อ่าน 5 นาที
พื้นผิวพลังงานศักยภาพ
พื้น ผิวพลังงานศักยภาพ ( PES ) หรือ ภูมิทัศน์พลังงาน อธิบายถึงพลังงานของ ระบบ โดยเฉพาะอย่างยิ่งกลุ่มอะตอม ในแง่ของ พารามิเตอร์ บางอย่าง ซึ่งโดยปกติคือตำแหน่งของอะตอม พื้นผิว...
พื้นผิวพลังงานศักยภาพ


พื้นผิวพลังงานศักยภาพ ( PES ) หรือภูมิทัศน์พลังงานอธิบายถึงพลังงานของระบบโดยเฉพาะอย่างยิ่งกลุ่มอะตอม ในแง่ของพารามิเตอร์ บางอย่าง ซึ่งโดยปกติคือตำแหน่งของอะตอมพื้นผิวอาจกำหนดพลังงานเป็นฟังก์ชันของพิกัดหนึ่งหรือมากกว่านั้น หากมีเพียงพิกัดเดียว พื้นผิวจะเรียกว่าเส้นโค้งพลังงานศักยภาพหรือโปรไฟล์พลังงานตัวอย่างเช่นศักยภาพมอร์ส/ศักยภาพระยะไกล
การใช้อุปมาอุปไมยของภูมิทัศน์จะเป็นประโยชน์: สำหรับระบบที่มีสององศาอิสระ (เช่น ความยาวพันธะสองค่า) ค่าของพลังงาน (อุปมาอุปไมย: ความสูงของพื้นดิน) เป็นฟังก์ชันของความยาวพันธะสองค่า (อุปมาอุปไมย: พิกัดของตำแหน่งบนพื้นดิน) [ 1 ]
แนวคิด PES ( Energy Energy Landscape) มีการประยุกต์ใช้ในสาขาต่างๆ เช่นฟิสิกส์เคมีและชีวเคมีโดยเฉพาะอย่างยิ่งในสาขาย่อยเชิงทฤษฎีของวิชาเหล่านี้ สามารถใช้เพื่อสำรวจคุณสมบัติของโครงสร้างที่ประกอบด้วยอะตอมในเชิงทฤษฎีได้ เช่น การหาโครงสร้างที่มีพลังงานต่ำสุดของโมเลกุลหรือการคำนวณอัตราการเกิดปฏิกิริยาเคมีสามารถใช้เพื่ออธิบายโครงสร้างที่เป็นไปได้ทั้งหมดของโมเลกุลหรือตำแหน่งเชิงพื้นที่ของโมเลกุล ที่ทำปฏิกิริยากัน ในระบบ หรือพารามิเตอร์และระดับพลังงานที่สอดคล้องกัน โดยทั่วไปคือพลังงานอิสระของกิบส์ในทางเรขาคณิต ภูมิทัศน์พลังงานคือกราฟของฟังก์ชันพลังงานบนพื้นที่การกำหนดค่าของระบบ คำนี้ยังใช้ในมุมมองทางเรขาคณิตทั่วไปสำหรับการเพิ่มประสิทธิภาพทางคณิตศาสตร์เมื่อโดเมนของฟังก์ชันความสูญเสียคือพื้นที่พารามิเตอร์ของระบบบางระบบ
นิยามและการคำนวณทางคณิตศาสตร์
รูปทรงเรขาคณิตของกลุ่มอะตอมสามารถอธิบายได้ด้วยเวกเตอร์rซึ่งองค์ประกอบของเวกเตอร์แสดงถึงตำแหน่งของอะตอม เวกเตอร์rอาจเป็นชุดพิกัดคาร์ทีเซียนของอะตอม หรืออาจเป็นชุดระยะทางและมุมระหว่างอะตอมก็ได้
เมื่อกำหนดr แล้ว พลังงานที่เป็นฟังก์ชันของตำแหน่งE ( r )คือค่าของE ( r )สำหรับทุกrที่สนใจ โดยใช้การเปรียบเทียบกับภูมิทัศน์จากบทนำE จะให้ความสูงบน "ภูมิทัศน์พลังงาน" ดังนั้นจึงเกิดแนวคิดของ พื้นผิวพลังงานศักย์ขึ้นมา
ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีโดยใช้ PES เป็นฟังก์ชันของตำแหน่งอะตอม จำเป็นต้องคำนวณพลังงานสำหรับทุกการจัดเรียงอะตอมที่สนใจ วิธีการคำนวณพลังงานของการจัดเรียงอะตอมแบบเฉพาะเจาะจงนั้นได้อธิบายไว้อย่างละเอียดใน บทความ เคมีเชิงคำนวณและในที่นี้จะเน้นที่การหาค่าประมาณของE ( r )เพื่อให้ได้ข้อมูลพลังงาน-ตำแหน่งที่ละเอียดขึ้น
สำหรับระบบเคมีที่ง่ายมาก หรือเมื่อมีการประมาณค่าแบบง่ายเกี่ยวกับปฏิสัมพันธ์ระหว่างอะตอม บางครั้งอาจสามารถใช้การแสดงออกที่ได้มาจากการวิเคราะห์สำหรับพลังงานเป็นฟังก์ชันของตำแหน่งอะตอมได้ ตัวอย่างเช่น ศักยภาพ London - Eyring - Polanyi -Sato [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]สำหรับระบบ H + H 2เป็นฟังก์ชันของระยะ HH ทั้งสาม
สำหรับระบบที่ซับซ้อนกว่า การคำนวณพลังงานของการจัดเรียงอะตอมที่เฉพาะเจาะจงมักจะมีค่าใช้จ่ายในการคำนวณสูงเกินไปจนไม่สามารถแสดงพื้นผิวในระดับใหญ่ได้ สำหรับระบบเหล่านี้ แนวทางที่เป็นไปได้คือการคำนวณเฉพาะชุดจุดที่ลดลงบน PES แล้วใช้วิธีการประมาณค่าแบบประหยัดกว่าในการคำนวณ เช่นการประมาณค่าแบบ Shepardเพื่อเติมช่องว่าง[ 5 ]
แอปพลิเคชัน
พื้นผิวพลังงานศักย์ (PES) เป็นเครื่องมือเชิงแนวคิดที่ช่วยในการวิเคราะห์รูปทรงเรขาคณิตของโมเลกุลและพลวัตของปฏิกิริยา เคมี เมื่อประเมินจุดที่จำเป็นบน PES แล้ว จุดเหล่านั้นสามารถจำแนกได้ตามอนุพันธ์อันดับที่หนึ่งและอันดับที่สองของพลังงานเทียบกับตำแหน่ง ซึ่งก็คือเกรเดียนต์และความโค้งตามลำดับ จุดนิ่ง (หรือจุดที่มีเกรเดียนต์เป็นศูนย์) มีความหมายทางกายภาพ: จุดต่ำสุดของพลังงานสอดคล้องกับชนิดของสารเคมีที่มีเสถียรภาพทางกายภาพ และจุดอานม้าสอดคล้องกับสถานะเปลี่ยนผ่านซึ่งเป็นจุดที่มีพลังงานสูงสุดบนพิกัดปฏิกิริยา (ซึ่งเป็นเส้นทางที่มีพลังงานต่ำที่สุดที่เชื่อมต่อสารตั้งต้นทางเคมีกับผลิตภัณฑ์ทางเคมี)
คำนี้มีประโยชน์เมื่อพิจารณาการพับตัวของโปรตีนในทางทฤษฎีแล้ว โปรตีนสามารถมีอยู่ได้ในรูปแบบโครงสร้างที่แทบจะไม่มีที่สิ้นสุดตามระดับพลังงานของมัน แต่ในความเป็นจริง โปรตีนจะพับตัว (หรือ "คลายตัว") ไปเป็นโครงสร้างทุติยภูมิและ ตติยภูมิที่มี พลังงานอิสระต่ำที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้แนวคิดหลักในแนวทางระดับพลังงานในการพับตัวของโปรตีนคือสมมติฐานกรวยการพับตัว (folding funnel hypothesis)
ในการเร่งปฏิกิริยาเมื่อออกแบบตัวเร่งปฏิกิริยาใหม่หรือปรับปรุงตัวเร่งปฏิกิริยาที่มีอยู่แล้ว จะต้องพิจารณาภูมิทัศน์พลังงานเพื่อหลีกเลี่ยงตัวกลางที่มีพลังงานต่ำหรือพลังงานสูงซึ่งอาจหยุดปฏิกิริยาหรือต้องการพลังงานมากเกินไปเพื่อให้ได้ผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้าย[ 6 ]
ในแบบจำลองแก้วจุดต่ำสุดเฉพาะที่ของภูมิทัศน์พลังงานสอดคล้องกับสถานะอุณหภูมิต่ำที่ไม่เสถียรของระบบเทอร์โมไดนามิก[ 7 ] [ 8 ]
ในการเรียนรู้ของเครื่องจักรเครือข่ายประสาทเทียมอาจได้รับการวิเคราะห์โดยใช้แนวทางที่คล้ายคลึงกัน[ 9 ]ตัวอย่างเช่น เครือข่ายประสาทอาจสามารถปรับให้เข้ากับชุดข้อมูลฝึกฝน ได้อย่างสมบูรณ์แบบ ซึ่งสอดคล้องกับค่าต่ำสุดทั่วโลก ของการสูญเสียเป็นศูนย์ แต่เกิดการโอเวอร์ฟิตโมเดล("เรียนรู้สัญญาณรบกวน" หรือ "จดจำชุดข้อมูลฝึกฝน") การทำความเข้าใจว่าเมื่อใดที่เกิดเหตุการณ์นี้ขึ้นสามารถศึกษาได้โดยใช้เรขาคณิตของภูมิทัศน์พลังงานที่สอดคล้องกัน[ 10 ]
พื้นผิวที่ดึงดูดใจและพื้นผิวที่น่ารังเกียจ
พื้นผิวพลังงานศักยภาพสำหรับปฏิกิริยาเคมีสามารถจำแนกได้เป็นแบบดึงดูดหรือแบบผลักโดยการเปรียบเทียบการขยายความยาวพันธะในสารเชิงซ้อนที่ถูกกระตุ้นเมื่อเทียบกับสารตั้งต้นและผลิตภัณฑ์[ 11 ] [ 12 ]สำหรับปฏิกิริยาประเภท A + B—C → A—B + C การขยายความยาวพันธะสำหรับพันธะ A—B ที่เกิดขึ้นใหม่จะถูกกำหนดเป็น R* AB = R AB − R 0 ABโดยที่ R ABคือความยาวพันธะ A—B ในสถานะเปลี่ยนผ่านและ R 0 ABในโมเลกุลของผลิตภัณฑ์ ในทำนองเดียวกันสำหรับพันธะที่แตกในปฏิกิริยา R* BC = R BC − R 0 BCโดยที่ R 0 BCหมายถึงโมเลกุลของสารตั้งต้น[ 13 ]
สำหรับปฏิกิริยาคายความร้อน PES จะถูกจัดประเภทเป็นแบบดึงดูด (หรือลงเนินเร็ว ) ถ้า R* AB > R* BCซึ่งหมายความว่าถึงสถานะการเปลี่ยนผ่านในขณะที่สารตั้งต้นกำลังเข้าใกล้กัน หลังจากสถานะการเปลี่ยนผ่าน ความยาวพันธะ A—B จะลดลงอย่างต่อเนื่อง ทำให้พลังงานปฏิกิริยาที่ปลดปล่อยออกมาส่วนใหญ่ถูกแปลงเป็น พลังงาน การสั่นของพันธะ A—B [ 13 ] [ 14 ]ตัวอย่างเช่นปฏิกิริยาฉมวก K + Br 2 → K—Br + Br ซึ่งแรงดึงดูดระยะไกลเริ่มต้นของสารตั้งต้นนำไปสู่สารเชิงซ้อนที่ถูกกระตุ้นซึ่งมีลักษณะคล้าย K + •••Br − •••Br [ 13 ]ประชากรของโมเลกุลผลิตภัณฑ์ที่ถูกกระตุ้นด้วยการสั่นสามารถตรวจจับได้ด้วยการเรืองแสงเคมีอินฟราเรด[ 15 ] [ 16 ]
ในทางตรงกันข้าม PES สำหรับปฏิกิริยา H + Cl 2 → HCl + Cl นั้นเป็นแบบผลัก (หรือลงช้า ) เนื่องจาก R* HCl < R* ClClและสถานะการเปลี่ยนผ่านจะเกิดขึ้นเมื่อผลิตภัณฑ์แยกออกจากกัน[ 13 ] [ 14 ]สำหรับปฏิกิริยานี้ซึ่งอะตอม A (ในที่นี้คือ H) เบากว่า B และ C พลังงานปฏิกิริยาจะถูกปล่อยออกมาเป็นหลักในรูปของพลังงานจลน์ การเคลื่อนที่ ของผลิตภัณฑ์[ 13 ]สำหรับปฏิกิริยาเช่น F + H 2 → HF + H ซึ่งอะตอม A หนักกว่า B และ C จะมี การปลดปล่อยพลังงาน แบบผสมทั้งการสั่นและการเคลื่อนที่ แม้ว่า PES จะเป็นแบบผลักก็ตาม[ 13 ]
สำหรับปฏิกิริยาดูดความร้อนประเภทของพื้นผิวจะเป็นตัวกำหนดประเภทของพลังงานที่มีประสิทธิภาพมากที่สุดในการทำให้เกิดปฏิกิริยา พลังงานการเคลื่อนที่ของสารตั้งต้นมีประสิทธิภาพมากที่สุดในการกระตุ้นปฏิกิริยากับพื้นผิวที่ดึงดูด ในขณะที่การกระตุ้นการสั่น (ไปสู่เลขควอนตัมการสั่น ที่สูงขึ้น v) มีประสิทธิภาพมากกว่าสำหรับปฏิกิริยากับพื้นผิวที่ผลักกัน[ 13 ]ตัวอย่างเช่น ในกรณีหลัง ปฏิกิริยา F + HCl(v=1) → Cl + HF จะเร็วกว่า F + HCl(v=0) → Cl + HF ประมาณห้าเท่าสำหรับพลังงานรวมของ HCl ที่เท่ากัน[ 17 ]
ประวัติศาสตร์
แนวคิดของพื้นผิวพลังงานศักยภาพสำหรับปฏิกิริยาเคมีได้รับการเสนอครั้งแรกโดยนักฟิสิกส์ชาวฝรั่งเศสRené Marcelinในปี พ.ศ. 2456 [ 18 ]การคำนวณพื้นผิวพลังงานศักยภาพแบบกึ่งเชิงประจักษ์ครั้งแรกได้รับการเสนอสำหรับปฏิกิริยา H + H 2โดยHenry EyringและMichael Polanyiในปี พ.ศ. 2474 Eyring ใช้พื้นผิวพลังงานศักยภาพในการคำนวณค่าคงที่อัตราปฏิกิริยาในทฤษฎีสถานะการเปลี่ยนผ่านในปี พ.ศ. 2478
H + H 2 PES สองมิติ
พื้นผิวพลังงานศักย์มักแสดงเป็นกราฟสามมิติ แต่ก็สามารถแสดงด้วยกราฟสองมิติได้เช่นกัน โดยที่ความคืบหน้าของปฏิกิริยาจะถูกพล็อตโดยใช้เส้นไอโซเอนเนอร์เจติก ระบบเชิงเส้น H + H₂ เป็นปฏิกิริยาง่ายๆ ที่ช่วยให้สามารถพล็อตพื้นผิวพลังงานศักย์สองมิติได้อย่างง่ายดายและเข้าใจ ในปฏิกิริยานี้ อะตอมไฮโดรเจน (H) ทำปฏิกิริยากับโมเลกุลไดไฮโดรเจน (H₂ )โดยการสร้างพันธะใหม่กับอะตอมหนึ่งจากโมเลกุล ซึ่งจะทำให้พันธะของโมเลกุลเดิมแตกออก สัญลักษณ์ที่ใช้คือ H₂a + H₂b –H₂c → H₂a –H₂b + H₂cความคืบ หน้าของปฏิกิริยาจากสารตั้งต้น (H + H₂) ไปสู่ผลิตภัณฑ์ (HHH) รวมถึงพลังงานของสารที่เกี่ยวข้องในปฏิกิริยา จะถูกกำหนดไว้อย่างชัดเจนในพื้นผิวพลังงานศักย์ที่ เกี่ยวข้องโปรไฟล์พลังงานอธิบายพลังงานศักย์เป็นฟังก์ชันของตัวแปรทางเรขาคณิต (พื้นผิวพลังงานศักย์ในมิติใดๆ ก็ตามเป็นอิสระจากเวลาและอุณหภูมิ)

เรามีองค์ประกอบที่เกี่ยวข้องต่างๆ ในเกม PES แบบ 2 มิติ ดังนี้:
- แผนภาพ 2 มิติแสดงจุดต่ำสุดซึ่งเป็นจุดที่พบสารตั้งต้นผลิตภัณฑ์และจุดอานม้าหรือสถานะเปลี่ยนผ่าน
- สถานะการเปลี่ยนผ่านเป็นจุดสูงสุดในพิกัดปฏิกิริยาและจุดต่ำสุดในพิกัดที่ตั้งฉากกับเส้นทางปฏิกิริยา
- การดำเนินไปของเวลาอธิบายถึงวิถีการเปลี่ยนแปลงในทุกปฏิกิริยา ขึ้นอยู่กับสภาวะของปฏิกิริยา กระบวนการจะแสดงวิธีการที่แตกต่างกันในการไปสู่การสร้างผลิตภัณฑ์ ซึ่งแสดงไว้ระหว่างแกนทั้งสอง
ดูเพิ่มเติม
- เคมีเชิงคำนวณ
- การลดการใช้พลังงาน (หรือการปรับรูปทรงเรขาคณิตให้เหมาะสมที่สุด)
- ข้อมูลพลังงาน (เคมี)
- บ่อน้ำที่มีศักยภาพ
- พิกัดปฏิกิริยา
บรรณานุกรม
Schön, JC (5 สิงหาคม 2024). "ภูมิทัศน์พลังงาน—อดีต ปัจจุบัน และอนาคต: มุมมอง" . วารสารเคมีฟิสิกส์ . 161 (5) 050901. Bibcode : 2024JChPh.161e0901S . doi : 10.1063/5.0212867 . PMID 39101536 .
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ พื้นผิวพลังงานศักยภาพ
พื้น ผิวพลังงานศักยภาพ ( PES ) หรือ ภูมิทัศน์พลังงาน อธิบายถึงพลังงานของ ระบบ โดยเฉพาะอย่างยิ่งกลุ่มอะตอม ในแง่ของ พารามิเตอร์ บางอย่าง ซึ่งโดยปกติคือตำแหน่งของอะตอม พื้นผิว...
นิยามและการคำนวณทางคณิตศาสตร์
รูปทรงเรขาคณิตของกลุ่มอะตอมสามารถอธิบายได้ด้วยเวกเตอร์ r ซึ่งองค์ประกอบของเวกเตอร์แสดงถึงตำแหน่งของอะตอม เวกเตอร์ r อาจเป็นชุด พิกัดคาร์ทีเซียน ของอะตอม หรืออาจเป็นชุดระยะทางและมุมระหว่างอะตอมก็ได้
แอปพลิเคชัน
พื้นผิวพลังงานศักย์ (PES) เป็นเครื่องมือเชิงแนวคิดที่ช่วยในการวิเคราะห์รูป ทรงเรขาคณิตของโมเลกุล และ พลวัตของปฏิกิริยา เคมี เมื่อประเมินจุดที่จำเป็นบน PES แล้ว จุดเหล่านั้นสามารถจำแนกได้ตามอนุพันธ์อันดับที่หนึ่งและอันดับที่สองของพลังงานเทียบกับตำแหน่ง...
พื้นผิวที่ดึงดูดใจและพื้นผิวที่น่ารังเกียจ
พื้นผิวพลังงานศักยภาพสำหรับปฏิกิริยาเคมีสามารถจำแนกได้เป็น แบบดึงดูด หรือ แบบผลัก โดยการเปรียบเทียบการขยายความยาวพันธะในสาร เชิงซ้อนที่ถูกกระตุ้น เมื่อเทียบกับสารตั้งต้นและผลิตภัณฑ์ [ 11 ] [ 12 ] สำหรับปฏิกิริยาประเภท A + B—C → A—B + C...