นอกจากการนำกฎประตูทีมเยือนมาใช้แล้วแทบไม่มีอะไรเปลี่ยนแปลงในรายการนี้จนกระทั่งปี 1997 เมื่อ CAF ภายใต้การนำของIssa Hayatouได้ก้าวไปอีกขั้นด้วยการเดินตามรอย UEFA ที่ริเริ่มไว้เมื่อไม่กี่ปีก่อนหน้านั้น โดยการสร้างรอบแบ่งกลุ่ม/รอบลีกในทัวร์นาเมนต์ และเปลี่ยนชื่อเป็นCAF Champions League (ให้สอดคล้องกับChampions League ของ UEFA ) CAF ยังได้ริเริ่มเงินรางวัลสำหรับผู้เข้าร่วมเป็นครั้งแรก โดยเริ่มต้นด้วยเงิน 1 ล้านดอลลาร์สหรัฐสำหรับผู้ชนะ และ 750,000 ดอลลาร์สหรัฐสำหรับรองชนะเลิศ ทำให้รายการแข่งขันที่เปลี่ยนชื่อใหม่นี้กลายเป็นรายการแข่งขันสโมสรแอฟริกันที่ร่ำรวยที่สุดในขณะนั้น

ในรูปแบบใหม่นี้ แชมป์ลีกของประเทศสมาชิก CAF แต่ละประเทศจะผ่านรอบคัดเลือกหลายรอบจนถึงรอบ 16 ทีมสุดท้าย จากนั้นทีมที่ชนะทั้ง 8 ทีมจะถูกจับสลากแบ่งออกเป็นสองกลุ่ม กลุ่มละ 4 ทีม โดยแต่ละกลุ่มจะแข่งขันกันแบบเหย้าและเยือน เมื่อสิ้นสุดรอบแบ่งกลุ่ม ทีมอันดับหนึ่งของแต่ละกลุ่มจะพบกันในรอบชิงชนะเลิศแบบสองนัด (เหย้าและเยือน) ในฤดูกาล 2001 CAF ได้นำรอบรองชนะเลิศมาใช้ต่อจากรอบแบ่งกลุ่ม โดยสองทีมอันดับสูงสุดในแต่ละกลุ่มจะพบกันในรอบรองชนะเลิศ และผู้ชนะจะผ่านเข้ารอบชิงชนะเลิศ

เริ่มตั้งแต่ฤดูกาล 2009เงินรางวัลเพิ่มขึ้นเป็น 1.5 ล้านดอลลาร์สหรัฐสำหรับแชมป์ และ 1 ล้านดอลลาร์สหรัฐสำหรับรองแชมป์ นับตั้งแต่การแข่งขันเปลี่ยนชื่อใหม่ในปี 1997 ทีมจากแอฟริกาเหนือก็เข้ามาครองการแข่งขันและทำลายสถิติ ทีมRaja Casablanca ของโมร็อกโก ชนะ 2 ใน 3 ครั้งแรก^{[ 13 ]}แต่ Al Ahly กลายเป็นทีมที่ประสบความสำเร็จมากที่สุด โดยชนะในปี2001 [ ^{14 ]} 2005 [ ^{15 ]} 2006 ^{[ 16 ]} 2008 [ ^{17 ]}และ2012 ^{[ 18 ]}ในขณะที่Zamalekสามารถคว้าแชมป์ได้ใน^ปี 2002 [ ^{19 ] ทีม}จากตูนิเซียได้ก้าวเข้าสู่กลุ่มผู้ชนะ โดยÉtoile du Sahelชนะ ใน ปี 2007หลังจากเป็นผู้แพ้ในรอบชิงชนะ^เลิศใน^ปี 2004และ2005 ^{[ 20 ]}ในส่วนของEspérance de Tunisได้รับรางวัลระดับทวีปเป็นครั้งที่สองในปี 2011หลังจากที่แพ้ในรอบชิงชนะเลิศในปี1999 , 2000 , 2010และ2012 ^{[ 21 ]}

แม้ว่าทีมจากแอฟริกาเหนือจะครองความได้เปรียบอย่างชัดเจน แต่สโมสรเอ็นยิมบา ของไนจีเรียก็ คว้าแชมป์สองสมัยติดต่อกันในปี2546และ2547 ^{[ 22 ] [ 23 ]} ASEC Mimosasจากไอวอรี่โคสต์และAccra Hearts of Oakจากกานาเพิ่มแชมป์อีกสองรายการให้กับแอฟริกาตะวันตก ในปี2553 TP MazembeจากDRCกลายเป็นสโมสรแรกที่คว้าแชมป์สองสมัยติดต่อกัน โดยคว้าแชมป์สองสมัยแรกในปี 2510และ2511 [ ^{24 ] [ 25 ] ก่อนที่จะ ทำ}ซ้ำความสำเร็จนี้อีกครั้งในปี2552และ2553 ^{[ 26 ] [ 27 ]}ในปี 2560 รอบแบ่งกลุ่มได้ขยายจาก 2 กลุ่ม กลุ่มละ 4 ทีม เป็น 4 กลุ่ม กลุ่มละ 16 ทีม โดยมีการเพิ่มรอบก่อนรองชนะเลิศโดยอัตโนมัติ^{[ 28 ] [ 29 ] [ 30 ]}

ฤดูกาล2020–21เล่นแบบปิดสนามเนื่องจากการระบาดของโรคโควิด-19 ในแอฟริกาสอดคล้องกับลีกฟุตบอลและการแข่งขันระดับโลกอย่างไรก็ตาม อัล อาห์ลี เผชิญหน้ากับคู่ปรับตัวฉกาจอย่างซามาเลกในรอบชิงชนะเลิศแบบอียิปต์ล้วน (เป็นครั้งแรกที่สองสโมสรจากประเทศเดียวกันแข่งขันในรอบชิงชนะเลิศในประวัติศาสตร์ของการแข่งขัน) ^{[ 31 ]}โดยอัล อาห์ลี เป็นฝ่ายชนะและคว้าแชมป์สมัยที่ 9 ^{[ 32 ]}อัล อาห์ลีป้องกันแชมป์ได้สำเร็จเป็นสมัยที่ 10 ซึ่งเป็นสถิติสูงสุดในฤดูกาลถัดมา โดยเอาชนะไคเซอร์ ชีฟส์จากแอฟริกาใต้ ที่ เหลือผู้เล่นเพียง 10 คน ^{[ 33 ]}แต่ไม่สามารถคว้าแชมป์สมัยที่ 3 ติดต่อกันและสมัยที่ 11 ในปี 2022ได้ เนื่องจากพ่ายแพ้ให้กับสโมสรวายดาด เอซี จากโมร็อกโก 2–0 ซึ่งคว้าแชมป์สมัยที่ 3 ไปครองแทน^{[ 34 ]}หลังจากหยุดไป 24 เดือนเนื่องจากการระบาดของโรคโควิด-19 ทำให้การแข่งขันรอบชิงชนะเลิศกลับมาเป็น นัด เหย้าเยือน อีกครั้ง อัล อาห์ลีก็กลับมาอย่างยิ่งใหญ่ แก้แค้นได้สำเร็จ ในฤดูกาลถัดมาและแย่งชิงตำแหน่งแชมป์คืนจากวิดาด คว้าแชมป์สมัยที่ 11 ในปี 2023ด้วยผลรวม 3-2 จากประตูชัยของโมฮาเหม็ด อับเดลโมเนม^{[ 35 ]}และป้องกันแชมป์ได้สำเร็จเป็นครั้งที่สองในรอบครึ่งทศวรรษ (5 ปี) ในปี 2024คว้าแชมป์สมัยที่ 12 ซึ่งเป็นสถิติสูงสุด ด้วยผลรวม 1-0 เหนือเอสเปรันซ์จากตูนิเซีย^{[ 36 ]}

ด้วยการเปิดตัวAfrica Football Leagueในฤดูกาล 2023–24 CAF พยายามที่จะสร้างการแข่งขันใหม่เพื่อแข่งขันกับ CAF Champions League ^{[ 37 ] [ 38 ]}อย่างไรก็ตาม Africa Football League ไม่สามารถสร้างความกระตื่นร้นในระดับเดียวกันได้ และจัดได้เพียงครั้งเดียวเท่านั้น CAF Champions League ยังคงเป็นการแข่งขันระดับสโมสรชั้นนำของแอฟริกา โดยมีเงินรางวัลสูงสุดในทวีป^{[ 39 ] [ 40 ]}การแข่งขันในปี 2026 ชนะโดยMamelodi Sundowns จากแอฟริกาใต้ หลังจากที่สโมสรจากแอฟริกาเหนือครองแชมป์มานานกว่าทศวรรษ นับเป็นแชมป์ CAF Champions League ครั้งแรกของพวกเขาตั้งแต่ปี 2016 หลังจากเอาชนะAS FAR จากโมร็อกโก ในรอบชิงชนะเลิศ^{[ 41 ]}

การแข่งขัน CAF Champions League เปิดโอกาสให้ผู้ชนะเลิศจากลีกระดับชาติที่สังกัด CAF ทั้งหมด รวมถึงผู้ครองตำแหน่งแชมป์จากฤดูกาลก่อนหน้า ตั้งแต่ฤดูกาล 2547เป็นต้นไป ด้วยการรวมCAF CupและAfrican Cup Winners' Cup เข้าด้วยกันเพื่อสร้าง CAF Confederation Cupซึ่งเป็นรายการระดับที่สองทีมรองชนะเลิศจากลีกฟุตบอลของ12 ประเทศที่มีอันดับสูงสุดก็จะเข้าร่วมการแข่งขันด้วย ทำให้มีทีมเข้าร่วมทั้งหมด 64 ทีม โดย 12 ประเทศนี้จะได้รับการจัดอันดับตามผลงานของสโมสรในช่วง 5 ฤดูกาล/ครั้งก่อนหน้าของการแข่งขัน (ตามคำจำกัดความทั่วไปของการจัดอันดับ 5 ปีของ CAF ) ^{[ 42 ]}

จำนวนทีมที่แต่ละสมาคมส่งเข้าแข่งขันใน CAF Champions League จะถูกกำหนดในแต่ละปีตามเกณฑ์ที่กำหนดโดยคณะกรรมการการแข่งขันของ CAF ^{[ 43 ] [ 44 ]}ยิ่งอันดับของสมาคมสูงขึ้นตามเกณฑ์ที่กำหนด ทีมของสมาคมนั้นก็จะยิ่งเข้าร่วมการแข่งขัน Champions League มากขึ้น และทีมของสมาคมนั้นก็จะต้องแข่งขันในรอบคัดเลือกน้อยลง

การแข่งขัน CAF Champions League ดำเนินการในรูปแบบน็อกเอาต์เป็นหลัก โดยมีรอบคัดเลือก รอบแบ่งกลุ่ม รอบน็อกเอาต์แบบสองนัด และรอบชิงชนะเลิศแบบสองนัด ในช่วงเริ่มต้นของการแข่งขัน ทีมที่ผ่านเข้ารอบ 64 ทีมจะเข้าสู่รอบคัดเลือก 2 รอบ ได้แก่ รอบแรกและรอบแบ่งกลุ่ม หลังจากรอบคัดเลือกแรก ทีมที่เหลือจะถูกแบ่งออกเป็น 4 กลุ่ม กลุ่มละ 4 ทีม โดยทีมที่ชนะในรอบแรกจะผ่านเข้ารอบคัดเลือกที่สองของ CAF Champions League เพื่อหวังที่จะผ่านเข้ารอบแบ่งกลุ่ม ผู้ชนะและรองชนะเลิศของแต่ละกลุ่มจะผ่านเข้ารอบ น็อกเอาต์ แบบสองนัดเพื่อหวังที่จะผ่านเข้ารอบชิงชนะเลิศแบบสองนัด เพื่อชิงถ้วยรางวัลให้กับสมาคมสมาชิกของตน

ในแต่ละปี ทีมที่ชนะจะได้รับรางวัล CAF Champions League ซึ่งรางวัลเวอร์ชันปัจจุบันนี้มีการมอบมาตั้งแต่การเปลี่ยนชื่อการแข่งขันในปี 1997 โดยจะมอบเหรียญทอง 40 เหรียญให้กับผู้ชนะการแข่งขัน และเหรียญเงิน 40 เหรียญให้กับรองชนะเลิศ เมื่อวันที่ 22 พฤษภาคม 2025 CAF ได้เปิดตัวดีไซน์ใหม่ที่โดดเด่นของถ้วยรางวัล TotalEnergies CAF Champions League ที่สำนักงานใหญ่ของ TotalEnergies ในโจฮันเนสเบิร์ก^{[ 59 ] [ 60 ]}ถ้วยรางวัลนี้ทำจากเงินเงางามพร้อมการตกแต่งด้วยสีทองอย่างโดดเด่น โดยมีทรงกลมสีทองประดับด้วยลวดลายแอฟริกันอยู่ด้านบนสุด ซึ่งเป็นสัญลักษณ์ของชัยชนะสูงสุด ในขณะที่เส้นสีเงินและสีทองสลับกันสะท้อนถึงความเป็นหนึ่งเดียว การแข่งขัน และความสมดุลในการแข่งขันที่กำหนดการแข่งขันระดับสโมสรชั้นนำของแอฟริกา^{[ 59 ] [ 61 ]}การปรับปรุงครั้งนี้เป็นส่วนหนึ่งของความพยายามที่กว้างขึ้นของ CAF ในการปรับปรุงการแข่งขันให้ทันสมัยและเพิ่มความน่าสนใจ

หลังจากเปลี่ยนชื่อการแข่งขันเป็นชื่อปัจจุบันในปี 1997 สหพันธ์ฟุตบอลแอฟริกา (CAF) ได้เริ่มมอบเงินรางวัลให้กับทีมที่เข้าร่วมรอบแบ่งกลุ่มทั้ง 8 ทีมเป็นครั้งแรกในประวัติศาสตร์การแข่งขันฟุตบอลสโมสรของแอฟริกา โดยเงินรางวัลงวดแรกนี้มอบต่อเนื่องจนถึงปี 2008

CAF เพิ่มเงินรางวัลที่จะแบ่งให้กับสโมสรในรอบแบ่งกลุ่ม ซึ่งในขณะนั้นมี 8 สโมสร ดังนี้: ^{[ 62 ]}

เงินรางวัลงวดที่สามจาก CAF แสดงให้เห็นถึงการเพิ่มขึ้นที่จะแบ่งให้กับสโมสรในรอบแบ่งกลุ่ม ซึ่งเพิ่มขึ้นเป็น 16 สโมสรตั้งแต่ปี 2017 จนถึงปัจจุบัน ดังนี้: ^{[ 63 ] [ 64 ] [ 65 ] [ 66 ]}

*หมายเหตุ: สมาคมระดับชาติจะได้รับส่วนแบ่งเพิ่มเติมอีก 5% สำหรับจำนวนเงินแต่ละจำนวนที่มอบให้แก่สโมสร

เมื่อวันที่ 16 สิงหาคม 2567 CAF ได้ประกาศเพิ่มเงินรางวัลที่จะแบ่งให้กับสโมสรในรอบแบ่งกลุ่ม 16 ทีม รวมถึงทีมในรอบเบื้องต้น ซึ่งเป็นงวดล่าสุด ดังนี้: ^{[ 67 ]}

ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2569 มีการประกาศเพิ่มขึ้นเพิ่มเติมดังนี้: ^{[ 68 ]}