โครงการ Genographic

| ส่วนหนึ่งของชุดบทความเกี่ยวกับ |
| ลำดับวงศ์ตระกูลทางพันธุกรรม |
|---|
| แนวคิด |
| หัวข้อที่เกี่ยวข้อง |
โครงการGenographicซึ่งเปิดตัวเมื่อวันที่ 13 เมษายน พ.ศ. 2548 โดยNational Geographic SocietyและIBMเป็นการ ศึกษา ทางมานุษยวิทยาพันธุกรรมที่มุ่งเป้าไปที่การทำแผนที่ รูปแบบ การอพยพของมนุษย์ในอดีตโดยการรวบรวมและวิเคราะห์ตัวอย่างDNA [ 1 ]
ขั้นตอนสุดท้ายของโครงการคือ Geno 2.0 Next Generation [ 2 ]
เมื่อเว็บไซต์ปิดตัวลง มีผู้เข้าร่วมโครงการ 1,006,543 คนจากกว่า 140 ประเทศ[ 3 ]
ประวัติโครงการ
จุดเริ่มต้น
ในปี 2548 Spencer Wells ผู้อำนวยการโครงการ ได้สร้างและนำโครงการ Genographic ซึ่งเป็นการร่วมมือกันระหว่างNational Geographic Society , IBMและ Waitt Foundation ที่ ได้รับทุนสนับสนุนจากภาคเอกชนและไม่แสวงหาผลกำไร [ 4 ]นักวิจัยภาคสนามในศูนย์ภูมิภาค 11 แห่งทั่วโลกเริ่มต้นด้วยการเก็บตัวอย่าง DNA จากประชากร พื้นเมือง

ในฤดูใบไม้ร่วงปี 2012 โครงการ Genographic ประกาศความสำเร็จของ อาร์เรย์ การตรวจหาจีโนไทป์ แบบใหม่ ซึ่งอุทิศให้กับมานุษยวิทยาทางพันธุกรรมเรียกว่าGenoChip GenoChip ได้รับการออกแบบมาโดยเฉพาะสำหรับการทดสอบทางมานุษยวิทยาและรวมถึงSNPจากDNA ออโตโซม DNA โครโมโซม X DNA โครโมโซม YและDNA ไมโทคอนเดรีย (mtDNA) การออกแบบชิป ใหม่นี้ เป็นความร่วมมือระหว่าง Wells จาก National Geographic, Eran ElhaikจากJohns Hopkins , Family Tree DNAและIllumina [ 5 ]
การวิเคราะห์การผสมผสานออโตโซมที่พัฒนาโดย Wells และ Elhaik จำแนกบุคคลโดยประเมินสัดส่วนของบรรพบุรุษทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับภูมิภาคบรรพบุรุษเก้าแห่ง ได้แก่เอเชียตะวันออกเฉียงเหนือเมดิเตอร์เรเนียนแอฟริกาใต้เอเชียตะวันตกเฉียงใต้โอเชียเนียเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ ยุโรปเหนือแอฟริกาใต้ทะเลทรายซาฮาราและชนพื้นเมืองอเมริกัน[ 6 ]
ในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2558 ชิปตัวใหม่ได้รับการออกแบบโดยความร่วมมือระหว่าง Vilar ซึ่งเป็นหัวหน้านักวิทยาศาสตร์ด้านจีโนกราฟิก และ Family Tree DNA [ 7 ]
ในฤดูใบไม้ร่วงปี 2015 มิเกล วิลาร์ เข้ามารับตำแหน่งผู้นำโครงการ[ 8 ]
จีโน 2.0 รุ่นต่อไป
ในปี 2559 โครงการเริ่มใช้เทคโนโลยีการจัดลำดับดีเอ็นเอ Helixที่ทันสมัย[ 2 ] สำหรับขั้นตอนใหม่ของโครงการ Genographic ที่เรียกว่า Geno 2.0 Next Generation [ 2 ] [ 9 ]
ในขณะที่เฟสก่อนหน้าใช้การแบ่งภูมิภาค 9 ภูมิภาค Geno 2.0 Next Generation วิเคราะห์ประชากรพื้นเมืองในปัจจุบันทั่วโลกโดยใช้การแบ่งภูมิภาค 18 หรือ 22 ภูมิภาค[ 10 ]
Helix จะใช้ชุดเก็บตัวอย่าง DNA เพื่อเก็บตัวอย่างน้ำลายจากผู้เข้าร่วม จากนั้นจะนำไปวิเคราะห์หาตัวระบุทางพันธุกรรมที่ออกแบบมาเพื่อให้ข้อมูลเชิงลึกที่ไม่เคยมีมาก่อน[ 2 ]เกี่ยวกับต้นกำเนิดทางพันธุกรรมของบุคคล[ 2 ]จากนั้นข้อมูลจะถูกอัปโหลดไปยังฐานข้อมูล DNA ของโครงการ Genographic [ 2 ]
| ประชากร | เมดิเตอร์เรเนียน | ยุโรปเหนือ | เอเชียตะวันตกเฉียงใต้ | แอฟริกาใต้ทะเลทรายซาฮารา | แอฟริกาตอนใต้ | เอเชียตะวันออกเฉียงเหนือ | เอเชียตะวันออกเฉียงใต้ | ชนพื้นเมืองอเมริกัน | โอเชียเนีย | ทั้งหมด |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| อัลตาเอียน | 2 | 17 | 22 | 53 | 4 | 98 | ||||
| ชนพื้นเมืองอเมริกัน (เม็กซิโก) | 4 | 5 | 3 | 4 | 83 | 99 | ||||
| ชาวเบอร์มิวเดียน | 15 | 20 | 7 | 48 | 3 | 7 | 4 | 100 | ||
| ชาวอังกฤษ | 33 | 50 | 17 | 100 | ||||||
| บัลแกเรีย | 47 | 31 | 20 | 2 | 100 | |||||
| ชาวจีน | 72 | 28 | 100 | |||||||
| เดนมาร์ก | 30 | 53 | 16 | 99 | ||||||
| โดมินิกัน | 29 | 11 | 1 | 47 | 1 | 1 | 1 | 4 | 95 | |
| อินเดียตะวันออก | 2 | 2 | 43 | 50 | 2 | 99 | ||||
| อียิปต์ | 65 | 18 | 14 | 97 | ||||||
| ฟินแลนด์ | 17 | 57 | 17 | 7 | 98 | |||||
| จอร์เจีย | 61 | 7 | 31 | 99 | ||||||
| ภาษาเยอรมัน | 36 | 46 | 17 | 99 | ||||||
| กรีก | 54 | 28 | 17 | 99 | ||||||
| ไอบีเรีย | 48 | 37 | 13 | 98 | ||||||
| อิหร่าน | 42 | 8 | 42 | 5 | 97 | |||||
| ญี่ปุ่น | 75 | 25 | 100 | |||||||
| โคอิซาน | 47 | 52 | 99 | |||||||
| คิง | 57 | 43 | 100 | |||||||
| ชาวคูเวต | 57 | 4 | 27 | 8 | 2 | 98 | ||||
| ชาวเลบานอน | 66 | 5 | 26 | 2 | 99 | |||||
| ลูห์ยา | 2 | 89 | 8 | 99 | ||||||
| มาดากัสการ์ | 2 | 57 | 4 | 15 | 20 | 98 | ||||
| เม็กซิกัน | 28 | 20 | 8 | 4 | 2 | 36 | 98 | |||
| มองโกล | 2 | 7 | 76 | 10 | 5 | 100 | ||||
| ชาวคอเคซัสเหนือ | 46 | 16 | 33 | 4 | 99 | |||||
| อินเดียเหนือ | 6 | 5 | 34 | 26 | 27 | 98 | ||||
| โอเชียเนีย | 12 | 88 | 100 | |||||||
| ปาปัว | 5 | 4 | 91 | 100 | ||||||
| ชาวเปรูบนที่สูง | 2 | 2 | 95 | 99 | ||||||
| ชาวเปรู | 15 | 10 | 3 | 2 | 68 | 98 | ||||
| ชาวเปอร์โตริโก | 31 | 21 | 9 | 25 | 2 | 11 | 99 | |||
| โรมาเนีย | 43 | 36 | 19 | 2 | 100 | |||||
| ชาวรัสเซีย | 25 | 51 | 18 | 4 | 98 | |||||
| ชาวซาร์ดิเนีย | 67 | 24 | 8 | 99 | ||||||
| อินเดียใต้ | 4 | 2 | 58 | 35 | 99 | |||||
| ทาจิกิสถาน | 22 | 22 | 44 | 10 | 98 | |||||
| ตาตาร์ | 21 | 40 | 21 | 16 | 98 | |||||
| ตูนิเซีย | 62 | 6 | 10 | 19 | 2 | 99 | ||||
| ทัสคาน | 54 | 28 | 17 | 99 | ||||||
| วานูอาตู | 4 | 15 | 78 | 97 | ||||||
| อินเดียตะวันตก | 9 | 6 | 58 | 26 | 99 | |||||
| ชาวโยรูบา | 97 | 3 | 100 |
| ประชากร | อาระเบีย | เอเชียไมเนอร์ | เอเชียกลาง | แอฟริกาตะวันออก | ยุโรปตะวันออก | บริเตนใหญ่และไอร์แลนด์ | ชาวยิวพลัดถิ่น | แอฟริกาเหนือ | แอฟริกาตอนใต้ | เอเชียใต้ | เอเชียตะวันตกเฉียงใต้และอ่าวเปอร์เซีย | ยุโรปใต้ | แอฟริกาตะวันตกและแอฟริกากลาง |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ชาวอเมริกันเชื้อสายแอฟริกัน (ภาคตะวันตกเฉียงใต้ของสหรัฐอเมริกา) | 2% | 4% | 9% | 3% | 81% | ||||||||
| อียิปต์ | 3% | 3% | 4% | 68% | 17% | 3% | |||||||
| เอธิโอเปีย | 11% | 64% | 5% | 7% | 8% | 5% | |||||||
| กรีก | 9% | 7% | 2% | 2% | 79% | ||||||||
| อิหร่าน | 56% | 6% | 4% | 4% | 2% | 24% | 2% | ||||||
| ชาวคูเวต | 7% | 3% | 4% | 84% | |||||||||
| ลูห์ยา (เคนยา) | 81% | 4% | 4% | 4% | 2% | 5% | |||||||
| ตูนิเซีย | 88% | 4% | 5% | 2% | |||||||||
| ชาวโยรูบา (แอฟริกาตะวันตก) | 2% | 3% | 6% | 89% |
ตอนจบ
ในฤดูใบไม้ผลิปี 2019 มีการประกาศว่าโครงการ Geno ได้สิ้นสุดลงแล้ว แต่ผลลัพธ์จะยังคงสามารถดูได้ทางออนไลน์จนถึงปี 2020
เว็บไซต์ดังกล่าวถูกปิดตัวลงในเดือนกรกฎาคม ปี 2020
มรดก
ตลอดระยะเวลาของโครงการริเริ่ม ตั้งแต่ปี 2005 ถึง 2019 Genographic ได้ดึงอาสาสมัคร (ในการทำงานภาคสนามและการจัดหาตัวอย่าง DNA) และ โครงการ วิทยาศาสตร์ภาคประชาชน เข้า ร่วม ในช่วงเวลานี้ สมาคมเนชั่นแนลจีโอกราฟิกได้จำหน่ายชุดทดสอบด้วยตนเองที่ไม่แสวงหาผลกำไรให้กับประชาชนทั่วไปที่ต้องการเข้าร่วมโครงการในฐานะ "นักวิทยาศาสตร์ภาคประชาชน" การเผยแพร่การมีส่วนร่วมของประชาชนในการวิจัยดังกล่าวได้รับการสนับสนุนจากองค์กรต่างๆ เช่นสมาคมพันธุศาสตร์ระหว่างประเทศ (ISOGG) ซึ่งมุ่งหวังที่จะส่งเสริมประโยชน์จากการวิจัยทางวิทยาศาสตร์[ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]ซึ่งรวมถึงการสนับสนุน การจัด และการเผยแพร่การทดสอบ DNA (พันธุกรรม) ส่วนบุคคล
ISOGG สนับสนุนการมีส่วนร่วมของประชาชนในการวิจัยทางพันธุกรรม[ 15 ]และเชื่อว่าอาสาสมัครดังกล่าวได้ให้ข้อมูลและการวิจัยที่มีค่าแก่ชุมชนวิทยาศาสตร์มืออาชีพ[ 16 ]
ในปี 2013 สเปนเซอร์ เวลส์ ได้กล่าวสุนทรพจน์ต่อที่ประชุมสมาคมลำดับวงศ์ตระกูลแห่งแคลิฟอร์เนียตอนใต้ โดยเน้นย้ำถึงการสนับสนุนนักวิทยาศาสตร์พลเมืองของสมาคมฯ:
นับตั้งแต่ปี 2005 โครงการ Genographic ได้ใช้เทคโนโลยีทางพันธุกรรมล่าสุดเพื่อขยายความรู้เกี่ยวกับเรื่องราวของมนุษย์ และการใช้การทดสอบ DNA ที่เป็นนวัตกรรมเพื่อดึงดูดและมีส่วนร่วมของประชาชนในความพยายามวิจัยได้ช่วยสร้าง "นักวิทยาศาสตร์พลเมือง" รุ่นใหม่ Geno 2.0 ขยายขอบเขตของวิทยาศาสตร์พลเมือง โดยใช้พลังของกลุ่มคนเพื่อค้นพบรายละเอียดใหม่ๆ เกี่ยวกับประวัติศาสตร์ประชากรมนุษย์[ 17 ]
การวิจารณ์
ในเดือนเมษายน พ.ศ. 2548 ไม่นานหลังจากประกาศโครงการสภาชนพื้นเมืองว่าด้วยชีวอาณานิคม (IPCB) ได้ตั้งข้อสังเกตถึงความเชื่อมโยงกับประเด็นที่เป็นข้อถกเถียง (เช่น ความกังวลในหมู่ชนเผ่าบางเผ่าว่าผลการศึกษาการย้ายถิ่นฐานของมนุษย์ทางพันธุกรรมอาจบ่งชี้ว่าชาวอเมริกันพื้นเมืองไม่ได้เป็นชนพื้นเมืองของทวีปอเมริกาเหนือ) IPCB แนะนำไม่ให้ชนพื้นเมืองเข้าร่วม[ 18 ]
เดบรา แฮร์รี ผู้ก่อตั้ง IPCB ได้เสนอเหตุผลว่าทำไมชนพื้นเมืองจึงไม่ได้รับการสนับสนุนให้เข้าร่วมโครงการจีโนกราฟิก ตามที่แฮร์รี ซึ่งเป็นชาวอเมริกันพื้นเมืองเผ่าไพยูตเหนือและรองศาสตราจารย์ด้านการศึกษาชนพื้นเมืองที่มหาวิทยาลัยเนวาดา กล่าวว่า โครงการจีโนกราฟิกส่งผลให้เกิด การ ทดสอบทางพันธุกรรม ของมนุษย์ ที่ดูเหมือนจะปกปิดแรงจูงใจแอบแฝงมากกว่าการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ความกังวลอย่างมากเกี่ยวกับผลประโยชน์ทางการเมืองที่อาจอยู่เบื้องหลังโครงการจีโนกราฟิก ทำให้ IPCB แจ้งเตือนชุมชนชนพื้นเมืองทั่วโลกเกี่ยวกับ "แรงจูงใจที่ไม่เสียสละ" [ 19 ]ของโครงการ นอกจากนี้ IPCB ยังโต้แย้งว่าโครงการจีโนกราฟิกไม่เพียงแต่ไม่มีประโยชน์โดยตรงต่อชนพื้นเมืองเท่านั้น แต่ยังก่อให้เกิดความเสี่ยงอย่างมากอีกด้วย ความเสี่ยงดังกล่าวที่แฮร์รีกล่าวถึงในการสัมภาษณ์ที่เผยแพร่ในเดือนธันวาคม 2005 ถูกนำมาใช้เพื่อคัดค้านการมีส่วนร่วมของชนพื้นเมืองในโครงการ[ 20 ]
ข้อโต้แย้งอีกประการหนึ่งที่เสนอโดย Debra Harry ผู้ก่อตั้ง IPCB คือโครงการ Genographic ทำหน้าที่เป็นวิธีการลดความน่าเชื่อถือของความสัมพันธ์ทางเครือญาติผ่านความเป็นไปได้ที่อัตลักษณ์บรรพบุรุษอาจถูกทำให้เป็นโมฆะและนำไปใช้ในทางที่ผิดเพื่อปฏิเสธการเข้าถึงและอำนาจของชนพื้นเมืองเหนือดินแดนที่อุดมไปด้วยทรัพยากรซึ่งพวกเขาอาศัยอยู่มานาน[ 20 ]
IPCB ยังแนะนำว่าความพยายามอีกประการหนึ่งของลัทธิอาณานิคมชีวภาพในโครงการ Genographic เกี่ยวข้องกับความน่าจะเป็นสูงที่ผลการทดสอบทางพันธุกรรมจะก่อให้เกิดข้อผิดพลาดทางสถิติ เช่น ผลลบเท็จและผลบวกเท็จ ซึ่งนำไปสู่การระบุชนพื้นเมืองผิดว่าเป็นคนที่ไม่ใช่ชนพื้นเมืองและในทางกลับกัน[ 21 ]
TallBearแสดงความคิดเห็นว่าผลเสียอีกประการหนึ่งที่อาจเกิดขึ้นได้คือความเสี่ยงที่อัตลักษณ์ทางวัฒนธรรมของบุคคลจะถูกกำหนดอย่างเด็ดขาดผ่านโครงการอาณานิคมชีวภาพ เช่น โครงการ Genographic [ 21 ]ในที่สุด ข้อโต้แย้งของ TallBear ก็ถูกมองว่าสอดคล้องกับความกังวลของ Harry เกี่ยวกับโครงการ Genographic อย่างใกล้ชิด ซึ่งทำหน้าที่เป็นแรงผลักดันสำคัญที่กระตุ้นให้ IPCB สนับสนุนการต่อต้านอาณานิคมชีวภาพ
ในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2549 โครงการนี้ได้รับความสนใจจากเวทีถาวรแห่งสหประชาชาติว่าด้วยประเด็นชนพื้นเมือง (UNPFII) UNPFII ได้ทำการตรวจสอบวัตถุประสงค์ของโครงการ Genographic และแนะนำให้ National Geographic และผู้สนับสนุนรายอื่น ๆ ระงับโครงการ[ 22 ]มีข้อกังวลว่าความรู้ที่ได้จากการวิจัยอาจขัดแย้งกับความเชื่อที่มีมายาวนานของชนพื้นเมืองและคุกคามวัฒนธรรมของพวกเขา นอกจากนี้ยังมีข้อกังวลว่าการอ้างสิทธิ์ในที่ดินและทรัพยากรอื่น ๆ ของชนพื้นเมืองอาจถูกคุกคาม[ 23 ]
ณ เดือนธันวาคม พ.ศ. 2549 ชนเผ่าที่ได้รับการยอมรับจากรัฐบาลกลางในสหรัฐอเมริกาบางเผ่าปฏิเสธที่จะเข้าร่วมในการศึกษา รวมถึงมอริซ ฟ็อกซ์ ประธานคณะกรรมการกิจการอินเดียนแห่งรัฐแมสซาชูเซตส์และสมาชิกของชนเผ่ามาชพีวัมปาโนแอก[ 22 ]
ไม่ใช่ชนพื้นเมืองทั้งหมดที่เห็นด้วยกับจุดยืนของเขา ณ เดือนธันวาคม 2012 มีผู้เข้าร่วมโครงการที่เป็นชนพื้นเมืองมากกว่า 70,000 คนจากทวีปอเมริกา แอฟริกา เอเชีย ยุโรป และโอเชียเนีย[ 10 ]
ดูเพิ่มเติม
- การตรวจดีเอ็นเอเพื่อ ระบุลำดับวงศ์ตระกูล – การตรวจทางพันธุกรรมโดยใช้ดีเอ็นเอ
- ความหลากหลายทางพันธุกรรม – จำนวนลักษณะทางพันธุกรรมทั้งหมดในสิ่งมีชีวิตชนิดหนึ่ง
- ความแปรผันทางพันธุกรรมของมนุษย์ – ความหลากหลายทางพันธุกรรมในประชากรมนุษย์
- พันธุศาสตร์มนุษย์ – การศึกษาเกี่ยวกับการถ่ายทอดทางพันธุกรรมที่เกิดขึ้นในมนุษย์
- การย้ายถิ่นฐานของมนุษย์ – การเคลื่อนย้ายผู้คนเพื่อประโยชน์ของพวกเขา
- กลุ่มแฮปโลไทป์ของดีเอ็นเอไมโทคอนเดรียของมนุษย์ – กลุ่มแฮปโลไทป์ที่กำหนดโดยความแตกต่างของดีเอ็นเอไมโทคอนเดรียของมนุษย์
- กลุ่มแฮปโลไทป์ของดีเอ็นเอโครโมโซม Y ของมนุษย์ – การจัดกลุ่มดีเอ็นเอของมนุษย์
- ไมโตคอนเดรียล อีฟ – บรรพบุรุษร่วมที่ใกล้ที่สุดทางสายแม่ของมนุษย์ทุกคนที่ยังมีชีวิตอยู่
- จีโนมิกส์ส่วนบุคคล – สาขาหนึ่งของจีโนมิกส์ที่เกี่ยวข้องกับจีโนมของแต่ละบุคคล
- อาดัมผู้มีโครโมโซม Y – บรรพบุรุษร่วมที่ใกล้ที่สุดทางสายพ่อของมนุษย์ทุกคนที่ยังมีชีวิตอยู่
- กลุ่มแฮพลอของโครโมโซม Y ในประชากรทั่วโลก
บรรณานุกรม
บทความข่าว
- "การค้นหารากเหง้าของมนุษย์ยุคใหม่"ซีเอ็นเอ็น 14 เมษายน 2548
- "“โครงการลำดับวงศ์ตระกูลมีเป้าหมายเพื่อบอกเราว่าเรามาจากไหน” USA Today . 17 เมษายน 2548
- "ชนพื้นเมืองคัดค้านเนชั่นแนล จีโอกราฟิก"สภาชนพื้นเมืองว่าด้วยลัทธิล่าอาณานิคมชีวภาพ 13 เมษายน 2548
- "ติดตามความจริง" นิตยสาร DB2 ( IBM) ข้อมูลเกี่ยวกับบทบาทของ IBM ในโครงการนี้ ธันวาคม 2549
- เรื่องราวความสำเร็จด้านการจัดลำดับวงศ์ตระกูล
- "นักรบครูเสดทิ้งมรดกทางพันธุกรรมไว้"บีบีซี นิวส์ 27 มีนาคม 2551
- "กลุ่ม Human Line เกือบแตกเป็นสองเสี่ยง"" . บีบีซี นิวส์. 24 เมษายน 2551.
ลิงก์ภายนอก
เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ
- เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ ของโครงการ Genographicที่ National Geographic
- ห้องปฏิบัติการวิจัยแอริโซนา (ARL) เก็บถาวรเมื่อวันที่ 9 ตุลาคม 2022 ที่Wayback Machine
- มูลนิธิครอบครัวเวทท์