ในปี พ.ศ. 2531 เขาเริ่มต้นอาชีพราชการในตำแหน่งผู้ฝึกงานผู้ว่าราชการอำเภอ หลังจากทำงานสองปีที่สำนักงานผู้ว่าราชการจังหวัดซาการ์ยา และศึกษาต่อในสหราชอาณาจักรเป็นเวลาหนึ่งปี เขาก็ได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้ว่าราชการอำเภอ และดำรงตำแหน่งสองปีในแต่ละอำเภอของเมืองเดอร์เนกปาซารี จังหวัดทรับซอนและ เมือง คาบาตาช จังหวัดออร์ดู ต่อมาอาลาได้รับการแต่งตั้งเป็นรองผู้ว่าราชการจังหวัดในเมืองตุนเจลี^{[ 1 ] [ 2 ]}

หลังจากดำรงตำแหน่งต่างๆ ในกระทรวงต่างๆ เขาได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้ว่าราชการจังหวัดบัตมันในปี 2546 โดยดำรงตำแหน่งเป็นเวลาหนึ่งปี ในวันที่ 14 กันยายน 2547 เขาได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้ว่าราชการจังหวัดดิยาบาคีร์และดำรงตำแหน่งนั้นจนถึงปี 2550 ^{[ 1 ] [ 2 ]}

เมื่อวันที่ 10 กันยายน พ.ศ. 2550 อาลาได้ดำรงตำแหน่งเป็นรองปลัดกระทรวงนายกรัฐมนตรี^{[ 1 ] [ 2 ]}

เมื่อวันที่ 25 ธันวาคม พ.ศ. 2556 รัฐมนตรีว่าการกระทรวงมหาดไทยมูอัมเมอร์ กือเลอร์ ลาออกจากตำแหน่งพร้อมกับสมาชิกคณะรัฐมนตรีอีกสองคน หลังจากการสอบสวนคดีทุจริตซึ่งเกี่ยวข้องกับบุตรชายของเขา^{[ 3 ]}ในวันเดียวกันนั้น นายกรัฐมนตรีเออร์โดกันได้ประกาศปรับคณะรัฐมนตรีโดยมีชื่อใหม่ 10 คน^{[ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}ในวันถัดมาคือวันที่ 26 ธันวาคม เอฟคาน อลา เข้ารับตำแหน่งรัฐมนตรีว่าการกระทรวงมหาดไทย^{[ 1 ] [ 2 ] [ 6 ]} ในฐานะผู้ไม่ได้เป็นสมาชิกสภาผู้แทนราษฎร ซึ่งการกระทำดังกล่าวถูกวิพากษ์วิจารณ์อย่างรุนแรงจาก ส.ส. บางคนของ พรรค AKPของนายกรัฐมนตรีเองรวมถึงผู้นำของพรรคCHP ฝ่ายค้าน ด้วย^{[ 4 ​​] [ 8 ]}

อาลาลาออกจากคณะรัฐมนตรีเมื่อวันที่ 31 สิงหาคม 2559 หลังจากถูกฝ่ายค้านวิพากษ์วิจารณ์อย่างต่อเนื่องว่าล้มเหลวในการจัดการกับการก่อการร้ายที่เพิ่มขึ้นโดยพรรคแรงงานเคิร์ด (PKK) กลุ่มรัฐอิสลามแห่งอิรักและเลแวนต์ (ISIL) และขบวนการกูเลน (FETÖ) การโจมตีในอังการา อิสตันบูลและทางตะวันออกเฉียงใต้ รวมถึงในจังหวัดชายแดนซีเรียอย่างกาซิอันเตปและคิลิสส่งผลให้มีการเรียกร้องให้ Ala ลาออกอย่างต่อเนื่อง พร้อมทั้งมีการวิพากษ์วิจารณ์ถึงวิธีการที่กระทรวงมหาดไทยแต่งตั้งผู้ว่าราชการจังหวัดผู้บัญชาการตำรวจ และข้าราชการหลายคนทั่วประเทศ ซึ่งต่อมาพบว่าเป็นผู้สนับสนุน FETÖ องค์กรที่ถูกกล่าวหาว่าก่อรัฐประหารล้มเหลวในเดือนกรกฎาคม 2016 ไม่มีการระบุเหตุผลการลาออกของ Ala แม้ว่าพรรคฝ่ายค้านหลักอย่างพรรคประชาชนสาธารณรัฐ (CHP) จะอ้างว่า Ala ถูกปลดออกจากตำแหน่งหลังจากผู้ว่าราชการจังหวัดซิโนปที่ ถูกจับกุม และผู้สนับสนุน FETÖ ที่ถูกกล่าวหาอ้างว่าเขามีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับ Ala ^{[ 9 ] [ 10 ]}