ซี2ออร์ฟ73
โปรตีน C2orf73 ที่ยังไม่ได้รับการระบุ ลักษณะเฉพาะ เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกสร้างขึ้นโดยยีนC2orf73 โปรตีนนี้คาดว่าจะอยู่ภายในนิวเคลียส
ยีน
ยีนทั้งหมดมีความยาว 53,712 คู่เบสและประกอบด้วยเอ็กซอน 9 เอ็กซอน ตำแหน่งของยีนในจีโนมมนุษย์อยู่บนโครโมโซม 2ที่ตำแหน่ง 2p16.2 และอยู่ติดกับยีนACYP2และSPTBN1 [ 5 ] ไม่มีชื่อเรียกอื่นสำหรับยีนนี้
เอ็มอาร์เอ็นเอ
mRNAหลักที่สร้างโดยยีน C2or73 มีความยาว 1921 นิวคลีโอไทด์มีไอโซฟอร์ม mRNA อื่นๆ อีก 6 แบบ ที่สร้างขึ้นโดยการตัดต่อทางเลือกและการเปลี่ยนแปลงความยาวของเอ็กซอน[ 6 ]
| ไอโซฟอร์ม | เอ็กซอน | ความยาวของ mRNA (เบส) |
|---|---|---|
| หลัก | 2, 3, 5, 6, 7 | 1921 |
| เอ็กซ์1 | 2, 3, 5, 6, 7 (ตัดทอน), 8, 9 | 1726 |
| เอ็กซ์2 | 2, 3 (ตัดทอน), 5, 6, 7 (ตัดทอน) | 971 |
| เอ็กซ์3 | 2 (ตัดทอน), 5, 6, 7 (ตัดทอน) | 868 |
| เอ็กซ์4 | 4, 5, 6, 7 (ตัดทอน) | 951 |
| เอ็กซ์5 | 1, 5, 6, 7 (ตัดทอน) | 1049 |
| เอ็กซ์6 | 2, 3, 5, 7 (ตัดทอน) | 1034 |
โปรตีน
โปรตีนมีมวลโมเลกุล 32,142 ดาลตัน [ 7 ] มีโปรตีนไอโซฟอร์ม สี่ชนิด ไอโซฟอร์มหลัก (X1) มีความยาว 287 กรดอะมิโน[ 8 ]
C2orf73 ประกอบด้วยลำดับโมทีฟ สั้นๆ GDWWSH (โมทีฟนี้ยังไม่มีฟังก์ชันที่ทราบ) โปรตีนนี้มีไลซีนมากและลิวซีนน้อยเมื่อเทียบกับเนื้อหาของยีนมนุษย์โดยเฉลี่ย และมีจุดไอโซอิเล็กทริก ที่คาดการณ์ไว้ ที่ 9.305 [ 9 ]
| ไอโซฟอร์ม | จากไอโซฟอร์ม mRNA | ความยาว (กรดอะมิโน) | น้ำหนักโมเลกุล (กิโลดาลตัน) | จุดไอโซอิเล็กทริก |
|---|---|---|---|---|
| เอ็กซ์1 | หลัก, X1 | 287 | 32.1 | 9.305 |
| เอ็กซ์2 | เอ็กซ์2 | 229 | 25.4 | 9.120 |
| เอ็กซ์3 | X3, X4, X5 | 166 | 18.1 | 9.703 |
| เอ็กซ์4 | เอ็กซ์6 | 143 | 16.7 | 8.790 |
โครงสร้าง
โครงสร้าง 3 มิติของ C2orf73 ยังไม่ได้รับการกำหนดโดยการทดลอง การคาดการณ์เชิงคำนวณที่ทำโดยI-TASSERแสดงอยู่ในรูปที่ 1 [ 10 ]

เครื่องมือ PELE บน Biology Workbench ทำนายว่าโปรตีน จะมี α-helix ที่น่าจะเป็นไปได้ 3 อัน และβ-strand 1 อัน [ 14 ]
การดัดแปลงหลังการแปล
เครื่องมือ GPS, NetPhos, MyHits และ SUMOsp บนExPASy [ 15 ]ทำนายการดัดแปลงหลังการแปล ที่เป็นไปได้ สำหรับโปรตีนมีการทำนายตำแหน่งฟอสโฟรีเลชัน ที่เป็นไปได้หกตำแหน่ง และตำแหน่งซูโมอิเลชัน หนึ่งตำแหน่ง
การระบุตำแหน่งภายในเซลล์
PSORT II ทำนายว่า C2orf73 จะถูกจัดตำแหน่งในนิวเคลียส[ 16 ]ซึ่งได้รับการสนับสนุนจากการทำนายการมีอยู่ของไซต์ซูโมอิเลชัน ซึ่งเกี่ยวข้องกับ การขนส่งไซโตพลาสซึม ในนิวเคลียส[ 17 ]
การแสดงออก
โปรไฟล์ GEOจากNCBIแสดงให้เห็นว่า C2orf73 มีการแสดงออกอย่างอ่อนในเนื้อเยื่อต่อไปนี้ในมนุษย์: ไขกระดูกตับ หัวใจ ปอด สมองไขสันหลัง กล้ามเนื้อโครงร่าง ต่อมไทมัสและเยื่อบุผิว[ 18 ]
การควบคุมการแสดงออก
เครื่องมือ Genomatix El Dorado ทำนายว่าปัจจัยการถอดรหัส จำนวนมาก มีความสัมพันธ์ในการจับสูงใน 1100 คู่เบสเหนือC2orf73ปัจจัยการถอดรหัสจำนวนมากมักควบคุมกระบวนการต่างๆ เช่นการพัฒนาและการแบ่งเซลล์การตายของเซลล์และวงจรเซลล์[ 19 ]
โปรตีนที่ทำปฏิกิริยากัน
โปรตีนสามชนิดได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีปฏิสัมพันธ์กับ C2orf73 ผ่านการทดลองYeast Two-Hybrid [ 20 ]
- โดเมน FCH และ Double SH3 2 ( FCHSD2 ) – ยังไม่ได้กำหนดหน้าที่
- โปรตีนช็อกความร้อนชนิดบี สมาชิกที่ 1 ( HSPB1 ) – ช่วยเสริมความต้านทานของเซลล์ต่อความเครียด
- โปรตีน SH3 Domain Binding Protein 4 ( SH3BP4 ) – มีส่วนเกี่ยวข้องกับ การ ดูดซึมตัวรับบนพื้นผิวเซลล์จำเพาะเข้าสู่เซลล์ ( endocytosis )
การทำงาน
ปัจจุบัน นักวิทยาศาสตร์และบุคคลทั่วไปยังไม่เข้าใจหน้าที่ของยีน C2orf73 อย่างถ่องแท้
ความเหมือนกัน
ไม่มีพาราล็อกของ C2orf73 ในจีโนมของมนุษย์ออร์โธล็อก พบได้ทั่วทั้งไฟลัม Chordataแต่จำกัดเฉพาะ(โดยมีข้อยกเว้นเล็กน้อยในไฟลัมอื่น ๆ ของอาณาจักรAnimaliaเช่นOctopus bimaculoides ) [ 21 ]
| สายพันธุ์ | ชื่อสามัญ | หมายเลขการเข้าถึง NCBI | ความยาวของลำดับ (AA) | หลายล้านปีนับตั้งแต่LCA [ 22 ] | % ตัวตน | เปอร์เซ็นต์ความคล้ายคลึง |
|---|---|---|---|---|---|---|
| โฮโมเซเปียนส์ | มนุษย์ | NP_001093866.1 | 287 | - | - | - |
| เฮเทอโรเซฟาลัส กลาเบอร์ | หนูตุ่นไร้ขน | XP_004867342.1 | 235 | 90 | 62.2 | 68.2 |
| มัส มัสคูลัส | หนู | NP_001093864.1 | 233 | 90 | 54.9 | 62.8 |
| ฟูโคมีส ดามาเรนซิส | หนูตุ่นดามาราแลนด์ | XP_010614136.2 | 288 | 90 | 75.0 | 83.7 |
| เทอโรปัส แวมไพรัส | ค้างคาวขนาดใหญ่ | XP_011362281.1 | 291 | 96 | 77.7 | 82.8 |
| เอปทีซิคัส ฟัสคัส | ค้างคาวสีน้ำตาลตัวใหญ่ | XP_008160678.1 | 321 | 96 | 61.8 | 67.6 |
| ไรโนโลฟัส ซินิคัส | ค้างคาวเกือกม้าจีนสีน้ำตาลแดง | XP_019575083.1 | 301 | 96 | 71.4 | 79.4 |
| Erinaceus europaeus | เม่นยุโรป | XP_007528011.1 | 284 | 96 | 63.8 | 71.4 |
| คอนดิลูรา คริสตาตา | ไฝจมูกดาว | XP_012586937.1 | 291 | 96 | 69.8 | 79.0 |
| อูฐป่า | อูฐแบกเทรียนป่า | XP_006174505.1 | 291 | 96 | 75.6 | 83.2 |
| Capra hircus | แพะ | XP_013823176.1 | 285 | 96 | 73.1 | 77.9 |
| บอส ทอรัส | วัว | NP_001094753.1 | 290 | 96 | 75.5 | 81.0 |
| Panthera pardus | เสือดาว | XP_019277335.1 | 292 | 96 | 75.0 | 82.2 |
| Ursus maritimus | หมีขั้วโลก | XP_008698084.1 | 290 | 96 | 77.3 | 84.5 |
| ฟัลโค เพเรกรินัส | เหยี่ยวเพเรกริน | XP_013152712.1 | 231 | 312 | 36.2 | 44.6 |
| แอปเทอริกซ์ แมนเทลลี | นกกีวีสีน้ำตาลเกาะเหนือ | XP_013805202.1 | 197 | 312 | 36.9 | 41.9 |
| ไพธอน บิวิตตาตัส | งูเหลือมพม่า | XP_007425859.1 | 314 | 312 | 30.8 | 45.0 |
| อโนลิส คาโรลิเนนซิส | กิ้งก่าแคโรไลนา | XP_003216202.2 | 320 | 312 | 35.3 | 42.7 |
| Xenopus laevis | กบเล็บแอฟริกัน | XP_018118010.1 | 307 | 352 | 36.9 | 52.2 |
| นาโนรานา ปาร์คเกรี | กบ | XP_018419829.1 | 307 | 352 | 36.4 | 45.8 |
| คัลโลรินคัส มิลี | ฉลามผีออสเตรเลีย | XP_007890694.1 | 293 | 473 | 28.0 | 34.9 |
| Ciona intestinalis | เพรียงทะเล | XP_002125895.1 | 235 | 676 | 22.4 | 34.5 |
| ปลาหมึกยักษ์บิมาคูโลอิดส์ | ปลาหมึกสองจุดแคลิฟอร์เนีย | XP_014784430.1 | 242 | 797 | 22.4 | 30.0 |
| Saccoglossus kowalevskii | หนอนลูกโอ๊ก | XP_002735239.2 | 232 | 684 | 17.9 | 27.9 |