จีตา6

Q: ความสำคัญทางคลินิก

การกลายพันธุ์ในยีนมีความเชื่อมโยงกับ ภาวะ ไม่มีตับอ่อน และ ความผิดปกติของหัวใจแต่ กำเนิด [ 7 ]

จีตา6
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	GATA6 , โปรตีนที่จับกับ GATA 6
รหัสภายนอก	โอมิม : 601656 ; เอ็มจีไอ : 107516 ; โฮโมโลยีน : 68449 ; GeneCards : GATA6 ; OMA : GATA6 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ )
คริส.	โครโมโซม 18 (มนุษย์)
จบ	22,202,528 bp
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ )
คริส.	โครโมโซม 18 (เมาส์)
จบ	11,085,635 bp
รูปแบบการแสดงออกของ RNA
	สูงสุดที่แสดงใน
	เยื่อบุผิวสืบพันธุ์; เยื่อหุ้มปอดส่วนข้าง; เยื่อบุลำไส้เล็กส่วนเจจูนัม; ไพลอรัส; ห้องหัวใจด้านขวา; เนื้อเยื่อกล้ามเนื้อหัวใจของห้องหัวใจด้านขวา; รังไข่ข้างขวา; รังไข่ซ้าย; กลีบปอดล่าง; ต่อมหมวกไตซ้าย;
	สูงสุดที่แสดงใน
	ห้องโถงกลาง; ลิ้นหัวใจเอทริโอเวนทริคูลาร์; เนื้อเยื่อบุผิวของกระเพาะอาหาร; เบาะรองหัวใจ; ห้องหัวใจด้านขวา; กระเพาะอาหารส่วนปลาย; เซลล์ยอดประสาทลำไส้ที่เคลื่อนที่; โมรูลา; วาล์วรูปพระจันทร์เสี้ยว; เซปตัมทรานส์เวอร์ซัม;
	ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
	ไม่มีข้อมูล
ออนโทโลยีของยีน
หน้าที่ระดับโมเลกุล	การจับกับ DNA; การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับ; การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับในบริเวณควบคุมการถอดรหัสของ RNA polymerase II; กิจกรรมกระตุ้นการถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II; กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA; การจับไอออนสังกะสี; การจับตัวของปัจจัยถอดรหัส; การจับโครมาติน; การจับไอออนโลหะ; การจับโปรตีน; กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัส, การจับจำเพาะของลำดับตัวเร่งปฏิกิริยาระยะไกลของ RNA polymerase II; การจับโปรตีนไคเนส; การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับของบริเวณควบคุมซิสของ RNA polymerase II; กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II; การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับในบริเวณควบคุมซิส;
ส่วนประกอบของเซลล์	คอมเพล็กซ์ควบคุมการถอดรหัส; นิวคลีโอพลาสม์; นิวเคลียส; เยื่อหุ้มนิวเคลียส;
กระบวนการทางชีวภาพ	การแยกเซลล์คลับ; การพัฒนาอวัยวะสืบพันธุ์เพศชาย; การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การแยกแยะเซลล์เยื่อบุผิว; การแยกแยะเซลล์เอนโดเดอร์มัล; การควบคุมเชิงลบของการผลิตทรานส์ฟอร์มิงโกรทแฟคเตอร์เบตา1; การพัฒนาเนื้อเยื่อกล้ามเนื้อหัวใจ; การแยกแยะเซลล์ A ของตับอ่อน; การแยกแยะเซลล์กล้ามเนื้อหัวใจ; การแยกแยะเซลล์กล้ามเนื้อเรียบของหลอดเลือดหัวใจ; การตอบสนองของเซลล์ต่อสิ่งกระตุ้น BMP; การกำหนดชะตากรรมของเซลล์เอนโดเดอร์มัล; การแข็งตัวของเลือด; การพัฒนาตัวอ่อนในครรภ์; การควบคุมเชิงลบของการถอดรหัสโดย RNA polymerase II; การถอดรหัสโดย RNA polymerase II; การควบคุมเชิงลบของการผลิตทรานส์ฟอร์มิงโกรทแฟคเตอร์เบตา2; การสร้างรูปร่างของท่อ; การควบคุมเชิงลบของกระบวนการอะพอพโทซิส; การแยกแยะเซลล์กล้ามเนื้อเรียบ; การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การควบคุมการสร้างหลอดเลือดใหม่ในเชิงบวก; การสร้างรูปร่างของผนังกั้นทางออกของช่องระบาย; การตอบสนองต่อเอสโตรเจน; การสร้างอวัยวะของสัตว์; การควบคุมเชิงบวกของการเพิ่มจำนวนเซลล์กล้ามเนื้อหัวใจ; ภาวะกล้ามเนื้อหัวใจโตจากการตอบสนองต่อความเครียด; การแยกเซลล์เยื่อบุลำไส้; การควบคุมเชิงบวกของเส้นทางการส่งสัญญาณ BMP; การควบคุมเชิงบวกของการแตกต่างของเซลล์หัวใจ; การควบคุมการแสดงออกของยีน; กระบวนการเผาผลาญฟอสโฟลิปิด; การพัฒนาของตับ; การพัฒนาของตับอ่อน; การตอบสนองต่อปัจจัยการเจริญเติบโต; การแยกแยะเซลล์ปอดชนิดที่ 2; การพัฒนาถุงปอด; การควบคุมการถอดรหัสเชิงลบโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การตอบสนองของเซลล์ต่อภาวะขาดออกซิเจน; การแยกแยะเซลล์ตับอ่อนชนิด B; การตอบสนองของเซลล์ต่อการกระตุ้นด้วยโกนาโดโทรปิน; การควบคุมการถอดรหัสในเชิงบวกโดย RNA polymerase II; การควบคุมการถอดรหัสเชิงบวกโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การควบคุมเชิงบวกของการเพิ่มจำนวนไมโอบลาสต์กล้ามเนื้อหัวใจ; การพัฒนาของหัวใจ; การสร้างรูปร่างอวัยวะของสัตว์; การพัฒนาเนื้อเยื่อ; การพัฒนาเซลล์; การสร้างโครงสร้างทางกายวิภาคที่เกี่ยวข้องกับการเกิดรูปร่าง; การพัฒนาระบบทางเดินอาหาร;
	แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก
	2627
	14465
	ENSG00000141448
	ENSMUSG00000005836
	Q92908
	Q61169
	NM_005257
	NM_010258
	NP_005248
	NP_034388
	วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์	ดู/แก้ไขเมาส์

ปัจจัยการถอดรหัส GATA-6หรือที่รู้จักกันในชื่อ GATA - binding factor 6 (GATA6) เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนGATA6 ^[⁵^]ผลิตภัณฑ์ของยีนจะจับกับ (A/T/C)GAT(A/T)(A) ของลำดับการจับแบบฉันทามติโดย เฉพาะ ^[⁶^]

ความสำคัญทางคลินิก

การกลายพันธุ์ในยีนมีความเชื่อมโยงกับภาวะ ไม่มีตับอ่อน และความผิดปกติของหัวใจแต่กำเนิด^{[ 7 ]}

การพัฒนาของเยื่อบุผิวชั้นเอนโดเดอร์มัลของปอด

GATA-6 ซึ่งเป็นปัจจัยถอดรหัสแบบซิงค์ฟิง เกอร์ มีความสำคัญต่อ การแยก ตัวของเนื้อเยื่ออวัยวะ จากเอนโดเดอร์ม ^{[ 8 ]}นอกจากนี้ยังบ่งชี้ถึงการพัฒนาปอดที่เหมาะสมโดยการควบคุมระยะการแยกตัวในระยะหลังของเยื่อบุผิวถุงลมและการกระตุ้นโปรโมเตอร์ของอะควาพอริน-5 ยิ่งไปกว่านั้น GATA-6 ยังเชื่อมโยงกับการผลิต LIF ซึ่งเป็นไซโตไคน์ที่กระตุ้นการเพิ่มจำนวนของเซลล์ต้นกำเนิดตัวอ่อนจากเอนโดเดอร์มและยับยั้งการแยกตัวของเอพิบลาสต์ในระยะเริ่มต้น หากปล่อยให้การผลิตไซโตไคน์และสัญญาณเคมีนี้ไม่ได้รับการควบคุมในตัวอ่อนที่กำลังพัฒนา จะส่งผลให้เกิดลักษณะทางฟีโนไทป์ที่กล่าวถึงต่อไป^{[ 9 ]}

เมื่อ GATA-6 ในตัวอ่อนถูกรบกวน การพัฒนาของเยื่อบุผิวปอดส่วนปลายจะหยุดชะงักในแบบจำลองหนูทรานสเจนิก^{[ 8 ]}เซลล์ต้นกำเนิดหรือสเต็มเซลล์สำหรับเนื้อเยื่อเยื่อบุผิวถุงลมจะพัฒนาและถูกกำหนดอย่างเหมาะสม อย่างไรก็ตามการแยกความแตกต่างเพิ่มเติมจะไม่เกิดขึ้น นอกจากนี้การพัฒนาของหลอดลมฝอยส่วนปลาย-ส่วนต้นก็ได้รับผลกระทบ ส่งผลให้ปริมาณของแหล่งแลกเปลี่ยนทางเดินหายใจลดลง^{[ 8 ]}

ความบกพร่องของการแตกแขนงนี้ ซึ่งจะทำให้เกิดภาวะปอดเจริญ ไม่เต็มที่ทั้งสองข้าง หลังคลอด ได้ถูกเชื่อมโยงกับบริเวณที่ขาดเยื่อบุผิวถุงลมที่แตกต่างกัน ซึ่งบ่งชี้ว่าลักษณะเฉพาะนี้เป็นลักษณะเฉพาะของการทำงานของเอนโดเดอร์มัล และดังนั้นอาจเชื่อมโยงกับการแสดงออกของ GATA-6 ที่ไม่เหมาะสมโดยอ้อม^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}กล่าวคือ ความบกพร่องของการแตกแขนงของหลอดลมฝอยอาจไม่ได้เป็นผลมาจากข้อผิดพลาดในการถอดรหัสโดยตรงใน GATA-6 แต่เป็นผลข้างเคียงของข้อผิดพลาดดังกล่าว

ดูเพิ่มเติม

ปัจจัยการถอดรหัส GATA

อ่านเพิ่มเติม

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: วิธีง่ายๆ ในการแทนที่โครงสร้าง cap ของ mRNA ยูคาริโอตด้วยโอลิโกไรโบนิวคลีโอไทด์" Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki E, Evans T, Lowry J, Truong L, Bell DW, Testa JR, Walsh K (1997). "ยีน GATA-6 ของมนุษย์: โครงสร้าง ตำแหน่งโครโมโซม และการควบคุมการแสดงออกโดยสัญญาณเฉพาะเนื้อเยื่อและสัญญาณตอบสนองต่อไมโทเจน" Genomics . 38 (3): 283– 90. doi : 10.1006/geno.1996.0630 . PMID 8975704 .
Huggon IC, Davies A, Gove C, Moscoso G, Moniz C, Foss Y, Farzaneh F, Towner P (1997). "การโคลนโมเลกุลของโปรตีนจับ DNA GATA-6 ของมนุษย์: ระดับการแสดงออกสูงในหัวใจและลำไส้" Biochim. Biophys. Acta . 1353 (2): 98– 102. doi : 10.1016/s0167-4781(97)00049-3 . PMID 9294001 .
Yoshida T, Sato R, Mahmood S, Kawasaki S, Futai M, Maeda M (1997). "โปรตีนจับ DNA GATA-6 ที่แสดงออกในเซลล์มะเร็งกระเพาะอาหาร MKN45 ของมนุษย์" FEBS Lett . 414 ( 2): 333– 7. Bibcode : 1997FEBSL.414..333Y . doi : 10.1016/S0014-5793(97)01017-X . PMID 9315713. S2CID 31858845 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "การสร้างและลักษณะเฉพาะของไลบรารี cDNA ที่อุดมด้วยความยาวเต็มและอุดมด้วยปลาย 5'" Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Wada H, Hasegawa K, Morimoto T, Kakita T, Yanazume T, Sasayama S (2000). "โปรตีน p300 เป็นตัวกระตุ้นร่วมของ GATA-6 ในการถอดรหัสยีนโซ่หนักไมโอซินกล้ามเนื้อเรียบ" . J. Biol. Chem . 275 (33): 25330– 5. doi : 10.1074/jbc.M000828200 . PMID 10851229 .
Crawford SE, Qi C, Misra P, Stellmach V, Rao MS, Engel JD, Zhu Y, Reddy JK (2002). "ความบกพร่องของหัวใจ ตา และเมกะคาริโอไซต์ในตัวอ่อนที่ขาดโปรตีนที่จับกับตัวกระตุ้นการเพิ่มจำนวนของเพอร์ออกซิโซม (PBP) บ่งชี้ถึงตระกูลปัจจัยการถอดรหัส GATA" . J. Biol. Chem . 277 (5): 3585– 92. doi : 10.1074/jbc.M107995200 . PMID 11724781 .
Liu C, Glasser SW, Wan H, Whitsett JA (2002). "GATA-6 และปัจจัยการถอดรหัสไทรอยด์-1 มีปฏิสัมพันธ์โดยตรงและควบคุมการแสดงออกของยีนโปรตีนเซอร์แฟกแทนท์-C" . J. Biol. Chem . 277 (6): 4519– 25. doi : 10.1074/jbc.M107585200 . PMID 11733512 .
Kiiveri S, Liu J, Westerholm-Ormio M, Narita N, Wilson DB, Voutilainen R, Heikinheimo M (2003). "ปัจจัยการถอดรหัส GATA-4 และ GATA-6 ในระหว่างการพัฒนาของต่อมหมวกไตในหนูและมนุษย์" Endocr . Res . 28 (4): 647– 50. doi : 10.1081/ERC-120016980 . PMID 12530677. S2CID 22011163 .
Chang DF, Belaguli NS, Iyer D, Roberts WB, Wu SP, Dong XR, Marx JG, Moore MS, Beckerle MC, Majesky MW, Schwartz RJ (2003). "โปรตีน LIM-only ที่อุดมไปด้วยซิสเทอีน CRP1 และ CRP2 เป็นโคแฟคเตอร์ที่มีศักยภาพในการสร้างความแตกต่างของกล้ามเนื้อเรียบ" Dev . Cell . 4 (1): 107– 18. doi : 10.1016/S1534-5807(02)00396-9 . PMID 12530967 .
Nemer G, Nemer M (2003). "การกระตุ้นการถอดรหัสของ BMP-4 และการควบคุมการสร้างอวัยวะของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมโดย GATA-4 และ -6" Dev. Biol . 254 (1): 131– 48. doi : 10.1016/S0012-1606(02)00026-X . PMID 12606287 .
Abe M, Hasegawa K, Wada H, Morimoto T, Yanazume T, Kawamura T, Hirai M, Furukawa Y, Kita T (2003). "GATA-6 มีส่วนเกี่ยวข้องกับการกระตุ้นฟีโนไทป์ที่แตกต่างกันในเซลล์กล้ามเนื้อเรียบของหลอดเลือดมนุษย์โดย PPARgamma" . Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol . 23 (3): 404– 10. doi : 10.1161/01.ATV.0000059405.51042.A0 . hdl : 2433/147514 . PMID 12615657 .
Ketola I, Toppari J, Vaskivuo T, Herva R, Tapanainen JS, Heikinheimo M (2003). "ปัจจัยการถอดรหัส GATA-6 การเพิ่มจำนวนเซลล์ การตายของเซลล์ และโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการตายของเซลล์ Bcl-2 และ Bax ในอัณฑะของทารกในครรภ์มนุษย์" J. Clin. Endocrinol. Metab . 88 (4): 1858– 65. doi : 10.1210/jc.2002-021647 . PMID 12679484 .
Siltanen S, Heikkilä P, Bielinska M, Wilson DB, Heikinheimo M (2004). "ปัจจัยการถอดรหัส GATA-6 แสดงออกในเอนโดเดอร์มที่เป็นมะเร็งของเนื้องอกถุงไข่แดงในเด็กและในเทอราโตมา" Pediatr . Res . 54 (4): 542– 6. doi : 10.1203/01.PDR.0000081295.56529.E9 . PMID 12867597 .
Liu C, Ikegami M, Stahlman MT, Dey CR, Whitsett JA (2003). "การยับยั้งการสร้างถุงลมและการเปลี่ยนแปลงกลไกการทำงานของปอดในหนูที่แสดงออก GATA-6" Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol . 285 (6): L1246–54. doi : 10.1152/ajplung.00443.2002 . PMID 12909592 .
Benchabane H, Wrana JL (2003). "ตัวเร่งปฏิกิริยาที่ขึ้นอยู่กับ GATA และ Smad1 ในยีน Smad7 ตีความความเข้มข้นของโปรตีนสร้างกระดูกแตกต่างกัน" . Mol. Cell. Biol . 23 (18): 6646– 61. doi : 10.1128/MCB.23.18.6646-6661.2003 . PMC 193708 . PMID 12944489 .
Jimenez P, Saner K, Mayhew B, Rainey WE (2003). "GATA-6 ถูกแสดงออกในต่อมหมวกไตของมนุษย์และควบคุมการถอดรหัสของยีนที่จำเป็นสำหรับการสังเคราะห์แอนโดรเจนในต่อมหมวกไต" Endocrinology . 144 ( 10): 4285– 8. doi : 10.1210/en.2003-0472 . PMID 12959982 .
Saner KJ, Suzuki T, Sasano H, Pizzey J, Ho C, Strauss JF, Carr BR, Rainey WE (2005). "การถอดรหัสยีนสเตียรอยด์ซัลโฟทรานสเฟอเรส 2A1 ถูกควบคุมโดยสเตียรอยด์เจนิคแฟคเตอร์ 1 และ GATA-6 ในต่อมหมวกไตของมนุษย์" . Mol. Endocrinol . 19 (1): 184– 97. doi : 10.1210/me.2003-0332 . PMID 15388788 .
คิเวรี เอส, หลิว เจ, ไฮคิลา พี, อโรลา เจ, เลห์โตเนน อี, วูติไลเนน อาร์, ไฮคินไฮโม เอ็ม (2005) "ปัจจัยการถอดรหัส GATA-4 และ GATA-6 ในเนื้องอกต่อมหมวกไตของมนุษย์" เอ็นโดแคร์ ความละเอียด30 (4): 919– 23. ดอย : 10.1081/ERC-200044149 . PMID15666845 . S2CID 27526305 .

ลิงก์ภายนอก

GATA6+โปรตีน+มนุษย์ ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[

[

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]