ในปี 1997 สโมสรประสบความสำเร็จในฤดูกาลนั้น

สโมสรประสบความสำเร็จในลักษณะเดียวกันในรายการแข่งขันต่างๆ ในฤดูกาลปี 1999

CS Bourgoin-Jallieu ยังเข้าชิงชนะเลิศฟุตบอลถ้วยฝรั่งเศสอีก 2 ครั้ง ในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2546 อย่างไรก็ตาม พวกเขาแพ้ทั้งสองนัด โดยแพ้ให้กับLa Rochelle 22 ต่อ 20 ในช่วงต้นปี พ.ศ. 2546 และแพ้ให้กับ Castres 27 ต่อ 26 ในเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2546 ^{[ 1 ]}ในการแข่งขัน Heineken Cup ฤดูกาล 2545–2546สโมสรทำผลงานได้ดีที่สุด โดยจบอันดับสองในกลุ่ม ชนะ 4 จาก 6 เกม แต่ก็ยังพลาดการเข้าชิงชนะเลิศ อย่างไรก็ตาม การแข่งขัน Heineken Cup ฤดูกาล 2547–2548 ของพวกเขา ไม่ประสบความสำเร็จเลย โดยแพ้ทั้ง 6 เกมในรอบแบ่งกลุ่มและจบอันดับสุดท้ายในกลุ่ม

สำหรับการแข่งขัน Heineken Cup ในบ้านกับ Munster ในฤดูกาล 2006-07 สนามStade de Genèveซึ่งจุผู้ชมได้มากกว่า 30,000 คน ถูกใช้แทนสนาม Stade Pierre Rajonจำนวนผู้ชมในวันนั้นอยู่ที่ 16,255 คน^{[ 2 ]}

ฤดูกาล 2008–09 มีทั้งความสำเร็จและความเสี่ยงต่อการตกชั้นอยู่บ้าง แม้ว่าพวกเขาจะเข้าถึงรอบชิงชนะเลิศของEuropean Challenge Cup ในฤดูกาลนั้นโดยแพ้ให้กับNorthampton Saintsแต่พวกเขาก็ใช้เวลาส่วนใหญ่ของฤดูกาลอยู่ในโซนตกชั้น นอกจากนี้พวกเขายังประสบปัญหาทางการเงินอย่างหนักจนเสี่ยงต่อการตกชั้นไปสู่ ​​Pro D2 อย่างไรก็ตาม CSBJ จบฤดูกาลในอันดับที่ปลอดภัย (อันดับ 11) และสามารถให้การรับประกันทางการเงินที่เพียงพอแก่ LNR เพื่อให้พวกเขาอยู่ใน Top 14 ต่อไปในฤดูกาล 2009–10 ได้^{[ 3 ]}