เมื่อปี ค.ศ. 866 สมเด็จพระสันตะปาปานิโคลัสที่ 1ทรงแนะนำเจ้าชายบอริสผู้ซึ่งเพิ่งเปลี่ยนชาวคริสต์ ให้มานับถือศาสนาคริสต์ ให้เปลี่ยนจากการใช้หางม้าเป็นธงไปใช้ไม้กางเขนศักดิ์สิทธิ์แทน^{[ 2 ]}

ต่อมา พงศาวดารฉบับประดับประดาของจอห์น สกายลิตเซสและคอนสแตนติน มานาสเซสแสดงให้เห็นกองทัพของข่านครัมถือธงสีแดงล้วน^{[ 3 ]}หรือสีแดงขอบดำ^{[ 4 ]} กองทัพของซีเมียนมหาราชก็ถูกวาดให้ถือธงสีแดงรูปทรงต่างๆ เช่นกัน^{[ 4 ]}พงศาวดารราดซิวิลยังแสดงให้เห็นกองทัพของซาร์ซีเมียนที่ 1 ภายใต้ธงสีแดงในการรบกับไบแซนเทียมในปี 921–922แต่ภาพการรุกรานของฮังการีในปี 894แสดงให้เห็นป้อมปราการดราสตาร์ของบัลแกเรียภายใต้ธงสีขาวที่มีพระจันทร์เสี้ยวและดาวหกแฉกภาพวาดธงใดๆ ในต้นฉบับที่กล่าวถึงข้างต้น ไม่ว่าจะแสดงถึงฝ่ายใดหรือช่วงเวลาใด ก็สอดคล้องกับรูปแบบการวาดภาพโดยรวมที่ใช้ในแต่ละต้นฉบับอย่างมาก นอกจากนี้ ไม่มีต้นฉบับใดที่มาจากยุคจักรวรรดิบัลแกเรียที่หนึ่ง ดังนั้นจึงไม่สามารถตรวจสอบความถูกต้องทางประวัติศาสตร์ของธงเหล่านั้นได้

ภาพวาดธงชาติบัลแกเรียสามารถพบได้ใน แผนที่ เดินเรือ ต่างๆ จากศตวรรษที่ 14 และ 15 ในแผนที่เหล่านั้น ธงมักจะมีพื้นหลังสีขาวหรือสีทอง^{[ 5 ] [ 6 ]}และแสดงตราสัญลักษณ์ของราชวงศ์ชิชแมน^{[ 7 ]}หรือสัญลักษณ์ที่ไม่ทราบที่ มา ^{[ 8 ] [ 9 ]}เป็นสีแดง ภาพวาดเหล่านี้มีความหลากหลายมากกว่าธงของประเทศเพื่อนบ้าน เช่นจักรวรรดิโรมันตะวันออกโกลเดนฮอร์ดหรือจักรวรรดิเซอร์เบียซึ่งในแผนที่เดียวกันนั้นส่วนใหญ่จะมีความสอดคล้องกัน

หลังจากการปลดปล่อยบัลแกเรียหลังสงครามรัสเซีย-ตุรกีในปี 1878 ธงชาติได้รับการอธิบายไว้ในรัฐธรรมนูญทาร์โนโวปี 1879 ดังนี้:

มาตรา 23 ธงชาติบัลแกเรียมีสามสี ประกอบด้วยสีขาว สีเขียว และสีแดง วางเรียงในแนวนอน^{[ 10 ]}

หลังจากการสถาปนาสาธารณรัฐประชาชนบัลแกเรีย ในปี 1946 รัฐธรรมนูญฉบับใหม่ ของดิมิทรอฟ ในปี 1947 ได้เปลี่ยนแปลงธงชาติ โดยสีและลำดับของสียังคงเหมือนเดิม แต่ตราสัญลักษณ์ประจำชาติใหม่ถูกวางไว้ทางด้านซ้ายของแถบสีขาว ตราสัญลักษณ์ใหม่ประกอบด้วยสิงโตอยู่ภายในพวงรวงข้าว ใต้ดาวสีแดงและเหนือริบบิ้นที่มีวันที่ 9.IХ.1944 (9 กันยายน 1944) ซึ่งเป็นวันที่เกิดรัฐประหารในปี 1944 ที่ยุติระบอบกษัตริย์ ในปี 1971 ตราสัญลักษณ์ (และธงชาติ) ได้รับการแก้ไขเล็กน้อย โดยริบบิ้นถูกแบ่งออกเป็นสองส่วน มีปี 681 และ 1944 กำกับอยู่ โดยปี 681 เป็นปีที่สถาปนาจักรวรรดิบัลแกเรียแห่งแรก

หลังจากการล่มสลายของคอมมิวนิสต์ในปี 1990 รัฐธรรมนูญ Zhivkov ที่บังคับใช้ในขณะนั้น ได้รับการแก้ไขเพื่อให้สามารถนำธงชาติกลับไปใช้ในยุคก่อนคอมมิวนิสต์ได้^{[ 11 ]} รัฐธรรมนูญฉบับ ใหม่ของบัลแกเรียที่ประกาศใช้ในปี 1991 อธิบายธงชาติบัลแกเรียไว้ดังนี้:

มาตรา 166 ธงชาติสาธารณรัฐบัลแกเรียจะเป็นธงสามสี ได้แก่ สีขาว สีเขียว และสีแดง โดยเรียงจากบนลงล่างในแนวนอน^{[ 12 ]}

ธงเวอร์ชันที่เป็นที่นิยมซึ่งไม่มีสถานะอย่างเป็นทางการก็เป็นที่รู้จักกันทั่วไปเช่นกัน โดยมีตราแผ่นดินเต็มรูปแบบอยู่ทางด้านซ้ายของธง วางพาดผ่านเฉพาะพื้นสีขาวและสีเขียวเท่านั้น^{[ 13 ]}