อ่าน 3 นาที
ความแปรปรวนทางพันธุกรรม
ความแปรปรวนทางพันธุกรรมเป็นแนวคิดที่นักชีววิทยาและนักสถิติชาวอังกฤษโรนัลด์ ฟิชเชอร์ ได้อธิบายไว้ ในทฤษฎีบทพื้นฐานของการคัดเลือกโดยธรรมชาติในหนังสือThe Genetical Theory of Natural..
ความแปรปรวนทางพันธุกรรม
ความแปรปรวนทางพันธุกรรมเป็นแนวคิดที่นักชีววิทยาและนักสถิติชาวอังกฤษโรนัลด์ ฟิชเชอร์ ได้อธิบายไว้ ในทฤษฎีบทพื้นฐานของการคัดเลือกโดยธรรมชาติในหนังสือThe Genetical Theory of Natural Selection ที่ตีพิมพ์ในปี 1930 ฟิชเชอร์ได้ตั้งสมมติฐานว่าอัตราการเปลี่ยนแปลงของความเหมาะสมทางชีวภาพสามารถคำนวณได้จากความแปรปรวนทางพันธุกรรมของความเหมาะสมนั้นเอง[ 1 ]ฟิชเชอร์พยายามให้สูตรทางสถิติเกี่ยวกับวิธีที่การเปลี่ยนแปลงของความเหมาะสมในประชากรสามารถเกิดจากการเปลี่ยนแปลงในความถี่ของอัลลีลฟิชเชอร์ไม่ได้ตั้งสมมติฐานที่จำกัดใดๆ ในสูตรของเขาเกี่ยวกับพารามิเตอร์ความเหมาะสม การเลือกคู่ครองหรือจำนวนอัลลีลและตำแหน่งที่เกี่ยวข้อง[ 2 ]
คำนิยาม
ความแปรปรวนของฟีโนไทป์มักจะรวมความแปรปรวนของจีโนไทป์เข้ากับความแปรปรวนของสิ่งแวดล้อม ความแปรปรวนทางพันธุกรรมมีองค์ประกอบหลัก 3 ประการ ได้แก่ ความแปรปรวนทางพันธุกรรมแบบเพิ่มพูน ความแปรปรวนแบบเด่น และความแปรปรวนแบบเอพิสแตติก[ 3 ]
ความแปรปรวนทางพันธุกรรมแบบเพิ่มพูนเกี่ยวข้องกับการสืบทอดอัลลีลเฉพาะจากพ่อแม่และผลกระทบที่เป็นอิสระของอัลลีลนี้ต่อฟีโนไทป์เฉพาะ ซึ่งจะทำให้ฟีโนไทป์เบี่ยงเบนจากฟีโนไทป์เฉลี่ย ความแปรปรวนทางพันธุกรรมแบบเด่นหมายถึงการเบี่ยงเบนของฟีโนไทป์ที่เกิดจากปฏิสัมพันธ์ระหว่างอัลลีลทางเลือกที่ควบคุมลักษณะหนึ่งที่โลคัสเฉพาะหนึ่ง ความแปรปรวนแบบเอพิสแตติกเกี่ยวข้องกับปฏิสัมพันธ์ระหว่างอัลลีลที่แตกต่างกันในโลคัสที่แตกต่างกัน[ 4 ]
การถ่ายทอดทางพันธุกรรม
ค่าการถ่ายทอดทางพันธุกรรมหมายถึงความแปรปรวนของลักษณะทางฟีโนไทป์ที่เกิดจากความแปรปรวนของปัจจัยทางพันธุกรรมมากน้อยเพียงใด โดยปกติหลังจากที่เรารู้ปริมาณความแปรปรวนทางพันธุกรรมทั้งหมดที่รับผิดชอบต่อลักษณะแล้ว เราสามารถคำนวณค่าการถ่ายทอดทางพันธุกรรมของลักษณะนั้นได้ ค่าการถ่ายทอดทางพันธุกรรมสามารถใช้เป็นตัวทำนายที่สำคัญในการประเมินว่าประชากรสามารถตอบสนองต่อการคัดเลือกโดยมนุษย์หรือโดยธรรมชาติได้หรือไม่[ 5 ]
ค่าความสามารถในการถ่ายทอดทางพันธุกรรมในความหมายกว้าง H 2 = V G /V Pเกี่ยวข้องกับสัดส่วนของความแปรผันของลักษณะทางฟีโนไทป์อันเนื่องมาจากผลกระทบของความแปรผันแบบเพิ่มพูน ความเด่น และความแปรผันแบบเอพิสแตติก ค่าความสามารถในการถ่ายทอดทางพันธุกรรมในความหมายแคบ h 2 = V A /V Pหมายถึงสัดส่วนของความแปรผันของลักษณะทางฟีโนไทป์อันเนื่องมาจากค่าทางพันธุกรรมแบบเพิ่มพูน (V A ) [ 6 ]
สูตรเชิงปริมาณ
ความแปรปรวนทางฟีโนไทป์ (V P ) ในประชากรได้รับอิทธิพลจากความแปรปรวนทางพันธุกรรม (V G ) และแหล่งที่มาจากสิ่งแวดล้อม (V E )
ปริมาณความแปรปรวนทางพันธุกรรมทั้งหมดสามารถแบ่งออกเป็นหลายกลุ่ม ได้แก่ ความแปรปรวนแบบเพิ่มพูน (VA )ความแปรปรวนแบบเด่น (VD )และความแปรปรวนแบบเอพิสแตติก ( VI )
V G = V A + V D + V I [ 4 ]
วิธีการวัด
1. ตามธรรมเนียมแล้ว การใช้ ข้อมูล ลำดับวงศ์ตระกูลในมนุษย์ พืช และสัตว์เลี้ยง เพื่อประมาณค่าความแปรปรวนทางพันธุกรรมแบบสะสม
2. การใช้วิธีการถดถอยโพลีมอร์ฟิซึมของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว ( SNP ) เพื่อหาปริมาณการมีส่วนร่วมของความแปรปรวนแบบเพิ่มพูน ความเด่น และการประทับตราต่อความแปรปรวนทางพันธุกรรมทั้งหมด[ 9 ]
3. เมทริกซ์ความแปรปรวนร่วมทางพันธุกรรม (G) สรุปความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างชุดลักษณะต่างๆ ได้อย่างสะดวก และเป็นพารามิเตอร์หลักในการกำหนดการตอบสนองแบบหลายตัวแปรต่อการคัดเลือก[ 10 ]
ตัวอย่างงานวิจัย
1. การกระจายความแปรปรวนทางพันธุกรรมทั่วพื้นที่ฟีโนไทป์และการตอบสนองต่อการคัดเลือก[ 11 ]
ทำความเข้าใจว่าการกระจายสเปกตรัมเชิงประจักษ์ของ G ทำนายการตอบสนองต่อการคัดเลือกในพื้นที่ฟีโนไทป์ได้อย่างไร โดยเฉพาะอย่างยิ่ง การรวมกันของลักษณะที่ก่อให้เกิดพื้นที่ย่อยทางพันธุกรรมที่เกือบเป็นศูนย์ซึ่งมีความแปรปรวนทางพันธุกรรมน้อย จะตอบสนองต่อการคัดเลือกอย่างไม่สม่ำเสมอ พวกเขาได้วางกรอบสำหรับการทำความเข้าใจว่าการกระจายสเปกตรัมเชิงประจักษ์ของ G อาจแตกต่างจากความคาดหวังแบบสุ่มที่พัฒนาขึ้นภายใต้ทฤษฎีเมทริกซ์สุ่ม (RMT) อย่างไร โดยใช้ชุดข้อมูลที่มีลักษณะการแสดงออกของยีนจำนวนมาก
2. การเปรียบเทียบค่าประมาณความแปรปรวนทางพันธุกรรมระหว่างแบบจำลองความสัมพันธ์ต่างๆ[ 12 ]
ในการวิจัยนี้ นักวิจัยใช้แบบจำลองความสัมพันธ์ที่แตกต่างกันเพื่อเปรียบเทียบค่าประมาณของส่วนประกอบความแปรปรวนทางพันธุกรรมและค่าการถ่ายทอดทางพันธุกรรม อย่างไรก็ตาม แบบจำลองที่แตกต่างกันอาจให้ค่าประมาณของความแปรปรวนทางพันธุกรรมที่แตกต่างกัน พวกเขาพบว่าความแปรปรวนทางพันธุกรรมที่คาดหวังมักจะเท่ากับความแปรปรวนที่ประมาณได้คูณด้วยค่าสถิติ Dk และสำหรับแบบจำลองความสัมพันธ์ทั่วไปส่วนใหญ่ ค่า Dk จะใกล้เคียงกับ 1 ซึ่งหมายความว่าแบบจำลองส่วนใหญ่เหล่านี้สามารถใช้ในการประมาณความแปรปรวนทางพันธุกรรมได้
3. การประมาณค่าความแปรปรวนทางพันธุกรรมแบบเพิ่มพูน แบบเด่น และแบบประทับโดยใช้ข้อมูลจีโนม[ 13 ]
การพัฒนาวิธีการทำแผนที่โพลีมอร์ฟิซึมของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว (SNPs) ช่วยให้สามารถสำรวจความแปรผันทางพันธุกรรมของลักษณะที่ซับซ้อนในแต่ละตำแหน่งของยีนได้ นักวิจัยสามารถวัดปริมาณการมีส่วนร่วมของความแปรผันแบบเพิ่มพูน ความแปรผันแบบเด่น และความแปรผันแบบประทับทางพันธุกรรมต่อความแปรผันทางพันธุกรรมทั้งหมดได้โดยใช้วิธีการวิเคราะห์การถดถอยของ SNPs
ลิงก์ภายนอก
- วิดีโอ YouTube เกี่ยวกับความแปรปรวนทางพันธุกรรมเชิงปริมาณ
- บทนำเกี่ยวกับส่วนประกอบความแปรปรวนทางพันธุกรรมและพันธุกรรม
- บทนำสู่ความแปรปรวนทางพันธุกรรมเชิงปริมาณ
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ความแปรปรวนทางพันธุกรรม
ความแปรปรวนทางพันธุกรรมเป็นแนวคิดที่นักชีววิทยาและนักสถิติชาวอังกฤษโรนัลด์ ฟิชเชอร์ ได้อธิบายไว้ ในทฤษฎีบทพื้นฐานของการคัดเลือกโดยธรรมชาติในหนังสือThe Genetical Theory of Natural..
คำนิยาม
ความแปรปรวนของฟีโนไทป์มักจะรวมความแปรปรวนของจีโนไทป์เข้ากับความแปรปรวนของสิ่งแวดล้อม ความแปรปรวนทางพันธุกรรมมีองค์ประกอบหลัก 3 ประการ ได้แก่ ความแปรปรวนทางพันธุกรรมแบบเพิ่มพูน ความแปรปรวนแบบเด่น และความแปรปรวนแบบเอพิสแตติก [ 3 ]
การถ่ายทอดทางพันธุกรรม
ค่าการถ่ายทอดทางพันธุกรรม หมายถึงความแปรปรวนของลักษณะทางฟีโนไทป์ที่เกิดจากความแปรปรวนของปัจจัยทางพันธุกรรมมากน้อยเพียงใด โดยปกติหลังจากที่เรารู้ปริมาณความแปรปรวนทางพันธุกรรมทั้งหมดที่รับผิดชอบต่อลักษณะแล้ว...
สูตรเชิงปริมาณ
ความแปรปรวนทางฟีโนไทป์ (V P ) ในประชากรได้รับอิทธิพลจากความแปรปรวนทางพันธุกรรม (V G ) และแหล่งที่มาจากสิ่งแวดล้อม (V E )