ฟาดี เมอร์ซา เกิดที่เมืองอัล-ดิร์บาซิยาห์ประเทศซีเรียเมื่ออายุได้สิบขวบ เขาและครอบครัวได้ย้ายออกจากบ้านเกิดที่ซีเรียไปอยู่ที่เวียนนา เมื่ออายุ 16 ปี ฟาดีเริ่มฝึกคิกบ็อกซิ่ง หลังจากแข่งขันในฐานะนักมวยสมัครเล่นในวงการคิกบ็อกซิ่งแล้ว เขาได้เปลี่ยนมาแข่งขันมวยไทย เขาได้รับรางวัลแรกเมื่ออายุ 18 ปี โดยชนะการแข่งขัน WPKL Junior World Super Welterweight Championship ในงานแข่งขันที่จัดขึ้นใกล้กรุงเวียนนาประเทศออสเตรียเมื่อวันที่ 15 พฤศจิกายน 1997

หลังจากคว้าแชมป์เยาวชนมาได้ เมอร์ซาได้รับโอกาสในปี 2000 ให้ขึ้นชกชิงแชมป์โลกมวยไทยรุ่นมิดเดิลเวทของสภาคิกบ็อกซิ่งอาชีพโลก (WPKC) ซึ่งเป็นหนึ่งในองค์กรรับรองการแข่งขันระดับรองของโลก ฟาดีเอาชนะคู่ต่อสู้ด้วยคะแนน ทำให้เขาคว้าแชมป์โลกสมัยที่สองได้สำเร็จ ในเดือนพฤษภาคม 2001 เขาได้ขึ้นชกชิงแชมป์มวยไทยยุโรปของWKA ซึ่งเป็นองค์กรที่มีชื่อเสียงกว่า เขาเผชิญหน้ากับยูจีน วาเลริโอ นักมวยชาวอังกฤษที่ชกเป็นประจำ ในรายการ Vienna Fight Night ครั้งแรก วาเลริโอประสบปัญหาจากลูกเตะเข่าที่แม่นยำของฟาดี จนได้รับบาดเจ็บเป็นแผลแตกเหนือตา ในที่สุดลูกเตะที่เข้ากลางลำตัวอย่างแม่นยำก็เป็นจุดจบของนักมวยชาวอังกฤษ โดยทำให้แขนท่อนล่างของเขาหัก ฟาดีชนะด้วยการน็อกเอาต์ในรอบที่สอง

หนึ่งปีต่อมา ที่กรุงเวียนนาอีกครั้ง ฟาดีท้าชิง ตำแหน่งแชมป์โลกรุ่นมิดเดิลเวท ของ WKA Thaiboxing ที่ว่างอยู่กับโมฮัมเหม็ด อูอาลี การต่อสู้ดำเนินไปจนครบยกหลังจากห้ารอบที่ดุเดือด ต่อหน้าผู้ชมในบ้านเกิด ฟาดีพ่ายแพ้ด้วยคะแนนที่สูสี แม้จะพ่ายแพ้ แต่เขาก็ได้รับการเซ็นสัญญาจากนักธุรกิจชาวออสเตรีย มาร์คัส บาวเออร์ ให้เข้าร่วมองค์กรคิกบ็อกซิ่ง SuperLeague ของเขา

เมอร์ซาเปิดตัวในซูเปอร์ลีกครั้งแรกในรายการเปิดฤดูกาลที่เวียนนาในเดือนพฤษภาคมปี 2003 ฟาดีแสดงผลงานได้อย่างโดดเด่นในการต่อสู้กับทาคาฮิโกะ ชิมิซุจากญี่ปุ่น ในการปรากฏตัวครั้งที่สองในซูเปอร์ลีกที่เมืองวุพเพอร์ทาล ประเทศเยอรมนีเขาเผชิญหน้ากับนักสู้ชาวญี่ปุ่นอีกคนคืออาเคโอมิ นิตตะฟาดีครองเกมในสองยกแรก แต่การต่อสู้ก็กลายเป็นการดวลที่ดุเดือดในไม่ช้า หลังจากห้ายกที่ดุเดือด เมอร์ซาก็ได้รับชัยชนะด้วยคะแนน

ในเดือนมกราคมปี 2004 เมอร์ซาได้ท้าชิงเข็มขัดแชมป์โลกรุ่นมิดเดิลเวทของ IKBO กับ คามาล เอล อัมรานี ต่อหน้าผู้ชมเต็มสนาม การชกครั้งนั้นดุเดือดจนต้องตัดสินกันยกใหญ่ แต่ฟาดีก็พ่ายแพ้ไปอย่างเฉียดฉิวด้วยคะแนนจากคู่ต่อสู้ชาวโมร็อกโกชื่อดัง ฟาดี เมอร์ซา ขึ้นมาอยู่อันดับ 3 ในการจัดอันดับมิดเดิลเวทอย่างเป็นทางการของซูเปอร์ลีก ด้วยชัยชนะเหนือ ปีเตอร์ ครูก, โฮเซ เรส, เปตร โพลัค และ มาไลเป็ต ซาซิปราปา และแพ้เพียงแค่การชกกับ โอเล ลอว์เซน, ซาฮิน ยาคุท และ จอห์น เวย์น พาร์ เท่านั้น ปิดฉากอาชีพในซูเปอร์ลีกที่ประสบความสำเร็จ ฟาดีได้เผชิญหน้ากับอัลเวียร์ ลิมาเพื่อชิงเข็มขัดมิดเดิลเวทที่ว่างอยู่ของซูเปอร์ลีก แต่ก็พ่ายแพ้ไปอย่างเฉียดฉิว การชกของเขากับลิมายังคงได้รับการยกย่องจากแฟนๆ มวยหลายคนว่าเป็นหนึ่งในการชกที่ดีที่สุดในประวัติศาสตร์ของซูเปอร์ลีก

เมอร์ซา สามารถกลับมาคว้าชัยชนะได้อีกครั้งอย่างน่าประทับใจ ด้วยการน็อกเอาต์ อุมุต เดมิโรอุส และ ริโก เรซิเนอู ในคืนเดียวกัน คว้าแชมป์การแข่งขันรอบคัดเลือกคิงส์คัพที่ ส วิตเซอร์แลนด์ในเดือนกันยายน ปี 2009 ฟาดีได้รับสิทธิ์เข้าร่วมการแข่งขันคิงส์คัพ ซึ่งเป็นการแข่งขันมวยไทยที่ยิ่งใหญ่และทรงเกียรติที่สุดในโลก จัดขึ้นปีละครั้งที่กรุงเทพฯประเทศไทย ท่ามกลางเสียงเชียร์ของผู้ชมกว่า 150,000 คน เมอร์ซาเอาชนะคู่ต่อสู้ในรอบก่อนรองชนะเลิศอย่าง เอ็นริโก เคห์ล จากเยอรมนี เคห์ลล้มลงสองครั้งหลังจากโดนศอกและเข่าอย่างหนัก ทำให้เมอร์ซาได้รับชัยชนะด้วยคะแนนอย่างสมควร แต่โชคร้ายที่ฟาดีต้องถอนตัวจากการแข่งขันเนื่องจากแก้วหูฉีกขาดและมีแผลเหนือตาขวา ทำให้แพทย์ข้างเวทีไม่อนุญาตให้เขาขึ้นชกอีก

หลังจากชกในรายการ SuperLeague แล้ว เมอร์ซาได้ขึ้นชกในรายการแข่งขันระดับนานาชาติทั่วโลกอย่างสม่ำเสมอ เมอร์ซาได้รับโอกาสชิงแชมป์โลกอีกครั้งในวันที่ 7 กุมภาพันธ์ 2010 โดยพบกับลูกา ดิซานโต ในการชิง แชมป์ ISKA Oriental Light Middleweight Championship การแข่งขันจัดขึ้นที่สนาม Wiener Stadium ใจกลางกรุงเวียนนา เมอร์ซาทำร้ายดิซานโตในรอบแรกด้วยการใช้เข่ากระแทกศีรษะ นักชกชาวอิตาลีถูกนับแปดแต่ยังไม่ยอมแพ้ เมอร์ซาต้องต่อสู้จนได้แชมป์มาครองด้วยคะแนนเอกฉันท์อย่างชัดเจน ก่อนสิ้นปีนั้น เขายังคว้าแชมป์โลกอีกรายการ โดยเอาชนะบาชีร์ มารูน ในมิวนิก ประเทศเยอรมนี เมื่อวันที่ 25 สิงหาคม 2010 เพื่อคว้า เข็มขัดแชมป์โลก WKA K-1 รุ่นซูเปอร์เวลเตอร์เวท

เมื่อวันที่ 22 มกราคม 2011 ฟาดี เมอร์ซา ได้ขึ้นชกกับ โจอาคิม คาร์ลสัน ที่กรุงเวียนนา ประเทศออสเตรีย เป็นการชกแก้ตัวหลังจากที่คาร์ลสันเอาชนะเขาในการพบกันครั้งแรก เมอร์ซาเอาชนะนักชกชาวสวีเดนด้วยคะแนนใน 5 ยก คว้า แชมป์โลกรุ่นมิดเดิลเวทภายใต้กติกา WKA K-1 มาครองได้สำเร็จ เมอร์ซาป้องกันตำแหน่งแชมป์ได้ถึง 6 ครั้งอย่างน่าประทับใจ ในการป้องกันตำแหน่งครั้งแรก เขาเลือกที่จะชกกับ แดน บัลเซมาโอ จากโปรตุเกส ในการชกแก้ตัว บัลเซมาโอทำผลงานได้ดีในการพบกันครั้งแรก โดยชนะด้วยคะแนน อย่างไรก็ตาม ครั้งนี้เมอร์ซาเอาชนะนักชกชาวโปรตุเกสได้ใน 5 ยก เพื่อป้องกันเข็มขัดแชมป์ไว้ได้

การป้องกันตำแหน่งครั้งต่อไปของฟาดีเป็นการเผชิญหน้ากับดาร์โก เดลิช นักคิกบ็อกซิ่งจากบอสเนียและเฮอร์เซโกวีนา ซึ่งไม่ได้รับการยกย่องว่าเป็นผู้ท้าชิงอันดับต้นๆ และเมอร์ซาใช้เวลาเพียงสองยกในการปิดเกม การป้องกันตำแหน่งครั้งต่อไปของเขาเป็นการเผชิญหน้ากับคู่ต่อสู้ที่แข็งแกร่งกว่ามาก ในเดือนกันยายน 2012 เขาเผชิญหน้ากับโมฮัมเหม็ด เอล มีร์ นักสู้ชาวเดนมาร์กที่ได้รับการยกย่องอย่างสูง เมอร์ซาพิสูจน์ให้เห็นว่าเขายังคงคู่ควรในเวทีโลกเมื่อเขาเอาชนะเอล มีร์ด้วยคะแนน ในการป้องกันตำแหน่งครั้งที่หก ฟาดีถูกท้าทายโดยเจสัน วูดแฮม แชมป์ WMC MAD จากอังกฤษ เมอร์ซาครองเกมตั้งแต่ต้นจนจบ ในยกแรก นักสู้ชาวอังกฤษล้มลงกับพื้น เห็นได้ชัดว่ายังไม่ฟื้นตัว แมนฮูดล้มลงอีกครั้งในยกที่สองหลังจากโดนหมัดขวา 2 ครั้งและหมัดซ้าย 1 ครั้ง กรรมการจึงเข้ามายุติการแข่งขัน

เมื่อวันที่ 4 พฤษภาคม 2012 เมอร์ซาเสียตำแหน่งแชมป์โลกรุ่นมิดเดิลเวทภายใต้ กติกา WKA K-1 ในการป้องกันตำแหน่งครั้งที่ 7 ของเขา หลังจากชกกันครบ 5 ยก แทบทุกคนที่อยู่ข้างเวทีต่างมองว่าเป็นการเสมอกัน อย่างไรก็ตาม ผลการแข่งขันกลับเป็นของเฟอร์นันโด คัลเซตตา คู่ต่อสู้ของฟาดี ซึ่งได้รับชัยชนะด้วยคะแนน