คลูเวโรไมเซส แลคติส
| คลูเวโรไมเซส แลคติส | |
|---|---|
| การเพาะเลี้ยงยีสต์ Kluyveromyces lactisบนจานเพาะเชื้อ | |
| การจำแนกทางวิทยาศาสตร์ | |
| อาณาจักร: | เชื้อรา |
| แผนก: | แอสโคไมโคตา |
| ระดับ: | แซคคาโรไมซีส |
| คำสั่ง: | แซคคาโรไมซีทาเลส |
| ตระกูล: | แซคคาโรไมซีตา |
| ประเภท: | คลูเวโรไมเซส |
| สายพันธุ์: | เค. แลคติส |
| ชื่อทวินาม | |
| คลูเวโรไมเซส แลคติส (สเตล.-เด็ค.) แวน เดอร์ วอลท์ | |
Kluyveromyces lactisเป็นยีสต์ในสกุลKluyveromyces ที่นิยมใช้ใน การศึกษา ทางพันธุกรรมและการใช้งานในอุตสาหกรรม ชื่อของมันมาจากความสามารถในการดูดซึมแลคโตสและเปลี่ยนเป็นกรดแลคติก
Kluyveromyces lactis (เดิมชื่อSaccharomyces lactis ) เป็นยีสต์ที่มีความสามารถในการดูดซึมแลคโตสและเปลี่ยนเป็นกรดแลคติกK. lactisและจุลินทรีย์อื่นๆ เช่นAspergillus niger var awamori และEscherichia coli K-12 ถูกนำมาเพาะเลี้ยงในถังหมักเพื่อผลิตไคโมซิน ( เรนเนต ) ในเชิงพาณิชย์ เร นเนตชนิดนี้ซึ่งใช้แทนเรนเนตแบบดั้งเดิมที่ได้จากสัตว์ที่ถูกฆ่า ปัจจุบันถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในการผลิตชีส
ยีสต์และราเป็นสิ่งมีชีวิตที่เหมาะสมอย่างยิ่งสำหรับการศึกษาจีโนมเปรียบเทียบในยูคาริโอตเนื่องจากมีจีโนม ขนาดเล็กและกะทัดรัด และเนื่องจากมีหลายชนิด เช่นNeurospora crassa , Saccharomyces cerevisiaeและSchizosaccharomyces pombeซึ่งถูกนำมาใช้และยังคงใช้กันอย่างแพร่หลายในการศึกษาทางพันธุกรรม อย่างไรก็ตาม การแยกสายพันธุ์ระหว่างสามชนิดนี้เกิดขึ้นมานานแล้ว (คาดว่าอย่างน้อย 300 ล้านปี) และโครงสร้างของจีโนมก็แตกต่างกันมาก ความหลากหลายของเฮมิอาสโคไมซีส ซึ่งเป็นกลุ่มของแอสโคไมซีสที่ประกอบด้วยยีสต์ส่วนใหญ่ที่รู้จักกันนั้น ได้รับการสำรวจครั้งแรกในปี 2000
ได้มีการดำเนินการจัดลำดับและเปรียบเทียบจีโนมของยีสต์ในกลุ่มเฮมิอาสโคไมซีต 4 ชนิด ได้แก่Nakaseomyces glabratus , Kluyveromyces lactis , Debaryomyces hanseniiและYarrowia lipolyticaโดยเลือกยีสต์เหล่านี้จาก ตำแหน่ง ทางสายวิวัฒนาการและความสำคัญเฉพาะด้านในฐานะเชื้อก่อโรคในมนุษย์หรือยีสต์ที่มีความสำคัญทางอุตสาหกรรมหรือสิ่งแวดล้อม งานวิจัยนี้ซึ่งเป็นการสำรวจวิวัฒนาการของจีโนมในหลายสายพันธุ์ของไฟลัมยูคาริโอตทั้งหมดเป็นครั้งแรก เผยให้เห็นถึงเหตุการณ์และกลไกต่างๆ ที่เกิดขึ้น และควรจะช่วยให้สามารถเปรียบเทียบกับไฟลัมอื่นๆ ของสิ่งมีชีวิตหลายเซลล์ได้อย่างมีประโยชน์ เมื่อมีการกำหนดลำดับจีโนมเพิ่มเติมในอนาคต
K. lactisเป็น สปีชีส์ เฮเทอโรทัลลิกที่มีวงจรแฮพลอนติกเป็นหลัก ซึ่งแตกต่างจากS. cerevisia eที่มีวงจรดิพลอบิออนติกเป็นหลักซึ่งเป็นแบบเฮเทอโรทัลลิกเทียมเนื่องจากการสลับประเภทการผสมพันธุ์[ 1 ]
การวิเคราะห์จีโนมิกส์
ในช่วงทศวรรษ 1990 มีเพียงไม่กี่จีนที่เป็นที่รู้จักและได้รับการวิเคราะห์โดยนักวิทยาศาสตร์ จนกระทั่งมีการวิเคราะห์จีโนมครั้งแรกโดยทีมงานจากสถาบันปาสเตอร์แห่งปารีส[ 2 ]จีโนมของ Kluyveromyces lactisได้รับการสำรวจโดยการจัดลำดับแท็กสั้น 588 แท็กจากไลบรารีจีโนมแบบสุ่มสองแห่ง (แท็กที่จัดลำดับแบบสุ่ม หรือ RSTs) มีการระบุจีนของ K. lactis จำนวน 296 จีน ซึ่ง 292 จีนเป็นจีนใหม่
จีโนมที่สมบูรณ์ของK. lactisได้รับการถอดรหัสในปี 2547 [ 1 ]
สายพันธุ์นี้มียีนประมาณ 5,300 ยีนกระจายอยู่บนโครโมโซม นิวเคลียร์ 6 โครโมโซม และจีโนมไมโทคอนเดรียโครโมโซมทั้ง 6 โครโมโซมมีป้ายกำกับว่า AF [ 3 ]