กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 2 นาที

ลำดับการแทรก

องค์ประกอบทางพันธุกรรมเคลื่อนที่/อณูชีววิทยา

องค์ประกอบแทรก (หรือเรียกอีกอย่างว่าIS , องค์ประกอบลำดับแทรกหรือองค์ประกอบ IS ) คือลำดับ ดีเอ็นเอสั้นๆที่ทำหน้าที่เป็นองค์ประกอบเคลื่อนย้ายได้ ง่ายๆ...

ลำดับการแทรก

องค์ประกอบแทรก (หรือเรียกอีกอย่างว่าIS , องค์ประกอบลำดับแทรกหรือองค์ประกอบ IS ) คือลำดับ ดีเอ็นเอสั้นๆที่ทำหน้าที่เป็นองค์ประกอบเคลื่อนย้ายได้ ง่ายๆ ลำดับแทรกมีลักษณะสำคัญสองประการคือ มีขนาดเล็กเมื่อเทียบกับองค์ประกอบเคลื่อนย้ายได้อื่นๆ (โดยทั่วไป มีความยาวประมาณ 700 ถึง 2500 คู่เบส ) และเข้ารหัสเฉพาะโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับกิจกรรม การเคลื่อนย้าย เท่านั้น (ดังนั้นจึงแตกต่างจากทรานสโพซอน อื่นๆ ซึ่งมียีนเสริม เช่น ยีน ต้านทานยาปฏิชีวนะ ด้วย )

ลำดับการแทรกเฉพาะอาจถูกตั้งชื่อตามรูปแบบ IS nโดยที่nคือตัวเลข (เช่น IS 1 , IS 2 , IS 3 , IS 10 , IS 50 , IS 911 , IS 26เป็นต้น) อย่างไรก็ตาม นี่ไม่ใช่รูปแบบการตั้งชื่อเพียงรูปแบบเดียวที่ใช้กัน

องค์ประกอบ

โปรตีนเหล่านี้โดยทั่วไปคือทรานสโพเซสซึ่งทำหน้าที่เร่งปฏิกิริยาทางเอนไซม์ที่ทำให้ IS เคลื่อนที่ได้ และยังมีโปรตีนควบคุมอีกหนึ่งตัวซึ่งทำหน้าที่กระตุ้นหรือยับยั้งกิจกรรมการเคลื่อนย้าย บริเวณรหัสพันธุกรรมในลำดับแทรกมักถูกขนาบข้างด้วยลำดับซ้ำแบบกลับหัวตัวอย่างเช่น IS 911 ที่รู้จักกันดี (1250 bp) ถูกขนาบข้างด้วยปลายลำดับซ้ำแบบกลับหัว 36 bp สองด้าน และบริเวณรหัสพันธุกรรมมีสองยีนที่ทับซ้อนกันบางส่วน คือorfAและorfABซึ่งเข้ารหัสทรานสโพเซส (OrfAB) และโปรตีนควบคุม (OrfA)

แผนภาพแสดงบทบาทของลำดับแทรก ("IS") ในทรานสโพซอนแบบผสม

นอกจากจะเกิดขึ้นอย่างอิสระแล้ว ลำดับการแทรกยังอาจเกิดขึ้นเป็นส่วนหนึ่งของทรานสโพซอนแบบผสมได้ อีก ด้วย ในทรานสโพซอนแบบผสม ลำดับการแทรกสองลำดับจะขนาบข้างยีนเสริมหนึ่งยีนหรือมากกว่า เช่น ยีนต้านทานยาปฏิชีวนะ (เช่นTn10 , Tn 5 ) อย่างไรก็ตาม ยังมีทรานสโพซอนอีกประเภทหนึ่งที่เรียกว่าทรานสโพซอนแบบหน่วย ซึ่งไม่มีลำดับการแทรกอยู่ที่ปลาย (เช่น Tn 7 )

ทรานสโพซอนที่ซับซ้อนไม่จำเป็นต้องอาศัยลำดับแทรกที่อยู่ขนาบข้างสำหรับรีโซลเวส รีโซลเวสเป็นส่วนหนึ่งของจีโนม tns และตัดที่ลำดับซ้ำแบบกลับหัวที่อยู่ขนาบข้าง

บทบาทเชิงวิวัฒนาการ

แม้ว่าลำดับการแทรกมักจะถูกกล่าวถึงในบริบทของจีโนมโปรคาริโอต แต่ ลำดับ DNA ยูคาริโอต บางส่วน ที่อยู่ในตระกูลองค์ประกอบเคลื่อนย้ายได้ Tc1/ marinerอาจถือได้ว่าเป็นลำดับการแทรก[ 1 ]

ความถี่ของการเคลื่อนย้ายขององค์ประกอบ IS ขึ้นอยู่กับพารามิเตอร์หลายอย่าง รวมถึงระยะการเจริญเติบโตของวัฒนธรรม องค์ประกอบของอาหารเลี้ยงเชื้อ ความดันออกซิเจน ขนาดการเจริญเติบโต และโครงสร้างของไซต์เป้าหมาย (เช่น ความโค้ง การมีอยู่ของโมทีฟบางอย่าง องค์ประกอบของ DNA) [ 2 ]การรวมตัวกันใหม่ระหว่างไซต์ IS ในจีโนมสามารถทำให้แบคทีเรียปรับตัวเข้ากับสภาพแวดล้อมใหม่ได้ ทำให้องค์ประกอบ IS เป็นกลไกสำคัญสำหรับการวิวัฒนาการในแบคทีเรีย[ 3 ]

ดูเพิ่มเติม

  • IS Finder
ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Insertion_sequence&oldid=1327672509 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ลำดับการแทรก

องค์ประกอบแทรก (หรือเรียกอีกอย่างว่าIS , องค์ประกอบลำดับแทรกหรือองค์ประกอบ IS ) คือลำดับ ดีเอ็นเอสั้นๆที่ทำหน้าที่เป็นองค์ประกอบเคลื่อนย้ายได้ ง่ายๆ...

องค์ประกอบ

โปรตีนเหล่านี้โดยทั่วไปคือ ทรานสโพเซส ซึ่งทำหน้าที่เร่งปฏิกิริยาทางเอนไซม์ที่ทำให้ IS เคลื่อนที่ได้ และยังมีโปรตีนควบคุมอีกหนึ่งตัวซึ่งทำหน้าที่กระตุ้นหรือยับยั้งกิจกรรมการเคลื่อนย้าย บริเวณรหัสพันธุกรรมในลำดับแทรกมักถูกขนาบข้างด้วย ลำดับซ้ำแบบกลับหัว...

บทบาทเชิงวิวัฒนาการ

แม้ว่าลำดับการแทรกมักจะถูกกล่าวถึงในบริบทของ จีโนม โปรคาริโอต แต่ ลำดับ DNA ยูคาริโอต บางส่วน ที่อยู่ในตระกูลองค์ประกอบเคลื่อนย้ายได้ Tc1/ mariner อาจถือได้ว่าเป็นลำดับการแทรก [ 1 ]

ลิงก์ภายนอก

IS Finder ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Insertion_sequence&oldid=1327672509 "