เอ็กซ์เนอร์ผู้น้องสนใจการวาดภาพและระบายสีมาตั้งแต่อายุยังน้อย และได้รับการฝึกฝนส่วนตัวหลังจากรับศีลมหาสนิท เขาเริ่มศึกษาที่ราชบัณฑิตยสถานศิลปะแห่งเดนมาร์ก ( Det Kongelige Danske Kunstakademi ) ในเดือนเมษายน ค.ศ. 1839 โดยตั้งใจจะเป็นจิตรกรภาพประวัติศาสตร์ เขาได้รับความสนใจจากศาสตราจารย์เจ.แอล. ลุนด์ซึ่งเขาได้เรียนรู้การวาดภาพประวัติศาสตร์จากอาจารย์ท่านนั้น ต่อมาเขาได้ศึกษาต่อกับคริสตอฟเฟอร์ วิลเฮล์ม เอคเคอร์สเบิร์กผู้ซึ่งมีความเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับยุคทองของจิตรกรรมเดนมาร์ก และได้รับการยกย่องว่าเป็นบิดาแห่งจิตรกรรมเดนมาร์ก

ในปี ค.ศ. 1844 เขาได้จัดแสดงภาพเขียนชิ้นแรกของเขาชื่อ " Fra Kunstakademiets figursal " ("จากคอลเลกชันแบบจำลองปูนปลาสเตอร์ของสถาบันศิลปะ") ซึ่งวาดขึ้นในปี ค.ศ. 1843 ภาพเขียนนี้แสดงให้เห็นนักเรียนคนหนึ่งกำลังร่างแบบจำลองปูนปลาสเตอร์ของรูปปั้นในคอลเลกชันแบบจำลองปูนปลาสเตอร์ของสถาบัน โดยมีนักเรียนอีกคนหนึ่งอยู่เบื้องหลังกำลังเคลื่อนไหวไปมาระหว่างบุคคลทั้งสอง

เขาได้รับรางวัลเหรียญเงินเล็กของสถาบันในปี 1843 และรางวัลเหรียญเงินใหญ่ในปี 1845 ในช่วงปีแรก ๆ เขาได้จัดแสดงภาพเขียนประวัติศาสตร์หลายภาพ รวมถึงภาพเหมือนบุคคล จำนวนหนึ่ง ภาพเหมือนบุคคลภาพหนึ่งในนั้น ซึ่งเป็นภาพเหมือนของน้องสาวของเขา ทำให้เขาได้รับรางวัลนอยเฮาเซนส์ ( Neuhausens præmie ) ของสถาบันในปี 1847

ในปี ค.ศ. 1849 ภาพเขียนประวัติศาสตร์ชิ้นหนึ่งของเขา ชื่อ " Thyra Danebod forsøger at formilde Gorm den Gamles vrede mod nogle fangne ​​kristne " ("เทรา ดาเนโบด พยายามปลอบประโลมความโกรธของกอร์มผู้เฒ่าด้วยคริสเตียนที่ถูกคุมขัง") ถูกซื้อโดยคอลเลกชันภาพเขียนหลวงแห่งเดนมาร์ก ซึ่งปัจจุบันคือหอศิลป์แห่งชาติเดนมาร์ก ( Statens Museum for Kunst )ส่วนภาพเขียนอีกชิ้นหนึ่งจากปี ค.ศ. 1851 ชื่อ " Marsk Stigs Døtre " ("ธิดาของมาร์สค์ สติก") ได้รับการว่าจ้างจากเคานต์เฟรเดอริก คริสเตียน จูเลียส คนูท ให้ไปแขวนไว้ที่ พระราชวัง คนูเทนบอร์ก เคานต์ใจดีกับเอ็กซ์เนอร์มาก ไม่เพียงแต่จ่ายค่าตอบแทนให้เขาอย่างดี แต่ยังจัดสตูดิโอให้เขาใช้เป็นเวลาหลายปี ภาพเขียนทั้งสองชิ้นนี้บอกเล่าเรื่องราวประวัติศาสตร์และตำนานโบราณของเดนมาร์ก

แต่แม้แต่เอ็กซ์เนอร์เองก็ยอมรับว่าเขามี "ความปรารถนาทางอารมณ์ที่ไม่สมเหตุสมผลที่จะเป็นจิตรกรภาพประวัติศาสตร์" (" usalige lyst til at blive historiemaler ") นีลส์ ลอริตซ์ ฮอยเยนนักวิจารณ์ อาจารย์ประจำสถาบัน และผู้สนับสนุนขบวนการศิลปะแห่งชาติ มีส่วนช่วยในการกำหนดทิศทางศิลปะในอนาคตของเอ็กซ์เนอร์ และเอ็กซ์เนอร์เริ่มมองหาบุคคลพื้นเมืองชาวเดนมาร์กที่มีเอกลักษณ์เฉพาะตัวที่อาศัยอยู่ในเขตนั้นมาเป็นแรงบันดาลใจในการสร้างสรรค์งานศิลปะ สิ่งนี้พาเขาไปยัง เกาะ อามาเกอร์ทางใต้ของโคเปนเฮเกน ซึ่งเป็นที่ที่ ชาวนา ชาวดัตช์มาตั้งถิ่นฐานในปี 1521 แต่ยังไม่เป็นที่รู้จักมากนักในหมู่ชาวเดนมาร์กด้วยกัน ที่นั่นเขาได้วาดภาพชิ้นเอกขนาดเท่าคนจริง " En Amagerkone, der tæller sine Penge efter " ("หญิงจากอามาเกอร์กำลังนับเงิน") ซึ่งจัดแสดงในปี 1852 และถูกซื้อโดยพิพิธภัณฑ์แห่งชาติ

เขาได้รับอิทธิพลไม่เพียงแต่จากขบวนการศิลปะแห่งชาติที่ส่งเสริมโดยฮอยเยนเท่านั้น แต่ยังได้รับอิทธิพลจากความรู้สึกรักชาติอย่างแรงกล้าในช่วงเวลานั้นหลังสงครามนโปเลียน และจากการใช้ธีม "เดนมาร์ก" โดยเฉพาะในงานศิลปะ วรรณกรรม และละคร ธีมเหล่านี้มุ่งเน้นไปที่แบบแผนพื้นบ้านในพื้นที่ต่างๆ ของเดนมาร์ก โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้คนที่อาศัยอยู่ในชนบทและในฟาร์ม ในด้านศิลปะ ศิลปินรุ่นก่อนๆ ได้สำรวจธีมต่างๆ เช่น ภูมิทัศน์แบบเดนมาร์กทั่วไป และการพรรณนาถึงธีมเดนมาร์กและนอร์ดิก เรื่องราวในตำนาน และประวัติศาสตร์ ศิลปินหลายคนในรุ่นก่อนหน้าเป็นศิษย์ของเอ็กเคอร์สเบิร์ก และประกอบกันเป็นกลุ่มศิลปินที่รู้จักกันในชื่อยุคทองของจิตรกรรมเดนมาร์ก พวกเขาได้รับผลกระทบจากการเน้นย้ำของเอ็กเคอร์สเบิร์กเกี่ยวกับการศึกษาและการนำเสนอธรรมชาติของเดนมาร์กอย่างเอาใจใส่ รวมถึงทักษะทางเทคนิคที่เขาสอนให้พวกเขาบรรลุเป้าหมายเหล่านั้น

ภาพวาดชิ้นต่อมาหลังจากภาพวาด Amager ภาพแรกของเขาคือ " Et Besøg hos Bedstefaderen " ("การไปเยี่ยมบ้านคุณปู่") ซึ่งวาดในปี 1853 ทำให้เขาประสบความสำเร็จในอาชีพการงานด้วยความนิยมอย่างกว้างขวางและการทำซ้ำมากมาย เขาได้รับ รางวัลเหรียญจากการจัดแสดงนิทรรศการ Thorvaldsensสำหรับผลงานชิ้นนี้ และภาพวาดนี้ถูกซื้อไปเก็บไว้ในคอลเลกชันแห่งชาติ

เขาได้วาดภาพบนเกาะอามาเกอร์เป็นจำนวนมากตลอดช่วงหลายปี และฝีมือของเขาก็พัฒนาขึ้นเรื่อยๆ ขณะที่เขาวาดภาพที่ท้าทายทางศิลปะมากขึ้นเรื่อยๆ ไม่ว่าจะเป็นกลุ่มคนจำนวนมากที่ซับซ้อนขึ้น ทิวทัศน์ของทุ่งโล่งกว้าง เครื่องแต่งกายพื้นเมืองที่มีสีสัน และภายในบ้านของชาวนาเก่าแก่ ภาพวาดเหล่านี้ดึงดูดความสนใจของสาธารณชนที่หลงใหลในการได้เห็นชาวต่างชาติแปลกใหม่ที่อาศัยอยู่ในเดนมาร์กอย่างใกล้ชิด พวกเขารู้สึกเหมือนได้เข้าไปในบ้านของคนแปลกหน้าและได้เห็นชีวิตประจำวันของพวกเขา เอ็กซ์เนอร์เป็นศิลปินที่มีฝีมือและวาดภาพผู้คนด้วยความรัก ความสนใจ และอารมณ์ขันที่อ่อนโยน

เขามักเดินทางไปยังชนบทในช่วงฤดูร้อนเพื่อศึกษาธรรมชาติแบบสดๆ ซึ่งเป็นธรรมเนียมปฏิบัติในสมัยนั้น และวาดภาพให้เสร็จสมบูรณ์ในสตูดิโอในช่วงฤดูหนาว นอกจากนี้เขายังเริ่มมองหาแรงบันดาลใจในสถานที่อื่นๆ บนเกาะเชลลันด์ด้วย ซึ่งส่งผลให้เกิดภาพวาด " Et Bondegilde i Hedeboegnen " ("งานเลี้ยงในฟาร์มแถบเฮเดโบ") ที่วาดในปี 1856 รวมถึงภาพอื่นๆ ในทำนองเดียวกัน ภาพวาดชิ้นหนึ่งของเขา " Lille pige lader en gammel mand lugte til en blomst " ("เด็กหญิงตัวน้อยให้ชายชราดมดอกไม้") ที่วาดในปี 1856 กลายเป็นจุดเริ่มต้นของ คอลเลกชันของ ไฮน์ริช ฮิร์ชส ปรุง (พิพิธภัณฑ์ที่ปัจจุบันรู้จักกันในชื่อคอลเลกชันฮิร์ชสปรุงในโคเปนเฮเกน) เมื่อเขาซื้อภาพนี้ในปี 1866

เขาได้รับทุนเดินทางสองปีจากสถาบันศิลปะ (ค.ศ. 1857–1858) สำหรับการเดินทางไปอิตาลีในฐานะนักศึกษา ซึ่งพาเขาไปยังเดรสเดนเวียนนาสวิ ต เซอร์แลนด์และปารีสนอกเหนือจากเมืองเวนิสปาร์มาฟลอเรนซ์เนเปิลส์และโรมในอิตาลีเขาวาดภาพอิตาลีเป็นครั้งคราว รวมถึงภาพที่มีชื่อเสียงของเขา " En gondol " ("เรือกอนโดลา") จากปี ค.ศ. 1859 ซึ่งเป็นภาพที่มองออกไปจากภายในเรือกอนโดลา ที่มืด มิด หญิงสาวทางด้านซ้ายของภาพมองออกมาจากความมืด คนพายเรือกอนโดลาทางด้านขวาของซุ้มประตูตรงกลางโน้มตัวเข้ามาหาใจกลางภาพ อาบไปด้วยแสงสว่าง ไกลออกไปเป็นภาพแวบหนึ่งของทางน้ำและเรือลำอื่นๆ

เขาวาดภาพBilleder og Versของ กวี Christian Winther ("Pictures and Verses") ในปี พ.ศ. 2405 เขาแต่งงานกับ Inger Henriette Sophie Jensine Ringsted เมื่อวันที่ 15 มิถุนายน พ.ศ. 2406

เขาเดินทางไปสวีเดนหลายครั้งระหว่างปี 1863 ถึง 1864 และในการเดินทางในเดนมาร์ก เขาได้ไปถึงจุดเหนือสุดของคาบสมุทร จั ตแลนด์ คือเมือง สกาเกน ในปี 1867 หมู่บ้านชาวประมงแห่งนี้ จะกลายเป็นที่พำนักของกลุ่มศิลปินที่รู้จักกันในชื่อกลุ่ม จิตรกรสกาเกนในอีกหนึ่งชั่วอายุคนต่อมา

ในปี 1864 เขาได้เป็นสมาชิกของสถาบันศิลปะแห่งเดนมาร์ก และในปี 1866 ก็ได้เป็นสมาชิกของสถาบันศิลปะแห่งสตอกโฮล์มประเทศสวีเดน เขาได้วาดภาพที่มีชื่อเสียงอีกภาพหนึ่งเกี่ยวกับชาวอามาเกอร์ คือภาพ " Blindebuk " ("Blind Man's Bluff") ที่ร่าเริงสดใส ซึ่งแสดงให้เห็นภายในบ้านไร่ที่มีเด็กๆ กำลังเล่นอยู่ ในปี 1866 ในยุคที่การพัฒนาอุตสาหกรรมกำลังรุกคืบเข้ามาอย่างรวดเร็วต่อวิถีชีวิตแบบดั้งเดิมในฟาร์ม เอ็กซ์เนอร์ได้วาดภาพวิสัยทัศน์ที่ไร้กาลเวลาของชาวไร่หลายรุ่นที่รวมตัวกันอยู่รอบๆ บ้านในอุดมคติที่ร่าเริงสดใส พึ่งพาตนเองได้ และมีความสุข ศิลปินรุ่นหลังจะต่อต้านอุดมคตินี้ด้วย การวาดภาพ ที่สมจริงของความต้องการและความจำเป็นในหมู่คนประเภทเดียวกัน

นอกจากนี้ เขายังวาดภาพเหมือนของบุคคลผู้มั่งคั่งและมีชื่อเสียงในยุคนั้น เช่น เจนนี แอดเลอร์ ภรรยาของเดวิด บารุค แอดเลอร์ นักธุรกิจ นายธนาคาร และนักการเมือง พร้อมกับลูกสาวของเธอในปี 1868 และกวีสูงวัย " คริสเตียน วินเทอร์ พา สปาเซเรตูร์ " ("คริสเตียน วินเทอร์ เดินเที่ยวชมเมือง") ในปี 1869

เขาได้รับการแต่งตั้งเป็นศาสตราจารย์ประจำสถาบันศิลปะแห่งเดนมาร์กในปี 1876 หลังจากดำรงตำแหน่งผู้ช่วยศาสตราจารย์ในโรงเรียนสอนการวาดภาพแบบจำลองมาตั้งแต่ปี 1872

ตั้งแต่ปลายทศวรรษ 1870 เอ็กซ์เนอร์เริ่มวาดภาพธีมจากเกาะฟาโน เกาะของเดนมาร์กใน ทะเลเหนือนอกชายฝั่งตะวันตกของคาบสมุทรจัตแลนด์แผ่นดินใหญ่ของเดนมาร์ก เขาเดินทางมายังเกาะนี้เป็นครั้งแรกในปี 1877 เขาและครอบครัวใช้เวลาช่วงฤดูร้อนที่นั่นเป็นประจำทุกปีเป็นเวลาหลายปีต่อมา เขามีสตูดิโออยู่ที่ซอนเดอร์โฮ โคร ที่นั่นเขาได้พบกับกลุ่มคนที่เขาสนใจอย่างลึกซึ้ง ผู้คนที่กำลังจะสูญหายไปอย่างรวดเร็วจากการเปลี่ยนแปลงทางสังคมในเวลานั้น ธีมเหล่านี้เป็นหัวข้อที่ยอดเยี่ยมสำหรับภาพวาดของเขาจนกระทั่งเขาเสียชีวิต

ผลงานของเขาถูกจัดแสดงในงานนิทรรศการระดับโลกที่ปารีสในปี 1878

เขาได้รับรางวัลเทรสโชว์ในปี 1887 เขาได้เป็นสมาชิกของคณะกรรมการจัดนิทรรศการที่ชาร์ลอตเทนบอร์กในปี 1879 และได้รับการแต่งตั้งเป็นหัวหน้าคณะกรรมการในปี 1890 เขาทำหน้าที่ในตำแหน่งนี้เป็นเวลาห้าปี เขาเป็นสมาชิกสภาโรงเรียน ( Skolerådet ) ระหว่างปี 1883 ถึง 1905 เป็นเหรัญญิกตั้งแต่ปี 1884 และเป็นสมาชิกสภาสถาบัน ( Akademirådet ) ตั้งแต่ปี 1887

ในช่วงปีสุดท้ายของชีวิต เขาได้วาดภาพเหมือนตนเองหลายภาพ ภาพหนึ่งในปี 1906 และอีกภาพหนึ่งในปี 1910 เขาเสียชีวิตเมื่อวันที่ 15 พฤศจิกายน 1910 ในโคเปนเฮเกน สองสัปดาห์ก่อนวันเกิดครบรอบ 85 ปีของเขา เขาถูกฝังอยู่ที่สุสานโฮลเมนในใจกลางโคเปนเฮเกน

เขาได้นำผลงานไปจัดแสดงในงานนิทรรศการฤดูใบไม้ผลิชาร์ลอตเทนบอร์กเป็นประจำทุกปีตั้งแต่ปี 1844 จนกระทั่งเสียชีวิตในปี 1910 โดยมีข้อยกเว้นเพียงไม่กี่ครั้ง