ชุงฮุนรับราชการบนเรือรบUSS Arizona ในตำแหน่ง^{ร้อยโท [ 9 ]}แต่กำลัง^{อยู่ใน}ช่วงวันหยุดสุดสัปดาห์ ที่ โฮโนลูลู ระหว่าง การโจมตีเพิร์ลฮาร์เบอร์ชุงฮุนได้ยินข่าวการโจมตีจากโฮโนลูลูและพยายามกลับไปยังเรือของเขา แต่ถูกขัดขวางโดยด่านตรวจและรถติด^{[ 10 ]}เมื่อเขาไปถึงเรือArizonaเรือก็ระเบิดและจมลงแล้ว

หลังจากเรืออริโซน่าจม ชุงฮุนได้ปฏิบัติหน้าที่เป็นเจ้าหน้าที่ประสานงานกองทัพเรือประจำปืนใหญ่ชายฝั่งก่อนที่จะขึ้นเป็นเจ้าหน้าที่บริหารบนเรือพิฆาตในปี พ.ศ. 2485 โดยทำหน้าที่คุ้มกันขบวนเรือในมหาสมุทรแอตแลนติก^{[ 11 ]}เขายังประจำการอยู่บนเรือลาดตระเวนUSS Honolulu  อีก ด้วย^{[ 12 ]}

ตั้งแต่เดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2487 ถึงตุลาคม พ.ศ. 2488 ชุงฮุนได้บังคับบัญชาเรือพิฆาตUSS Sigsbee ในฤดูใบไม้ผลิปี พ.ศ. 2488 Sigsbeeได้ช่วยทำลายเครื่องบินข้าศึก 20 ลำ ขณะคุ้มกัน กองกำลังโจมตี ของเรือบรรทุกเครื่องบินนอก ชายฝั่งเกาะ คิวชูของญี่ปุ่นเมื่อวันที่ 14 เมษายน พ.ศ. 2488 ขณะประจำการอยู่ที่สถานีเรดาร์นอกชายฝั่งโอกินาวาเครื่องบินกามิกาเซ่ได้พุ่งชนSigsbee ทำให้เครื่องยนต์ ด้านขวา ของเรือ ลด ความเร็ว ลงเหลือ5 นอต(9.3 กม./ชม.; 5.8 ไมล์/ชม.) และทำให้เครื่องยนต์ ด้านซ้าย และระบบควบคุมการบังคับเลี้ยว ของเรือเสียหายแม้จะได้รับความเสียหาย แต่ผู้บัญชาการชุงฮุนยังคงสั่งการให้ปืนต่อต้านอากาศยานยิง "อย่างต่อเนื่องและมีประสิทธิภาพ" ต่อต้านการโจมตีทางอากาศของญี่ปุ่นที่ยังคงดำเนินต่อไป ในขณะเดียวกันก็สั่งการควบคุมความเสียหายที่ทำให้Sigsbeeสามารถเข้าเทียบท่าได้ด้วยตนเอง^{[ 1 ]}ลูกเรือทั้งหมด 23 นายเสียชีวิต  

ความเสียหายรุนแรงมากจนพลเรือเอกวิลเลียม ฮัลซีย์ จูเนียร์สั่งให้ชุงฮุนจมเรือ อย่างไรก็ตาม ชุงฮุนปฏิเสธที่จะทำเช่นนั้น โดยบอกกับพลเรือเอกว่า "ไม่ ผมมีเด็กๆ อยู่บนเรือที่ว่ายน้ำไม่เป็น และผมจะไม่ให้พวกเขาลงไปในน้ำ ผมจะนำเรือกลับไป" ^{[ 13 ]}

วันต่อมา ชุงฮุนนำพิธีฝังศพในทะเลสำหรับผู้เสียชีวิต ลูกเรือคนหนึ่งกล่าวถึงชุงฮุนระหว่างพิธีฝังศพว่า "ฉันมักจะจำได้ว่าผู้ชายคนเดียวที่แข็งแกร่งพอที่จะไม่หลบ ก็เป็นผู้ชายคนเดียวที่อ่อนโยนพอที่จะร้องไห้" ^{[ 12 ]}

จากการปฏิบัติหน้าที่บนเรือ ซิกส์บีของชุงฮุนเขาได้รับเหรียญเนวีครอสและเหรียญซิลเวอร์สตาร์สำหรับความกล้าหาญอันโดดเด่นและวีรกรรมอันเหนือธรรมดา^{[ 1 ]}

ในช่วงสงคราม พี่ชายสองคนของชุงฮุนรับราชการทหารในเขตแปซิฟิก^{[ 11 ]}

หลังจากที่Sigsbeeถูกยุบเลิกหลังสงครามสิ้นสุดลง Chung-Hoon ก็ถูกย้ายไปที่เพิร์ลฮาร์เบอร์ในเดือนพฤศจิกายนในฐานะเจ้าหน้าที่ผู้รับผิดชอบกองกิจกรรมพิเศษของกองกำลังบริการกองเรือแปซิฟิกซึ่งรับผิดชอบหน้าที่ด้านการบริหารต่างๆ^{[ 14 ]}

ระหว่างวันที่ 16 สิงหาคม 1950 ถึง 7 มีนาคม 1952 ชุงฮุนดำรงตำแหน่งผู้บังคับการเรือพิฆาตUSS John W. Thomason ในช่วงสงครามเกาหลีภายใต้การบังคับบัญชาของชุงฮุน เรือพิฆาตลำนี้ปฏิบัติการในฐานะส่วนหนึ่งของกองเรือที่ 7ลาดตระเวนอยู่นอกชายฝั่งเกาหลีและเข้าร่วมในการระดมยิงปืนใหญ่

เขาได้รับการเลื่อนยศเป็นกัปตันเมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม พ.ศ. 2496 ^{[ 15 ]}

เขาดำรงตำแหน่งผู้บังคับบัญชาของกลุ่มฝึกอบรมทางทะเลในแปซิฟิกตอนกลาง ตั้งแต่เดือนมีนาคมถึงมิถุนายน ปี 1954 โดยมีหน้าที่กำกับการฝึกอบรมและรับรองคุณสมบัติของเรือที่ประจำการอยู่ในฮาวาย

ชุง-ฮุนดำรงตำแหน่งกัปตันเรือทดสอบขีปนาวุธนำวิถีUSS Norton Sound ระหว่างเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2499 ^{[ 16 ]}และสิงหาคม พ.ศ. 2490 ต่อมาเขาถูกย้ายไปประจำการที่สำนักงานเสนาธิการกองทัพเรือในกรุงวอชิงตัน ดี.ซี. ^{[ 17 ]}ซึ่งเป็นตำแหน่งสุดท้ายของเขา^{[ 18 ]}ชุง-ฮุนเกษียณอายุราชการในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2492 และได้รับการเลื่อนยศเป็นพลเรือตรีเมื่อเกษียณอายุราชการทำให้เขากลายเป็นนายทหารระดับสูงชาวอเมริกันเชื้อสายเอเชีย คนแรก ของกองทัพเรือสหรัฐฯ^{[ 15 ] [ 19 ]}

ประธานาธิบดีแห่งสหรัฐอเมริกา มีความยินดีที่จะมอบเหรียญกล้าหาญเนวีครอสให้แก่ นาวาโท กอร์ดอน ปาอีอา ชุง-ฮุน แห่งกองทัพเรือสหรัฐฯ สำหรับความกล้าหาญเป็นพิเศษและการปฏิบัติหน้าที่อันโดดเด่นในฐานะผู้บังคับการเรือพิฆาต USS SIGSBEE (DD-502) ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มเรือลาดตระเวนขั้นสูง ในการปฏิบัติการต่อต้านกองกำลังญี่ปุ่นในบริเวณใกล้เคียงโอกินาวา หมู่เกาะริวกิว เมื่อวันที่ 14 เมษายน 1945 แม้ว่าเรือของเขาจะได้รับความเสียหายอย่างหนักจากการถูกเครื่องบินข้าศึกโจมตีและสูญเสียพลังงานทั้งหมด นาวาโท ชุง-ฮุน ก็ยังคงดำเนินการป้องกันอย่างใจเย็นและสั่งการให้ปืนต่อต้านอากาศยานยิงตอบโต้การโจมตีทางอากาศอย่างหนักหน่วงของข้าศึกอย่างต่อเนื่องและมีประสิทธิภาพ หลังจากนั้น เขาได้ควบคุมดูแลขั้นตอนการซ่อมแซมความเสียหาย ซึ่งส่งผลให้เรือของเขาสามารถกลับเข้าสู่ท่าเรือได้อย่างปลอดภัยด้วยพลังงานที่ฟื้นคืนมา ความกล้าหาญ ความมุ่งมั่น และความทุ่มเทในการปฏิบัติหน้าที่อย่างไม่ย่อท้อของนาวาโท ชุง-ฮุน สอดคล้องกับประเพณีสูงสุดของกองทัพเรือสหรัฐฯ^{[ 30 ]}

ประธานาธิบดีแห่งสหรัฐอเมริกามีความยินดีที่จะมอบเหรียญเงินดาว (Silver Star) ให้แก่ผู้บัญชาการกอร์ดอน ปาอี ชุง-ฮุน แห่งกองทัพเรือสหรัฐฯ สำหรับความกล้าหาญและความไม่เกรงกลัวอย่างเด่นชัดในฐานะผู้บังคับบัญชาเรือพิฆาต USS SIGSBEE (DD-502) ในการปฏิบัติการต่อต้านกองกำลังญี่ปุ่นในบริเวณใกล้เคียงเกาะคิวชู ประเทศญี่ปุ่น ตั้งแต่วันที่ 17 มีนาคม พ.ศ. 2488 ถึง 10 เมษายน พ.ศ. 2488 ในฐานะผู้บัญชาการหน่วยสำคัญของกลุ่มลาดตระเวนแนวหน้า ผู้บัญชาการชุง-ฮุนได้เข้าร่วมปฏิบัติการรุกต่อกองกำลังทางอากาศของศัตรูและช่วยทำลายเครื่องบินข้าศึก 20 ลำ ต่อมาเมื่อถูกโจมตีโดยเครื่องบิน 6 ลำ เขาได้สั่งการให้เรือ SIGSBEE ยิงเครื่องบินทิ้งระเบิดดำดิ่งตก 1 ลำก่อนที่มันจะแทรกซึมเข้ามาในขบวน ด้วยความกล้าหาญและภาวะผู้นำของเขา เขาได้มีส่วนสำคัญต่อความสำเร็จในการปฏิบัติการของเรือ SIGSBEE และความทุ่มเทในการปฏิบัติหน้าที่ของเขาสอดคล้องกับประเพณีสูงสุดของกองทัพเรือสหรัฐฯ^{[ 30 ]}