เบตาโคโรนาไวรัส
| เบตาโคโรนาไวรัส | |
|---|---|
| ภาพถ่ายอิเล็กตรอนไมโครสโคปของอนุภาคไวรัสไวรัสโคโรนาในหนู (MHV) โครงสร้างแผนผัง และจีโนม | |
| การจำแนกประเภทไวรัส | |
| (ไม่จัดอันดับ): | ไวรัส |
| อาณาจักร: | ไรโบวิเรีย |
| อาณาจักร: | ออร์ธอร์นาไวเร |
| ไฟลัม: | พิสุวิริโคตา |
| ระดับ: | พิโซนิวิริเซเตส |
| คำสั่ง: | นิโดไวรัลส์ |
| ตระกูล: | ไวรัสโคโรนา |
| อนุวงศ์: | ออร์โธโคโรนาไวรีนา |
| ประเภท: | เบตาโคโรนาไวรัส |
| สกุลย่อยและชนิด | |
เบตาโคโรนาไวรัส (β-CoVs หรือ Beta-CoVs) เป็นหนึ่งในสี่สกุล (อัลฟา -,เบตา- ,แกมมา - และเดลตา- ) ของโคโรนาไวรัส ไวรัสในกลุ่มนี้เป็นไวรัส RNA สายบวกที่ มีเปลือก หุ้มซึ่งติดเชื้อในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมรวมถึงมนุษย์แหล่งที่อยู่ตามธรรมชาติของเบตาโคโรนาไวรัสคือค้างคาวและหนู หนูเป็นแหล่งที่อยู่ของสกุลย่อย Embecovirusในขณะที่ค้างคาวเป็นแหล่งที่อยู่ของสกุลย่อยอื่นๆ [ 1 ]
สกุลของไวรัสโคโรนาแต่ละสกุลประกอบด้วยสายพันธุ์ไวรัสที่แตกต่างกัน โดยสกุลเบตาโคโรนาไวรัสประกอบด้วยสายพันธุ์ดังกล่าวสี่สายพันธุ์ ได้แก่ A, B, C และ D ในเอกสารเก่า สกุลนี้ยังเป็นที่รู้จักในชื่อ "ไวรัสโคโรนากลุ่ม 2" สกุลนี้อยู่ในวงศ์ย่อยOrthocoronavirinae ในวงศ์CoronaviridaeอันดับNidovirales
เบตาโคโรนาไวรัสที่มีความสำคัญทางคลินิกมากที่สุดเกี่ยวกับมนุษย์ ได้แก่OC43และHKU1 (ซึ่งสามารถทำให้เกิดโรคหวัดธรรมดา ได้ ) ของสายพันธุ์ A, SARS-CoV-1และSARS-CoV-2 (สาเหตุของSARSและCOVID-19ตามลำดับ) ของสายพันธุ์ B [ 2 ]และMERS-CoV (สาเหตุของMERS ) ของสายพันธุ์ C MERS-CoV เป็นเบตาโคโรนาไวรัสตัวแรกที่อยู่ในสายพันธุ์ C ที่ทราบว่าสามารถติดเชื้อในมนุษย์ได้[ 3 ] [ 4 ]
นิรุกติศาสตร์
ชื่อ "เบตาโคโรนาไวรัส" มาจากภาษากรีกโบราณ βῆτα ( bē̂ta , " อักษร ตัวที่สอง ของอักษรกรีก ") และ κορώνη (korṓnē, "พวงมาลัย, พวงหรีด") ซึ่งหมายถึงมงกุฎ ซึ่งอธิบายลักษณะของส่วนที่ยื่นออกมาบนพื้นผิวที่เห็นภายใต้กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนซึ่งมีลักษณะคล้ายโคโรนาของดวงอาทิตย์สัณฐานวิทยานี้เกิดจากโปรตีนสไป ค์ (S) ของไวรัส ซึ่งเป็นโปรตีนที่กระจายอยู่บนพื้นผิวของไวรัสและกำหนดความชอบของโฮสต์อันดับNidoviralesตั้งชื่อตามภาษาละตินnidus ซึ่งหมายถึง 'รัง' หมายถึงการสร้างชุด mRNA ย่อยจีโนมแบบซ้อนกันที่ปลาย 3′ ร่วมกันของอันดับนี้ในระหว่างการติดเชื้อ[ 5 ]
โครงสร้าง

โครงสร้างของโปรตีนหนามหลายโครงสร้างได้รับการแก้ไขแล้ว โดเมนการจับกับตัวรับในโปรตีนหนามของอัลฟาและเบตาโคโรนาไวรัสได้รับการจัดทำเป็นแคตตาล็อกในInterPro : IPR018548 [ 6 ]โปรตีนหนามซึ่งเป็นเครื่องฟิวชั่นประเภท 1 จะประกอบกันเป็นไตรเมอร์ ( PDB : 3jcl , 6acg ) ; โครงสร้างแกนกลางของมันคล้ายกับโปรตีน F (ฟิวชั่น) ของ พาราไมโซไวรัส[ 7 ]การใช้ตัวรับไม่ได้รับการอนุรักษ์ไว้มากนัก ตัวอย่างเช่น ในกลุ่มSarbecovirusมีเพียงสายพันธุ์ย่อยที่มี SARS เท่านั้นที่ใช้ตัวรับACE2 ร่วมกัน
ไวรัสในสกุลย่อยEmbecovirusแตกต่างจากไวรัสอื่นๆ ในสกุลเดียวกันตรงที่มี โปรตีนคล้ายหนามที่สั้นกว่า (8 นาโนเมตร) เพิ่มเติมที่เรียกว่าhemagglutinin esterase (HE) ( P15776 ) เชื่อกันว่าได้รับมาจากไวรัสไข้หวัดใหญ่ C [ 5 ] [ 8 ]
จีโนม

ไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่มี ขนาด จีโนม ใหญ่ ตั้งแต่ 26 ถึง 32 กิโลเบส โครงสร้างโดยรวมของจีโนม β-CoV คล้ายกับไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่สายพันธุ์อื่นๆ โดยมี โพลีโปรตีนรีพลิเคส ORF1ab ( rep , pp1ab ) อยู่หน้าองค์ประกอบอื่นๆ โพลีโปรตีนนี้จะถูกตัดแบ่งออกเป็นโปรตีนที่ไม่ใช่โครงสร้าง 16 ชนิด (ดูคำอธิบายประกอบ UniProt ของ SARS rep , P0C6X7 )
ณ เดือนพฤษภาคม 2013 GenBankมีจีโนมที่สมบูรณ์ที่เผยแพร่แล้ว 46 ชุดของ α- (กลุ่ม 1), β- (กลุ่ม 2), γ- (กลุ่ม 3) และ δ- (กลุ่ม 4) CoV [ 9 ]
การรวมตัวใหม่
การรวมตัวทางพันธุกรรม สามารถเกิดขึ้นได้เมื่อมี จีโนมไวรัสสองตัวขึ้นไปอยู่ในเซลล์โฮสต์เดียวกันไวรัสโคโรนาเบต้า HKU23 ของ อูฐดรอเมดารี แสดงให้เห็นถึงความหลากหลายทางพันธุกรรมในประชากรอูฐแอฟริกา [ 10 ] ความหลากหลายนี้เกิดจากเหตุการณ์การรวมตัวทางพันธุกรรมหลายครั้งที่เกิดขึ้นในอดีตระหว่างเบตาโคโรนาไวรัสที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดในสกุลย่อยEmbecovirus [ 10 ] นอกจากนี้ เบตาโคโรนาไวรัสSARS-CoV ของมนุษย์ ดูเหมือนจะมีประวัติการ รวมตัว ทางพันธุกรรมที่ ซับซ้อนระหว่าง โคโรนาไวรัสบรรพบุรุษที่อาศัยอยู่ในกลุ่มสัตว์ที่แตกต่างกันหลายกลุ่ม[ 11 ] [ 12 ]
กลไกการเกิดโรค

อัลฟาและเบตาโคโรนาไวรัสส่วนใหญ่ติดเชื้อในค้างคาว แต่ก็ติดเชื้อในสัตว์ชนิดอื่น เช่นมนุษย์อูฐและสัตว์ฟันแทะได้ เช่น กัน[ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]เบตาโคโรนาไวรัสที่ก่อให้เกิดโรคระบาดในมนุษย์โดยทั่วไปจะทำให้เกิดไข้และอาการทางระบบทางเดินหายใจ ซึ่งรวมถึง:
- ไวรัส SARS-CoVซึ่งเป็นสาเหตุของโรคซาร์ส
- ไวรัส MERS-CoVซึ่งเป็นสาเหตุของโรคMERS
- SARS-CoV-2ทำให้เกิดโรคโควิด-19
การจำแนกประเภท

ภายในสกุลBetacoronavirus (Group 2 CoV) มีการจำแนกออกเป็น 4 สกุลย่อยหรือสายพันธุ์ (A, B, C และ D) ตามธรรมเนียม[ 5 ]สายพันธุ์ทั้ง 4 นี้ได้รับการตั้งชื่อโดยใช้อักษรกรีกหรือตัวเลข[ 9 ]สกุลย่อยที่ 5 คือHibecovirusได้ถูกเพิ่มเข้ามาเมื่อไม่นานมานี้[ 16 ]สกุลย่อยและสายพันธุ์ที่เป็นสมาชิก ได้แก่: [ 17 ] [ 18 ]
- สกุลย่อยEmbecovirus (สายพันธุ์ A)
- เบตาโคโรนาไวรัส เกรฟดินิส , โคโรนาไวรัสของมนุษย์ OC43 , โคโรนาไวรัสของวัว
- เบตาโคโรนาไวรัสฮ่องกง , โคโรนาไวรัสของมนุษย์ HKU1
- Betacoronavirus muris , ไวรัสตับอักเสบ Murine
- Betacoronavirus myodae , Myodes rufocanus vole โคโรนาไวรัส 2/JL2014
- เบตาโคโรนาไวรัสรัตติ , เบตาโคโรนาไวรัส HKU24
- สกุลย่อยHibecovirus
- Betacoronavirus hipposideri , Bat Hp-betacoronavirus/Zhejiang2013
- สกุลย่อยMerbecovirus (สายพันธุ์ C)
- ไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ เบตาคาเมลีหรือไวรัสโคโรนาที่เกี่ยวข้องกับโรคทางเดินหายใจตะวันออกกลาง (MERS-CoV)
- เบตาโคโรนาไวรัส อีรินาซี , โคโรนาไวรัสเฮดจ์ฮ็อก 1
- Betacoronavirus pipistrelli , Pipistrellus ค้างคาวโคโรนาไวรัส HKU5
- เบตาโคโรนาไวรัส ไทโลไนคเทอริดิส , ไทโลไนคเทอริส แบท โคโรนาไวรัส HKU4
- สกุลย่อยโนเบโคไวรัส (สายพันธุ์ D)
- เบตาโคโรนาไวรัสโคโรเรียมรูเซตตัส ค้างคาวโคโรนาไวรัส GCCDC1
- ไวรัสโคโรนาเบตาอีโดลี , ไวรัสโคโรนาค้างคาวอีโดลอนเฮลวัม CMR704-P12
- เบตาโคโรนาไวรัส รูเซตติ , โคโรนาไวรัสค้างคาวรูเซตตัส HKU9
- สกุลย่อยSarbecovirus (สายพันธุ์ B)
ดูเพิ่มเติม
ลิงก์ภายนอก
- ไวรัสโคโรน่า
- ไวรัลโซน : เบตาโคโรนาไวรัส
- ฐานข้อมูลและแหล่งวิเคราะห์เชื้อไวรัส (ViPR): ไวรัสโคโรนา