อาร์มาดิลโล ซ้ำ
ลำดับ กรดอะมิ โน ซ้ำแบบ อาร์มาดิลโลเป็นลักษณะเฉพาะที่มีความยาวประมาณ 42 หน่วยซึ่งพบได้ในโปรตีนหลายชนิด โปรตีนที่มีลำดับกรดอะมิโนซ้ำแบบอาร์มาดิลโลมักจะมีสำเนาที่ซ้ำกันหลายชุดเรียงต่อกัน[ 2 ] [ 3 ]ลำดับกรดอะมิโนซ้ำแบบอาร์มาดิลโลแต่ละชุดประกอบด้วยเกลียวอัลฟาคู่หนึ่งที่สร้างโครงสร้างแบบกิ๊บหนีบผม สำเนาหลายชุดของลำดับซ้ำนี้ก่อให้เกิดโครงสร้างที่เรียกว่าโครงสร้างอัลฟาโซลีนอยด์
ตัวอย่างของโปรตีนที่มี armadillo repeat ได้แก่β-catenin , Sarm1 ( SARM1 ), [ 4 ] α-importin , [ 5 ] plakoglobin , [ 6 ] adenomatous polyposis coli (APC), [ 7 ]และอื่นๆ อีกมากมาย
คำว่า armadillo มาจากชื่อทางประวัติศาสตร์ของ ยีน β-cateninในแมลงวันผลไม้Drosophilaซึ่งเป็นที่ที่ค้นพบ armadillo repeat เป็นครั้งแรก แม้ว่า ก่อนหน้านี้เชื่อกันว่า β-cateninเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการเชื่อมโยงโปรตีนยึดเกาะเซลล์cadherin กับ โครงสร้างเซลล์แต่ผลงานวิจัยล่าสุดระบุว่าβ-cateninควบคุมการเกิด homodimerization ของ alpha-catenin ซึ่งในทางกลับกันจะควบคุมการแตกแขนงและการรวมกลุ่ม ของ แอคติ น [ 8 ]แต่ armadillo repeat พบได้ในโปรตีนหลากหลายชนิดที่มีหน้าที่อื่นๆ โดเมนโปรตีนประเภทนี้มีความสำคัญในการส่งสัญญาณ WNTในระหว่างการพัฒนาของตัวอ่อน
โครงสร้าง
โครงสร้าง พับสามมิติของหน่วยซ้ำอาร์มาดิลโลถูกสังเกตครั้งแรกในโครงสร้างผลึกของβ-catenin โดยที่ หน่วยซ้ำ 12 หน่วยเรียงต่อกัน ก่อตัวเป็นซูเปอร์เฮลิกซ์ของอัลฟาเฮลิกซ์ที่มีสามเฮลิกซ์ต่อหน่วย[ 1 ]โครงสร้างทรงกระบอกมีร่องที่มีประจุบวก ซึ่งคาดว่าจะทำปฏิกิริยากับพื้นผิวที่เป็นกรดของพันธมิตรที่ทราบกันดีของβ- catenin [ 9 ]
ลิงก์ภายนอก
- แหล่งข้อมูลโมทีฟเชิงเส้นของยูคาริโอต คลาสโมทีฟTRG_NLS_Bipartite_1
- แหล่งข้อมูลลวดลายเชิงเส้นของยูคาริโอตคลาสลวดลายTRG_NLS_MonoCore_2
- แหล่งข้อมูลโมทีฟเชิงเส้นของยูคาริโอต คลาสโมทีฟTRG_NLS_MonoExtC_3
- แหล่งข้อมูลโมทีฟเชิงเส้นของยูคาริโอต คลาสโมทีฟTRG_NLS_MonoExtN_4
- Armadillo+Domain+Proteins ที่ หัวข้อทางการแพทย์(MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
- Armadillo/plakoglobin ARM ทำซ้ำในPROSITE