เบาเออร์ได้รับการฝึกฝนในฐานะนักเคมีไฟฟ้าและรายงานผลงานวิจัยของเขาในสิ่งพิมพ์จำนวนมากในช่วงทศวรรษ 1950 และ 1960 ตั้งแต่ทศวรรษ 1970 แม้ว่าเขาจะยังคงดำรงตำแหน่งศาสตราจารย์เคมี แต่เบาเออร์ก็ทำการวิจัยเกี่ยวกับวิทยาศาสตร์นอกกระแสและวิทยาศาสตร์เทียม ที่เวอร์จิเนียเทค เบาเออร์เป็นสมาชิกผู้ก่อตั้งโครงการศึกษาด้านวิทยาศาสตร์ หนังสือของเบาเออร์เกี่ยวกับการศึกษาด้านวิทยาศาสตร์เรื่องScientific Literacy and the Myth of the Scientific Methodได้รับการวิจารณ์ในScience ^{[ 6 ]}และNature ^{[ 7 ]}ในการวิจารณ์ของเขาในPublic Understanding of Scienceจอห์น ซิแมนเรียกเบาเออร์ว่า "ทหารผ่านศึกผู้แข็งแกร่ง" ของการศึกษาด้านวิทยาศาสตร์^{[ 8 ]}

ระหว่างการสืบสวนของเขาเกี่ยวกับสิ่งที่ถือเป็นวิทยาศาสตร์เทียม บาวเออร์เริ่มเชื่อในการมีอยู่ของสัตว์ประหลาดล็อกเนสส์ ยูเอฟโอ^{[ 9 ]}และ "ความเชื่อทางวิทยาศาสตร์นอกกรอบ" อื่นๆ เขาเปรียบเทียบการที่ชุมชนวิทยาศาสตร์ไม่ยอมรับความเชื่อทางวิทยาศาสตร์เทียมกับการถูกกดขี่ข่มเหงที่ครอบครัวของเขาได้รับจากพวกนาซี โดยกล่าวว่า "ผมคิดว่าผมค่อนข้างจะขัดแย้งโดยธรรมชาติ...ผมคิดว่าคุณสามารถให้เหตุผลที่ดีได้ว่ามันไม่คุ้มค่าที่จะยอมรับสิ่งที่เป็นมาตรฐาน" ^{[ 10 ]}

เบาเออร์เริ่มสนใจสัตว์ประหลาดล็อกเนสส์และความเชื่อเรื่องการมีอยู่ของสัตว์ประหลาดนั้นมาจากภาพยนตร์ที่สร้างโดยทิม ดินส์เดลผู้ คลั่งไคล้ "เนสซี" ชื่อดัง ^{[ 10 ]}ภาพยนตร์ดังกล่าวแสดงให้เห็นวัตถุ ซึ่งโดยทั่วไปคิดว่าเป็นเรือ กำลังเคลื่อนที่อยู่ในทะเลสาบสก็อตแลนด์ ในช่วงทศวรรษ 1980 เบาเออร์ได้ทำการวิจัยและเขียนหนังสือเกี่ยวกับสัตว์ประหลาดล็อกเนสส์และความหลงใหลในเรื่องนี้ หนังสือ "The Enigma of Loch Ness" ได้รับการวิจารณ์ในเชิงบวกในIsis [ ^{11 ] เบา}เออร์ดูแลเว็บไซต์ที่โต้แย้งว่ามีหลักฐานที่แข็งแกร่งสำหรับการมีอยู่ของสัตว์ประหลาด ซึ่งเขากล่าวว่าสื่อได้สมรู้ร่วมคิดกันทำให้เรื่องนี้ดูเป็นเรื่องเล็กน้อยและน่าตื่นเต้น^{[ 12 ] [ 13 ]}ในช่วงที่เขาดำรงตำแหน่งศาสตราจารย์ที่เวอร์จิเนียเทค เบาเออร์ได้เดินทางไปยังล็อกเนสส์มากกว่ายี่สิบครั้งเพื่อค้นหาสัตว์ประหลาด^{[ 10 ]}

ในการให้สัมภาษณ์ข่าว บาวเออร์แสดงความคิดเห็นเกี่ยวกับความเชื่อของเขาในสัตว์ประหลาดล็อกเนสส์และอิทธิพลที่มีต่ออาชีพของเขาว่า "ผมเปิดเผยเรื่องนี้ค่อนข้างมาก...ถ้าผมเป็นนักชีววิทยาแทนที่จะเป็นนักเคมี ผมคงหนีไม่พ้นเรื่องนี้ไปได้ คนอาจจะยิ้มและพูดว่า 'ก็เขามีงานอดิเรกเป็นของตัวเองนี่นา'" ^{[ 10 ]}

ในหนังสือของเขาBeyond Velikovsky: The History of a Public Controversyเฮนรี เบาเออร์วิพากษ์วิจารณ์งานวิจัยของอิมมานูเอล เวลิคอฟสกีผู้เขียน หนังสือขายดี ของนิวยอร์กไทมส์เรื่องWorlds in Collision (1950) ซึ่งเป็นหนังสือวิทยาศาสตร์ ^{เทียม} และประวัติศาสตร์เทียม นิตยสาร ไทม์กล่าวถึงหนังสือของเบาเออร์ว่าเป็น "บทความที่หักล้างอิมมานูเอล เวลิคอฟสกีได้อย่างชัดเจน" ^{[ 13 ]} หนังสือของเบาเออร์เกี่ยว กับเวลิคอฟสกีได้รับการวิจารณ์ในScience [ ^{14 ]} Nature [ ^{15 ]} ISIS ^{[ 16 ]}และJournal for the History ^of Astronomy ^{[ 17 ]}

เบาเออร์กล่าวว่าเขาออกจากสำนักงานคณบดีที่เวอร์จิเนียเทค "เมื่อความถูกต้องทางการเมืองมาถึง" ในช่วงทศวรรษ 1980 ^{[ 2 ]}เบาเออร์เข้าร่วมสมาคมนักวิชาการแห่งชาติซึ่งเป็น กลุ่มสนับสนุน ทางการเมืองแบบอนุรักษ์นิยมที่ต่อต้านการดำเนินการเชิงบวก และเริ่มจัดทำจดหมายข่าวสำหรับสาขาเวอร์จิเนียของกลุ่ม^{[ 18 ] [ 19 ]}ใน "นักวิชาการเวอร์จิเนีย" เบาเออร์โต้แย้งว่าการนำโปรแกรมความหลากหลายมาใช้ทำให้มาตรฐานทางวิชาการลดลง เขาอธิบายลักษณะของโปรแกรมดังกล่าวว่าเป็นการส่งเสริม "พวกเหยียดเพศหญิงที่เรียกผู้ชายว่าเหยียดเพศ" และ "พวกคลั่งไคล้คนผิวดำที่เหยียดผิวเรียกคนอื่นว่าเหยียดผิว" ^{[ 18 ]}

เบาเออร์คัดค้านการจัดตั้ง "หน่วยอาชญากรรมอ่อนไหว" ของตำรวจเพื่อจัดการกับการล่วงละเมิดทางเพศและอาชญากรรมจากความเกลียดชังที่เวอร์จิเนียเทค โดยชี้ว่าปัญหาเหล่านี้ไม่ใช่ปัญหาที่ร้ายแรงในมหาวิทยาลัยและไม่สมควรได้รับความสนใจเป็นพิเศษ เบาเออร์เรียกหน่วยตำรวจนี้ว่าเป็นภัยคุกคามต่อเสรีภาพในการพูด^{[ 18 ] [ 20 ]}เขาวิจารณ์การสร้างตำแหน่งบริหารใหม่สำหรับกิจการพหุวัฒนธรรมของเวอร์จิเนียเทคเพื่อตอบสนองต่อเหตุการณ์เหยียดเชื้อชาติในมหาวิทยาลัยในช่วงกลางทศวรรษ 1990 ว่าเป็นการจัดสรรทรัพยากรที่สิ้นเปลือง เบาเออร์ตำหนินโยบายของเวอร์จิเนียเทคในการยกเว้นการขาดเรียนของนักศึกษาเพื่อเข้าร่วมพิธีกรรมทางศาสนาหรือชาติพันธุ์ เมื่อจำนวนนักศึกษาผิวดำที่เวอร์จิเนียเทคลดลงในช่วงทศวรรษ 1990 เบาเออร์กล่าวว่ามหาวิทยาลัยกำลังทำมากเกินไปแล้ว ("ทำทุกวิถีทาง") เพื่อดึงดูดนักศึกษาชนกลุ่มน้อย^{[ 21 ]}และควรหันมาเน้นที่การยกระดับมาตรฐานทางวิชาการแทน

บาวเออร์ยังถูกวิพากษ์วิจารณ์จากความคิดเห็นของเขาเกี่ยวกับเรื่องรักร่วมเพศอีก ด้วย ^{[ 22 ]}ในบันทึกความทรงจำที่เขียนโดยใช้นามแฝงว่า To Rise Above Principle: The Memoirs of an Unreconstructed Deanบาวเออร์เขียนว่า "ผมมองว่าการรักร่วมเพศเป็นความผิดปกติหรือความเจ็บป่วย ไม่ใช่ 'วิถีชีวิตที่ถูกต้องเท่าเทียมกัน' หรือคำพูดที่ใช้กันในปัจจุบัน" ในหนังสือของเขา บาวเออร์กล่าวว่าปัญหาที่รับรู้เกี่ยวกับการรักร่วมเพศนั้นเกิดจากปัจจัยทางพันธุกรรม กรรมพันธุ์ และสิ่งแวดล้อม และแนะนำว่าควรเพิกถอนเสรีภาพในการพูดและสิทธิพลเมืองอื่นๆ ของผู้รักร่วมเพศเพื่อป้องกันสิ่งที่บาวเออร์มองว่าเป็นผลกระทบเชิงลบของการรักร่วมเพศไม่ให้แพร่กระจาย^{[ 23 ]}ตั้งแต่นั้นมา บาวเออร์ได้กล่าวว่าเขาไม่ได้ยึดถือมุมมองนี้อีกต่อไป โดยกล่าวว่าเขา "ผิด" เกี่ยวกับประเด็นนี้ และโดยเฉพาะอย่างยิ่งได้พึ่งพาความผิดพลาดแบบ "ธรรมชาตินิยม" ที่ลดวัฒนธรรมและจริยธรรมให้เหลือเพียงชีววิทยาอย่างผิดพลาด^{[ 24 ]} AIDSTruth.org ซึ่งเป็นแหล่งข้อมูลเกี่ยวกับเอดส์ ระบุว่า Bauer ได้โพสต์ข้อความดังกล่าวหนึ่งวันหลังจากที่รายงานเกี่ยวกับมุมมองของเขาปรากฏบนเว็บไซต์ของพวกเขา^{[ 22 ]}

หลายปีหลังจากเกษียณจากเวอร์จิเนียเทค บาวเออร์เริ่มยืนยันว่ามี "เหตุผลสำคัญที่ทำให้สงสัยว่าเชื้อเอชไอวีเป็นสาเหตุที่จำเป็นและเพียงพอของโรคเอดส์ และการรักษาด้วยยาต้านไวรัสมีประโยชน์อย่างชัดเจน" ^{[ 25 ]}ในหนังสือของเขาในปี 2007 เรื่องThe Origins, Persistence, and Failings of HIV/AIDS Theory [ ^{26 ] บา}วเออร์ตั้งคำถามว่าเชื้อเอชไอวีมีอยู่จริงหรือไม่ โดยอ้างว่าการทดสอบเอชไอวีไม่แม่นยำ และสถิติการเสียชีวิตจากโรคเอดส์ถูกสื่อกระแสหลัก นักวิทยาศาสตร์ และบริษัทยาทำให้เกินจริง

ความเชื่อของ Bauer เกี่ยวกับ HIV/AIDS ถูกปฏิเสธโดยชุมชนวิทยาศาสตร์ กระแสหลัก โดยอิงจากงานวิจัยจำนวนมากที่ยืนยันว่า HIV มีอยู่จริง เป็นโรคติดต่อ ก่อให้เกิดโรคเอดส์ และการทดสอบ HIV มีความแม่นยำ^{[ 27 ] [ 28 ]}

• (2017). วิทยาศาสตร์ไม่ใช่สิ่งที่คุณคิด: มันเปลี่ยนแปลงไปอย่างไร ทำไมเราจึงเชื่อถือมันไม่ได้ และจะแก้ไขได้อย่างไร สำนักพิมพ์ McFarland ISBN 9781476669106
• (2012). ลัทธิความเชื่อแบบตายตัวในวิทยาศาสตร์และการแพทย์: ทฤษฎีที่ครอบงำผูกขาดการวิจัยและขัดขวางการแสวงหาความจริง สำนักพิมพ์ McFarland ISBN 9780786463015
• (2007). ที่มา ความคงอยู่ และความล้มเหลวของทฤษฎีเอชไอวี/เอดส์ สำนักพิมพ์ McFarland ISBN 0-7864-3048-6
• (2001). วิทยาศาสตร์หรือวิทยาศาสตร์เทียม: การรักษาด้วยแม่เหล็ก ปรากฏการณ์ทางจิต และความเชื่อนอกรีตอื่นๆสำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยอิลลินอยส์ISBN 0-252-02601-2
• (2001). แรงดึงดูดอันร้ายแรง: ปัญหาของวิทยาศาสตร์ . สำนักพิมพ์ Paraview Press ISBN 1-931044-28-7
• (1992). ความรู้ทางวิทยาศาสตร์และตำนานของวิธีการทางวิทยาศาสตร์สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยอิลลินอยส์ISBN 0-252-06436-4
• (1988). เพื่อก้าวข้ามหลักการ: บันทึกความทรงจำของคณบดีผู้ไม่ยอมเปลี่ยนแปลง . สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยอิลลินอยส์ (ภายใต้นามปากกา 'โจเซฟ มาร์ติน') ISBN 0-252-01507-X^{[ 29 ]}
• (1986). ปริศนาแห่งทะเลสาบเนสส์: ไขปริศนาลึกลับ.สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยอิลลินอยส์. ISBN 0-252-01284-4
• (1984). นอกเหนือจากเวลิคอฟสกี: ประวัติศาสตร์ของข้อโต้แย้งสาธารณะ , สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยอิลลินอยส์. ISBN 0-252-01104-X

• Henry H. Bauer (2002). "กรณีของสัตว์ประหลาดล็อกเนสส์: หลักฐานทางวิทยาศาสตร์" วารสารการสำรวจทางวิทยาศาสตร์ 16 ( 2). สมาคมเพื่อการสำรวจทางวิทยาศาสตร์ : 225– 246.
• Henry H. Bauer (2002). " ความรู้ทั่วไปเกี่ยวกับสัตว์ประหลาดล็อกเนสส์: โทรทัศน์ วิดีโอ และภาพยนตร์" (PDF)วารสารการสำรวจทางวิทยาศาสตร์ 16 ( 3). สมาคมเพื่อการสำรวจทางวิทยาศาสตร์ : 455– 477 สืบค้นเมื่อ2008-06-03
• เฮนรี เอช. เบาเออร์ (2002) "'วิทยาศาสตร์ที่ผิดปกติ' ไม่ใช่การประพฤติมิชอบทางวิทยาศาสตร์ (และไม่ใช่ความผิดปกติ) (ส่วนหนึ่งของฉบับพิเศษเกี่ยวกับจริยธรรมของเคมี, 2)"วารสารนานาชาติว่าด้วยปรัชญาเคมี 8 ( 1). สำนักพิมพ์ HYLE, คาร์ลสรูห์: 5– 20. ISSN 1433-5158 . สืบค้นเมื่อ2008-06-03 . 
• เฮนรี เอช. เบาเออร์ (9 มกราคม 1995) "บทวิจารณ์หนังสือ "Beyond Psychology" ของวิลเฮล์ม ไรช์" . Skeptical Inquirer . คณะกรรมการเพื่อการตรวจสอบทางวิทยาศาสตร์เกี่ยวกับข้ออ้างเรื่องเหนือธรรมชาติ . เก็บถาวรจากต้นฉบับเมื่อวันที่ 18 มกราคม 2551 . เรียกดูเมื่อ วันที่ 3 มิถุนายน 2551 .
• Henry H. Bauer (ฤดูหนาว 2007). "การตั้งคำถามเกี่ยวกับ HIV/AIDS: ผิดศีลธรรมหรือมีเหตุผลทางวิทยาศาสตร์?" (PDF)วารสารแพทย์และศัลยแพทย์อเมริกัน 12 ( 4). สมาคมแพทย์และศัลยแพทย์อเมริกันสืบค้นเมื่อ2008-06-03
• Henry H. Bauer (มิถุนายน 2002). "Toby Smith: Little Gray Men: Roswell and the Rise of a Popular Culture". Isis . 93 (2): 354– 355. doi : 10.1086/345050 .
• Bauer, Henry H (ฤดูร้อน 2003). "ความก้าวหน้าของวิทยาศาสตร์และนัยยะต่อการศึกษาด้านวิทยาศาสตร์และนโยบายวิทยาศาสตร์" . มุมมองเกี่ยวกับวิทยาศาสตร์ . 11 (2). สำนักพิมพ์ MIT : 236– 278. doi : 10.1162/106361403322495902 . S2CID 57566740 . สืบค้นเมื่อ2008-06-03 .