กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 3 นาที

กลุ่มอ้างอิงจีโนม

กลุ่มความร่วมมืออ้างอิงจีโนม ( Genome Reference ConsortiumหรือGRC ) เป็นกลุ่มความร่วมมือระดับนานาชาติของสถาบันการศึกษาและสถาบันวิจัยที่มีความเชี่ยวชาญด้านการทำแผนที่จีโนม...

กลุ่มอ้างอิงจีโนม

จีโนมอ้างอิงมนุษย์ฉบับสมบูรณ์จากชุดประกอบ GRCh38/hg38 (Genome Reference Consortium Human Build 38)

กลุ่มความร่วมมืออ้างอิงจีโนม ( Genome Reference ConsortiumหรือGRC ) เป็นกลุ่มความร่วมมือระดับนานาชาติของสถาบันการศึกษาและสถาบันวิจัยที่มีความเชี่ยวชาญด้านการทำแผนที่จีโนม การจัดลำดับ และสารสนเทศจีโนม ก่อตั้งขึ้นเพื่อปรับปรุงการนำเสนอจีโนมอ้างอิงในขณะที่จีโนมอ้างอิงของมนุษย์ได้รับการอธิบายครั้งแรกนั้น เป็นที่ชัดเจนว่าบางส่วนของจีโนมนั้นยากต่อการวิเคราะห์ด้วยเทคโนโลยีที่มีอยู่ ทำให้เกิดช่องว่างในลำดับที่ทราบ เหตุผลหลักในการปรับปรุงชุดประกอบจีโนมอ้างอิงก็คือ ชุดประกอบเหล่านี้เป็นรากฐานสำคัญของการศึกษาจีโนมทั้งหมด (เช่นโครงการ 1000 จีโนม )

GRC เป็นความพยายามร่วมกันซึ่งมีปฏิสัมพันธ์กับกลุ่มต่างๆ ในชุมชนวิทยาศาสตร์[ 1 ]สถาบันสมาชิกหลัก ได้แก่:

เป้าหมายของกลุ่มความร่วมมือคือการแก้ไขภูมิภาคจำนวนเล็กน้อยในข้อมูลอ้างอิงที่แสดงผิดพลาดในปัจจุบัน เพื่อปิดช่องว่างที่เหลืออยู่ให้ได้มากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ และสร้างชุดประกอบทางเลือกของตำแหน่ง ที่มีโครงสร้างแตกต่างกัน เมื่อจำเป็น ในตอนแรกเน้นที่ จีโนมอ้างอิง ของมนุษย์และหนูแต่ในการขยายกลุ่มความร่วมมือได้มีการเพิ่มสิ่งมีชีวิตใหม่ๆ เข้ามา ในเดือนตุลาคม 2010 การบำรุงรักษาและการปรับปรุงลำดับ จีโนม ปลาซีบราฟิช อย่างเต็มรูปแบบ ได้ถูกเพิ่มเข้าไปใน GRC [ 2 ]ในปี 2015 หลังจากมีการเผยแพร่ ชุดประกอบจีโนม ไก่ Gallus_gallus-5.0 GRC ได้เพิ่มจีโนมอ้างอิงของไก่[ 3 ]และในเดือนพฤศจิกายน 2020 ได้มีการเพิ่มชุดประกอบจีโนมหนู[ 4 ]

ณ เดือนกันยายน พ.ศ. 2562 การเผยแพร่ชุดประกอบหลักสำหรับมนุษย์ หนู ปลาซีบราฟิช และไก่ คือ GRCh38, GRCm38, GRCz11 และ GRCg6a ตามลำดับ การเผยแพร่ชุดประกอบหลักไม่ได้เป็นไปตามรอบที่กำหนดไว้ตายตัว อย่างไรก็ตาม มีการอัปเดตชุดประกอบย่อยในรูปแบบของแพตช์จีโนม ซึ่งแก้ไขข้อผิดพลาดในชุดประกอบหรือเพิ่มตำแหน่งทางเลือกเพิ่มเติม[ 5 ] ชุดประกอบเหล่านี้แสดงอยู่ในเบราว์เซอร์จีโนมและฐานข้อมูลต่างๆ รวมถึงEnsembl , ที่อยู่ในNCBIและUCSC Genome Browser

บุคลากรที่โดดเด่น

  • กลุ่มอ้างอิงจีโนม

หน้าหลักของสถาบัน

  • สถาบันชีวสารสนเทศแห่งยุโรป
  • สถาบันจีโนมแห่งมหาวิทยาลัยวอชิงตัน
  • ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
  • สถาบันเวลคัมทรัสต์แซงเกอร์
  • ฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบปลาซีบร้า (ZFIN)
  • ฐานข้อมูลจีโนมหนู (RGD)

การประกอบจีโนม

  • ชุดประกอบจีโนมไก่Gallus_gallus-5.0และGRCg6a/galGal6
  • การประกอบจีโนมมนุษย์GRCh38/hg38
  • การประกอบจีโนมหนูGRCm38
  • การประกอบจีโนมปลาซีบร้าฟิชGRCz11/danRer11
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Genome_Reference_Consortium&oldid=1316176723 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ กลุ่มอ้างอิงจีโนม

กลุ่มความร่วมมืออ้างอิงจีโนม ( Genome Reference ConsortiumหรือGRC ) เป็นกลุ่มความร่วมมือระดับนานาชาติของสถาบันการศึกษาและสถาบันวิจัยที่มีความเชี่ยวชาญด้านการทำแผนที่จีโนม...

บุคลากรที่โดดเด่น

Deanna M. Church นักวิจัยด้านชีวสารสนเทศและจีโนมิกส์ [ 6 ] ริชาร์ด เดอร์บิน นักชีววิทยาเชิงคำนวณแห่ง มหาวิทยาลัยเคม บริดจ์ [ 7 ] ทิม ฮับบาร์ด นักชีววิทยาเชิงคำนวณที่ คิงส์คอลเลจลอนดอน และหัวหน้าฝ่ายวิเคราะห์จีโนมใน จีโนมิกส์อิง แลนด์ [ 8 ]