อ่าน 5 นาที
ซีดีเคเอ็น2บาเอส
CDKN2B-AS หรือที่รู้จักกันในชื่อ ANRIL (antisense non-coding RNA in the INK4 locus) เป็น RNA ที่ไม่เข้ารหัสโปรตีนสายยาว ประกอบด้วย 19 เอ็กซอน ครอบคลุมพื้นที่ 126.
ซีดีเคเอ็น2บาเอส
| ซีดีเคเอ็น2บี-เอเอส1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | CDKN2B-AS1 , ANRIL, CDKN2B-AS, CDKN2BAS, NCRNA00089, PCAT12, p15AS, CDKN2B antisense RNA 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 613149 ; GeneCards : CDKN2B-AS1 ; OMA : CDKN2B-AS1 - ออร์โธล็อก | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| บริเวณอนุรักษ์อินทรอนิกส์ของ CDKN2B antisense RNA 1 | |
|---|---|
การคาดการณ์โครงสร้างทุติยภูมิและการอนุรักษ์ลำดับของ CDKN2B-AS | |
| ตัวระบุ | |
| เครื่องหมาย | ซีดีเคเอ็น2บี-เอเอส |
| สัญลักษณ์ทางเลือก | อันริล |
| อาร์แฟม | RF01909 |
| ข้อมูลอื่นๆ | |
| ประเภทRNA | ยีน ; |
| โดเมน | ยูคาริโอตา ; |
| ไป | GO:0006342 GO:0005515 |
| ดังนั้น | SO:0001463 |
| โครงสร้างPDB | พีดีบี |
CDKN2B-ASหรือที่รู้จักกันในชื่อ ANRIL (antisense non-coding RNA in the INK4 locus) เป็น RNA ที่ไม่เข้ารหัสโปรตีนสายยาว ประกอบด้วย 19 เอ็กซอนครอบคลุมพื้นที่ 126.3 กิโลเบสในจีโนมและผลิตภัณฑ์จากการตัดต่อของมันคือRNA ขนาด 3834 คู่ เบส มันตั้งอยู่ในกลุ่มยีน p15/ CDKN2B -p16/ CDKN2A -p14/ ARFในทิศทางแอนติเซนส์การเปลี่ยนแปลงนิวคลีโอไทด์เดี่ยว (SNPs) ที่เปลี่ยนแปลงการแสดงออกของ CDKN2B-AS เกี่ยวข้องกับอายุขัยที่มีสุขภาพดี ของมนุษย์ รวมถึงโรคต่างๆ มากมาย เช่นโรคหลอดเลือดหัวใจโรคเบาหวานและมะเร็ง หลาย ชนิด[ 3 ]มันจับกับโครโมบ็อกซ์ 7 (CBX7) ภายในคอมเพล็กซ์การยับยั้งโพลีคอมบ์ 1และกับSUZ12ซึ่งเป็นส่วนประกอบของคอมเพล็กซ์การยับยั้งโพลีคอมบ์ 2และผ่านปฏิสัมพันธ์เหล่านี้จึงมีส่วนเกี่ยวข้องในการยับยั้งการถอดรหัส[ 4 ] [ 5 ]
ดูเพิ่มเติม
อ่านเพิ่มเติม
- Mußotter T, Kluwe L, Högel J, Nguyen R, Cooper DN, Mautner VF, Kehrer-Sawatzki H (ตุลาคม 2012). "RNA ที่ไม่เข้ารหัส ANRIL และจำนวนของเนื้องอกประสาทแบบเพล็กซิฟอร์มในผู้ป่วยที่มีการขาดหายของยีน NF1 ขนาดเล็ก" . BMC Medical Genetics . 13 98. doi : 10.1186/1471-2350-13-98 . PMC 3500256 . PMID 23101500 .
- McPherson R, Pertsemlidis A, Kavaslar N, Stewart A, Roberts R, Cox DR และคณะ (มิถุนายน 2550). "อัลลีลทั่วไปบนโครโมโซม 9 ที่เกี่ยวข้องกับโรคหลอดเลือดหัวใจ" Science . 316 ( 5830): 1488– 1491. Bibcode : 2007Sci...316.1488M . doi : 10.1126/science.1142447 . PMC 2711874 . PMID 17478681 .
- Folkersen L, Kyriakou T, Goel A, Peden J, Mälarstig A, Paulsson-Berne G และคณะ (พฤศจิกายน 2552). Reitsma PH (บรรณาธิการ). "ความสัมพันธ์ระหว่างจีโนไทป์ความเสี่ยง CAD ในตำแหน่งโครโมโซม 9p21 และการแสดงออกของยีน การระบุตัวแปรการต่อเชื่อม ANRIL ใหม่แปดตัว" PLOS ONE . 4 (11) e7677. Bibcode : 2009PLoSO...4.7677F . doi : 10.1371/journal.pone.0007677 . PMC 2765615 . PMID 19888323 .
- Uno S, Zembutsu H, Hirasawa A, Takahashi A, Kubo M, Akahane T และคณะ (สิงหาคม 2010). "การศึกษาการเชื่อมโยงทั่วทั้งจีโนมระบุตัวแปรทางพันธุกรรมในตำแหน่ง CDKN2BAS ที่เกี่ยวข้องกับโรคเยื่อบุโพรงมดลูกเจริญผิดที่ในชาวญี่ปุ่น" Nature Genetics . 42 (8): 707– 710. doi : 10.1038/ng.612 . PMID 20601957 . S2CID 205356736 .
- Wrensch M, Jenkins RB, Chang JS, Yeh RF, Xiao Y, Decker PA และคณะ (สิงหาคม 2552) "ความแปรผันในบริเวณ CDKN2B และ RTEL1 เกี่ยวข้องกับความเสี่ยงต่อการเกิดเนื้องอกสมองชนิดร้ายแรง" Nature Genetics 41 ( 8): 905– 908. doi : 10.1038/ng.408 . PMC 2923561 . PMID 19578366 .
- Bilguvar K, Yasuno K, Niemelä M, Ruigrok YM, von Und Zu Fraunberg M, van Duijn CM และคณะ (ธันวาคม 2551). "ตำแหน่งที่อ่อนแอต่อหลอดเลือดโป่งพองในกะโหลกศีรษะในประชากรยุโรปและญี่ปุ่น " พันธุศาสตร์ธรรมชาติ . 40 (12): 1472– 1477. ดอย : 10.1038/ng.240 . PMC 2682433 . PMID18997786 .
- Sato K, Nakagawa H, Tajima A, Yoshida K, Inoue I (กันยายน 2010). "ANRIL มีส่วนเกี่ยวข้องในการควบคุมนิวเคลียสและเป้าหมายการถอดรหัสที่เป็นไปได้ของ E2F1" . Oncology Reports . 24 (3): 701– 707. doi : 10.3892/or_00000910 . PMID 20664976 .
- Yasuno K, Bilguvar K, Bijlenga P, Low SK, Krischek B, Auburger G และคณะ (พฤษภาคม 2010). "การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมของหลอดเลือดโป่งพองในสมองระบุตำแหน่งเสี่ยงใหม่ 3 ตำแหน่ง" Nature Genetics . 42 (5): 420– 425. doi : 10.1038/ng.563 . PMC 2861730 . PMID 20364137 .
- Broadbent HM, Peden JF, Lorkowski S, Goel A, Ongen H, Green F และคณะ (มีนาคม 2551) "ความเสี่ยงต่อโรคหลอดเลือดหัวใจและโรคเบาหวานถูกเข้ารหัสโดย SNP ที่แตกต่างกันและเชื่อมโยงกันอย่างแน่นหนาในตำแหน่ง ANRIL บนโครโมโซม 9p" Human Molecular Genetics . 17 (6): 806– 814. doi : 10.1093/hmg/ddm352 . PMID 18048406 .
- Hashikata H, Liu W, Inoue K, Mineharu Y, Yamada S, Nanayakkara S และคณะ (มิถุนายน 2010). "การยืนยันความสัมพันธ์ของโพลีมอร์ฟิซึมแบบนิวคลีโอไทด์เดี่ยว rs1333040 บน 9p21 กับหลอดเลือดโป่งพองในสมองแบบครอบครัวและแบบไม่เป็นกรรมพันธุ์ในผู้ป่วยชาวญี่ปุ่น" . Stroke . 41 (6): 1138– 1144. doi : 10.1161/STROKEAHA.109.576694 . hdl : 2433/142049 . PMID 20395613 .
- Helgadottir A, Thorleifsson G, Manolescu A, Gretarsdottir S, Blondal T, Jonasdottir A, และคณะ (มิถุนายน 2550). "ตัวแปรทั่วไปของโครโมโซม 9p21 ส่งผลต่อความเสี่ยงของภาวะกล้ามเนื้อหัวใจตาย" ศาสตร์ . 316 (5830): 1491– 1493. Bibcode : 2007Sci...316.1491H . ดอย : 10.1126/science.1142842 . PMID17478679 . S2CID 71851374 .
- Yang XR, Liang X, Pfeiffer RM, Wheeler W, Maeder D, Burdette L และคณะ (ธันวาคม 2010) "ความสัมพันธ์ของตัวแปร 9p21 กับมะเร็งผิวหนังชนิดเมลาโนมา ไฝ และลักษณะการสร้างเม็ดสีในครอบครัวที่มีแนวโน้มเป็นมะเร็งเมลาโนมาที่มีและไม่มีการกลายพันธุ์ของ CDKN2A"มะเร็งในครอบครัว 9 ( 4): 625– 633. doi : 10.1007/s10689-010-9356-3 . PMC 3233727 . PMID 20574843 .
- Shete S, Hosking FJ, Robertson LB, Dobbins SE, Sanson M, Malmer B และคณะ (สิงหาคม 2552) "การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมระบุตำแหน่งความเสี่ยง 5 ตำแหน่งสำหรับเนื้องอกในสมอง" Nature Genetics 41 ( 8): 899– 904. doi : 10.1038/ng.407 . PMC 4501476 . PMID 19578367 .
- Bei JX, Li Y, Jia WH, Feng BJ, Zhou G, Chen LZ และคณะ (กรกฎาคม 2553). "การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมของมะเร็งโพรงจมูกระบุตำแหน่งความเสี่ยงใหม่ 3 ตำแหน่ง" Nature Genetics . 42 (7): 599– 603. doi : 10.1038/ng.601 . PMID 20512145 . S2CID 205356689 .
- Turnbull C, Ahmed S, Morrison J, Pernet D, Renwick A, Maranian M และคณะ (มิถุนายน 2010). "การศึกษาการเชื่อมโยงทั่วทั้งจีโนมระบุตำแหน่งความเสี่ยงมะเร็งเต้านมใหม่ 5 ตำแหน่ง" Nature Genetics . 42 (6): 504– 507. doi : 10.1038/ng.586 . PMC 3632836 . PMID 20453838 .
- Schaefer AS, Richter GM, Groessner-Schreiber B, Noack B, Nothnagel M, El Mokhtari NE และคณะ (กุมภาพันธ์ 2552) Marchini J (บรรณาธิการ) "การระบุตำแหน่งยีนที่ทำให้เกิดความเสี่ยงร่วมกันของโรคหลอดเลือดหัวใจและโรคปริทันต์" PLOS Genetics 5 ( 2 ) e1000378 doi : 10.1371/ journal.pgen.1000378 PMC 2632758 PMID 19214202
- Chen L, Qu H, Guo M, Zhang Y, Cui Y, Yang Q และคณะ (เมษายน 2563). "ANRIL และหลอดเลือด" . วารสารเภสัชศาสตร์คลินิกและการบำบัด . 45 (2): 240– 248. ดอย : 10.1111/jcpt.13060 . PMID31703157 . S2CID 207956113 .
ลิงก์ภายนอก
- หน้าสำหรับบริเวณอนุรักษ์อินทรอนิกส์ของแอนติเซนส์ CDKN2B 1ที่Rfam
- ตำแหน่งจีโนมของยีน CDKN2B-ASในมนุษย์และรายละเอียดของยีนCDKN2B-AS ใน UCSC Genome Browser
- ตำแหน่งจีโนมของยีน CDKN2B-AS1ในมนุษย์และรายละเอียดของยีนCDKN2B-AS1 ใน UCSC Genome Browser
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ซีดีเคเอ็น2บาเอส
CDKN2B-AS หรือที่รู้จักกันในชื่อ ANRIL (antisense non-coding RNA in the INK4 locus) เป็น RNA ที่ไม่เข้ารหัสโปรตีนสายยาว ประกอบด้วย 19 เอ็กซอน ครอบคลุมพื้นที่ 126.
อ่านเพิ่มเติม
Mußotter T, Kluwe L, Högel J, Nguyen R, Cooper DN, Mautner VF, Kehrer-Sawatzki H (ตุลาคม 2012). "RNA ที่ไม่เข้ารหัส ANRIL และจำนวนของเนื้องอกประสาทแบบเพล็กซิฟอร์มในผู้ป่วยที่มีการขาดหายของยีน NF1 ขนาดเล็ก" . BMC Medical Genetics . 13 98. doi : 10.
ลิงก์ภายนอก
หน้าสำหรับบริเวณอนุรักษ์อินทรอนิกส์ของแอนติเซนส์ CDKN2B 1ที่ Rfam ตำแหน่งจีโนมของยีน CDKN2B-AS ในมนุษย์และรายละเอียดของยีน CDKN2B-AS ใน UCSC Genome Browser ตำแหน่งจีโนมของยีน CDKN2B-AS1 ในมนุษย์และรายละเอียดของยีน CDKN2B-AS1 ใน UCSC Genome Browser...