อีจีอาร์1
โครงสร้างที่มีอยู่ พีดีบี การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB รายชื่อรหัส PDB 4R2A , 4R2C , 4R2D , 4X9J
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	EGR1 , AT225, G0S30, KROX-24, NGFI-A, TIS8, ZIF-268, ZNF225, การตอบสนองการเจริญเติบโตในระยะเริ่มต้น 1
รหัสภายนอก	โอมิม : 128990 ; เอ็มจีไอ : 95295 ; โฮโมโลยีน : 56394 ; การ์ดยีน : EGR1 ; OMA : EGR1 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ ) คริส. โครโมโซม 5 (มนุษย์) [ 1 ] วงดนตรี 5q31.2 เริ่ม 138,465,479 bp [ 1 ] จบ 138,469,303 bp [ 1 ]
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ ) คริส. โครโมโซม 18 (เมาส์) [ 2 ] วงดนตรี 18 B1|18 ​​18.76 cM เริ่ม 34,992,876 bp [ 2 ] จบ 34,998,037 bp [ 2 ]
รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก) สูงสุดที่แสดงใน เยื่อบุของกระเพาะอาหาร ท่อนำไข่ซ้าย ถุงน้ำดี เส้นเลือดดำซาเฟนัส เวน่า คาวา ผิวหนังต้นขา หัวนม เส้นใยปริทันต์ ถุงน้ำอสุจิ ไขกระดูกไต สูงสุดที่แสดงใน แกรนูโลไซต์ เปลือกสมองส่วนหน้า สไตรอาตัมส่วนหลัง ไจรัสซิงกูเลต เปลือกสมองส่วนสั่งการหลัก เปลือกสมองส่วนรับภาพ เซลล์คิวมูลัส นิวเคลียสแอคคัมเบนส์ เปลือกสมองส่วนรับภาพหลัก ร่องหน้าผากส่วนบน ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม ไบโอจีพีเอส ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับกับ DNA การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับ การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับในบริเวณควบคุมการถอดรหัสของ RNA polymerase II กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA กิจกรรมกระตุ้นการถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II การจับกับบริเวณควบคุมการถอดรหัสแบบซิส การจับไอออนโลหะ กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัส, การจับจำเพาะของลำดับบริเวณใกล้เคียงโปรโมเตอร์หลักของ RNA polymerase II การจับโปรตีน การจับตัวของฮิสโตนอะเซทิลทรานสเฟอเรส การจับกรดนิวคลีอิก การจับกับ DNA ที่ถูกเมทิลเลตครึ่งหนึ่ง การจับกับดีเอ็นเอสายคู่ที่มีเมทิล การจับไอออนสังกะสี การจับโครมาตินแบบจำเพาะต่อโปรโมเตอร์ กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II ส่วนประกอบของเซลล์ นิวคลีโอพลาสม์ นิวเคลียส ไซโตพลาซึม กระบวนการทางชีวภาพ การควบคุมกระบวนการอะพอพโทซิส การตอบสนองของเซลล์ต่อสารอินทรีย์ การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การเพิ่มจำนวนของเซลล์เมแซงเจียลในโกลเมอรูลัส การควบคุมเชิงลบของการถอดรหัสโดย RNA polymerase II การตอบสนองต่อกลูโคส การถอดรหัสโดย RNA polymerase II เส้นทางการส่งสัญญาณ BMP การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การควบคุมการถอดรหัสเชิงบวกโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ การตอบสนองต่ออินซูลิน เส้นทางการส่งสัญญาณที่ควบคุมโดยอินเตอร์ลิวคิน-1 การตอบสนองของเซลล์ต่อกรดไมโคฟีนอลิก การแยกแยะเซลล์ T วิถีการส่งสัญญาณของอินเตอร์เฟรอนชนิดที่ 1 การควบคุมเชิงบวกของการเพิ่มจำนวนเซลล์เมแซงเจียลเมตาเนฟริกของโกลเมอรูลัส การตอบสนองของเซลล์ต่อรังสีแกมมา การควบคุมการถอดรหัสจากโปรโมเตอร์ของ RNA polymerase II เพื่อตอบสนองต่อภาวะขาดออกซิเจน การจำแนกเซลล์กล้ามเนื้อโครงร่าง การตอบสนองของเซลล์ต่อเฮปาริน การควบคุมการซูโมอิเลชันของโปรตีน การควบคุมเชิงลบของวิถีการส่งสัญญาณ Wnt แบบดั้งเดิม การควบคุมการถอดรหัสในเชิงบวกโดย RNA polymerase II การตอบสนองของเซลล์ต่ออินเตอร์ลิวคิน-8 การตอบสนองต่อภาวะขาดออกซิเจน การตอบสนองต่อภาวะขาดเลือด วงจรการเป็นสัด การควบคุมเชิงบวกของกระบวนการสังเคราะห์ฮอร์โมน การควบคุมกระบวนการสังเคราะห์โปรเจสเตอโรน การควบคุมการถอดรหัสโดย RNA polymerase II การควบคุมการแสดงออกของยีนในเชิงบวก การควบคุมการแสดงออกของยีนตามจังหวะชีวภาพ จังหวะการเคลื่อนไหว กระบวนการจังหวะ การรักษาสมดุลอุณหภูมิตามวงจรชีวิตประจำวัน การควบคุมการตายของเซลล์ประสาทในเชิงบวก การควบคุมเชิงบวกของกิจกรรมไคเนสของโปรตีนเทา แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ 1958 13653 วงดนตรี ENSG00000120738 ENSMUSG00000038418 ยูนิโปรท พี18146 พี08046 RefSeq (mRNA) NM_001964 NM_007913 RefSeq (โปรตีน) NP_001955 NP_031939 สถานที่ตั้ง (UCSC) Chr 5: 138.47 – 138.47 Mb Chr 18: 34.99 – 35 Mb การค้นหาใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ ดู/แก้ไขเมาส์

EGR-1 (Early growth response protein 1) หรือNGFI-A (nerve growth factor-induced protein A) เป็นโปรตีน ที่ใน มนุษย์ ถูกสร้างขึ้นโดยยีนEGR1

EGR-1 เป็นปัจจัยการถอดรหัสในสัตว์ เลี้ยงลูกด้วยนม เดิมทีมันถูกตั้งชื่อว่า Krox-24, TIS8 และZENKโดยถูกค้นพบครั้งแรกใน หนู

โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้เป็นของตระกูล EGR ของโปรตีน ซิงค์ฟิงเกอร์ชนิดCys His เป็นโปรตีนนิวเคลียร์และทำหน้าที่เป็นตัวควบคุมการถอดรหัส ผลิตภัณฑ์ของยีนเป้าหมายที่มันกระตุ้นมีความจำเป็นสำหรับการแบ่งตัวและการแบ่งเซลล์การศึกษาชี้ให้เห็นว่านี่เป็นยีนยับยั้งเนื้องอก^{[ 5 ]}

มีรูปแบบการแสดงออกที่แตกต่างกันในสมอง และพบว่าการเหนี่ยวนำมีความเกี่ยวข้องกับกิจกรรมของเซลล์ประสาท การศึกษาหลายชิ้นชี้ให้เห็นว่ามีบทบาทในความยืดหยุ่นของเซลล์ประสาท^{[ 6 ]}

EGR-1 เป็นปัจจัยการถอดรหัส ที่สำคัญ ใน การสร้าง ความทรงจำมีบทบาทสำคัญในการปรับเปลี่ยนเอพิเจเนติก ของ เซลล์ ประสาทใน สมอง EGR-1 ดึงดูดโปรตีน TET1ซึ่งเริ่มต้นกระบวนการกำจัดเมทิลของ DNA ^{[ 7 ]}การ กำจัดเครื่องหมายเมทิลของ DNA ช่วยให้ยีนปลายทางทำงานได้ EGR-1 ร่วมกับ TET1 ถูกนำมาใช้ในการกำหนดการกระจายของตำแหน่งเมทิลบน DNA ในสมองระหว่างการพัฒนาสมองการเรียนรู้ และ ความยืดหยุ่นของเซลล์ประสาทในระยะยาวนอกจากนี้ยังพบว่า EGR-1 ควบคุมการแสดงออกของVAMP2 (โปรตีนที่สำคัญสำหรับการปล่อยสารสื่อประสาท ) ^{[ 8 ]}

นอกจากหน้าที่ในระบบประสาทแล้ว ยังมีหลักฐานสำคัญที่แสดงว่า EGR-1 พร้อมกับพาราล็อก EGR-2 ที่ถูกเหนี่ยวนำในโรคไฟโบรซิสมีหน้าที่สำคัญในการสร้างไฟบรินและจำเป็นต่อการเกิดไฟโบรซิสที่เหนี่ยวนำในหนูทดลอง^{[ 9 ]}

นอกจากนี้อาจเกี่ยวข้องกับการทำงานของรังไข่ด้วย^{[ 10 ]}

โดเมนจับกับ DNA ของ EGR-1 ประกอบด้วย โดเมน ซิงค์ฟิงเกอร์ 3 โดเมน ชนิด Cys His โครงสร้างกรดอะมิโนของโดเมนซิงค์ฟิงเกอร์ EGR-1 แสดงอยู่ในตารางนี้ โดยใช้รหัสกรดอะมิโนแบบตัวอักษรเดี่ยว ฟิงเกอร์ที่ 1 ถึง 3 ระบุด้วย f1 - f3 ตัวเลขหมายถึงตำแหน่งของกรดอะมิโนในอัลฟาเฮ ลิกซ์ (ไม่มีเลขศูนย์) กรดอะมิโนที่ทำเครื่องหมาย 'x' ไม่ใช่ส่วนหนึ่งของซิงค์ฟิงเกอร์ แต่ทำหน้าที่เชื่อมต่อซิงค์ฟิงเกอร์เข้าด้วยกัน

คำอธิบายกรดอะมิโน: อลานีน (Ala, A), อาร์จินีน (Arg, R) , แอส ปาราจีน ( Asn, N ), กรดแอสปาร์ติก (Asp, D ) , ซิสเทอีน (Cys, C) , กรดกลูตามิก (Glu, E), กลูตามีน( Gln, Q), ไกล ซีน (Gly, G) , ฮิสติดีน ( His, H), ไอโซลิวซีน (Ile, I) , ลิวซีน ( Leu, L ), ไลซีน ( Lys, K), เมไทโอนีน (Met, M) , ฟีนิลอะลานีน (Phe, F), โพรลีน (Pro, P), เซรีน (Ser, S), ทรีโอนีน (Thr, T), ทริปโตเฟน (Trp, W), ไทโรซีน (Tyr, Y), วาลีน (Val, V)

โครงสร้างผลึกของDNAที่จับกับโดเมนนิ้วสังกะสีของ EGR-1 ได้รับการไขปริศนาในปี พ.ศ. 2534 ซึ่งช่วยอย่างมากในการวิจัยเบื้องต้นเกี่ยวกับโดเมนนิ้วสังกะสีที่จับกับ DNA ^{[ 11 ]}

โปรตีน EGR-1 ของมนุษย์ (ในรูปแบบที่ยังไม่ผ่านกระบวนการ) ประกอบด้วยกรดอะมิโน 543 ตัว มีน้ำหนักโมเลกุล 57.5 กิโลดาลตันและยีนตั้งอยู่บน โครโมโซมคู่ ที่ 5

EGR-1 จับกับลำดับ DNA 5'-GCG TGG GCG-3' (และลำดับที่คล้ายกัน เช่น 5'-GCG GGG GCG-3') ^{[ 12 ] [ 13 ]} ตำแหน่ง f1 ที่ 6 จับกับ 5' G (เบสตัวแรกนับจากซ้าย); ตำแหน่ง f1 ที่ 3 จับกับเบสตัวที่สอง (C); ตำแหน่ง f1 ที่ -1 จับกับตำแหน่งที่สาม (G); ตำแหน่ง f2 ที่ 6 จับกับเบสตัวที่สี่ (T); และอื่นๆ^{[ 14 ]}

จากการศึกษาพบว่า EGR-1 มีปฏิกิริยากับสารดังต่อไปนี้:

• CEBPB , ^{[ 15 ]}
• ^{โปรตีนที่จับ กับ} CREB [ ^{16 ]}
• EP300 , ^{[ 16 ]}
• NAB1 , ^{[ 17 ]}
• P53 , ^{[ 18 ]}และ
• PSMA3 ^{[ 19 ]}

• นิ้วสังกะสี

• Zif+268+protein,+humanที่ US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
• แฟคทอรบุ๊คอีจีอาร์-1
• ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ในPDBสำหรับUniProt : P18146 (โปรตีนตอบสนองการเจริญเติบโตช่วงต้นของมนุษย์ 1) ที่PDBe- KB
• ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ในPDBสำหรับUniProt : P08046 (โปรตีนตอบสนองการเจริญเติบโตระยะแรกของหนู 1) ที่PDBe- KB