Bug Fablesดำเนินเรื่องในดินแดนบูกาเรีย ซึ่งอยู่ภายในสนามหลังบ้านร้างหลังหนึ่ง ที่นี่เป็นที่อยู่อาศัยของแมลงที่มีสติปัญญาหลากหลายชนิด ซึ่งได้รับการยกระดับขึ้นโดยพลังลึกลับหลังจากการหายสาบสูญของมนุษย์ในภัยพิบัติที่ไม่ระบุสาเหตุ แมลงชนิดอื่นๆ ไม่ได้รับผลกระทบจากพลังนั้นและยังคงมีพฤติกรรมดุร้าย บูกาเรียแบ่งออกเป็นหลายอาณาจักร ได้แก่ มดอยู่ตรงกลาง ผึ้งอยู่ทางทิศตะวันตก ปลวกอยู่ทางทิศใต้ และตัวต่ออยู่ทางทิศเหนือ ดินแดนแห่งนี้ยังมีลักษณะเด่น เช่น ทะเลทรายอันกว้างใหญ่ ซึ่งจริงๆ แล้วเป็นสนามทราย เก่า และทะเลสาบที่เกิดจากท่อรั่ว บูกาเรียเป็นที่หลบภัยที่หายากเนื่องจากอิทธิพลของผลึกวิเศษ และถึงแม้จะมีดินแดนอื่นๆ อยู่ทางทิศเหนือและทิศตะวันออก แต่ก็ตกอยู่ภายใต้การคุกคามของสัตว์ร้ายขนาดยักษ์ที่ไม่รู้จัก

ดินแดนแห่งนี้ยังเป็นที่ตั้งของโบราณวัตถุและซากปรักหักพังแปลก ๆ ที่หลงเหลืออยู่จากกลุ่มแมลงกลุ่มแรกที่ได้รับสติปัญญา นั่นก็คือ แมลงสาบ หนึ่งในโบราณวัตถุในตำนานเหล่านั้นคือ ต้นกล้าอมตะ ซึ่งกล่าวกันว่าจะมอบชีวิตอมตะให้แก่แมลง ต้นกล้านี้ถูกซ่อนไว้โดยแมลงสาบ แต่เป็นที่รู้กันว่ามีสิ่งประดิษฐ์บางอย่างที่สามารถใช้เพื่อปลดล็อกมันได้ ในอดีตที่ผ่านมาไม่นานนี้ ราชินีเอลิซานต์ที่ 1 ได้เดินทางมาจากดินแดนอันห่างไกล ก่อตั้งอาณาจักรมด และค้นหาต้นกล้าอมตะจนกระทั่งทรงยอมให้ตนเองอยู่ในสภาวะหยุดนิ่งทางเวทมนตร์ หลังจากนั้น พระธิดาของพระองค์ ราชินีเอลิซานต์ที่ 2 ได้ขึ้นครองราชย์และก่อตั้งสมาคมนักสำรวจเพื่อระดมทุนสำหรับการสำรวจเพื่อค้นหาสิ่งประดิษฐ์เหล่านี้เพื่อเป็นวิธีการกู้คืนต้นกล้าอมตะ

เกม Bug Fablesมีตัวละครหลักที่เล่นได้สามตัว ได้แก่ Vi, Kabbu และ Leif Vi เป็นผึ้งสาวตัวเล็กและรักอิสระมากเมื่อเทียบกับผึ้งตัวอื่นๆ ภายนอกดูโลภและไม่ค่อยโต แต่จริงๆ แล้วจิตใจดี เธออ้างว่าถูกขับไล่ออกจากรัง แต่ความจริงแล้วเธอหนีออกจากบ้านหลังจากถูกพี่สาวกล่าวหาว่าเป็นคนอ่อนแอ Kabbu เป็นด้วงนักรบผู้กล้าหาญที่เดินทางมาจากทางเหนือ เขารู้สึกผิด อย่างมาก ที่ไม่สามารถช่วยเพื่อนร่วมทางจากแมลงดุร้ายตัวมหึมาได้ระหว่างการเดินทาง ส่วน Leif ซึ่งอีกสองตัวพบขณะสำรวจถ้ำ Snakemouth Den เป็นผีเสื้อกลางคืนนักสำรวจที่มีรูปร่างเหมือนศพที่ดูเหมือนจะตายไปแล้วเมื่อร้อยปีก่อน และสามารถใช้เวทมนตร์น้ำแข็งอันทรงพลังได้ เขาเป็นคนเคร่งขรึม เป็นผู้ใหญ่ และมีไหวพริบคมคาย แสดงอารมณ์น้อย ต่อมา ลีฟค้นพบว่าแท้จริงแล้วเขาคือเห็ดถั่งเช่า สายพันธุ์ขั้นสูง ที่พวกแมลงสาบสร้างขึ้นเพื่อเป็นส่วนหนึ่งของการทดลองความเป็นอมตะ เขาได้รับสืบทอดความทรงจำของลีฟคนเดิม แต่เขากลับพบความหมายในการสานต่อเจตนารมณ์ของลีฟ ตัวละครที่เล่นได้อีกตัวหนึ่งคือพืชกินเนื้อ ขนาดเล็กที่ผู้เล่นตั้งชื่อได้ (ชื่อเริ่มต้นคือชอมปี้) ซึ่งสามารถปลดล็อกเพื่อช่วยเหลือทีมในการต่อสู้ และ จะติดตามทีมไปโดยไม่คิดอะไรเพราะการฝังใจ

ราชินีเอลิซานต์ที่ 2 เป็นตัวละครสนับสนุน หลัก แม้ว่าแรงจูงใจของเธอในตอนแรกอาจดูน่าสงสัย แต่แท้จริงแล้วการตามหาต้นกล้าของเธอนั้นเกิดจากความไม่มั่นคงในฐานะผู้ปกครองและความปรารถนาที่จะฟื้นคืนชีพมารดาของเธอ ตัวร้ายที่แท้จริงของเกมคือราชาแตน โฮแอกซ์ - แมลงที่เคยยากจนซึ่งบังเอิญไปพบมงกุฎแมลงสาบโบราณที่มีความสามารถในการควบคุมแตนและควบคุมไฟ และเต็มใจที่จะสังเวยทุกคนในการตามหาต้นกล้าอย่างไม่ลดละเพื่อมอบพลังอำนาจอันไร้ขีดจำกัดให้แก่ตนเอง

เกมเริ่มต้นด้วยตัวละคร Kabbu และ Vi เดินทางมาถึงสมาคม พวกเขารวมตัวกันเป็นทีมสำรวจเพื่อบรรลุเป้าหมายร่วมกันในการสำรวจถ้ำปากงู ระหว่างทาง พวกเขาพบผีเสื้อกลางคืนตัวหนึ่งที่ติดอยู่ในใยแมงมุม ช่วยมันออกมา และหนีรอดจากแมงมุมมาได้อย่างหวุดหวิด ผีเสื้อกลางคืนตัวนั้นชื่อ Leif ได้เรียนรู้ความสามารถใหม่ในการใช้เวทมนตร์น้ำแข็งและภาษาแมลงสาบ และเข้าร่วมกับทั้งสองในฐานะนักรบ ในตอนท้ายของถ้ำปากงู ทีมพบสิ่งประดิษฐ์โบราณชิ้นหนึ่ง แต่การนำมันไปทำให้กับดักทำงาน น้ำท่วมห้อง และพวกเขาก็ถูกแมงมุมโจมตีอีกครั้ง

หลังจากปราบแมงมุมได้แล้ว กลุ่มของพวกเขาก็ถูกกระแสน้ำพัดกระหน่ำ แต่ก็ถูกพัดพาไปใกล้กับอาณาจักรมด ทั้งสามคนได้รับฉายาอย่างเป็นทางการว่า ทีมสเนคเมาท์ และเริ่มออกค้นหาวัตถุโบราณที่เหลืออยู่ พร้อมกับค้นหาคำตอบเกี่ยวกับอดีตและพลังเวทมนตร์ของลีฟ พวกเขารวบรวมวัตถุโบราณได้หลายชิ้น แต่อาณาจักรแตนกลับยิ่งก้าวร้าวมากขึ้น จนกระทั่งพวกเขารุกรานอาณาจักรมดเพื่อตามหาวัตถุโบราณเหล่านั้น ราชาแตนผู้แย่งชิงบัลลังก์ถูกขับไล่ออกไปอย่างหวุดหวิด และทีมสเนคเมาท์ก็ปฏิบัติภารกิจลับเพื่อเผชิญหน้ากับราชา แต่แผนการนี้ถูกเปิดเผยว่าเป็นแผนล่อลวง และราชาแตนก็บุกรังมดเป็นครั้งที่สอง ยึดเอาวัตถุโบราณไปเป็นของตนเอง

เอลิแซนท์ที่ 2 เปิดเผยว่าเธอตามหาต้นกล้าเพื่อปลดปล่อยมารดาของเธอจากการหลับใหลชั่วนิรันดร์และสถาปนาเธอขึ้นครองบัลลังก์ตลอดไป โดยเชื่อว่าตนเองเป็นผู้ปกครองที่ด้อยกว่า เธอและทีมสเนคเมาท์เดินทางไปยังเมืองเทอร์ไมท์เพื่อขอความช่วยเหลือจากเผ่าพันธุ์ที่ก้าวหน้ากว่า เมื่อประทับใจในทักษะการต่อสู้ของทีม เทอร์ไมท์จึงมอบเรือดำน้ำให้พวกเขา ทำให้พวกเขาสามารถโจมตีคุกยาง ซึ่งเป็นสถานที่ที่พวกต่อยึดครองไว้เป็นฐานในการเข้าสู่ถ้ำยักษ์ บ้านที่ถูกปิดตายซึ่งอยู่ใกล้กับบูกาเรีย ทีมสเนคเมาท์ยึดคุกคืนได้ แต่ก็สายเกินไปที่จะหยุดยั้งราชาต่อจากการเข้าไปในบ้าน ราชินีที่แท้จริงของพวกต่อมอบวัตถุศักดิ์สิทธิ์ที่สามารถเบี่ยงเบนเปลวไฟเวทมนตร์ของราชาให้กับทีม

ทีมได้เข้าไปในถ้ำยักษ์ที่ไร้ชีวิต ต่อสู้กับสิ่งมีชีวิตแปลกประหลาดที่เรียกว่า เดดแลนเดอร์ พวกเขาค้นพบเผ่าแมลงสาบที่รอดชีวิตซึ่งเฝ้ารักษาต้นกล้าอยู่ แต่ก็พ่ายแพ้ให้กับราชาแตนอย่างง่ายดาย เอลิซานท์เปลี่ยนใจเกี่ยวกับต้นกล้า และสั่งให้ทำลายมัน ทีมสเนคเมาท์ตามทันราชาแตนที่ต้นกล้า แต่ไม่สามารถหยุดเขาจากการทำลายมันได้ อย่างไรก็ตาม ต้นกล้าเหี่ยวเฉาลงหลังจากขาดแสงแดดมานานหลายศตวรรษ หลังจากกินผลไม้ลูกสุดท้ายที่เหลืออยู่ ราชาแตนก็กลายเป็นราชาอมตะ ได้รับพลังมหาศาลและเผาต้นกล้าจนราบเป็นหน้าดิน หลังจากพ่ายแพ้ เขาก็สูญเสียการควบคุมและกลายร่างเป็นต้นไม้ธรรมดา เมื่อพลังของต้นกล้าหายไปตลอดกาล แมลงสาบที่เหลืออยู่บางส่วนก็กลับไปรวมตัวกับแมลงอื่นๆ ในบูกาเรีย และทีมก็ได้รับการแต่งตั้งเป็นอัศวินจากความพยายามของพวกเขา