กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 4 นาที

ซี2ออร์ฟ73

โปรตีน C2orf73 ที่ยังไม่ได้รับการ ระบุ ลักษณะเฉพาะ เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกสร้างขึ้นโดย ยีน C2orf73 โปรตีนนี้คาดว่าจะอยู่ภายใน นิวเคลียส

ซี2ออร์ฟ73

โปรตีน C2orf73 ที่ยังไม่ได้รับการระบุ ลักษณะเฉพาะ เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกสร้างขึ้นโดยยีนC2orf73 โปรตีนนี้คาดว่าจะอยู่ภายในนิวเคลียส

ยีน

ยีนทั้งหมดมีความยาว 53,712 คู่เบสและประกอบด้วยเอ็กซอน 9 เอ็กซอน ตำแหน่งของยีนในจีโนมมนุษย์อยู่บนโครโมโซม 2ที่ตำแหน่ง 2p16.2 และอยู่ติดกับยีนACYP2และSPTBN1 [ 5 ] ไม่มีชื่อเรียกอื่นสำหรับยีนนี้

เอ็มอาร์เอ็นเอ

mRNAหลักที่สร้างโดยยีน C2or73 มีความยาว 1921 นิวคลีโอไทด์มีไอโซฟอร์ม mRNA อื่นๆ อีก 6 แบบ ที่สร้างขึ้นโดยการตัดต่อทางเลือกและการเปลี่ยนแปลงความยาวของเอ็กซอน[ 6 ]

ไอโซฟอร์มเอ็กซอนความยาวของ mRNA (เบส)
หลัก2, 3, 5, 6, 71921
เอ็กซ์12, 3, 5, 6, 7 (ตัดทอน), 8, 91726
เอ็กซ์22, 3 (ตัดทอน), 5, 6, 7 (ตัดทอน)971
เอ็กซ์32 (ตัดทอน), 5, 6, 7 (ตัดทอน)868
เอ็กซ์44, 5, 6, 7 (ตัดทอน)951
เอ็กซ์51, 5, 6, 7 (ตัดทอน)1049
เอ็กซ์62, 3, 5, 7 (ตัดทอน)1034

โปรตีน

โปรตีนมีมวลโมเลกุล 32,142 ดาลตัน [ 7 ] มีโปรตีนไอโซฟอร์ม สี่ชนิด ไอโซฟอร์มหลัก (X1) มีความยาว 287 กรดอะมิโน[ 8 ]

C2orf73 ประกอบด้วยลำดับโมทีฟ สั้นๆ GDWWSH (โมทีฟนี้ยังไม่มีฟังก์ชันที่ทราบ) โปรตีนนี้มีไลซีนมากและลิวซีนน้อยเมื่อเทียบกับเนื้อหาของยีนมนุษย์โดยเฉลี่ย และมีจุดไอโซอิเล็กทริก ที่คาดการณ์ไว้ ที่ 9.305 [ 9 ]

ไอโซฟอร์มจากไอโซฟอร์ม mRNAความยาว (กรดอะมิโน)น้ำหนักโมเลกุล (กิโลดาลตัน)จุดไอโซอิเล็กทริก
เอ็กซ์1หลัก, X128732.19.305
เอ็กซ์2เอ็กซ์222925.49.120
เอ็กซ์3X3, X4, X516618.19.703
เอ็กซ์4เอ็กซ์614316.78.790

โครงสร้าง

โครงสร้าง 3 มิติของ C2orf73 ยังไม่ได้รับการกำหนดโดยการทดลอง การคาดการณ์เชิงคำนวณที่ทำโดยI-TASSERแสดงอยู่ในรูปที่ 1 [ 10 ]

รูปที่ 1. โครงสร้างสามมิติที่คาดการณ์ของโปรตีน Human C2orf73 ที่สร้างโดย I-TASSER [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]

เครื่องมือ PELE บน Biology Workbench ทำนายว่าโปรตีน จะมี α-helix ที่น่าจะเป็นไปได้ 3 อัน และβ-strand 1 อัน [ 14 ]

การดัดแปลงหลังการแปล

เครื่องมือ GPS, NetPhos, MyHits และ SUMOsp บนExPASy [ 15 ]ทำนายการดัดแปลงหลังการแปล ที่เป็นไปได้ สำหรับโปรตีนมีการทำนายตำแหน่งฟอสโฟรีเลชัน ที่เป็นไปได้หกตำแหน่ง และตำแหน่งซูโมอิเลชัน หนึ่งตำแหน่ง

การระบุตำแหน่งภายในเซลล์

PSORT II ทำนายว่า C2orf73 จะถูกจัดตำแหน่งในนิวเคลียส[ 16 ]ซึ่งได้รับการสนับสนุนจากการทำนายการมีอยู่ของไซต์ซูโมอิเลชัน ซึ่งเกี่ยวข้องกับ การขนส่งไซโตพลาสซึม ในนิวเคลียส[ 17 ]

การแสดงออก

โปรไฟล์ GEOจากNCBIแสดงให้เห็นว่า C2orf73 มีการแสดงออกอย่างอ่อนในเนื้อเยื่อต่อไปนี้ในมนุษย์: ไขกระดูกตับ หัวใจ ปอด สมองไขสันหลัง กล้ามเนื้อโครงร่าง ต่อมไทมัสและเยื่อบุผิว[ 18 ]

การควบคุมการแสดงออก

เครื่องมือ Genomatix El Dorado ทำนายว่าปัจจัยการถอดรหัส จำนวนมาก มีความสัมพันธ์ในการจับสูงใน 1100 คู่เบสเหนือC2orf73ปัจจัยการถอดรหัสจำนวนมากมักควบคุมกระบวนการต่างๆ เช่นการพัฒนาและการแบ่งเซลล์การตายของเซลล์และวงจรเซลล์[ 19 ]

โปรตีนที่ทำปฏิกิริยากัน

โปรตีนสามชนิดได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีปฏิสัมพันธ์กับ C2orf73 ผ่านการทดลองYeast Two-Hybrid [ 20 ]

  • โดเมน FCH และ Double SH3 2 ( FCHSD2 ) – ยังไม่ได้กำหนดหน้าที่
  • โปรตีนช็อกความร้อนชนิดบี สมาชิกที่ 1 ( HSPB1 ) – ช่วยเสริมความต้านทานของเซลล์ต่อความเครียด
  • โปรตีน SH3 Domain Binding Protein 4 ( SH3BP4 ) – มีส่วนเกี่ยวข้องกับ การ ดูดซึมตัวรับบนพื้นผิวเซลล์จำเพาะเข้าสู่เซลล์ ( endocytosis )

การทำงาน

ปัจจุบัน นักวิทยาศาสตร์และบุคคลทั่วไปยังไม่เข้าใจหน้าที่ของยีน C2orf73 อย่างถ่องแท้

ความเหมือนกัน

ไม่มีพาราล็อกของ C2orf73 ในจีโนมของมนุษย์ออร์โธล็อก พบได้ทั่วทั้งไฟลัม Chordataแต่จำกัดเฉพาะ(โดยมีข้อยกเว้นเล็กน้อยในไฟลัมอื่น ๆ ของอาณาจักรAnimaliaเช่นOctopus bimaculoides ) [ 21 ]

สายพันธุ์ชื่อสามัญหมายเลขการเข้าถึง NCBIความยาวของลำดับ (AA)หลายล้านปีนับตั้งแต่LCA [ 22 ]% ตัวตนเปอร์เซ็นต์ความคล้ายคลึง
โฮโมเซเปียนส์มนุษย์NP_001093866.1287---
เฮเทอโรเซฟาลัส กลาเบอร์หนูตุ่นไร้ขนXP_004867342.12359062.268.2
มัส มัสคูลัสหนูNP_001093864.12339054.962.8
ฟูโคมีส ดามาเรนซิสหนูตุ่นดามาราแลนด์XP_010614136.22889075.083.7
เทอโรปัส แวมไพรัสค้างคาวขนาดใหญ่XP_011362281.12919677.782.8
เอปทีซิคัส ฟัสคัสค้างคาวสีน้ำตาลตัวใหญ่XP_008160678.13219661.867.6
ไรโนโลฟัส ซินิคัสค้างคาวเกือกม้าจีนสีน้ำตาลแดงXP_019575083.13019671.479.4
Erinaceus europaeusเม่นยุโรปXP_007528011.12849663.871.4
คอนดิลูรา คริสตาตาไฝจมูกดาวXP_012586937.12919669.879.0
อูฐป่าอูฐแบกเทรียนป่าXP_006174505.12919675.683.2
Capra hircusแพะXP_013823176.12859673.177.9
บอส ทอรัสวัวNP_001094753.12909675.581.0
Panthera pardusเสือดาวXP_019277335.12929675.082.2
Ursus maritimusหมีขั้วโลกXP_008698084.12909677.384.5
ฟัลโค เพเรกรินัสเหยี่ยวเพเรกรินXP_013152712.123131236.244.6
แอปเทอริกซ์ แมนเทลลีนกกีวีสีน้ำตาลเกาะเหนือXP_013805202.119731236.941.9
ไพธอน บิวิตตาตัสงูเหลือมพม่าXP_007425859.131431230.845.0
อโนลิส คาโรลิเนนซิสกิ้งก่าแคโรไลนาXP_003216202.232031235.342.7
Xenopus laevisกบเล็บแอฟริกันXP_018118010.130735236.952.2
นาโนรานา ปาร์คเกรีกบXP_018419829.130735236.445.8
คัลโลรินคัส มิลีฉลามผีออสเตรเลียXP_007890694.129347328.034.9
Ciona intestinalisเพรียงทะเลXP_002125895.123567622.434.5
ปลาหมึกยักษ์บิมาคูโลอิดส์ปลาหมึกสองจุดแคลิฟอร์เนียXP_014784430.124279722.430.0
Saccoglossus kowalevskiiหนอนลูกโอ๊กXP_002735239.223268417.927.9

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ซี2ออร์ฟ73

โปรตีน C2orf73 ที่ยังไม่ได้รับการ ระบุ ลักษณะเฉพาะ เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกสร้างขึ้นโดย ยีน C2orf73 โปรตีนนี้คาดว่าจะอยู่ภายใน นิวเคลียส

ยีน

ยีนทั้งหมดมีความยาว 53,712 คู่เบส และประกอบด้วย เอ็กซอน 9 เอ็กซอน ตำแหน่ง ของยีนในจีโนมมนุษย์อยู่บน โครโมโซม 2 ที่ตำแหน่ง 2p16.2 และอยู่ติดกับยีน ACYP2 และ SPTBN1 [ 5 ] ไม่มีชื่อเรียกอื่นสำหรับยีนนี้

เอ็มอาร์เอ็นเอ

mRNA หลักที่สร้างโดยยีน C2or73 มีความยาว 1921 นิวคลีโอไทด์ มี ไอโซฟอร์ม mRNA อื่นๆ อีก 6 แบบ ที่สร้างขึ้นโดย การตัดต่อทางเลือก และการเปลี่ยนแปลงความยาวของเอ็กซอน [ 6 ]

โปรตีน

โปรตีนมีมวลโมเลกุล 32,142 ดาลตัน [ 7 ] มี โปรตีน ไอโซฟอร์ม สี่ชนิด ไอโซฟอร์มหลัก (X1) มีความยาว 287 กรดอะมิโน [ 8 ]