การปฏิรูปเจนีวาเป็นการปรับทิศทางทางศาสนาและการเมืองของเมืองเจนีวา ประเทศสวิตเซอร์แลนด์ จาก ศาสนา โรมันคาทอลิกและการปกครองของบิชอปผู้เป็นพันธมิตรกับราชวงศ์ซาวอย^{[ 1 ]}ไปสู่ศาสนาโปรเตสแตนต์และการปกครองตนเอง แม้ว่าจะเป็นพันธมิตรกับลูเธอรานิสม์ในช่วงเริ่มต้น แต่การปฏิรูปในเจนีวาก็สิ้นสุดลงด้วยการนำของจอห์น คาลวินและการนำเอาเทววิทยาปฏิรูปหรือลัทธิคาลวินมา ใช้

ภายใต้ การปกครองของคาลวินและสภา เจนีวา เจนีวาได้กลายเป็นศูนย์กลางสำคัญแห่งหนึ่งของการปฏิรูปศาสนาโปรเตสแตนต์เจนีวาเป็นที่รู้จักในนาม "โรมแห่งโปรเตสแตนต์" ดึงดูดนักศึกษาและนักวิชาการด้านศาสนศาสตร์จากทั่วยุโรป ซึ่งหลายคนได้กลับไปยังบ้านเกิดและเผยแพร่ความคิดปฏิรูปต่อไป^{[ 2 ] [ 3 ]}

อำนาจของศาสนจักรคาทอลิกในเจนีวาอ่อนแอลงหลังจากความพยายามก่อกบฏที่ไม่ประสบความสำเร็จในปี 1526 โดยบรรดาบาทหลวงเพื่อประท้วงพันธมิตรกับเบิร์นและฟรีบูร์กในเดือนกรกฎาคม 1527 บาทหลวงคาทอลิกเชื้อสายขุนนางทั้งหมดถูกขับไล่ออกจากเจนีวาเนื่องจากมีแนวคิดสนับสนุนราชวงศ์ซาวอย บิชอปปิแอร์ เดอ ลา โบม แห่งเจนีวา ผู้สืบเชื้อสายจากราชวงศ์ซาวอย ได้ หลบหนีออกจากเมืองไปยังเก็กซ์ในเดือนสิงหาคม 1527 เพื่อหลีกเลี่ยงการถูกจับกุมหรือลอบสังหารโดยสายลับของชาร์ลส์ที่ 3 ดยุกแห่งซาวอยแต่ยังคงดำรงตำแหน่งบิชอปแห่งเจนีวาอย่างเป็นทางการ บิชอปสนับสนุนเอกราชของเจนีวาอยู่ช่วงหนึ่ง แต่ต่อมาได้สมคบกับชาร์ลส์ที่ 3 เพื่อใช้อิทธิพลของตนในการยกเลิกสนธิสัญญาพันธมิตรปี 1526 ผลที่ตามมาคือสภาใหญ่ได้ตัดสินใจในเดือนมกราคม 1528 ที่จะยึดมั่นใน ศาสนา ลูเทอร์และพระสันตะปาปาตอบโต้ด้วยการขับไล่ชาวเจนีวาออกจากศาสนา แม้ว่าเจนีวาจะยังคงอยู่ภายใต้เขตอำนาจของบิชอปคาทอลิกอย่างเป็นทางการ แต่สภาใหญ่ได้ใช้โอกาสที่บิชอปไม่อยู่ริเริ่มการปฏิรูปการนมัสการอย่างค่อยเป็นค่อยไปตามแนวทางของลูเธอรัน

หลังสนธิสัญญาพันธมิตรในปี 1526 พระเจ้าชาร์ลส์ที่ 3 ไม่ทรงยอมจำนนต่อความพ่ายแพ้ในเจนีวา และทรงวางแผนที่จะยึดครองเมืองนั้นอีกครั้งอยู่เสมอ ความกลัวการแทรกแซงของสวิสทำให้พระองค์ยับยั้งพระองค์ไว้ แต่พระองค์ก็ทรงสนับสนุนการกระทำรุนแรงเป็นระยะๆ ต่อเจนีวา เช่น การปล้นและการทำลายสินค้าที่ตั้งใจจะส่งไปยังเจนีวา บิชอปลาโบม ซึ่งไม่ได้พำนักอยู่ในเมืองนั้นอีกต่อไป ได้มีส่วนร่วมในแผนการโค่นล้มเอกราชของเมือง อัศวินบางส่วนที่สนใจจะยึดครองเจนีวาให้กับพระเจ้าชาร์ลส์ที่ 3 ได้รวมตัวกันเป็นองค์กรที่ไม่เป็นทางการที่เรียกว่าคณะแห่งช้อน^{[ 4 ]} อัศวินในกลุ่มนั้นพยายามบุกเจนีวาแต่ไม่สำเร็จ โดยปีนกำแพงเมืองด้วยบันไดในวันที่ 25 มีนาคม 1529 ซึ่งเหตุการณ์นี้เป็นที่รู้จักกันในชื่อ "วันแห่งบันได" นอกจากนี้ ดยุกแห่งซาวอยยังพยายามโน้มน้าวให้สาธารณรัฐสวิสอื่นๆ ยกเลิกพันธมิตรกับเจนีวา และเพื่อบรรลุเป้าหมายนั้น พระองค์จึงได้รับการสนับสนุนจากพระเจ้าฟรานซิสที่ 1 แห่งฝรั่งเศสและ จักรพรรดิชาร์ลส์ ที่5จักรพรรดิชาร์ลส์ที่ 5 พยายามโน้มน้าวสภาใหญ่แห่งเจนีวาให้กลับไปนับถือศาสนาคาทอลิก และในวันที่ 16 กรกฎาคม ค.ศ. 1529 พระองค์ถึงกับเขียนจดหมายด้วยลายมือของพระองค์เอง แต่สภาแห่งเจนีวาปฏิเสธคำขอร้องนั้น และชาร์ลส์ที่ 5 ก็มุ่งมั่นที่จะใช้กำลัง สหพันธ์สวิสรู้สึกตื่นตระหนกกับเหตุการณ์เหล่านี้ และในเดือนพฤษภาคม ค.ศ. 1530 คณะผู้แทนร่วมจากเบิร์น ฟริบูร์กซูริค บาเซิลและโซโลทูร์นได้เสนอต่อสภาใหญ่ให้ยกเลิกสนธิสัญญาพันธมิตรปี ค.ศ. 1526 เพื่อแลกกับการร่วมมือที่หลวมกว่า แต่สภาใหญ่ปฏิเสธข้อเสนอนั้นและตัดสินใจที่จะต่อต้านความพยายามใดๆ ที่จะนำเจนีวากลับไปอยู่ภายใต้การปกครองของซาวอย

เมื่อวันที่ 24 มิถุนายน ค.ศ. 1530 สภาใหญ่ได้จับกุมอัยการชื่อแมนโดเลีย ซึ่งเป็นผู้สนับสนุนดยุคชาร์ลส์ที่ 3 และเหตุการณ์นี้ทำให้บิชอปลาโบมไม่พอใจ เขาจึงตอบโต้ด้วยการจับกุมพ่อค้าชาวเจนีวาในเมืองเก็กซ์ ซึ่งเป็นที่ที่เขาอาศัยอยู่ นอกจากนี้เขายังทำข้อตกลงกับอัศวินแห่งช้อน และเมื่อวันที่ 20 สิงหาคม ได้ออกพระราชกฤษฎีกาสั่งให้พวกเขาก่อสงครามเพื่อคืนเจนีวาให้กับผู้ปกครองที่ถูกต้อง เมื่อวันที่ 30 กันยายน การโจมตีได้เริ่มต้นขึ้น โดยอัศวินแห่งช้อนได้เข้าร่วมกับกองกำลังของชาร์ลส์ที่ 3 ทำให้มีทหารรวมมากถึง 800 นาย กองทัพเจนีวามีกำลังพลเพียงประมาณ 600 นาย แต่เมื่อวันที่ 10 ตุลาคม กองกำลังเสริมประมาณ 10,000 นายได้เดินทางมาถึงจากเบิร์นและฟริบูร์ก^{[ 5 ]} นอกจากนี้ จักรพรรดิชาร์ลส์ที่ 5 แม้จะเป็นผู้สนับสนุนผลประโยชน์ของซาวอย แต่ก็ปฏิเสธที่จะเข้าร่วมในสงครามครั้งนั้น ทำให้กองทัพที่รุกรานต้องถอนตัว หลังจากการถอนทัพของซาวอย ได้มีการลงนามในสนธิสัญญาสันติภาพระหว่างเจนีวาและบิชอปบอม โดยสภาใหญ่ในเจนีวาได้ปล่อยตัวแมนโดเลียออกจากคุก และบิชอปได้ปล่อยตัวชาวเจนีวาที่ถูกจับกุมที่เก็กซ์

ในช่วงสงครามคัปเปลครั้งที่สองในเดือนตุลาคม ค.ศ. 1531 เจนีวาเกิดความแตกแยกทางการเมือง เนื่องจากรัฐบาลเบิร์นร้องขอความช่วยเหลือทางทหารแก่ฝ่ายโปรเตสแตนต์ในซูริค ขณะที่ฟรีบูร์กร้องขอความช่วยเหลือแก่ฝ่ายคาทอลิก สภาใหญ่แห่งเจนีวาจึงต้องเลือกข้างระหว่างสองฝ่าย แต่ตัดสินใจแบ่งกำลังและให้ความช่วยเหลือทั้งสองฝ่ายไปพร้อมกัน หลังจากการพ่ายแพ้ของซูริคในสงคราม ฟรีบูร์กได้ยกเลิกพันธมิตรกับเจนีวา ส่งผลให้ชาร์ลส์ที่ 3 แห่งซาวอยกลับมาวางแผนที่จะยึดเจนีวาอีกครั้ง ซึ่งทำให้รัฐบาลเบิร์นและฟรีบูร์กตื่นตระหนกถึงขั้นเสนอให้เจนีวาละทิ้งสนธิสัญญาพันธมิตรปี ค.ศ. 1526 และยอมรับการปกครองของซาวอย แต่สภาแห่งเจนีวาปฏิเสธข้อเสนอนี้

ในเดือนมิถุนายน ค.ศ. 1532 เกิดการปะทะกันบนท้องถนนระหว่างชาวคาทอลิกและชาวโปรเตสแตนต์ และรัฐบาลของฟริบูร์กขู่ว่าจะฉีกพันธมิตรกับเจนีวาหากอนุญาตให้มีการปฏิบัติศาสนกิจของโปรเตสแตนต์ อย่างไรก็ตาม รัฐบาลของเบิร์นได้กดดันสภาใหญ่แห่งเจนีวาให้ยอมอนุญาตให้มีการเผยแพร่ศาสนาของโปรเตสแตนต์ อำนาจของบิชอปคาทอลิกไม่ได้รับการยอมรับจากประชาชนและสถาบันต่างๆ ในเจนีวาอีกต่อไป แต่ในตอนแรกพวกเขาก็ปฏิเสธที่จะมอบเมืองของตนให้แก่ฝ่ายโปรเตสแตนต์ ด้วยความกลัวว่าจะสร้างความไม่พอใจให้กับผู้ปกครองคาทอลิกของอาณาจักรใกล้เคียง รวมถึงบาทหลวงคาทอลิกในเจนีวาด้วย

บาทหลวงและนักบวชคาทอลิกในเจนีวา ยังคงเป็นกลุ่มที่มีอิทธิพลทางสังคมอย่างมาก และใช้อิทธิพลของตนในการขับไล่นักเทศน์โปรเตสแตนต์ และในวันที่ 28 มีนาคม ค.ศ. 1533 พวกเขายังพยายามยุยงให้ชาวคาทอลิกสังหารหมู่ชาวโปรเตสแตนต์ ซึ่งแผนการนี้ล้มเหลวเนื่องจากความรู้สึกเป็นอันหนึ่งอันเดียวกันของชาวเมืองและความพยายามของสภาใหญ่ในการฟื้นฟูสันติภาพ สภาใหญ่มีความระมัดระวังในการกำหนดนโยบาย และพยายามหาทางสายกลางระหว่างสองฝ่าย ในส่วนหนึ่งของทางสายกลางนั้น สภาใหญ่ยอมทำตามข้อเรียกร้องของโปรเตสแตนต์โดยอนุมัติให้ตีพิมพ์พระคัมภีร์ ฉบับภาษา ฝรั่งเศสในเดือนมีนาคม ค.ศ. 1533 แต่เป็นการแปลแบบอนุรักษ์นิยมที่ไม่ถูกใจชาวโปรเตสแตนต์และเป็นที่ยอมรับของชาวคาทอลิกในสาธารณรัฐ สภาใหญ่ยังต้องคำนึงถึงความจำเป็นในการรักษาความเป็นพันธมิตรกับทั้งรัฐคาทอลิกและรัฐโปรเตสแตนต์ด้วย ในเดือนกุมภาพันธ์ ค.ศ. 1533 เมืองฟริบูร์กได้ยกเลิกสนธิสัญญาพันธมิตรปี ค.ศ. 1526 อย่างเปิดเผย และต่อมายังวางแผนที่จะบุกโจมตีเจนีวาอีกด้วย

เพื่อรักษาสันติภาพระหว่างคาทอลิกและโปรเตสแตนต์ รวมถึงนโยบายความเป็นกลางระหว่างอำนาจของคาทอลิกและโปรเตสแตนต์ สภาใหญ่แห่งเจนีวาได้ผ่านกฎหมายประนีประนอมเมื่อวันที่ 30 มีนาคม ค.ศ. 1533 ซึ่งอนุญาตให้ชาวเจนีวาทุกคนเลือกศาสนาที่ตนนับถือได้ ในขณะเดียวกันก็ห้ามการโจมตีหลักคำสอนและการปฏิบัติของคาทอลิกอย่างเปิดเผย และการเทศนาทางศาสนาในที่สาธารณะสำหรับทั้งสองฝ่าย พิธีบูชาของโปรเตสแตนต์ครั้งแรกจัดขึ้นในวันศุกร์ประเสริฐของปีนั้น การรับประทานเนื้อสัตว์ในวันศุกร์เป็นสิ่งต้องห้ามสำหรับทั้งสองฝ่าย^{[ 6 ]}อย่างไรก็ตาม ทั้งสองฝ่ายไม่มีเจตนาที่จะปฏิบัติตามกฎหมาย และเกิดการจลาจลบนท้องถนนขึ้นเป็นระยะ

บุคคลสำคัญที่เป็นปฏิปักษ์ต่อการปฏิรูปศาสนาในช่วงแรกในเจนีวาคือบาทหลวงโดมินิกันกาย เฟอร์บิตีผู้เป็นด็อกเตอร์ด้านเทววิทยาจากมหาวิทยาลัยซอร์บอนน์ เขาเดินทางมาถึงเมืองนี้ในเดือนธันวาคม ค.ศ. 1533 เพื่อเทศนาในช่วงเทศกาลเตรียมรับเสด็จพระคริสต์ และได้โจมตีนักเทศน์นิกายโปรเตสแตนต์อย่างรุนแรง คำเทศนาของเขาทำให้ เบิร์นตอบโต้ โดยขู่ว่าจะตัดความสัมพันธ์กับเจนีวาหากเฟอร์บิตีไม่ยอมถอนคำเทศนา แม้ว่าบิชอปจะเข้ามาแทรกแซงแล้วก็ตาม ทางการเจนีวาก็ยังจับกุมเขาและจัดการโต้วาทีสาธารณะกับวิลเลียม ฟาเรลในเดือนมกราคม ค.ศ. 1534 เฟอร์บิตีถูกคุมขังจนถึงเดือนเมษายน ค.ศ. 1536 จึงได้รับการปล่อยตัวตามคำขอของพระเจ้าฟรานซิส ที่1 ^{[ 7 ]}

แม้หลังจากการขับไล่บิชอปลาโบมออกจากเจนีวา ชัยชนะของนิกายโปรเตสแตนต์ก็ยังไม่แน่นอน เนื่องจากฝ่ายคาทอลิกในเมืองนั้นสมคบคิดกับฟริบูร์กเพื่อดำเนินการให้บิชอปคาทอลิกกลับมายังเจนีวา บิชอปลาโบมเองก็ลังเลในตอนแรก แต่สมเด็จพระสันตะปาปาเคลเมนต์ที่ 7ทรงกดดันให้เขายอมรับ ในวันที่ 3 กรกฎาคม ค.ศ. 1533 ด้วยความช่วยเหลือทางทหารจากฟริบูร์ก บิชอปจึงได้กลับเข้าสู่เจนีวาอีกครั้งในขบวนแห่ สภาใหญ่เรียกร้องให้บิชอปเคารพเสรีภาพดั้งเดิมของสาธารณรัฐ ซึ่งเขาสัญญาว่าจะรักษาไว้ อย่างไรก็ตาม ในไม่ช้าบิชอปก็เริ่มจับกุมชาวโปรเตสแตนต์ที่โดดเด่นในเจนีวา และมีข่าวลือว่าเขาตั้งใจจะนำตัวนักโทษไปยังฟริบูร์กและกักขังไว้ให้พ้นมือสภาใหญ่ ในวันที่ 12 กรกฎาคม เกิดการจลาจลขึ้น และบิชอปยอมจำนนต่อเสียงเรียกร้องของประชาชนและมอบตัวนักโทษให้แก่สภา ด้วยความกลัวว่าจะถูกทำร้ายถึงแก่ชีวิต บิชอปจึงหนีออกจากเมืองอีกครั้งในวันที่ 14 กรกฎาคม และครั้งนี้เขาไม่กลับมาอีกเลย โดยย้ายที่ทำการไปที่อาร์บัวส์และต่อมาไปที่แชมเบอรีอย่างไรก็ตาม ลาโบมยังคงดำรงตำแหน่งบิชอปแห่งเจนีวาอย่างเป็นทางการ และบาทหลวงและนักบวชคาทอลิกยังคงเป็นกลุ่มที่มีอิทธิพลในเมือง ลาโบมยังคงพยายามใช้อำนาจปกครองเหนือเจนีวา และในวันที่ 24 ตุลาคม ค.ศ. 1533 เขาได้เขียนจดหมายถึงสภาเรียกร้องให้หยุดการเผยแพร่ศาสนาโปรเตสแตนต์ในเจนีวา ซึ่งสภาปฏิเสธที่จะทำตาม

หลังจากการหลบหนีของบิชอป อิทธิพลของนักเทศน์โปรเตสแตนต์ในเจนีวาเพิ่มมากขึ้น ซึ่งสร้างความไม่พอใจให้กับบาทหลวงคาทอลิกในท้องถิ่น เนื่องจากแรงกดดันจากเบิร์นที่ขู่ว่าจะยกเลิกสนธิสัญญาพันธมิตรปี 1526 หากไม่ให้เสรีภาพแก่โปรเตสแตนต์ นอกจากนี้ บิชอปที่ถูกเนรเทศยังค่อยๆ สูญเสียความนิยมในหมู่ชาวคาทอลิกในสังคมเจนีวา เนื่องจากความพยายามหลายครั้งที่จะแทรกแซงกิจการยุติธรรมของสาธารณรัฐโดยทางอ้อม ซึ่งชาวเจนีวาเห็นว่าเป็นการโจมตีเสรีภาพของเมืองของพวกเขา ด้วยเหตุนี้ สภาใหญ่จึงตกลงในเดือนมกราคม 1534 ที่จะอนุญาตให้เจ้าหน้าที่ทางโลกพิจารณาคดีของนักบวช อิทธิพลของคาทอลิกในเจนีวาลดลงไปอีกหลังจากการหลบหนีของประชากรคาทอลิกบางส่วนในวันที่ 30 กรกฎาคม 1534 เนื่องจากความตึงเครียดที่เพิ่มขึ้นระหว่างคาทอลิกและโปรเตสแตนต์ และในการเลือกตั้งสภาใหญ่ในเดือนกุมภาพันธ์ 1535 โปรเตสแตนต์ก็ได้รับเสียงข้างมาก เมื่อบิชอปเดอ ลา โบม เห็นว่าเจนีวากำลังกลายเป็นเมืองโปรเตสแตนต์ จึงออกพระราชกฤษฎีกาเมื่อวันที่ 13 มิถุนายน ค.ศ. 1535 ห้ามการค้าขายกับเจนีวา โดยมีโทษถึงขั้นถูกตัดขาดจากศาสนาสภาใหญ่ แม้ว่าจะมีสมาชิกส่วนใหญ่เป็นโปรเตสแตนต์ ก็ยังลังเลที่จะประกาศให้เมืองนี้เป็นโปรเตสแตนต์อย่างเป็นทางการ ด้วยความกลัวการตอบโต้จากอาณาจักรคาทอลิกที่อยู่ใกล้เคียง เพื่อบีบให้สภาต้องดำเนินการดังกล่าว ผู้นำโปรเตสแตนต์ เช่น กิโยม ฟาเรล จึงเริ่มปลุกระดมฝูงชนให้ทำลายรูปเคารพและโยนแผ่นศีลมหาสนิทลงพื้นในโบสถ์คาทอลิก เพื่อเป็นการประนีประนอมระหว่างสองกลุ่ม สภาใหญ่จึงมีมติเมื่อวันที่ 10 สิงหาคม ค.ศ. 1535 ห้ามการทำลายรูปเคารพ และห้ามการประกอบพิธีมิสซาการกระทำนี้ยิ่งทำให้ชาวคาทอลิกหนีออกจากเมืองไปยังดินแดนซาวอยมากขึ้น และในวันที่ 1 ตุลาคม บิชอปปิแอร์ เดอ ลา โบม ก็หนีออกจากเมืองเป็นครั้งสุดท้าย

หลังจากการรุกรานเจนีวาอีกครั้งที่ไม่ประสบความสำเร็จโดยกองกำลังซาวอยในเดือนตุลาคม ค.ศ. 1535 ซึ่งจบลงด้วยความพ่ายแพ้ของซาวอยที่เมืองกิงจินส์สภาใหญ่ได้ตัดสินใจเมื่อวันที่ 3 กุมภาพันธ์ ค.ศ. 1536 ให้ทำลายปราสาททั้งหมดรอบเจนีวาเพื่อไม่ให้เจ้าชายใดมีข้ออ้างในการรุกรานเมืองของพวกเขาอีกต่อไป เมื่อวันที่ 21 พฤษภาคม ค.ศ. 1536 ชาวเจนีวาประกาศตนเป็นโปรเตสแตนต์โดยการสาบานตนต่อสาธารณะเพื่อแสดงความจงรักภักดีต่อ ศาสนา ลูเทอร์โดยมีผู้อยู่อาศัยทุกคนเข้าร่วม และประกาศให้เมืองของพวกเขาเป็นสาธารณรัฐ^{[ 8 ]}การเคลื่อนไหวนี้อยู่ในระหว่างการเตรียมการมาเป็นเวลานาน แต่ถูกเลื่อนออกไปเนื่องจากความกลัวการรุกรานของซาวอย อย่างไรก็ตาม การรุกรานดินแดนของซาวอยของฝรั่งเศสในช่วงต้นปีนั้นได้ขจัดอุปสรรคดังกล่าวออกไปแล้ว

จอห์น คาลวินผู้นำโปรเตสแตนต์ เดินทางมาถึงเจนีวาในปี ค.ศ. 1536 เมื่ออายุได้ 27 ปี^{[ 9 ]}และพำนักอยู่ในเจนีวาตั้งแต่ปี ค.ศ. 1536 จนกระทั่งเสียชีวิตในปี ค.ศ. 1564 (ยกเว้นช่วงที่ถูกเนรเทศระหว่างปี ค.ศ. 1538 ถึง ค.ศ. 1541) เขากลายเป็นผู้นำทางจิตวิญญาณของเมือง ซึ่งเป็นตำแหน่งที่สภาใหญ่สร้างขึ้นเมื่อเมืองนี้กลายเป็นเมืองโปรเตสแตนต์ เจนีวากลายเป็นศูนย์กลางของกิจกรรมโปรเตสแตนต์ โดยมีการผลิตผลงานต่างๆ เช่นGenevan Psalterแม้ว่าจะมีความตึงเครียดระหว่างคาลวินกับเจ้าหน้าที่ของเมืองอยู่บ่อยครั้ง คาลวินยังสนับสนุนการรับผู้ลี้ภัยโปรเตสแตนต์เข้าสู่เจนีวา ซึ่งบางกลุ่มคัดค้านอย่างรุนแรง

ในปี ค.ศ. 1584 เจนีวาได้กระชับความสัมพันธ์กับสมาพันธรัฐสวิสด้วย " สนธิสัญญา ถาวร " แยกต่างหากกับเมืองเบิร์นและซูริคซึ่งเป็นเมืองโปรเตสแตนต์ แต่เมืองทั้งห้าที่เป็นคาทอลิกได้ขัดขวางข้อเสนอใดๆ เกี่ยวกับการเข้าร่วมเป็นส่วนหนึ่งของสมาพันธรัฐอย่างเต็มรูปแบบของเจนีวา

ในปี ค.ศ. 1559 คาลวินได้ก่อตั้งสถาบันแห่งเจนีวา (ปัจจุบันคือมหาวิทยาลัยเจนีวา ) ในฐานะโรงเรียนศาสนศาสตร์ โดยแต่งตั้งธีโอดอร์ เบซานักปฏิรูปชาวฝรั่งเศสที่เดินทางมาถึงเจนีวาในปี ค.ศ. 1548 เป็นอธิการบดี ในขณะนั้น เบซาเป็นหัวหน้าสถาบันโลซาน เมื่อได้รับการคัดเลือกให้เป็นอธิการบดี เบซาได้สนับสนุนให้อาจารย์จากโลซานมาสอนที่สถาบันแห่งเจนีวาแห่งใหม่ หลังจากเหตุการณ์สังหารหมู่ในวันเซนต์บาร์โธโลมิว ในปี ค.ศ. 1572 ก็มีนักวิชาการ มนุษยนิยมปฏิรูปที่มีชื่อเสียงเช่น โจเซฟ จัสตัส สคา ลิเกอร์และไอแซค คาซาบอน เข้าร่วมด้วย ^{[ 10 ]}

แม้ว่าตัวเมืองเจนีวาจะยังคงเป็นฐานที่มั่นของนิกายโปรเตสแตนต์ แต่ส่วนใหญ่ของเขตปกครองทางศาสนาในอดีตได้หันกลับมานับถือนิกายคาทอลิกอีกครั้งในช่วงต้นศตวรรษที่ 17 ภายใต้ การนำของ นักบุญฟรานซิส เดอ ซาเลส เจนีวามีบทบาทสำคัญทางประวัติศาสตร์ในการเผยแพร่ศาสนาโปรเตสแตนต์ นอกจากการเป็นรัฐโปรเตสแตนต์แล้ว ในศตวรรษที่ 16 เจนีวายังกลายเป็นรัฐสวัสดิการอีกด้วย เนื่องจากโรงพยาบาลของรัฐทั่วไปก่อตั้งขึ้นในปี 1535 โดยโคลด ซาโลมง ผู้มั่งคั่งและเป็นโปรเตสแตนต์ ระบบการศึกษาแบบรวมศูนย์ก็ได้รับการจัดตั้งขึ้นโดยความร่วมมือของจอห์น คาลวิน

• การปฏิรูปศาสนาในสวิตเซอร์แลนด์