ในชีววิทยาโมเลกุลโพรบไฮบริดไดเซชัน ( HP ) คือชิ้นส่วนของDNAหรือRNAซึ่งโดยทั่วไปมีความยาว 15–10000 นิวคลีโอไทด์ซึ่งสามารถ ติดฉลาก ด้วยสารกัมมันตรังสีหรือ สารเรือง แสงได้ HP สามารถใช้ตรวจจับการมีอยู่ของ ลำดับ นิวคลีโอไทด์ใน RNA หรือ DNA ที่วิเคราะห์ซึ่งเป็นส่วนเสริมกับลำดับในโพรบ^{[ 1 ]}โพรบที่ติดฉลากจะถูกทำให้เสียสภาพ ก่อน (โดยการให้ความร้อนหรือภายใต้ สภาวะ ด่างเช่น การสัมผัสกับโซเดียมไฮดรอกไซด์ ) ให้กลายเป็น DNA สายเดี่ยว (ssDNA) จากนั้นจึงไฮบริดไดซ์กับ ssDNA เป้าหมาย ( Southern blotting ) หรือ RNA เป้าหมาย ( northern blotting ) ที่ตรึงอยู่บนเมมเบรนหรือในแหล่งกำเนิด

ในการตรวจจับการเกิดไฮบริดของโพรบกับลำดับเป้าหมาย โพรบจะถูกติดแท็ก (หรือ "ติดฉลาก") ด้วยเครื่องหมายโมเลกุลที่เป็นกัมมันตรังสีหรือ (ในปัจจุบัน) โมเลกุลเรืองแสง เครื่องหมายที่ใช้กันทั่วไป ได้แก่^32P ( ไอโซโทปกัมมันตรังสี ของฟอสฟอรัสที่รวมอยู่ใน พันธะ ฟอสโฟไดเอ สเทอ ร์ในดีเอ็นเอของโพรบ) ไดจอกซิ เจ นิน ซึ่งเป็นเครื่องหมาย ที่ไม่ใช่กัมมันตรังสี ที่ ใช้แอนติบอดีไบโอติน หรือฟลูออเรสซีน จากนั้นจะตรวจจับลำดับดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอที่มีความคล้ายคลึงกับโพรบในระดับปานกลางถึงสูงโดยการมองเห็นโพรบที่เกิดไฮบริดผ่านการถ่ายภาพรังสีอัตโนมัติหรือเทคนิคการถ่ายภาพอื่นๆ โดยปกติแล้ว จะถ่ายภาพเอกซเรย์ของตัวกรอง หรือวางตัวกรองไว้ใต้แสงยูวี การตรวจจับลำดับที่มีความคล้ายคลึงในระดับปานกลางหรือสูงขึ้นอยู่กับความเข้มงวดของเงื่อนไขการเกิดไฮบริดที่ใช้ ความเข้มงวดสูง เช่น อุณหภูมิการเกิดไฮบริดสูงและเกลือต่ำในบัฟเฟอร์การเกิดไฮบริด จะอนุญาตให้เกิดไฮบริดเฉพาะระหว่าง ลำดับ กรดนิวคลีอิกที่มีความคล้ายคลึงกันสูงเท่านั้น ในขณะที่ความเข้มงวดต่ำ เช่น อุณหภูมิต่ำและเกลือสูง จะอนุญาตให้เกิดไฮบริดได้เมื่อลำดับมีความคล้ายคลึงกันน้อยกว่า

โพรบไฮบริดไดเซชันที่ใช้ในไมโคร อาร์เรย์ดีเอ็นเอ หมายถึง ดีเอ็นเอที่ยึดติดกับพื้นผิวเฉื่อย เช่นแผ่นกระจก เคลือบ หรือชิปยีน ด้วยพันธะโควาเลนต์ โดย มีเป้าหมาย เป็น cDNA ที่เคลื่อนที่ได้ ขึ้นอยู่กับวิธีการโพรบอาจถูกสังเคราะห์โดยใช้ วิธีฟอส โฟราไมไดต์หรืออาจสร้างและติดฉลากโดย การขยายสัญญาณ PCRหรือการโคลนนิ่ง (ทั้งสองวิธีเป็นวิธีเก่า) เพื่อเพิ่ม ความเสถียรของโพรบ ในร่างกาย จึงไม่ได้ใช้ RNA แต่จะใช้สารอนาล็อกของ RNA แทน โดยเฉพาะอนุพันธ์ ของมอร์โฟลิโนโพรบที่ใช้ดีเอ็นเอหรืออาร์เอ็นเอในระดับโมเลกุลนั้นถูกนำมาใช้เป็นประจำในการคัดกรองคลังยีน การตรวจจับลำดับนิวคลีโอไทด์ด้วยวิธีการบล็อตติ้งและในเทคโนโลยีทางพันธุกรรมอื่นๆ เช่นไมโครอาร์เรย์ กรดนิวคลีอิกและ เนื้อเยื่อ

• หัววัด Scorpion®
• โพรบโมเลคูลาร์บี คอน
• โพ รบ TaqMan ®
• โพรบ LNA® ( กรดนิวคลีอิกแบบล็อก )
• เทคโนโลยีตรวจวัดการปั่นจักรยาน (CPT)
• การผสมแบบอินซิทู
• โพรบไบนารี (แยก)
• โพรบหลายองค์ประกอบ

ในสาขานิเวศวิทยาของจุลินทรีย์โพรบโอลิโกนิวคลีโอไทด์ถูกใช้เพื่อกำหนดการปรากฏตัวของจุลินทรีย์ชนิด สกุล หรือจุลินทรีย์ที่จัดอยู่ในกลุ่มที่กว้างขึ้น เช่นแบคทีเรีย อา ร์เคียและยูคาริโอตผ่านการไฮบริดไดเซชันแบบเรืองแสงในแหล่งกำเนิด (FISH) ^{[ 2 ]}โพรบ rRNA ช่วยให้นักวิทยาศาสตร์สามารถมองเห็นจุลินทรีย์ที่ยังไม่สามารถเพาะเลี้ยงในห้องปฏิบัติการได้ โดยการดึงลำดับ rRNA โดยตรงจากสิ่งแวดล้อม^{[ 3 ]}ตัวอย่างของจุลินทรีย์ประเภทนี้ ได้แก่:

• Nevskia ramosa : N. ramosaเป็นแบคทีเรียนิวสตันที่สร้างโรเซ็ตแบบแตกแขนงสองแฉกทั่วไปบนพื้นผิวของแหล่งที่อยู่อาศัยน้ำจืดตื้น ^{[ 4 ]}
• Achromatium oxaliferum : แบคทีเรียขนาดใหญ่ชนิดนี้ (ความยาวเซลล์สูงถึง >100 μm เส้นผ่านศูนย์กลางสูงถึง 50 μm) ประกอบด้วยก้อนกำมะถันและแคลไซต์จำนวนมาก และอาศัยอยู่ในชั้นบนของตะกอนน้ำจืด สามารถมองเห็นได้ด้วยตาเปล่า และเนื่องจากความต้านทานต่อการเพาะเลี้ยง ทำให้เหล่านักจุลชีววิทยาหลายรุ่นงุนงง ^{[ 5 ]}

ในบางกรณี การแยกแยะความแตกต่างระหว่างสายพันธุ์อาจเป็นปัญหาเมื่อใช้ ลำดับ 16S rRNAเนื่องจากความคล้ายคลึงกัน ในกรณีเช่นนี้23S rRNAอาจเป็นทางเลือกที่ดีกว่า^{[ 6 ]}คลังมาตรฐานระดับโลกของลำดับ rRNA กำลังมีขนาดใหญ่ขึ้นเรื่อยๆ และมีการอัปเดตอย่างต่อเนื่อง ดังนั้นความเป็นไปได้ของการเกิดไฮบริดไดเซชันแบบสุ่มระหว่างโพรบที่ออกแบบมาโดยเฉพาะ (โดยอิงจากข้อมูลที่สมบูรณ์และเป็นปัจจุบันจากสิ่งมีชีวิตทดสอบหลายชนิด) กับสิ่งมีชีวิตเป้าหมายที่ไม่ต้องการ/ไม่รู้จักจึงไม่สามารถมองข้ามไปได้ง่ายๆ^{[ 7 ]}ในทางตรงกันข้าม เป็นไปได้ว่ามีจุลินทรีย์ที่ยังไม่ได้รับการระบุ ซึ่งเป็นสมาชิกทางสายวิวัฒนาการของกลุ่มเป้าหมายของโพรบ แต่มีไซต์เป้าหมายบางส่วนหรือเกือบสมบูรณ์ ซึ่งมักใช้เมื่อออกแบบโพรบเฉพาะกลุ่ม

ข้อจำกัดเชิงปฏิบัติที่สำคัญที่สุดของเทคนิคนี้น่าจะเป็นการขาดระบบอัตโนมัติ^{[ 8 ]}

ในวิทยาศาสตร์นิติเวช โพรบไฮบริดไดเซชันถูกใช้เพื่อตรวจจับบริเวณซ้ำแบบสั้น ( ไมโครแซทเทลไลต์ ) ^{[ 9 ]}และในวิธีการโพลีมอร์ฟิซึมความยาวชิ้นส่วนจำกัด ( RFLP ) ซึ่งทั้งหมดนี้ใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิเคราะห์ โปรไฟล์ DNA

• โพรบโมเลกุล