เมื่ออายุสิบสี่ปี เขาเข้าร่วมกองทัพในตำแหน่ง นายทหารยศเอน ไซน์ในกรมทหารรักษาพระองค์โคลด์สตรี ม และหลังจากนั้นไม่นานก็เดินทางไปเบรเมนพร้อมกับกองทหารในปี 1807 กองพันที่เขาสังกัดได้เดินทางไปยังโคเปนเฮเกนและหลังจากยึดเมืองนั้นได้สำเร็จก็เดินทางกลับอังกฤษ

ในปี ค.ศ. 1809 กองทหารรักษาการณ์โคลด์สตรีมได้ออกเดินทางไปยังคาบสมุทรไอบีเรียและเข้าร่วมในการรบครั้งสำคัญทั้งหมดที่นั่นเพื่อต่อต้าน กองกำลัง ของนโปเลียนโดยเริ่มจากทาลาเวราและสิ้นสุดที่ ตู ลู ส แมคคินนอนได้รับยศร้อย โทก่อนจากนั้นเป็นร้อยเอก และได้รับแต่งตั้ง เป็น ผู้ช่วยนายพลเซอร์เอ็ดเวิร์ด สต็อปฟอร์ดขณะอยู่ที่นั่น เขายังถูกบันทึกว่าเป็นเพื่อนร่วมทางประจำของลอร์ดไบรอนซึ่งพักอยู่ในลิสบอน^{[ 4 ]}

เขากลายเป็นที่รู้จักตลอดการรบด้วยความกล้าหาญที่เยือกเย็น ในโอกาสหนึ่ง ขณะที่กองทัพกำลังผ่านช่องเขาที่ทหารอังกฤษกำลังบุกออกมาภายใต้การยิงอย่างหนัก ทหารพบว่ากัปตันแมคคินนอนกำลังโกนหนวดอย่างใจเย็นในจุดที่อันตรายที่สุด เมื่อเห็นเช่นนั้น ทหารจึงรีบรุกไปข้างหน้าและขับไล่กองทัพฝรั่งเศสไปได้

ในปี พ.ศ. 2357 แมคคินนอนได้รับการเลื่อนยศเป็นพันโท ต้นเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2358 เขาขึ้นเรือเปิดลำหนึ่งพร้อมกับนายทหารอีกคนหนึ่งที่แรมส์เกตเพื่อไปสมทบกับกองทหาร ของเขาซึ่งประจำการอยู่ใกล้ กรุงบรัสเซลส์และมาถึงออสเตนด์ ในเช้าวันรุ่งขึ้น เขาเข้าร่วมในการสู้รบในวันที่ 16 และ 17 และในยุทธการวอเตอร์ลูในวันที่ 18 ^{[ 5 ]}ซึ่งม้าของเขาถูกยิงตายไป 3 ตัว

ในการรุกเข้าโจมตีฝรั่งเศส โดยนำทหารส่วนหนึ่งในกรมของเขา เขาถูกยิงที่เข่า ทำให้ม้า ของเขาตาย และเมื่อล้มลง เขาก็ทำดาบหาย เขาล้มลงใกล้กับนายทหารฝรั่งเศสที่บาดเจ็บสาหัสกว่า และเมื่อหยิบดาบของนายทหารคนนั้น เขาก็บอกอย่างสุภาพว่าหวังว่าพวกเขาจะได้ร่วมรับประทานอาหารเย็นด้วยกันในคืนนั้น เมื่อทรงตัวได้แล้ว เขาก็ขึ้นม้าอีกครั้ง กระตุ้นให้ทหารของเขารุกไปข้างหน้า ในช่วงท้ายของวันนั้น พันเอกแมคคินนอนได้รับคำสั่งให้เข้ายึดฟาร์มฮูโกมงต์ ทางด้านข้างของกองกำลังพันธมิตร ซึ่งเขาประจำการอยู่กับทหารรักษาการณ์โคลด์สตรีมประมาณ 250 นาย และกรม ทหารรักษาการณ์เกรนาเดียร์ที่1 ^{[ 5 ]}

ดยุกแห่งเวลลิงตันตระหนักถึงความสำคัญอย่างยิ่งของตำแหน่งฟาร์ม จึงส่งคำสั่งให้ป้องกันฟาร์มจนถึงที่สุด นโปเลียนสั่งให้กองพันแล้วกองพันเล่าพยายามยึดฟาร์ม ซึ่งก่อให้เกิดการสังหารหมู่อย่างมากมาย แม้จะเจ็บปวดจากบาดแผล และขาของเขาเกือบพิการ พันเอกแมคคินนอนก็ยังคงป้องกันจุดยุทธศาสตร์อันอันตรายนั้นต่อไป จนกระทั่งการรุกคืบของแนวรบอังกฤษทั้งหมด และการแตกพ่ายของกองทัพฝรั่งเศสในเวลาต่อมา ได้ยุติการต่อสู้ในวันนั้น เมื่อการต่อสู้สิ้นสุดลง แมคคินนอนก็ล้มลงเนื่องจากการเสียเลือดและความเหนื่อยล้า และถูกส่งตัวไปรักษาที่บรัสเซลส์ด้วยเปลหาม เขาออกกำลังกายเป็นประจำก่อนได้รับบาดเจ็บ และรายงานข่าวในหนังสือพิมพ์ระบุว่าการเสียชีวิตก่อนวัยอันควรของเขาเกิดจากการต้องเลิกนิสัยนี้เนื่องจากผลกระทบหลังบาดแผล^{[ 2 ]}

เมื่อวันที่ 17 กรกฎาคม พ.ศ. 2366 ณโบสถ์เซนต์จอร์จ ฮาโนเวอร์ สแควร์ แดเนียล แมคคินนอน ได้แต่งงานกับแอนน์ เจน เดนต์ โดยได้รับอนุญาตจากบิชอป – เธอเป็นลูกสาวคนโตของ จอ ห์น เดนต์สมาชิกสภาผู้แทนราษฎรจากเมืองพูล^{[ 6 ] [ 5 ]}ในปี พ.ศ. 2369 เขาได้ซื้อหุ้นส่วนใหญ่ในหน่วยโคลด์สตรีมการ์ด ซึ่งทำให้เขามียศพันเอกเต็มยศในกองทัพอังกฤษ และได้รับคำสั่งให้บังคับบัญชากองทหารที่เขาเคยประจำการมาตลอดชีวิตการรับราชการทหาร

พระเจ้าวิลเลียมที่ 4 ทรงแสดงความปรารถนาว่านายทหารทุกคนในกองทหารควรส่งรายงานเกี่ยวกับกองทหารของตนไปยังกระทรวงกลาโหมและผู้บัญชาการทหารสูงสุดที่ฮอร์สการ์ดพันเอกแมคคินนอนได้จัดทำรายงานเกี่ยวกับกองทหารของเขาชื่อ "ที่มาและการบริการของกองทหารโคลด์สตรีม การ์ด " ซึ่งตีพิมพ์ในปี พ.ศ. 2476 ^{[ 5 ]}ห้องสมุดของเขาถูกขายในการประมูลโดยอีแวนส์เมื่อวันที่ 11 พฤษภาคม พ.ศ. 2463 ใน 243 รายการ แคตตาล็อกที่ไม่ระบุชื่อมีชื่อว่า "ห้องสมุดที่เลือกสรรและมีค่าของบุคคลผู้มีชื่อเสียงในวงการแฟชั่น" บันทึกร่วมสมัยในสำเนาแคตตาล็อกที่ห้องสมุดมหาวิทยาลัยเคมบริดจ์ (หมายเลขชั้น Munby.c.122(11)) ระบุว่าคอลเลกชันนี้เป็นของแมคคินนอน แมคคินนอนเสียชีวิตที่บ้านบนถนนเฮิร์ตฟอร์ดในเมย์แฟร์และถูกฝังที่สุสานเคนซัลกรีน^{[ 7 ]}