อ่าน 7 นาที
อีเอฟ6
ปัจจัยเริ่มต้นการแปลยูคาริโอต 6 ( EIF6 ) หรือที่รู้จักกันในชื่อ โปรตีนจับอินทิกรินเบตา 4 ( ITGB4BP ) เป็น ยีน ของ มนุษย์ [ 5 ]
อีเอฟ6
| อีเอฟ6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | EIF6 , CAB, EIF3A, ITGB4BP, b(2)gcn, eIF-6, p27(BBP), p27BBP, ปัจจัยเริ่มต้นการแปลของยูคาริโอต 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 602912 ; เอ็มจีไอ : 1196288 ; โฮโมโลยีน : 7135 ; การ์ดยีน : EIF6 ; OMA : EIF6 - ออโธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ปัจจัยเริ่มต้นการแปลยูคาริโอต 6 ( EIF6 ) หรือที่รู้จักกันในชื่อโปรตีนจับอินทิกรินเบตา 4 ( ITGB4BP ) เป็นยีนของ มนุษย์ [ 5 ]
เฮมิเดสโมโซมเป็นโครงสร้างที่เชื่อมโยงเบซัลลามินาเข้ากับไซโตสเกเลตัน ของเส้นใยระดับกลาง ส่วนประกอบที่สำคัญในการทำงานของเฮมิเดสโมโซมคือซับยูนิตเบตา-4 ของอินทิกริน ( ITGB4 ) ซึ่งเป็นโปรตีนที่มีโดเมนไฟโบรเนกตินชนิด III สองโดเมน โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้จะจับกับโดเมนไฟโบรเนกตินชนิด III ของ ITGB4 และอาจช่วยเชื่อมโยง ITGB4 เข้ากับไซโตสเกเลตันของเส้นใยระดับกลาง โปรตีนที่เข้ารหัสซึ่งไม่ละลายน้ำและพบได้ทั้งในนิวเคลียสและ ไซ โตพลาสซึมสามารถทำหน้าที่เป็นปัจจัยเริ่มต้นการแปลและเร่งปฏิกิริยาการเชื่อมโยงของ ซับยูนิต ไรโบโซม40Sและ60S พร้อมกับ eIF5 ที่จับกับ GTP มีการค้นพบ ตัวแปรการถอดรหัสหลายตัวที่เข้ารหัส ไอโซฟอร์มที่แตกต่างกันหลายแบบ สำหรับยีนนี้ [ 5 ]
EIF6 มีบทบาทสำคัญในการสร้างไรโบโซม 80S ของยูคาริโอต การเจริญเติบโตของเซลล์ และการแสดงออกของยีน ไรโบโซม 80S สามารถแยกออกเป็นซับยูนิต 40S และ 60S ได้ EIF6 ช่วยปกป้องซับยูนิต 60S ที่เจริญเต็มที่ จากนั้น EIF6 จะต้องแยกตัวออกจากซับยูนิต 60S เพื่อให้สามารถจับกับซับยูนิต 40S เพื่อสร้างไรโบโซม การรักษาสมดุลของ EIF6 เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับร่างกาย: EIF6 จำนวนน้อยช่วยในการสังเคราะห์ไรโบโซมปกติ ในขณะที่ EIF6 จำนวนมากจะยับยั้งการจับกันระหว่างซับยูนิต 60S กับซับยูนิต 40S [ 6 ]
การทำงาน
EIF6 พบได้ทั้งในนิวคลีโอลัสและไซโตพลาสซึม ในนิวคลีโอลัสของเซลล์ยูคาริโอต คอมเพล็กซ์พรีไรโบโซม 90S จะแยกตัวออกเป็นคอมเพล็กซ์พรีไรโบโซม 60S และคอมเพล็กซ์พรีไรโบโซม 40S ซึ่งเกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ไรโบโซมที่สมบูรณ์ EIF6 มีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการสร้างซับยูนิต 60S และการขาดหายไปของ EIF6 จะส่งผลร้ายแรง การขาดหายไปบางส่วนของ EIF6 ส่งผลให้ปริมาณซับยูนิตไรโบโซม 60S อิสระลดลง ซึ่งหมายความว่ามันทำให้สัดส่วนของซับยูนิต 40S/60S เสียสมดุล และจำกัดความเร็วของการสังเคราะห์โปรตีน คอมเพล็กซ์พรีไรโบโซม 60S ที่เกี่ยวข้องกับ EIF6 จะเคลื่อนย้ายจากนิวคลีโอลัสไปยังไซโตพลาสซึม จากนั้น EIF6 จะแยกตัวออกจากพรี 60S เพื่อให้ซับยูนิต 60S สามารถจับกับซับยูนิต 40S และดำเนินการต่อไปในขั้นตอนต่อไป EIF6 สามารถทำหน้าที่เป็นปัจจัยเริ่มต้นการแปลที่จำกัดอัตรา และระดับการแสดงออกของมันมีอิทธิพลต่ออัตราการแปล eIF6 จำนวนน้อยจะเร่งการแปลโปรตีนเล็กน้อย ในขณะที่ eIF6 จำนวนมากจะขัดขวางกระบวนการแปลโดยการยับยั้งการสร้างไรโบโซม[ 7 ]กิจกรรมของ eIF6 ยังทำให้เกิดไกลโคไลซิสและการสังเคราะห์กรดไขมันโดยการควบคุมการแปลของ mRNA [ 8 ]
โครงสร้าง
eIF6 มีความยาว 245 กรดอะมิโน
การแสดงออก
EIF6 มีระดับการแสดงออกที่แตกต่างกันในเนื้อเยื่อและเซลล์ต่างๆ EIF6 มีระดับการแสดงออกสูงในเซลล์ต้นกำเนิดและเซลล์ที่กำลังแบ่งตัว ในขณะที่ไม่มีการแสดงออกในเซลล์หลังการแบ่งตัว มีระดับสูงในสมองและเยื่อบุผิว ในขณะที่มีระดับต่ำในกล้ามเนื้อ[ 9 ]
ปฏิสัมพันธ์
EIF6 ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับFHL2 [ 10 ] ITGB4 [ 11 ]และGNB2L1 [ 12 ]
EIF6 มีบทบาทสำคัญในการสร้างไรโบโซม 80S การเจริญเติบโตของเซลล์ และการแสดงออกของยีน[ 13 ]
วิวัฒนาการ
eIF6 มีอยู่ในทั้งยีสต์และมนุษย์ และลำดับกรดอะมิโนของมันเหมือนกัน 77% ระหว่างทั้งสอง[ 7 ]ไม่พบการทำซ้ำของ eIF6 หรือแม้แต่โมทีฟที่อนุรักษ์ไว้ภายในโปรตีน[ 7 ]
ประวัติศาสตร์
กิจกรรม eIF6 ได้รับการอธิบายครั้งแรกโดยงานวิจัยในช่วงต้นทศวรรษ 1980 จากห้องปฏิบัติการของLinda L. SpremulliและUmadas Maitra [ 7 ]ในที่สุดยีนนี้ก็ถูกโคลนโดยกลุ่มของ Maitra และGene Carlo Marchisioซึ่งทั้งสองกลุ่มได้ตีพิมพ์ผลงานของพวกเขาในปี 1997 [ 7 ]
ดูเพิ่มเติม
อ่านเพิ่มเติม
- Biffo S, Sanvito F, Costa S, Preve L, Pignatelli R, Spinardi L, Marchisio PC (พฤศจิกายน 1997). "การแยกโปรตีนที่จับกับ เบต้า4 อินทิกรินชนิดใหม่ (p27(BBP)) ที่แสดงออกในระดับสูงในเซลล์เยื่อบุผิว"วารสารชีวเคมี 272 (48): 30314– 21. doi : 10.1074/jbc.272.48.30314 . PMID 9374518 .
- Si K, Chaudhuri J, Chevesich J, Maitra U (ธันวาคม 1997). "การโคลนโมเลกุลและการแสดงออกเชิงหน้าที่ของ cDNA ของมนุษย์ที่เข้ารหัสปัจจัยเริ่มต้นการแปล 6" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (26): 14285– 90. Bibcode : 1997PNAS...9414285S . doi : 10.1073/pnas.94.26.14285 . PMC 24943. PMID 9405604 .
- Mao M, Fu G, Wu JS, Zhang QH, Zhou J, Kan LX, Huang QH, He KL, Gu BW, Han ZG, Shen Y, Gu J, Yu YP, Xu SH, Wang YX, Chen SJ, Chen Z (กรกฎาคม 1998). "การระบุยีนที่แสดงออกในเซลล์ต้นกำเนิด/เซลล์บรรพบุรุษเม็ดเลือด CD34(+) ของมนุษย์โดยใช้แท็กของลำดับที่แสดงออกและการโคลน cDNA แบบเต็มความยาวที่มีประสิทธิภาพ" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (14): 8175– 80. Bibcode : 1998PNAS...95.8175M . doi : 10.1073/pnas.95.14.8175 . PMC 20949 . PMID 9653160 .
- Sanvito F, Arrigo G, Zuffardi O, Agnelli M, Marchisio PC, Biffo S (สิงหาคม 1998). "การระบุตำแหน่งของยีนโปรตีนที่จับกับ p27 beta4 (ITGB4BP) ในบริเวณโครโมโซมมนุษย์ 20q11.2" Genomics . 52 (1): 111– 2. doi : 10.1006/geno.1998.5403 . PMID 9740680 .
- Sanvito F, Piatti S, Villa A, Bossi M, Lucchini G, Marchisio PC, Biffo S (มีนาคม 1999). "โปรตีนปฏิสัมพันธ์ของเบต้า4 อินทิกริน p27(BBP/eIF6) เป็นโปรตีนเมทริกซ์นิวเคลียร์ที่จำเป็นซึ่งเกี่ยวข้องกับการประกอบหน่วยย่อยไรโบโซม 60S"วารสารชีววิทยาของเซลล์ 144 ( 5): 823– 37. doi : 10.1083/jcb.144.5.823 . PMC 2148184 . PMID 10085284 .
- Wixler V, Geerts D, Laplantine E, Westhoff D, Smyth N, Aumailley M, Sonnenberg A, Paulsson M (ตุลาคม 2000). "โปรตีน LIM-only DRAL/FHL2 จับกับโดเมนไซโตพลาสมิกของสายอินทิกรินอัลฟาและเบตาหลายสายและถูกดึงดูดไปยังคอมเพล็กซ์การยึดเกาะ"วารสารชีวเคมี275 (43): 33669– 78. doi : 10.1074 /jbc.M002519200 . PMID 10906324 .
- Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (ตุลาคม 2000). "การโคลนและการวิเคราะห์การทำงานของ cDNA ที่มีกรอบการอ่านแบบเปิดสำหรับยีน 300 ยีนที่ไม่เคยมีการระบุมาก่อนซึ่งแสดงออกในเซลล์ต้นกำเนิด/เซลล์บรรพบุรุษเม็ดเลือด CD34+" . Genome Research . 10 (10): 1546– 60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
- Donadini A, Giodini A, Sanvito F, Marchisio PC, Biffo S (มีนาคม 2001). "ยีน ITGB4BP ของมนุษย์มีการแสดงออกอย่างต่อเนื่องในหลอดทดลอง แต่มีการเปลี่ยนแปลงอย่างมากในร่างกาย" Gene . 266 ( 1– 2): 35– 43. doi : 10.1016/S0378-1119(01)00370-5 . PMID 11290417 .
- Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (มกราคม 2545). "การวิเคราะห์โปรตีนโดยตรงของนิวคลีโอลัสของมนุษย์" Current Biology . 12 (1): 1– 11. Bibcode : 2002CBio...12....1A . doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
- Basu U, Si K, Deng H, Maitra U (กันยายน 2546). "การฟอสโฟรีเลชันของปัจจัยเริ่มต้นการแปลรหัสยูคาริโอตของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม 6 และโฮโมล็อก Tif6p ของ Saccharomyces cerevisiae: หลักฐานที่แสดงว่าการฟอสโฟรีเลชันของ Tif6p ควบคุมการกระจายตัวในนิวเคลียสและไซโตพลาสซึม และจำเป็นต่อการเจริญเติบโตของเซลล์ยีสต์" . Molecular and Cellular Biology . 23 (17): 6187– 99. doi : 10.1128/MCB.23.17.6187-6199.2003 . PMC 180954 . PMID 12917340 .
- Ceci M, Gaviraghi C, Gorrini C, Sala LA, Offenhäuser N, Marchisio PC, Biffo S (ธันวาคม 2003). "การปลดปล่อย eIF6 (p27BBP) จากซับยูนิต 60S ช่วยให้การประกอบไรโบโซม 80S เกิดขึ้นได้" Nature . 426 (6966): 579– 84. Bibcode : 2003Natur.426..579C . doi : 10.1038/nature02160 . PMID 14654845 . S2CID 2431706 .
- รอสโซ่ พี, คอร์เตซิน่า จี, ซานวิโต้ เอฟ, โดนาดินี่ เอ, ดิ เบเนเดตโต้ บี, บิฟโฟ เอส, มาร์คิซิโอ พีซี (พฤษภาคม 2004) "การแสดงออกของ p27BBP มากเกินไปในมะเร็งศีรษะและคอ และการแพร่กระจายของต่อมน้ำเหลือง" ศีรษะและคอ . 26 (5): 408– 17. CiteSeerX 10.1.1.503.9652 . ดอย : 10.1002/hed.10401 . PMID15122657 . S2CID 39531947 .
- Lehner B, Sanderson CM (กรกฎาคม 2547). "กรอบปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนสำหรับการย่อยสลาย mRNA ของมนุษย์" . Genome Research . 14 (7): 1315– 23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
- Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (มกราคม 2548). "การวิเคราะห์โปรไฟล์อิมมูโนแอฟฟินิตีของการฟอสโฟรีเลชันของไทโรซีนในเซลล์มะเร็ง" Nature Biotechnology . 23 (1): 94– 101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (มกราคม 2548). "พลวัตของโปรตีนในนิวเคลียส" Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
- สเตลซล์ ยู, วอร์ม ยู, ลาลอฟสกี้ เอ็ม, แฮนิก ซี, เบรมเบ็ค เอฟเอช, โกห์เลอร์ เอช, สโตรเอดิคเก้ เอ็ม, เซนค์เนอร์ เอ็ม, เชินแฮร์ เอ, โคเอปเพน เอส, ทิมม์ เจ, มินท์ซลาฟฟ์ เอส, อับราฮัม ซี, บ็อค เอ็น, คีทซ์มันน์ เอส, โกเอดด์ เอ, ทอคเซิซ อี, ดรอจ เอ, โครบิตช์ เอส, คอร์น บี, เบิร์ชไมเออร์ ดับเบิลยู, เลห์รัค เอช, Wanker EE (กันยายน 2548) "เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนและโปรตีนของมนุษย์: ทรัพยากรสำหรับใส่คำอธิบายประกอบโปรตีโอม" เซลล์ 122 (6): 957– 68. ดอย : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ อีเอฟ6
ปัจจัยเริ่มต้นการแปลยูคาริโอต 6 ( EIF6 ) หรือที่รู้จักกันในชื่อ โปรตีนจับอินทิกรินเบตา 4 ( ITGB4BP ) เป็น ยีน ของ มนุษย์ [ 5 ]
การทำงาน
EIF6 พบได้ทั้งในนิวคลีโอลัสและไซโตพลาสซึม ในนิวคลีโอลัสของเซลล์ยูคาริโอต คอมเพล็กซ์พรีไรโบโซม 90S จะแยกตัวออกเป็นคอมเพล็กซ์พรีไรโบโซม 60S และคอมเพล็กซ์พรีไรโบโซม 40S ซึ่งเกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ไรโบโซมที่สมบูรณ์ EIF6 มีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการสร้างซับยูนิต...
การแสดงออก
EIF6 มีระดับการแสดงออกที่แตกต่างกันในเนื้อเยื่อและเซลล์ต่างๆ EIF6 มีระดับการแสดงออกสูงในเซลล์ต้นกำเนิดและเซลล์ที่กำลังแบ่งตัว ในขณะที่ไม่มีการแสดงออกในเซลล์หลังการแบ่งตัว มีระดับสูงในสมองและเยื่อบุผิว ในขณะที่มีระดับต่ำในกล้ามเนื้อ [ 9 ]
ปฏิสัมพันธ์
EIF6 ได้รับการแสดงให้เห็นว่า มี ปฏิสัมพันธ์ กับ FHL2 [ 10 ] ITGB4 [ 11 ] และ GNB2L1 [ 12 ]