วอเตอร์สเกิดที่เมืองโทเลโด รัฐโอไฮโอ ในปี 1976 และย้ายไปอยู่ที่เมืองเอลมอร์ รัฐโอไฮโอ ในปี 1984 เขาเล่นกีตาร์และแซกโซโฟนในชั้นมัธยมต้น จนกระทั่งได้ดูวงดนตรีเดินขบวนของมหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตททางโทรทัศน์กับคุณพ่อ และตัดสินใจว่าสักวันหนึ่งเขาจะต้องได้เล่นแซกโซโฟนใน วงดนตรี ของโอไฮโอสเตทให้ได้ ครูสอนดนตรีในโรงเรียนมัธยมต้นบอกเขาว่า ถ้าเขาอยากเข้าวงดนตรีของโอไฮโอสเตท เขาต้องเลือกเครื่องดนตรีอื่น เพราะในวงไม่มีแซกโซโฟน เขาจึงเปลี่ยนจากแซกโซโฟนเป็นซูซาโฟนเมื่อเข้าเรียนที่โอไฮโอสเตทในฤดูใบไม้ร่วงปี 1994 โดยวางแผนที่จะเป็นทนายความ เขาได้ลองเข้าวงดนตรีเดินขบวน แต่ไม่ผ่านการคัดตัว อย่างไรก็ตาม เขาได้รับเลือกในปีถัดมา ในปี 1996 เขาเปลี่ยนวิชาเอกเป็นดนตรี และในที่สุดเขาก็ได้เล่นแซกโซโฟนเป็นครั้งแรกในวันที่ 21 พฤศจิกายน 1998 ในเกมเหย้ากับมิชิแกน วอเตอร์สเป็นสมาชิกวงจนถึงปี 1999 ^{[ 3 ]} ในปี 2000 เขาได้รับปริญญาตรีด้านการศึกษาดนตรี^{[ 4 ]}

ในปี 2000 วอเตอร์สเริ่มต้นอาชีพในฐานะผู้อำนวยการวงดนตรี โดยยังคงทำงานกับวงดนตรีเดินขบวนของมหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตทในตำแหน่งผู้ช่วยบัณฑิตศึกษา ในปี 2002 เขาได้รับการว่าจ้างเป็นผู้ช่วยผู้อำนวยการ เมื่อผู้อำนวยการ จอน วูดส์ เกษียณอายุในเดือนกันยายน 2011 วอเตอร์สได้รับบทบาทเป็นผู้อำนวยการชั่วคราว^{[ 3 ]} ในวันที่ 10 ตุลาคม 2012 คณบดีบริหารและรองอธิการบดีของวิทยาลัยศิลปศาสตร์และวิทยาศาสตร์ โจเซฟ สไตน์เมตซ์ ประกาศการเลื่อนตำแหน่งของเขาให้เป็นผู้อำนวยการ^{[ 4 ]}

เมื่อวันที่ 6 ตุลาคม 2012 ในเกมเหย้ากับเนบราสกา วงดนตรีของวอเตอร์สได้แสดงโชว์ที่อ้างอิงถึงวิดีโอเกม โดยใช้แอนิเมชั่นต่างๆ รวมถึงม้าที่วิ่งควบลงสนามแล้วยกขาหลังขึ้น รวมถึงวิดีโอเกม Tetris และ Pac-Man ^{[ 5 ]} การแสดงนี้ได้รับความสนใจในระดับประเทศ โดยวิดีโอใน YouTube มียอดวิวถึงสี่ล้านครั้งภายในวันจันทร์ถัดมา^{[ 6 ]} ในปี 2013 วงดนตรีเริ่มใช้ iPad เพื่อลดการใช้กระดาษและเพื่อออกแบบและดำเนินการแสดงที่ซับซ้อนมากขึ้น วอเตอร์สและทีมงานของเขาสร้างการแสดงที่มีแอนิเมชั่นมากมาย รวมถึง การแสดง ไมเคิล แจ็กสันซึ่งมีแอนิเมชั่นให้มิสเตอร์แจ็กสันเดินแบบ มูนวอล์ค และทำท่า " ฉีกขา " และการแสดงฮอลลีวูดบล็อกบัสเตอร์ที่มีแอนิเมชั่นของซูเปอร์แมนช่วยอาคารที่กำลังพังทลายแฮร์รี่ พอตเตอร์ชนะ การแข่งขันควิด ดิชไดโนเสาร์กินนักฟุตบอลของมิชิแกน และการต่อสู้ครั้งยิ่งใหญ่ในทะเลระหว่างเรือใบสองลำ

วงดนตรีและวอเตอร์สได้รับความสนใจจากทั่วประเทศจากการแสดงเหล่านี้ และวอเตอร์สได้รับการสัมภาษณ์จากสำนักข่าวระดับชาติมากมาย รวมถึงGood Morning America , The Today Show, CNN และUSA Todayในเดือนพฤษภาคม 2014 เขาได้กล่าว สุนทรพจน์ TEDxในหัวข้อ "ประเพณีผ่านนวัตกรรม" ^{[ 7 ]}

เมื่อวันที่ 24 กรกฎาคม 2557 ไมเคิล วี. เดรก อธิการบดีมหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตท ประกาศว่า หลังจากการสอบสวนเกี่ยวกับวัฒนธรรมของวงดนตรีเดินขบวน วอเตอร์สถูกไล่ออก โดยกล่าวหาว่าวงดนตรีเดินขบวนได้ส่งเสริมวัฒนธรรมที่มีลักษณะทางเพศสูงและส่งเสริมการล่วงละเมิดทางเพศ วอเตอร์สถูกไล่ออกโดยอ้างว่าเขา "รู้หรือควรจะรู้" เกี่ยวกับปัญหาที่ถูกกล่าวหาภายในวงดนตรี แต่ล้มเหลวในการแก้ไขปัญหาเหล่านั้น

ต่อมาพบปัญหาหลายประการในรายงานการสอบสวนที่ใช้เป็นเหตุให้ไล่ Waters ออก พยานหลายคนออกมากล่าวว่าคำให้การของพวกเขาถูกนำไปใช้ผิดบริบท และพวกเขาไม่เห็นด้วยกับข้อสรุปของการสอบสวน อดีต ผู้ประสานงาน Title IXของมหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตทกล่าวหาว่าเธอถูกผู้บังคับบัญชาขัดขวางไม่ให้ทำงานได้อย่างมีประสิทธิภาพเกี่ยวกับวงดนตรีเดินขบวน อย่างไรก็ตาม ผู้สอบสวนอิสระได้ตัดสินว่ามีหลักฐานไม่เพียงพอที่จะสนับสนุนข้อกล่าวหานี้^{[ 8 ]}

เมื่อวันที่ 11 กันยายน 2014 กระทรวงศึกษาธิการได้ประกาศว่าได้ตกลงที่จะยุติการสอบสวนมหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตทเป็นเวลาสี่ปีเร็วกว่ากำหนดเนื่องจากการจัดการคดีของจอน วอเตอร์ส^{[ 9 ]} ในวันถัดมา องค์กรศิษย์เก่าวงดนตรีเดินขบวนได้เผยแพร่รายงานการสอบสวนของตนเองเกี่ยวกับสถานการณ์รอบ ๆ การไล่วอเตอร์สออก โดยกล่าวหาว่ามีปัญหามากมายกับการสอบสวนเดิม และแนะนำว่าวอเตอร์สถูกสังเวยเพื่อพิสูจน์การปฏิบัติตาม Title IX ต่อกระทรวงศึกษาธิการ^{[ 10 ]}

วอเตอร์สฟ้องร้องขอให้คืนตำแหน่งในเดือนกันยายน โดยกล่าวหาว่ามหาวิทยาลัย ประธานเดรก และรองอธิการบดีเลือกปฏิบัติกับเขาโดยลงโทษเขาต่างจากพนักงานหญิงและปฏิเสธสิทธิในการดำเนินกระบวนการยุติธรรม มหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตทตอบโต้ด้วยการแถลงข่าว โดยอ้างว่าวอเตอร์สได้ปกปิดวัฒนธรรมดังกล่าว และ "ได้ดำเนินการแก้ไขด้วยตนเอง" ^{[ 11 ]} เมื่อวันที่ 23 ตุลาคม มหาวิทยาลัยโอไฮโอสเตทได้ยื่นคำตอบต่อคดีฟ้องร้องนี้ โดยยืนยันข้อกล่าวหาเรื่องวัฒนธรรมทางเพศอีกครั้ง และเสนอหลักฐานเพิ่มเติมเกี่ยวกับวัฒนธรรมดังกล่าว การยื่นฟ้องยังเน้นย้ำข้อกล่าวหาที่ว่าวอเตอร์สทำให้ผู้สอบสวนเข้าใจผิดเกี่ยวกับระดับของปัญหาในวงดนตรี

เขาเป็นผู้ช่วยศาสตราจารย์ด้านการศึกษาดนตรีและผู้อำนวยการวงดนตรีที่มหาวิทยาลัยไฮเดลเบิร์กรัฐโอไฮโอ ตั้งแต่ปี 2016 ^{[ 12 ]}จนถึงปี 2022

ตั้งแต่เดือนกันยายน พ.ศ. 2565 วอเตอร์สได้ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการวงดนตรีเดินขบวนฟอลคอนที่มหาวิทยาลัยโบว์ลิงกรีนสเตท^{[ 13 ]}ภายใต้การนำของเขา วงดนตรีนี้มีขนาดใหญ่ที่สุดในประวัติศาสตร์ โดยมีสมาชิกมากกว่า 425 คนในปี พ.ศ. 2567 ทำให้วงดนตรีเดินขบวนฟอลคอนเป็นหนึ่งในวงดนตรีเดินขบวนระดับวิทยาลัยที่ใหญ่ที่สุดในฟุตบอลระดับวิทยาลัย FBS