• ค้างคาวขนาดเล็กใช้ระบบเอโคโลเคชั่นในขณะที่ค้างคาวขนาดใหญ่โดยทั่วไปไม่ใช้ (ค้างคาวผลไม้ของอียิปต์Rousettus egyptiacusเป็นข้อยกเว้น แต่ก็ไม่ได้ใช้ระบบเอโคโลเคชั่นจากกล่องเสียงเหมือนค้างคาวขนาดเล็ก แต่นักวิทยาศาสตร์ตั้งทฤษฎีว่ามันใช้การคลิกโดยใช้ทางเดินจมูกและโคนลิ้น)
• ค้างคาวขนาดเล็กไม่มีเล็บที่นิ้วที่สองของขาหน้า นิ้วนี้จึงดูบางกว่าปกติและแทบจะเชื่อมติดกับนิ้วที่สามด้วยเนื้อเยื่อเพื่อเสริมการทรงตัวขณะบิน
• ค้างคาวขนาดใหญ่ไม่มีหาง ยกเว้นบางสกุล เช่นNyctimeneในขณะที่ลักษณะนี้พบได้เฉพาะในค้างคาวขนาดเล็กบางชนิดเท่านั้น
• หูของค้างคาวขนาดเล็กมีติ่งหู (ซึ่งเชื่อว่ามีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการระบุตำแหน่งด้วยเสียงสะท้อน) และมีขนาดใหญ่กว่าหูของค้างคาวขนาดใหญ่ ในขณะที่หูของค้างคาวขนาดใหญ่นั้นค่อนข้างเล็กและไม่มีติ่งหู
• ดวงตาของค้างคาวขนาดใหญ่ค่อนข้างใหญ่ ในขณะที่ดวงตาของค้างคาวขนาดเล็กนั้นเล็กกว่าเมื่อเทียบกัน

รูปทรงและหน้าที่ของฟันค้างคาวขนาดเล็กแตกต่างกันไปตามอาหารที่หลากหลายของค้างคาวเหล่านี้ ฟันถูกออกแบบมาเพื่อบดเคี้ยวอาหารเป็นหลัก ดังนั้นรูปร่างของฟันจึงสัมพันธ์กับพฤติกรรมการกินอาหารที่เฉพาะเจาะจง^{[ 5 ]} เมื่อเปรียบเทียบกับค้างคาว ขนาดใหญ่ที่กินเฉพาะผลไม้และน้ำหวาน ค้างคาวขนาดเล็กมีอาหารที่หลากหลายและถูกจัดประเภทเป็นสัตว์กินแมลง สัตว์กินเนื้อ สัตว์กินเลือด สัตว์กินผลไม้และสัตว์กินน้ำหวาน [ ^{6 ] ความ}แตกต่างที่พบระหว่างขนาดและหน้าที่ของฟันเขี้ยวและฟันกรามในค้างคาวขนาดเล็กในกลุ่มเหล่านี้จึงแตกต่างกันไปตามนี้

อาหารที่หลากหลายของค้างคาวขนาดเล็กสะท้อนให้เห็นถึงการมีฟันหรือฟันกรามที่มีลักษณะรูปร่างที่ได้มาจากฟันไดแลมบ์โดดอนต์ ซึ่งมีลักษณะเป็นเอกโทโลฟรูปตัว W หรือชั้นวางสไตลาร์^{[ 7 ]}ฟันกรามบนไดแลมบ์โดดอนต์รูปตัว W ประกอบด้วยเมตาโคนและพาราโคน ซึ่งอยู่ด้านล่างของรูปตัว “W” ในขณะที่ส่วนที่เหลือของรูปตัว “W” เกิดจากสันที่วิ่งจากเมตาโคนและพาราโคนไปยังปุ่มของสไตลาร์เอง

ไมโครแบทแสดงความแตกต่างระหว่างขนาดและรูปร่างของฟันเขี้ยวและฟันกราม นอกเหนือจากความแตกต่างที่โดดเด่นในลักษณะกะโหลกศีรษะที่เอื้อต่อความสามารถในการหาอาหารอย่างมีประสิทธิภาพ ไมโครแบทที่กินผลไม้มีพื้นที่ชั้นวางสไตลาร์ขนาดเล็ก แถวฟันกรามสั้น และเพดานปากและใบหน้ากว้าง นอกจากจะมีใบหน้ากว้างแล้ว ไมโครแบทที่กินผลไม้ยังมีกะโหลกศีรษะสั้น ซึ่งทำให้ฟันอยู่ใกล้กับจุดหมุนของคานขากรรไกรมากขึ้น ทำให้ขากรรไกรแข็งแรงขึ้น^{[ 8 ]}ไมโครแบทที่กินผลไม้ยังมีรูปแบบบนฟันกรามที่แตกต่างจากไมโครแบทที่กินเนื้อ กินแมลง กินน้ำหวาน และกินเลือด^{[ 6 ]}ในทางตรงกันข้าม ไมโครแบทที่กินแมลงมีลักษณะเด่นคือมีฟันขนาดใหญ่กว่าแต่น้อยกว่า ฟันเขี้ยวยาว และฟันกรามบนซี่ที่สามสั้นกว่า ในขณะที่ไมโครแบทที่กินเนื้อมีฟันกรามบนขนาดใหญ่ โดยทั่วไป ค้างคาวขนาดเล็กที่กินแมลง กินเนื้อ และกินผลไม้จะมีฟันขนาดใหญ่และเพดานปากขนาดเล็ก แต่ค้างคาวขนาดเล็กที่กินน้ำหวานจะมีลักษณะตรงกันข้าม แม้ว่าจะมีความแตกต่างกันระหว่างขนาดของเพดานปากและฟันของค้างคาวขนาดเล็ก แต่สัดส่วนของขนาดของโครงสร้างทั้งสองนี้ยังคงเหมือนเดิมในค้างคาวขนาดเล็กที่มีขนาดต่างๆ กัน^{[ 6 ]}

ค้างคาวขนาดเล็กส่วนใหญ่สร้างคลื่นเสียงอัลตราซาวนด์ด้วยกล่องเสียงและเปล่งเสียงออกมาทางจมูกหรือปาก^{[ 12 ]}การสร้างเสียงเกิดขึ้นจากเส้นเสียงในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมเนื่องจากเยื่อหุ้มที่ยืดหยุ่นซึ่งประกอบเป็นเส้นเสียงเหล่านี้ การเปล่งเสียงต้องอาศัยเยื่อหุ้มที่ยืดหยุ่นเหล่านี้เพราะทำหน้าที่เป็นแหล่งเปลี่ยนการไหลของอากาศให้เป็นคลื่นความดันเสียง พลังงานถูกส่งไปยังเยื่อหุ้มที่ยืดหยุ่นจากปอดและส่งผลให้เกิดการสร้างเสียง กล่องเสียงเป็นที่อยู่ของเส้นเสียงและสร้างทางเดินสำหรับอากาศที่หายใจออกซึ่งจะทำให้เกิดเสียง^{[ 13 ]}ค้างคาวขนาดเล็กการโทร^ⓘช่วงความถี่ตั้งแต่ 14,000 ถึงมากกว่า 100,000เฮิรตซ์ซึ่งเกินช่วงการได้ยินของมนุษย์ (ช่วงการได้ยินของมนุษย์โดยทั่วไปอยู่ที่ 20 ถึง 20,000 เฮิรตซ์) เสียงร้องที่เปล่งออกมาเป็นลำแสงเสียงกว้างที่ใช้ในการสำรวจสภาพแวดล้อม รวมถึงการสื่อสารกับค้างคาวตัวอื่น ในระดับโมเลกุล พบว่าCPLX1มีส่วนเกี่ยวข้องกับการสร้างคลื่นอัลตราโซนิกนี้ ^{[ 14 ]}

การหาตำแหน่งด้วยเสียงสะท้อนจากกล่องเสียงเป็นรูปแบบการหาตำแหน่งด้วยเสียงสะท้อนที่เด่นชัดในค้างคาวขนาดเล็ก อย่างไรก็ตาม มันไม่ใช่เพียงวิธีเดียวที่ค้างคาวขนาดเล็กสามารถสร้างคลื่นอัลตราโซนิกได้ นอกเหนือจากค้างคาวขนาดเล็กที่ไม่ใช้การหาตำแหน่งด้วยเสียงสะท้อนและค้างคาวขนาดเล็กที่ใช้กล่องเสียงในการหาตำแหน่งด้วยเสียงสะท้อนแล้ว ค้างคาวขนาดเล็กและค้างคาวขนาดใหญ่ชนิดอื่นๆ ยังแสดงให้เห็นว่าสามารถสร้างคลื่นอัลตราโซนิก ได้ โดยการกระพือปีก คลิกลิ้น หรือใช้จมูก^{[ 9 ]}โดยทั่วไปแล้ว ค้างคาวที่ใช้กล่องเสียงในการหาตำแหน่งด้วยเสียงสะท้อนจะสร้างคลื่นอัลตราโซนิกด้วยกล่องเสียงของพวกมัน ซึ่งมีความเชี่ยวชาญในการสร้างเสียงที่มีความยาวคลื่น สั้น กล่องเสียงตั้งอยู่ที่ ปลาย ด้านศีรษะของหลอดลมและล้อมรอบด้วยกล้ามเนื้อไครโคไทรอยด์และกระดูกอ่อนไทรอยด์สำหรับการอ้างอิง ในมนุษย์นี่คือบริเวณที่ลูกกระเดือกตั้งอยู่ การสร้างเสียงอัลตราโซนิกเกิดขึ้นจากการสั่นสะเทือนของเยื่อเสียงในอากาศที่หายใจออก ความเข้มของการสั่นสะเทือนของเส้นเสียงเหล่านี้จะแตกต่างกันไปตามกิจกรรมและระหว่างสายพันธุ์ของค้างคาว^{[ 15 ]}ลักษณะเฉพาะของค้างคาวขนาดเล็กที่ใช้เสียงสะท้อนจากกล่องเสียง ซึ่งทำให้แตกต่างจากค้างคาวขนาดเล็กที่ใช้เสียงสะท้อนชนิดอื่น คือ การเชื่อมต่อกันของกระดูกสไตโลไฮอัลกับกระดูกทิมพานิกกระดูกสไตโลไฮอัลเป็นส่วนหนึ่งของกระดูกไฮออยด์ที่ช่วยพยุงคอและกล่องเสียง กระดูกทิมพานิกเป็นพื้นของหูชั้นกลางนอกจากการเชื่อมต่อระหว่างกระดูกสไตโลไฮอัลและกระดูกทิมพานิกจะเป็นตัวบ่งชี้ของค้างคาวขนาดเล็กที่ใช้เสียงสะท้อนจากกล่องเสียงแล้ว เครื่องหมายที่ชัดเจนอีกอย่างหนึ่งคือ การมีกระดูกสไตโลไฮอัลที่แบนและขยายออกที่ปลายด้านกะโหลก^{[ 10 ]}

ค้างคาวขนาดเล็กที่ใช้กล่องเสียงในการหาตำแหน่งโดยใช้เสียงสะท้อนจะต้องสามารถแยกแยะความแตกต่างของคลื่นเสียงที่พวกมันสร้างขึ้นและเสียงสะท้อนที่ตามมาได้ โดยการประมวลผลและทำความเข้าใจคลื่นอัลตราโซนิกใน ระดับ เซลล์ประสาทเพื่อให้ได้ข้อมูลเกี่ยวกับสภาพแวดล้อมโดยรอบและการวางตัวในนั้นอย่างแม่นยำ^{[ 9 ]}การเชื่อมต่อระหว่างกระดูกสไตโลไฮอัลและกระดูกแก้วหูทำให้ค้างคาวสามารถบันทึกคลื่นอัลตราโซนิกที่ส่งออกและรับเข้ามาซึ่งผลิตโดยกล่องเสียง ได้ในระดับเซลล์ประสาท ^{[ 11 ]}นอกจากนี้ กระดูกสไตโลไฮอัลยังเชื่อมต่อกล่องเสียงกับกระดูกแก้วหูผ่าน การเชื่อมต่อที่ เป็นกระดูกอ่อนหรือเส้นใย (ขึ้นอยู่กับชนิดของค้างคาว) ในทางกลศาสตร์ ความสำคัญของการเชื่อมต่อนี้คือการช่วยพยุงกล่องเสียงโดยยึดไว้กับ กล้ามเนื้อไครโคไทรอยด์ โดย รอบรวมถึงดึงกล่องเสียงให้เข้าใกล้โพรงจมูก มากขึ้น ในระหว่างการออกเสียงกระดูกสไตโลไฮอัลมักจะลดขนาดลงในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมชนิดอื่น ๆ หลายชนิด อย่างไรก็ตาม กระดูกเหล่านี้มีความโดดเด่นมากกว่าในค้างคาวที่ใช้กล่องเสียงในการหาตำแหน่งด้วยเสียงสะท้อน และเป็นส่วนหนึ่งของระบบกระดูกไฮออยด์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม ระบบกระดูกไฮออยด์ทำหน้าที่ในการหายใจ การกลืน และการออกเสียงในค้างคาวขนาดเล็ก เช่นเดียวกับสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมชนิดอื่น ๆ คุณลักษณะที่สำคัญของการเชื่อมต่อของกระดูกในค้างคาวขนาดเล็กที่ใช้กล่องเสียงในการหาตำแหน่งด้วยเสียงสะท้อน คือ การเชื่อมต่อที่ขยายออกไปของส่วนท้องของกระดูกแก้วหูและปลายด้านใกล้ของกระดูกสไตโลไฮอัลที่โค้งงอรอบ ๆ เพื่อสร้างการเชื่อมต่อนี้^{[ 9 ]}