ชาเวซคว้าแชมป์แรกของเขา ซึ่งเป็น ตำแหน่งแชมป์ WBC รุ่นซูเปอร์เฟเธอร์เวท ที่ว่างอยู่ เมื่อวันที่ 13 กันยายน 1984 ด้วยการน็อกเอาต์มาริโอ "อาซาบาเช" มาร์ติเนซ เพื่อนร่วมชาติชาวเม็กซิกัน ที่แกรนด์โอลิมปิกออดิทอเรียมในลอสแอนเจลิส มาร์ติเนซเป็นตัวเต็งในแมตช์นี้ ส่วนหนึ่งเป็นเพราะชัยชนะก่อนหน้านี้เหนือโรลันโด นาบาเร็ตต์ อดีตแชมป์โลก WBC ในการชกที่ไม่ใช่การชิงแชมป์ เมื่อวันที่ 19 เมษายน 1985 ชาเวซป้องกันตำแหน่งของเขาจาก รูเบน คาสติลโลผู้ท้าชิงอันดับหนึ่ง(63–4–2) ด้วยการน็อกเอาต์ในรอบที่หก^{[ 19 ]} เมื่อวันที่ 7 กรกฎาคม 1985 ชาเวซเอาชนะ โรเจอร์ เมย์เวทเธอร์ อดีต และแชมป์ในอนาคตด้วยการน็อกเอาต์ในรอบที่สอง เมื่อวันที่ 3 สิงหาคม 1986 ชาเวซชนะร็ อคกี้ ล็อกริจ อดีตแชมป์ WBAและแชมป์IBF รุ่นซูเปอร์เฟเธอร์เวทในอนาคต ด้วยคะแนนเสียงข้างมากในการชก 12 ยกที่ มอนเตคา ร์โลในการชกครั้งถัดไป เขาเอาชนะอดีตแชมป์Juan Laporteด้วยคะแนนเอกฉันท์ 12 ยก เมื่อวันที่ 18 มีนาคม พ.ศ. 2530 เขาเอาชนะผู้ท้าชิงอันดับหนึ่ง Francisco Tomas Da Cruz (27–1) ด้วยการน็อกเอาต์ในยกที่สาม^{[ 20 ]}เขาป้องกันตำแหน่งแชมป์ WBC รุ่นซูเปอร์เฟเธอร์เวทได้สำเร็จทั้งหมด 9 ครั้ง

เมื่อวันที่ 21 พฤศจิกายน 1987 ชาเวซเลื่อนขึ้นไปชกใน รุ่น ไลท์เวทและเผชิญหน้ากับเอ็ดวิน โรซาริโอ แชมป์โลกรุ่นไลท์เวทของสมาคมมวยโลก (WBA ) ก่อนการชก มีความกังวลเกี่ยวกับวิธีที่ชาเวซจะรับมือกับการเพิ่มน้ำหนัก ชาเวซกล่าวว่า "ทุกสิ่งที่ผมประสบความสำเร็จในฐานะแชมป์ และการป้องกันตำแหน่ง 9 ครั้ง จะสูญเปล่าหากแพ้โรซาริโอ" นักชกทั้งสองเกือบจะแลกหมัดกันระหว่างการแถลงข่าวหลังจากที่โรซาริโอขู่ว่าจะส่งชาเวซกลับเม็กซิโกในโลงศพ ในที่สุดชาเวซก็แสดงผลงานที่ยอดเยี่ยมที่สุดในอาชีพการงานของเขาด้วยการเอาชนะโรซาริโอด้วยการน็อกเอาต์ในยกที่ 11 เพื่อคว้าแชมป์ สถิติจาก HBO Punchstat แสดงให้เห็นว่าโรซาริโอชกเข้าเป้า 263 ครั้งจาก 731 ครั้ง (36%) และชาเวซชกเข้าเป้า 450 ครั้งจาก 743 ครั้ง (61%) หลังจากการแข่งขันSports Illustratedพาดหัวข่าวว่า "ถึงเวลายกย่องเซซาร์: เซซาร์ ชาเวซ แชมป์รุ่นไลท์เวท WBA จากเม็กซิโก อาจเป็นนักชกที่ดีที่สุดในโลก" ^{[ 21 ]}

เมื่อวันที่ 16 เมษายน พ.ศ. 2531 ชาเวซเอาชนะโรดอลโฟ อากีลาร์ (20–0–1) ผู้ท้าชิงอันดับหนึ่งด้วยการน็อกเอาต์ทางเทคนิคในรอบที่ 6 ^{[ 22 ]} เมื่อวันที่ 4 มิถุนายน พ.ศ. 2531 เขาเอาชนะ ราฟาเอล ลิมอนอดีตแชมป์สองสมัยด้วยการน็อกเอาต์ทางเทคนิคในรอบที่ 7 ต่อมาในปีนั้น เขาได้รวมเข็มขัดแชมป์ WBA และ WBC ด้วยการตัดสินทางเทคนิคเหนือโฮเซ่ หลุยส์ รามิเรซ แชมป์ คนปัจจุบัน การชนศีรษะโดยไม่ได้ตั้งใจทำให้เกิดแผลแตกบนหน้าผากของรามิเรซ และแพทย์ได้ยุติการชก ทำให้การตัดสินต้องไปที่กรรมการ ชาเวซซึ่งมีคะแนนนำในทุกใบบันทึกคะแนน ได้รับการประกาศให้เป็นผู้ชนะ เขายังได้รับ ตำแหน่งแชมป์รุ่นไลท์เวท ของ The Ringหลังจากการชนะครั้งนั้น ชาเวซสละตำแหน่งแชมป์รุ่นไลท์เวท WBA และ WBC เพื่อเลื่อนขึ้นไปชกในรุ่นซูเปอร์ไลท์เวท

ในการชกครั้งต่อไป เขาคว้าแชมป์โลก รุ่นไลท์เวลเตอร์เวทของ WBC มาครองได้ด้วยการเอาชนะโรเจอร์ เมย์เวทเธอร์เป็นครั้งที่สอง เมย์เวทเธอร์ไม่ยอมออกมาจากมุมของเขาหลังจากยกที่สิบ ทำให้ชาเวซชนะน็อก ในปี 1989 ชาเวซเอาชนะแซมมี ฟูเอนเตส แชมป์ในอนาคต ด้วยการชนะน็อกในยกที่สิบ ในการชกครั้งต่อไป เขาทำให้แอลเบร์โต เด ลาส เมอร์เซเดส คอร์เตส (44–0) แพ้เป็นครั้งแรกในอาชีพการชกมวยด้วยการน็อกในยกที่สาม

หลังจากป้องกันตำแหน่งแชมป์ไลท์เวลเตอร์เวทได้ถึง 18 ครั้งติดต่อกัน ซึ่งเป็นสถิติสูงสุดของรุ่น ชาเวซ (87–0) ได้ขยับขึ้นไปชกในรุ่นที่สูงกว่าเพื่อท้าชิง ตำแหน่ง แชมป์เวลเตอร์เวทของ WBC กับเพอร์เนลล์ วิทเทเกอร์ (32–1) ในเดือนกันยายน ปี 1993 ตั้งแต่ปลายทศวรรษ 1980 ชาเวซได้กล่าวหลายครั้งว่าเขาต้องการชกกับวิทเทเกอร์ ทีมงานของวิทเทเกอร์ ซึ่งรวมถึงลู ดูวาได้บอกกับThe Ringว่าพวกเขาไม่ต้องการชกกับชาเวซในเวลานั้น ผลการชกจบลงด้วยผลเสมอแบบไม่เป็นเอกฉันท์ ซึ่งเป็นที่ถกเถียงกัน ทำให้ชาเวซยังคงไร้พ่าย ในขณะที่วิทเทเกอร์ยังคงรักษาตำแหน่งแชมป์ไว้ได้ สื่อ อเมริกัน หลายแห่ง รวมถึงThe RingและSports Illustrated ต่าง วิพากษ์วิจารณ์การตัดสินใจดังกล่าวSports Illustratedนำภาพของเพอร์เนลล์ วิทเทเกอร์ขึ้นปกนิตยสารฉบับถัดไปพร้อมกับพาดหัวข่าวคำเดียวว่า "ถูกปล้น!" ^{[ 27 ]}ชาเวซกล่าวหลังการต่อสู้ว่า "ผมรู้สึกว่าผมกำลังฝืนการต่อสู้ ... เขากอดผมมากเกินไป เขายังชกต่ำมากเกินไปอีกด้วย" ^{[ 28 ]}ไม่มีการแข่งขันใหม่

ชาเวซยังคงป้องกัน ตำแหน่งแชมป์ ไลท์เวลเตอร์เวท ต่อไป และในวันที่ 18 ธันวาคม 1993 เขาเอาชนะแอนดี้ ฮอลลิแกน (21–0) แชมป์ไลท์เวลเตอร์เวท ของ เครือจักรภพ บริติช ด้วยการน็อกเอาต์ในยกที่ 5 ชาเวซเผชิญหน้ากับ แฟรงกี้ แรนดัลล์ในวันที่ 29 มกราคม 1994 ในการชกที่หลายคนคาดว่าเขาจะชนะได้อย่างง่ายดาย แต่แรนดัลล์กลับชกเขาล้มลงเป็นครั้งแรกในอาชีพการงานของเขา และชนะด้วยคะแนนเสียงไม่เป็นเอกฉันท์ ทำให้ชาเวซเสียตำแหน่งแชมป์ให้กับแรนดัลล์ ชาเวซโทษกรรมการริชาร์ด สตีล ที่หักคะแนนชาเวซ 2 คะแนนจากการชกต่ำกว่าเข็มขัด ซึ่งส่งผลต่อความแตกต่างของคะแนน WBC สั่งให้มีการชกแก้ตัวทันที และชาเวซได้ตำแหน่งแชมป์คืนด้วยคะแนนเสียงไม่เป็นเอกฉันท์ในเดือนพฤษภาคม 1994 การชกครั้งนั้นดุเดือดมากจนทั้งคู่ชนกันที่ศีรษะ ทำให้เกิดแผลแตกขนาดใหญ่เหนือคิ้วของชาเวซในยกที่ 7 หลังจากที่แรนดัลได้รับบาดเจ็บที่ศีรษะในยกที่แปด กรรมการได้เรียกแพทย์เข้ามาและยุติการชก ตามกฎของ WBC แรนดัลเสียไปหนึ่งคะแนน ทำให้ชาเวซเป็นฝ่ายชนะทางเทคนิค ทั้งสองได้เผชิญหน้ากันอีกครั้งในการชกตัดสินในอีก 10 ปีต่อมา ซึ่งชาเวซเป็นฝ่ายชนะ

จากนั้น ชาเวซได้เผชิญหน้ากับเมลดริก เทย์เลอร์ในการชกซ้ำอีกครั้ง สี่ปีหลังจากไฟต์แรกที่เป็นประวัติศาสตร์ ชาเวซเอาชนะเขาในรอบที่แปดด้วยการน็อกเอาต์ ทำให้เทย์เลอร์กระเด็นจากด้านหนึ่งของเวทีไปยังอีกด้านหนึ่ง ในการชกครั้งต่อไป ชาเวซเอาชนะโทนี่ โลเปซ แชมป์สามสมัย ในปี 1995 เขาเอาชนะจิโอวานนี ปาริซี อดีตและแชมป์รุ่นไลท์เวลเตอร์เวท ในอนาคต ต่อมาในปีนั้น เขาป้องกันตำแหน่งแชมป์ของเขาจาก เดวิด คาเมาผู้ท้าชิงอันดับหนึ่งแม้ว่าจะได้รับบาดเจ็บเป็นแผลแตกในรอบแรก ก่อนการชก ชาเวซระบุว่าเขากำลังพิจารณาที่จะเลิกชกมวย: "ผมมีปัญหามากมายกับแขนและหัวเข่า ผมไม่อยากฝืนตัวเองไปมากกว่านี้แล้ว" ชาเวซกล่าว "หลังจากฝึกซ้อมมาหลายปี ทุกอย่างก็สะสม ผมไม่ได้ทำได้เหมือนเมื่อก่อน ผมจะชกกับเดอ ลา โฮยาเพื่อเงินก้อนโต แล้วก็เลิกชกมวย" ^{[ 29 ] [ 30 ]}

ชาเวซชนะการชกสองไฟต์แรกในปี 1999 ก่อนจะแพ้ให้กับ วิลลี่ ไวส์ซึ่งขณะนั้นอายุ 32 ปีด้วยคะแนนเอกฉันท์หลังการชก 10 ยก ในปี 2000 เมื่ออายุ 38 ปี ชาเวซท้าชิงแชมป์รุ่นไลท์เวลเตอร์เวท กับ คอสเตีย ซีซูแต่แพ้ด้วยการน็อกเอาต์ในยกที่ 6 หลังจากเอาชนะเทอร์รี่ โทมัสได้ในปี 2001 ที่เมืองซิวดัดฮัวเรซประเทศเม็กซิโก ชาเวซก็ประกาศเลิกชกมวย อย่างไรก็ตาม ในวันที่ 24 พฤศจิกายน 2003 เขาได้กลับมาขึ้นชกอีกครั้งเพื่อล้างแค้นให้กับวิลลี่ ไวส์ โดยน็อกไวส์ในสองยกที่เมืองติฮัวนา ประเทศเม็กซิโกในเดือนเมษายน 2004 ชาเวซกลับขึ้นสังเวียนอีกครั้ง ซึ่งเขาอ้างว่าจะเป็นการชกครั้งสุดท้ายของเขา ในการชกครั้งนั้น ซึ่งมีชื่อเล่นว่าAdiós, México, Gracias ( ลาก่อน เม็กซิโก ขอบคุณ ) เขาเอาชนะคู่ต่อสู้เก่าอย่าง แฟรงกี้แรนดัลด้วยคะแนนใน 10 ยก เมื่อวันที่ 28 พฤษภาคม 2548 ชาเวซขึ้นชกอีกครั้ง โดยเอาชนะอีวาน โรบินสัน ด้วยคะแนน ใน 10 ยก ที่สเตเปิลส์ เซ็นเตอร์ (การชกครั้งนี้ถ่ายทอดสดทางShowtime Championship Boxing ) เมื่อวันที่ 17 กันยายน 2548 ที่US Airways Centerในฟีนิกซ์ รัฐแอริโซนาชาเวซพ่ายแพ้แบบ TKO ให้กับโกรเวอร์ ไวลีย์ ซึ่งในขณะนั้นยังไม่เป็นที่รู้จักมากนัก ในการชกครั้งที่ 115 ในอาชีพของเขา โดยขอถอนตัวออกจากการแข่งขันก่อนเริ่มยกที่ 5 หลังจากได้รับบาดเจ็บที่มือขวา^{[ 31 ]}หลังจากการชก ชาเวซบอกกับบ็อบ อารัม โปรโมเตอร์ของเขา ว่า ครั้งนี้เขาจะเลิกชกมวยอย่างเด็ดขาด ความพ่ายแพ้ของเขาถูกแก้แค้นได้ในอีกสองปีต่อมาโดยลูกชายของเขาฮูลิโอ เซซาร์ ชาเวซ จูเนียร์ซึ่งน็อกไวล์ลีย์ในยกที่สามของการชกของทั้งคู่

• แชมป์โลกรุ่นซูเปอร์เฟเธอร์เวท (130  ปอนด์) ของ WBC
• แชมป์โลกรุ่นไลท์เวท WBA (135  ปอนด์)
• แชมป์โลกรุ่นไลท์เวทของ WBC (135  ปอนด์)
• แชมป์โลกรุ่นไลท์เวลเตอร์เวทของ WBC (140  ปอนด์) (2 สมัย)
• แชมป์โลกรุ่นไลท์เวลเตอร์เวทของ IBF (140  ปอนด์)

• แชมป์รุ่นไลท์เวท (135 ปอนด์)จากนิตยสาร The Ring

• แชมป์ WBC โอโตมิ