อ่าน 17 นาที
อาดาร์
เอนไซม์ ตระกูล อะดีโนซีนดีอะมีเนสที่จำเพาะต่อ RNA สองสาย นั้นถูกเข้ารหัสโดย ยีน ตระกูล ADAR [ 5 ] ADAR ย่อมาจาก adenosine deaminase acting on RNA [ 6 ] [ 7 ]...
อาดาร์
| อาดาร์ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | ADAR , ADAR1, ADAR2, ADAR3, ADARB1, ADARB2, ADAR1p150, ADAR1p110, IFI-4, DSH, P136, อะดีโนซีนดีอะมีเนส RNA เฉพาะ, DRADA, IFI4, AGS6, G1P1, K88DSRBP, DSRAD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 146920 ; เอ็มจีไอ : 1889575 ; โฮโมโลยีน : 9281 ; GeneCards : ADAR ; OMA : ADAR - ออร์โธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
เอนไซม์ ตระกูล อะดีโนซีนดีอะมีเนสที่จำเพาะต่อ RNA สองสาย นั้นถูกเข้ารหัสโดยยีนตระกูลADAR [ 5 ] ADAR ย่อมาจากadenosine deaminase acting on RNA [ 6 ] [ 7 ]บทความนี้มุ่งเน้นไปที่โปรตีน ADAR โดยจะกล่าวถึงประวัติวิวัฒนาการ โครงสร้าง หน้าที่ กลไก และความสำคัญของโปรตีนทั้งหมดในตระกูลนี้โดยละเอียด[ 5 ]
เอนไซม์ ADAR จับกับ RNA สองสาย ( dsRNA ) และเปลี่ยนอะดีโนซีนเป็นอิโนซีน ( ไฮโปแซนทีน ) โดยการดีอะมิเนชัน [ 8 ] โปรตีน ADAR ทำงานหลังการถอดรหัส โดยเปลี่ยน ปริมาณ นิวคลีโอไทด์ของ RNA [ 9 ]การเปลี่ยนจากอะดีโนซีนเป็นอิโนซีน (A เป็น I) ใน RNA จะรบกวนการจับคู่ A:U ปกติ ทำให้ RNA ไม่เสถียร อิโนซีนมีโครงสร้างคล้ายกับกัวนีน (G) ซึ่งนำไปสู่การจับกันระหว่างอิโนซีนกับไซโตซีน (I:C) [ 10 ]โดยทั่วไปอิโนซีนจะเลียนแบบกัวโนซีนในระหว่างการแปล แต่ก็สามารถจับกับยูราซิลและอะดีโนซีนได้เช่นกัน แม้ว่าจะไม่เป็นที่นิยมก็ตาม
การเปลี่ยนแปลง โคดอนอาจเกิดขึ้นจากการแก้ไข RNA ซึ่งนำไปสู่การเปลี่ยนแปลงในลำดับการเข้ารหัสสำหรับโปรตีนและหน้าที่ของโปรตีน[ 11 ]ตำแหน่งการแก้ไขส่วนใหญ่พบในบริเวณที่ไม่ใช่การเข้ารหัสของ RNA เช่นบริเวณที่ไม่ได้รับการแปล (UTRs) องค์ประกอบ Aluและองค์ประกอบนิวเคลียร์แทรกยาว (LINEs) [ 12 ] การเปลี่ยนแปลงโคดอนสามารถก่อให้เกิดตัวแปรการตัดต่อการถอดรหัสทางเลือกได้ ADAR ส่งผลกระทบต่อทรานสคริปโตมในลักษณะที่ไม่ขึ้นกับการแก้ไข โดยน่าจะเกิดจากการรบกวนโปรตีนที่จับกับ RNA อื่นๆ[ 9 ]
การควบคุม ADAR ที่ผิดปกติมีความเกี่ยวข้องกับโรคหลายชนิด งานวิจัยล่าสุดสนับสนุนความเชื่อมโยงระหว่างการแก้ไข RNA และความผิดปกติของระบบประสาท เช่น โรคกล้ามเนื้ออ่อนแรง (ALS) การแก้ไข RNA ที่ผิดปกติซึ่งเชื่อมโยงกับ ADAR อาจมีความสัมพันธ์กับความผิดปกติทางจิต เช่น โรคจิตเภท โรคลมชัก และภาวะซึมเศร้าที่นำไปสู่การฆ่าตัวตาย[ 13 ]
การค้นพบ
เอนไซม์ ADAR และยีน ที่เกี่ยวข้อง ถูกค้นพบโดยบังเอิญในปี 1987 อันเป็นผลมาจากการวิจัยของBrenda BassและHarold Weintraub [ 14 ] นักวิจัยเหล่านี้ใช้ การยับยั้ง RNA แบบแอนติเซนส์เพื่อกำหนดว่ายีนใดมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาตัวอ่อนของXenopus laevis การวิจัยก่อนหน้านี้เกี่ยวกับเซลล์ไข่ของ Xenopusประสบความสำเร็จ อย่างไรก็ตาม เมื่อ Bass และ Weintraub ใช้โปรโตคอลเดียวกันกับ ตัวอ่อนของ Xenopusพวกเขาไม่สามารถกำหนดยีนที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาของตัวอ่อนได้ เพื่อทำความเข้าใจว่าทำไมวิธีการนี้จึงไม่ประสบความสำเร็จ พวกเขาจึงเริ่มเปรียบเทียบ RNA แบบคู่ในทั้งเซลล์ไข่และตัวอ่อน ซึ่งนำไปสู่การค้นพบกิจกรรมที่ควบคุมโดยการพัฒนาซึ่งทำให้ไฮบริด RNA:RNA ในตัวอ่อนเสียสภาพ
ในปี พ.ศ. 2531 Richard Wagner และคณะได้ศึกษาเพิ่มเติมเกี่ยวกับกิจกรรมที่เกิดขึ้นในตัวอ่อนXenopus [ 15 ]พวกเขาพบว่าโปรตีน ชนิดหนึ่ง มีหน้าที่ในการคลายเกลียว RNA เนื่องจากไม่มีกิจกรรมใดๆ เกิดขึ้นหลังจาก การบำบัด ด้วยโปรตีเอสโปรตีนชนิดนี้มีความจำเพาะต่อ dsRNA และไม่ต้องการATPเป็นที่ชัดเจนว่ากิจกรรมของโปรตีนชนิดนี้บน dsRNA จะปรับเปลี่ยน dsRNA เกินกว่าจุดของการเกิดไฮบริดไดเซชันใหม่ แต่ไม่ได้ทำให้เสียสภาพโดยสมบูรณ์ ในที่สุด นักวิจัยได้ระบุว่าการคลายเกลียวนี้เกิดจากการดีอะมิเนชันของ สารตกค้าง อะดีโนซีนเป็นอิโนซีนการดัดแปลงนี้ส่งผลให้เกิดการจับคู่เบสที่ไม่ตรงกันระหว่างอิโนซีนและยูริดีนซึ่งนำไปสู่การไม่เสถียรและการคลายเกลียวของ dsRNA
วิวัฒนาการและหน้าที่
ADAR เป็นหนึ่งในรูปแบบการแก้ไข RNA ที่พบได้บ่อยที่สุด และมีทั้งกิจกรรมแบบเลือกและไม่เลือก[ 16 ] ADAR สามารถปรับเปลี่ยนและควบคุมผลลัพธ์ของผลิตภัณฑ์ยีนได้ เนื่องจากเซลล์ ตีความอิโนซีน ว่าเป็นกัวโนซีน ADAR สามารถเปลี่ยนการทำงานของโมเลกุล RNA ขนาดเล็กได้ เมื่อเร็วๆ นี้ ADAR ยังถูกค้นพบว่าเป็นตัวควบคุมการต่อเชื่อมและ การสร้าง circRNAด้วยความสามารถในการแก้ไขหรือฟังก์ชันการจับ RNA [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ]เชื่อกันว่า ADAR วิวัฒนาการมาจาก ADAT (Adenosine Deaminase Acting on tRNA) ซึ่งเป็นโปรตีนที่สำคัญที่มีอยู่ในยูคาริโอต ทั้งหมด ในช่วงต้นของ ยุค เมตาโซแอนโดยการเพิ่มโดเมนการจับ dsRNA ซึ่งน่าจะเกิดขึ้นในสายพันธุ์ที่นำไปสู่กลุ่มเมตาโซแอน เมื่อยีน ADAT ที่ซ้ำกันถูกจับคู่กับยีนอื่นที่เข้ารหัสการจับ RNA สองสายอย่างน้อยหนึ่งตัว ยีนตระกูล ADAR ได้รับการอนุรักษ์ไว้เป็นอย่างดีตลอดประวัติศาสตร์การดำรงอยู่ของมัน สิ่งนี้ประกอบกับการพบยีนนี้ในไฟลัม ส่วนใหญ่ในปัจจุบัน บ่งชี้ว่าการแก้ไข RNA เป็นสิ่งจำเป็นในการควบคุมยีนสำหรับสิ่งมีชีวิตหลายเซลล์ อย่างไรก็ตาม ไม่พบยีน ADAR ในยูคาริโอตที่ไม่ใช่หลายเซลล์หลายชนิด เช่นพืชเชื้อราและ โคอา โนแฟลเจลเลต
มีการเสนอแนะว่า ADAR มีหน้าที่สองประการ ได้แก่ การเพิ่มความหลากหลายของโปรตีโอมโดยการกระตุ้นให้เกิดการสร้างโปรตีนที่ไม่เป็นอันตรายซึ่งไม่ได้เข้ารหัสในจีโนม และการปกป้องไซต์การแปลที่สำคัญ ความเชื่อทั่วไปคือบทบาทหลักของพวกมันคือการเพิ่มความหลากหลายของทรานสคริปต์และขยายความแปรผันของโปรตีน ส่งเสริมวิวัฒนาการของโปรตีน[ 5 ]
รูปแบบของเอนไซม์ ADAR
ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม มีเอนไซม์ ADAR สามประเภท ได้แก่ ADAR (ADAR1), ADARB1 (ADAR2) และADARB2 (ADAR3) [ 5 ]
ADAR (ADAR1) และ ADAR2 (ADARB1)
ADAR หนึ่งและสองพบได้ในเนื้อเยื่อต่างๆ ของร่างกาย ทั้งสองรูปแบบของ ADAR นี้ยังพบว่ามีฤทธิ์เร่งปฏิกิริยา ซึ่งหมายความว่าสามารถใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในปฏิกิริยาได้ ทั้งสองรูปแบบยังมีโครงสร้างรูปแบบการแสดงออกของโปรตีนที่คล้ายคลึงกันและต้องการโครงสร้าง RNA สองสายเป็นสารตั้งต้น[ 11 ] อย่างไรก็ตาม พวกมันแตกต่างกันในกิจกรรมการแก้ไข โดยที่ ADAR หนึ่งและสองสามารถแก้ไข GluR-B pre-mRNA ที่ไซต์ R/G ได้ และมีเพียง ADAR2 เท่านั้นที่สามารถเปลี่ยนแปลงไซต์ Q/R ได้[ 20 ]พบว่า ADAR1 มีสองไอโซฟอร์ม คือ ADAR1p150 และ ADARp110 โดยทั่วไปแล้ว ADAR1p110 จะพบในนิวเคลียส ในขณะที่ ADAR1p150 จะสลับไปมาระหว่างนิวเคลียสและไซโตพลาสซึม โดยส่วนใหญ่จะอยู่ในไซโตพลาสซึม
ADAR3 (ADARB2)
ADAR 3 แตกต่างจาก ADAR อีกสองรูปแบบตรงที่พบเฉพาะในเนื้อเยื่อสมองเท่านั้น นอกจากนี้ยังถือว่าไม่ทำงานในแง่ของกิจกรรมเร่งปฏิกิริยา[ 11 ]พบว่า ADAR3 เชื่อมโยงกับความจำและการเรียนรู้ในหนู แสดงให้เห็นว่ามีบทบาทสำคัญในระบบประสาท การศึกษาในหลอดทดลองยังแสดงให้เห็นว่า ADAR3 อาจมีบทบาทในการควบคุม ADAR หนึ่งและสอง[ 21 ]
กิจกรรมเร่งปฏิกิริยา
ปฏิกิริยาชีวเคมี

ADARs เร่งปฏิกิริยาไฮโดรไลติกดีอะมิเนชันจากอะดีโนซีนเป็นอิโนซีน[ 8 ]โมเลกุลน้ำที่ถูกกระตุ้นจะทำปฏิกิริยากับอะดีโนซีนในปฏิกิริยาการแทนที่แบบนิวคลีโอฟิลิกกับหมู่เอมีนคาร์บอน-6 ตัวกลางไฮเดรตจะคงอยู่เป็นระยะเวลาสั้นๆ จากนั้นหมู่เอมีนจะหลุดออกไปในรูปของไอออนแอมโมเนีย
เว็บไซต์ที่ใช้งานอยู่

ในมนุษย์ เอนไซม์ ADAR มีโดเมนจับ dsRNA ที่ปลายอะมิโน 2-3 โดเมน (dsRBD) และโดเมนดีอะมิเนสเร่งปฏิกิริยาที่ปลายคาร์บอกซิล 1 โดเมน[ 22 ]ใน dsRBD มีโครงสร้าง α-β-β-β-α ที่อนุรักษ์ไว้[ 11 ] ADAR1 มีสองบริเวณสำหรับจับZ-DNAที่รู้จักกันในชื่อ Zα และ Zβ [ 23 ] [ 24 ] ADAR2 และ ADAR3 มี โดเมนจับ RNA สายเดี่ยว (ssRNA) ที่อุดมไปด้วยอาร์จินีน โครงสร้างผลึกของ ADAR2 ได้รับการแก้ไขแล้ว[ 22 ]ในบริเวณออกฤทธิ์ของเอนไซม์ มีกรดกลูตามิก (E396) ที่สร้างพันธะไฮโดรเจนกับน้ำฮิสติดีน (H394) และ ซิ สเทอีน 2 ตัว (C451 และ C516) ประสานงานกับไอออนสังกะสีสังกะสีทำหน้าที่กระตุ้นโมเลกุลน้ำสำหรับปฏิกิริยาไฮโดรไลซิสแบบนิวคลีโอฟิลิกเพื่อกำจัดหมู่เอมีน ภายในแกนกลางของตัวเร่งปฏิกิริยามีอิโนซิทอลเฮกซาคิสฟอสเฟต (IP6) ซึ่งช่วยทำให้ หมู่ กรดอะมิโนอาร์จินีนและไลซีนมีความเสถียร
ไดเมอไรเซชัน
ADAR1 และ ADAR2 ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าสามารถสร้างโฮโมไดเมอร์ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมได้ ในขณะที่ ADAR3 ไม่สามารถทำได้[ 11 ]การศึกษาก่อนหน้านี้ชี้ให้เห็นว่าการสร้างไดเมอร์อาจจำเป็นสำหรับกิจกรรมของเอนไซม์และอาจเกิดขึ้นได้โดยไม่ขึ้นกับการจับกับ RNA โดยอิงจากการทดลองกับ ADAR กลายพันธุ์ที่ไม่สามารถจับกับ RNA สองสาย (dsRNA) ได้ แต่ยังคงสามารถสร้างไดเมอร์ได้ ซึ่งบ่งชี้ว่าปฏิกิริยาระหว่างโปรตีนกับโปรตีนนั้นเพียงพอ[ 11 ] [ 25 ]อย่างไรก็ตาม การวิจัยล่าสุดได้ชี้แจงว่าการสร้างไดเมอร์ไม่จำเป็นอย่างเคร่งครัดสำหรับกิจกรรมของเอนไซม์ ADAR1 การศึกษาล่าสุดแสดงให้เห็นว่าการสร้างไดเมอร์ของ ADAR1 เกิดขึ้นโดยเฉพาะผ่านโดเมนการจับกับ RNA สองสายที่สาม (dsRBD3) และที่สำคัญ การสร้างไดเมอร์นี้ไม่ขึ้นกับ RNA [ 26 ]ซึ่งแสดงให้เห็นว่า ADAR1 สามารถสร้างไดเมอร์ผ่านส่วนต่อประสานระหว่างโปรตีนกับโปรตีนที่กำหนดไว้โดยไม่ต้องเกี่ยวข้องกับ RNA นอกจากนี้ การรบกวนไดเมอไรเซชันไม่ได้ทำให้กิจกรรมการแก้ไขของ ADAR1 สิ้นสุดลงโดยสมบูรณ์ แต่ส่งผลต่อประสิทธิภาพการแก้ไขที่แตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับไซต์การแก้ไขที่เลือก[ 26 ]
บทบาทในโรค
กลุ่มอาการ Aicardi–Goutières และภาวะเนื้อเยื่อสมองส่วน striatal ตาย/กล้ามเนื้อบิดตัวผิดปกติทั้งสองข้าง
ADAR1 เป็นหนึ่งในยีนหลายตัวที่มักมีส่วนทำให้เกิดโรค Aicardi–Goutièresเมื่อเกิดการกลายพันธุ์[ 27 ]โรค Aicardi–Goutièresเป็นโรคอักเสบทางพันธุกรรมที่ส่งผลกระทบต่อผิวหนังและสมองเป็นหลัก และมีลักษณะเฉพาะคือมีระดับ IFN-α ในน้ำไขสันหลังสูง[ 28 ]การอักเสบเกิดจากการกระตุ้นยีนที่เหนี่ยวนำให้เกิดอินเตอร์เฟรอนอย่างไม่ถูกต้อง เช่น ยีนที่ถูกกระตุ้นเพื่อต่อสู้กับการติดเชื้อไวรัส การกลายพันธุ์และการสูญเสียการทำงานของ ADAR1 ป้องกันการทำให้ RNA สายคู่ (dsRNA) ไม่เสถียร[ 29 ]การสะสมของ dsRNA นี้กระตุ้นการผลิต IFN โดยไม่มีการติดเชื้อไวรัส ทำให้เกิดปฏิกิริยาการอักเสบและการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน[ 30 ]ฟีโนไทป์ในหนูน็อคเอาท์ได้รับการแก้ไขโดย ADAR1 รูปแบบ p150 ที่มีโดเมน Zα ซึ่งจับกับโครงสร้างเกลียวคู่แบบซ้ายมือที่พบใน Z-DNA และ Z-RNA โดยเฉพาะ แต่ไม่ใช่โดยไอโซฟอร์ม p110 ที่ขาดโดเมนนี้[ 31 ]ในมนุษย์ การกลายพันธุ์ P193A ในโดเมน Zα เป็นสาเหตุของกลุ่มอาการ Aicardi–Goutières [ 27 ]และสำหรับฟีโนไทป์ที่รุนแรงกว่าที่พบใน Bilateral Striatal Necrosis/Dystonia [ 32 ]ผลการวิจัยนี้สร้างบทบาททางชีววิทยาสำหรับโครงสร้าง Z-DNA แบบซ้ายมือ[ 33 ]
โรคกล้ามเนื้ออ่อนแรงเอแอลเอส (ALS)
ในเซลล์ประสาทสั่งการ ตัวบ่งชี้ที่น่าเชื่อถือที่สุดของโรคกล้ามเนื้ออ่อนแรง (ALS) คือโปรตีนที่จับกับ DNA ของ TAR (TDP-43)เมื่อการแก้ไข RNA ล้มเหลวเนื่องจากการลดระดับของ TDP-43 เซลล์ประสาทสั่งการที่ปราศจากเอนไซม์ ADAR2 จะแสดงออกอย่างไม่ได้รับการควบคุม ส่งผลให้ช่อง Ca 2+ ซึมผ่านได้ผิดปกติ หนูที่ขาด ADAR2 แสดงอาการคล้ายกับฟีโนไทป์ของ ALS นักวิจัยในปัจจุบันกำลังพัฒนาการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมายระดับโมเลกุลโดยการทำให้การแสดงออกของ ADAR2 เป็นปกติ[ 34 ]
มะเร็ง
การแก้ไข RNA แบบ A-to-I ที่เกิดจาก (ADAR) อาจก่อให้เกิด การกลายพันธุ์ ของกรดอะมิโนที่ เป็นอันตราย การแก้ไข mRNA โดยทั่วไปจะทำให้ เกิด การกลายพันธุ์แบบ missenseซึ่งนำไปสู่การเปลี่ยนแปลงในบริเวณเริ่มต้นและสิ้นสุดของการแปล อย่างไรก็ตาม การเปลี่ยนแปลงกรดอะมิโนที่สำคัญอาจเกิดขึ้น ส่งผลให้การทำงานของกระบวนการต่างๆ ในเซลล์เปลี่ยนแปลงไป การเปลี่ยนแปลงกรดอะมิโนอาจส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของโปรตีนในโครงสร้างทุติยภูมิ ตติยภูมิ และจตุรภูมิ นักวิจัยสังเกตเห็นการแก้ไข A-to-I ที่เป็นมะเร็งในระดับสูงในสารตั้งต้น RNA แบบวงกลม ซึ่งยืนยันความสัมพันธ์ของ ADAR กับมะเร็งโดยตรง[ 19 ]รายชื่อไซต์การแก้ไข RNA ที่เกี่ยวข้องกับเนื้องอกสามารถพบได้ที่นี่[ 35 ]
มะเร็งเซลล์ตับ
การศึกษาในผู้ป่วยมะเร็งตับ (HCC) แสดงให้เห็นแนวโน้มของการเพิ่มขึ้นของ ADAR1 และการลดลงของ ADAR2 ผลลัพธ์ชี้ให้เห็นว่าการควบคุมที่ไม่สม่ำเสมอเป็นสาเหตุของรูปแบบการแก้ไข A เป็น I ที่ผิดปกติที่พบใน HCC และ ADAR1 ทำหน้าที่เป็นยีนก่อมะเร็งในบริบทนี้ ในขณะที่ ADAR2 มีฤทธิ์ยับยั้งเนื้องอก[ 36 ]ความไม่สมดุลในการแสดงออกของ ADAR อาจเปลี่ยนแปลงความถี่ของการเปลี่ยน A เป็น I ในบริเวณการเข้ารหัสโปรตีนของยีน ส่งผลให้เกิดโปรตีนกลายพันธุ์ซึ่งเป็นสาเหตุของโรค การควบคุมที่ผิดปกติของ ADAR1 และ ADAR2 สามารถใช้เป็นเครื่องหมายพยากรณ์โรคได้
มะเร็งผิวหนัง
การศึกษาต่างๆ ชี้ให้เห็นว่าการสูญเสีย ADAR1 มีส่วนทำให้เกิดการเจริญเติบโตและการแพร่กระจายของมะเร็งผิวหนัง เอนไซม์ ADAR สามารถออกฤทธิ์ต่อไมโครอาร์เอ็นเอและส่งผลต่อการสร้าง การคงตัว และ/หรือเป้าหมายการจับของมัน[ 37 ] ADAR1 อาจถูกควบคุมโดยโปรตีนที่จับกับองค์ประกอบตอบสนอง cAMP (CREB) ซึ่งจำกัดความสามารถในการออกฤทธิ์ต่อไมโครอาร์เอ็นเอ[ 38 ]ตัวอย่างหนึ่งคือ miR-455-5p ซึ่งได้รับการแก้ไขโดย ADAR1 เมื่อ ADAR ถูกควบคุมโดย CREB miR-455-5p ที่ไม่ได้รับการแก้ไขจะควบคุมโปรตีนยับยั้งเนื้องอกที่เรียกว่า CPEB1 ซึ่งมีส่วนทำให้เกิดความก้าวหน้าของมะเร็งผิวหนังในแบบจำลองในร่างกาย
โรค Dyschromatosis symmetrica hereditaria (DSH1)
การกลายพันธุ์ Gly1007Arg ใน ADAR1 รวมถึงเวอร์ชันที่ถูกตัดทอนอื่นๆ ได้รับการระบุว่าเป็นสาเหตุในบางกรณีของ DSH1 [ 39 ]โรคนี้มีลักษณะเฉพาะคือมีเม็ดสีมากเกินไปที่มือและเท้า และสามารถเกิดขึ้นได้ในครอบครัวชาวญี่ปุ่นและชาวจีน
เอชไอวี
ระดับการแสดงออกของโปรตีน ADAR1 พบว่าเพิ่มสูงขึ้นในระหว่าง การติดเชื้อ HIVและมีการเสนอแนะว่าโปรตีนนี้มีหน้าที่ทำให้เกิดการกลายพันธุ์ A เป็น G ในจีโนมของ HIV ซึ่งยับยั้งการจำลองแบบ[ 40 ]การกลายพันธุ์ในจีโนมของ HIV โดย ADAR1 อาจนำไปสู่การกลายพันธุ์ของไวรัสที่เป็นประโยชน์ในบางกรณี ซึ่งอาจมีส่วนช่วยในการต้านทานยา
กิจกรรมของไวรัส
ยาต้านไวรัส
ADAR1 เป็นโปรตีนที่ถูกเหนี่ยวนำโดยอินเตอร์เฟรอน ( IFN ) (โปรตีนที่เซลล์ปล่อยออกมาเพื่อตอบสนองต่อเชื้อโรคหรือไวรัส) ซึ่งสามารถช่วยในเส้นทางภูมิคุ้มกันของเซลล์ได้ หลักฐานแสดงให้เห็นถึงการกำจัดรีพลิคอนของHCV , Lymphocytic choriomeningitis LCMVและโพลีโอไวรัส[ 41 ] [ 42 ]
โปรไวรัล
ADAR1 เป็นโปรไวรัสในสถานการณ์อื่นๆ การแก้ไข A เป็น I ของ ADAR1 พบได้ในไวรัสหลายชนิด รวมถึงไวรัสโรคหัด[ 43 ] [ 42 ] [ 44 ]ไวรัสไข้หวัดใหญ่[ 45 ]ไวรัส lymphocytic choriomeningitis [ 46 ]ไวรัส polyomavirus [ 47 ]ไวรัสตับอักเสบเดลต้า[ 48 ]และไวรัสตับอักเสบซี[ 49 ]แม้ว่า ADAR1 จะพบในไวรัสอื่นๆ แต่ก็มีการศึกษาอย่างกว้างขวางในไวรัสเพียงไม่กี่ชนิดเท่านั้น การวิจัยเกี่ยวกับไวรัสโรคหัดแสดงให้เห็นว่า ADAR1 ช่วยเพิ่มการจำลองแบบของไวรัสผ่านกลไกสองแบบที่แตกต่างกัน ได้แก่ การแก้ไข RNA และการยับยั้งโปรตีนไคเนสที่กระตุ้นด้วย dsRNA ( PKR ) [ 41 ] [ 42 ]โดยเฉพาะอย่างยิ่ง เชื่อกันว่าไวรัสใช้ ADAR1 เป็นปัจจัยการจำลองแบบเชิงบวกโดยการยับยั้งเส้นทางที่ขึ้นอยู่กับ dsRNA และเส้นทางต้านไวรัสอย่างเลือกสรร[ 50 ]
ดูเพิ่มเติม
อ่านเพิ่มเติม
- Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG และคณะ (1997). "โปรตีนเปลือกหุ้ม gp120 ของไวรัส HIV-1 และอนุภาคไวรัสขัดขวางการจับของอะดีโนซีนดีอะมีเนสกับ CD26 ของมนุษย์" เปปไทด์ในเซลล์ในหน้าที่และการเกิดโรคของระบบภูมิคุ้มกันความก้าวหน้าทางการแพทย์และชีววิทยาเชิงทดลอง เล่มที่ 421 หน้า 185–192 . doi : 10.1007/978-1-4757-9613-1_24 . ISBN 978-1-4757-9615-5. PMID 9330696 .
- Wathelet MG, Szpirer J, Nols CB, Clauss IM, De Wit L, Islam MQ และคณะ (กันยายน 1988). "การโคลนนิ่งและตำแหน่งโครโมโซมของยีนมนุษย์ที่ถูกเหนี่ยวนำโดยอินเตอร์เฟรอนชนิดที่ 1" Somatic Cell and Molecular Genetics . 14 (5): 415– 426. doi : 10.1007/BF01534709 . PMID 3175763 . S2CID 42406993 .
- Wang Y, Zeng Y, Murray JM, Nishikura K (พฤศจิกายน 1995). "การจัดระเบียบจีโนมและตำแหน่งโครโมโซมของยีน dsRNA adenosine deaminase ของมนุษย์: เอนไซม์สำหรับการแก้ไข RNA ของช่องไอออนที่กระตุ้นด้วยกลูตาเมต"วารสารชีววิทยาโมเลกุล 254 ( 2): 184– 195. doi : 10.1006/jmbi.1995.0610 . PMID 7490742 .
- Patterson JB, Samuel CE (ตุลาคม 1995). "การแสดงออกและการควบคุมโดยอินเตอร์เฟรอนของอะดีโนซีนดีอะมีเนสที่จำเพาะต่อ RNA สองสายจากเซลล์มนุษย์: หลักฐานสำหรับดีอะมีเนสสองรูปแบบ" . Molecular and Cellular Biology . 15 (10): 5376– 5388. doi : 10.1128/mcb.15.10.5376 . PMC 230787 . PMID 7565688 .
- Patterson JB, Thomis DC, Hans SL, Samuel CE (กรกฎาคม 1995). "กลไกการทำงานของอินเตอร์เฟรอน: อะดีโนซีนดีอะมีเนสที่จำเพาะต่อ RNA สองสายจากเซลล์มนุษย์สามารถถูกเหนี่ยวนำได้ด้วยอัลฟาและแกมมาอินเตอร์เฟรอน" . Virology . 210 (2): 508– 511. doi : 10.1006/viro.1995.1370 . PMID 7618288 .
- O'Connell MA, Krause S, Higuchi M, Hsuan JJ, Totty NF, Jenny A และคณะ (มีนาคม 1995). "การโคลน cDNA ที่เข้ารหัสเอนไซม์ adenosine deaminase ที่จำเพาะต่อ RNA สองสายของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม" . Molecular and Cellular Biology . 15 (3): 1389– 1397. doi : 10.1128/mcb.15.3.1389 . PMC 230363 . PMID 7862132 .
- Weier HU, George CX, Greulich KM, Samuel CE (พฤศจิกายน 1995). "ยีนอะดีโนซีนดีอะมีเนสเฉพาะ RNA สองสายที่เหนี่ยวนำโดยอินเตอร์เฟรอน (DSRAD) อยู่ในตำแหน่งโครโมโซมมนุษย์ 1q21.1-21.2" Genomics . 30 (2): 372– 375. doi : 10.1006/geno.1995.0034 . PMID 8586444 .
- Liu Y, George CX, Patterson JB, Samuel CE (กุมภาพันธ์ 1997). "โดเมนการจับ RNA สองสายที่แตกต่างกันในเชิงหน้าที่ซึ่งเกี่ยวข้องกับตัวแปรไซต์การตัดต่อทางเลือกของอะดีโนซีนดีอะมีเนสเฉพาะ RNA สองสายที่เหนี่ยวนำโดยอินเตอร์เฟรอน"วารสารเคมีชีวภาพ 272 ( 7): 4419– 4428. doi : 10.1074/jbc.272.7.4419 . PMID 9020165 .
- Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG และคณะ (เมษายน 1997) "การจับกันของอะดีโนซีนดีอะมีเนสกับ CD26 ของมนุษย์ถูกยับยั้งโดยไกลโคโปรตีนซองหุ้ม HIV-1 gp120 และอนุภาคไวรัส"วารสารภูมิคุ้มกันวิทยา 158 ( 8): 3721– 3729. doi : 10.4049/jimmunol.158.8.3721 . PMID 9103436 . S2CID 22609553 .
- Herbert A, Alfken J, Kim YG, Mian IS, Nishikura K, Rich A (สิงหาคม 1997). "โดเมนการจับ Z-DNA ที่มีอยู่ในเอนไซม์แก้ไขของมนุษย์ เอนไซม์อะดีโนซีนดีอะมีเนสของอาร์เอ็นเอสองสาย" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (16): 8421– 8426. Bibcode : 1997PNAS...94.8421H . doi : 10.1073/pnas.94.16.8421 . PMC 22942 . PMID 9237992 .
- Liu Y, Herbert A, Rich A, Samuel CE (กรกฎาคม 1998). "เอนไซม์อะดีโนซีนดีอะมีเนสที่จำเพาะต่ออาร์เอ็นเอสองสาย: คุณสมบัติการจับกรดนิวคลีอิก" Methods . 15 (3): 199– 205. doi : 10.1006/meth.1998.0624 . PMID 9735305 .
- George CX, Samuel CE (เมษายน 1999). "ทรานสคริปต์ของเอนไซม์อะดีโนซีนดีอะมีเนส ADAR1 ที่จำเพาะต่อ RNA ของมนุษย์มีโครงสร้างเอ็กซอน 1 ทางเลือกที่เริ่มต้นจากโปรโมเตอร์ที่แตกต่างกัน โดยโปรโมเตอร์หนึ่งทำงานอย่างต่อเนื่องและอีกโปรโมเตอร์หนึ่งถูกเหนี่ยวนำโดยอินเตอร์เฟรอน" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (8): 4621– 4626. Bibcode : 1999PNAS...96.4621G . doi : 10.1073/pnas.96.8.4621 . PMC 16382 . PMID 10200312 .
- Schwartz T, Rould MA, Lowenhaupt K, Herbert A, Rich A (มิถุนายน 1999). "โครงสร้างผลึกของโดเมน Zalpha ของเอนไซม์แก้ไข ADAR1 ของมนุษย์ที่จับกับ Z-DNA แบบมือซ้าย" Science . 284 (5421): 1841– 1845. doi : 10.1126/science.284.5421.1841 . PMID 10364558 .
- Schade M, Turner CJ, Kühne R, Schmieder P, Lowenhaupt K, Herbert A และคณะ (ตุลาคม 1999) "โครงสร้างสารละลายของโดเมน Zalpha ของเอนไซม์แก้ไข RNA ของมนุษย์ ADAR1 เผยให้เห็นพื้นผิวการจับที่จัดเตรียมไว้ล่วงหน้าสำหรับ Z-DNA" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (22): 12465– 12470. Bibcode : 1999PNAS...9612465S . doi : 10.1073/pnas.96.22.12465 . PMC 22950 . PMID 10535945 .
- Blanco J, Valenzuela A, Herrera C, Lluís C, Hovanessian AG, Franco R (กรกฎาคม 2543). "โปรตีน gp120 ของ HIV-1 ยับยั้งการจับกันของอะดีโนซีนดีอะมีเนสกับ CD26 โดยกลไกที่ถูกปรับเปลี่ยนโดยการแสดงออกของ CD4 และ CXCR4" FEBS Letters . 477 ( 1– 2): 123– 128. Bibcode : 2000FEBSL.477..123B . doi : 10.1016/S0014-5793(00)01751-8 . PMID 10899322 . S2CID 22229481 .
- Herrera C, Morimoto C, Blanco J, Mallol J, Arenzana F, Lluis C, และคณะ (มิถุนายน 2544). "การรวมตัวของ CXCR4 และ CD26 ในเซลล์เม็ดเลือดขาวของมนุษย์ " วารสารเคมีชีวภาพ . 276 (22): 19532– 19539. ดอย : 10.1074/ jbc.M004586200 PMID 11278278 .
- Wong SK, Sato S, Lazinski DW (มิถุนายน 2544). "การจดจำซับสเตรตโดย ADAR1 และ ADAR2" . RNA . 7 (6) S135583820101007X. doi : 10.1017/S135583820101007X . PMC 1370134 . PMID 11421361 .
- Eckmann CR, Neunteufl A, Pfaffstetter L, Jantsch MF (กรกฎาคม 2544). "เอนไซม์แก้ไข RNA ADAR1 ของมนุษย์ แต่ไม่ใช่ของ Xenopus มีสัญญาณระบุตำแหน่งในนิวเคลียสที่ผิดปกติและแสดงลักษณะของโปรตีนที่เคลื่อนย้ายไปมา" . Molecular Biology of the Cell . 12 (7): 1911– 1924. doi : 10.1091/mbc.12.7.1911 . PMC 55639 . PMID 11451992 .
- Yang S, Deng P, Zhu Z, Zhu J, Wang G, Zhang L และคณะ (ตุลาคม 2014). "เอนไซม์อะดีโนซีนดีอะมีเนสที่ออกฤทธิ์ต่อ RNA 1 จำกัดการตรวจจับ RNA ของ RIG-I และยับยั้งการผลิต IFN ที่ตอบสนองต่อ RNA ของไวรัสและ RNA ภายในร่างกาย"วารสารภูมิคุ้มกันวิทยา 193 ( 7): 3436– 3445. doi : 10.4049/jimmunol.1401136 . PMC 4169998 . PMID 25172485 .
ลิงก์ภายนอก
- รายการ OMIM ใน Dyschromatosis Symmetrica Hereditaria 1
- ตำแหน่งของยีน ADARในมนุษย์ใน UCSC Genome Browser
- รายละเอียดเกี่ยวกับยีน ADARของมนุษย์ใน UCSC Genome Browser
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ อาดาร์
เอนไซม์ ตระกูล อะดีโนซีนดีอะมีเนสที่จำเพาะต่อ RNA สองสาย นั้นถูกเข้ารหัสโดย ยีน ตระกูล ADAR [ 5 ] ADAR ย่อมาจาก adenosine deaminase acting on RNA [ 6 ] [ 7 ]...
การค้นพบ
เอนไซม์ ADAR และ ยีน ที่เกี่ยวข้อง ถูกค้นพบโดยบังเอิญในปี 1987 อันเป็นผลมาจากการวิจัยของ Brenda Bass และ Harold Weintraub [ 14 ] นัก วิจัยเหล่านี้ใช้ การยับยั้ง RNA แบบแอนติเซนส์ เพื่อกำหนดว่ายีนใดมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาตัวอ่อนของ Xenopus laevis...
วิวัฒนาการและหน้าที่
ADAR เป็นหนึ่งในรูปแบบการแก้ไข RNA ที่พบได้บ่อยที่สุด และมีทั้งกิจกรรมแบบเลือกและไม่เลือก [ 16 ] ADAR สามารถปรับเปลี่ยนและควบคุมผลลัพธ์ของผลิตภัณฑ์ยีนได้ เนื่องจาก เซลล์ ตีความอิโนซีน ว่าเป็น กัวโนซีน ADAR สามารถเปลี่ยนการทำงานของโมเลกุล RNA ขนาดเล็กได้...
รูปแบบของเอนไซม์ ADAR
ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม มีเอนไซม์ ADAR สามประเภท ได้แก่ ADAR (ADAR1), ADARB1 (ADAR2) และ ADARB2 (ADAR3) [ 5 ]