยฝูงบินนาวาร์ในช่วงปลายเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2508 ในระหว่างการเปลี่ยนผ่านจากมิราจ IIIE ฝูงบินได้เปลี่ยนภารกิจและมุ่งเน้นไปที่การป้องกันทางอากาศและการโจมตีทางยุทธวิธี นักบินต้องเตรียมพร้อมรับมือภายในห้านาที

ฝูงบินดังกล่าวออกจากเยอรมนีในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2510 เพื่อไปประจำการที่ฐานทัพแนนซี-โอเชย์ ในขณะเดียวกัน ฐานทัพแห่งนี้ได้ละทิ้งภารกิจสนับสนุนทางยุทธวิธี และรับภารกิจคุ้มครองฐานทัพของกองกำลังทางอากาศเชิงยุทธศาสตร์ ในระดับต่ำ แทน

ในปี 1969 เครื่องบิน Mirage IIIE ของฝูงบิน "  3  " มีความเชี่ยวชาญในการโจมตี โดยมีAS-30เป็นภารกิจป้องกันภัยทางอากาศเป็นภารกิจรอง

ในปี 1970 ฝูงบินได้รับการติดตั้งขีปนาวุธต่อต้านเรดาร์AS-37 Martel เมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม 1974 ฝูงบินขับไล่ล่าสังหารที่ 3/3 อาร์เดนส์ได้เริ่มปฏิบัติการโดยใช้เครื่องบิน Mirage 5F ต่อมาในเดือนเมษายน 1977 ฝูงบินนี้ได้เลิก ใช้เครื่องบินขับไล่ ล่าสังหารรูปทรง สามเหลี่ยมของ Dassault และหันมาใช้เครื่องบิน Jaguar แทน และ ต่อมาได้เปลี่ยนเครื่องบินอีกครั้งเป็น Mirage IIIE เมื่อวันที่ 1 มิถุนายน 1987

^{ฝูงบิน ที่} 3 เปลี่ยนยุคสมัยเมื่อวันที่ 31 กรกฎาคม 1991 เมื่อฝูงบินที่ 2/3 แชมเปญ เริ่มเปลี่ยนไปใช้เครื่องบินมิราจ 2000Nฝูงบินที่ 3/3 ทำการบินครั้งสุดท้ายด้วยเครื่องบินมิราจ IIIE ของกองทัพอากาศฝรั่งเศสเมื่อวันที่ 12 มีนาคม 1993 ฝูงบินทั้งสามของ "ฝูงบินที่ 3  " พัฒนาไปสู่เครื่องบินรุ่นปัจจุบันคือมิราจ2000D

ในช่วงท้าย (อย่างไม่เป็นทางการ) ของกองบินใหม่ของกองทัพอากาศฝรั่งเศส กองบินที่ 3 ^ถูกยุบเมื่อวันที่ 23 มิถุนายน 1995

กองบินใหม่กลับมาอยู่ในโครงสร้างของกองทัพอากาศฝรั่งเศสอีกครั้งในปี 2014 โดยกองบินขับไล่ที่ 3 (3 ^e Escadre de Chasse) เป็นหนึ่งในหน่วยแรกๆ ที่ถูกนำกลับมาจัดตั้งขึ้นใหม่เมื่อวันที่ 5 กันยายน 2014

ในปี 2558 เครื่องบิน Mirage 2000D จำนวน 3 ลำของฝูงบินได้เข้าร่วมปฏิบัติการ Chammal ^{[ 1 ]}

• GC I/4 Navarre (01/01/1944 ถึง 01/05/1944 และ 07/12/1944 ถึง 01/07/1947)
• GC I/3 Navarre (01/07/1947 ถึง 01/11/1950)
• EC 1/3 Navarre (01/11/1950 ถึง 23/06/1995 และตั้งแต่ 05/09/2014)

• GC I/5 Champagne (01/01/1944 ถึง 01/07/1947)
• GC II/3 แชมเปญ (01/07/1947 ถึง 01/11/1950)
• EC 2/3 Champagne (01/11/1950 ถึง 23/06/1995 และตั้งแต่ 05/09/2014)

• GC III/3 อาร์เดนส์ (17/07/1944 ถึง 31/10/1944)
• EC 3/3 อาร์เดนส์ (01/01/1953 ถึง 15/11/1957 และ 01/07/1974 ถึง 23/06/1995 และตั้งแต่ 05/09/2014)

• GC III/6 รูสซิยง (1 มกราคม 1944 ถึง 1 มีนาคม 1945)

ในระหว่างสงครามแอลจีเรีย กองบิน ขับไล่ ที่ 3 (3e ^Escadre de Chasse) ได้ให้การสนับสนุนกองบินสนับสนุนเบา (EALA) สองกองบิน:

• EALA 1/71 (01/04/1956 ถึง 30/06/1957) เปลี่ยนชื่อเป็น EALA 19/72 (01/07/1957 ถึง 06/1958 ซึ่งเป็นวันที่กองพัน^ที่ 13 กลับมารับหน้าที่ดูแลอีกครั้ง)
• ELA 4/72 (01/07/2499 ถึง 01/08/2504)