ไมโครโปรตีน (miP) เป็นโปรตีน ขนาดเล็ก ที่เข้ารหัสจากกรอบการอ่านแบบเปิดขนาดเล็ก (sORF) ^{[ 1 ]}หรือที่รู้จักกันในชื่อโปรตีนที่เข้ารหัสโดย sORF ( SEP ) พวกมันเป็นโปรตีนประเภทหนึ่งที่มีโดเมนโปรตีน เดียว พวกมันมีความเกี่ยวข้องกับโปรตีนหลายโดเมน^{[ 2 ]}ไมโครโปรตีนควบคุมโปรตีนหลายโดเมนขนาดใหญ่ในระดับหลังการแปล^{[ 3 ]}ไมโครโปรตีนมีความคล้ายคลึงกับไมโครอาร์เอ็นเอ (miRNA) และ สร้าง เฮเทอโรไดเมอร์กับเป้าหมายของพวกมัน ทำให้เกิดผลเด่นและผลลบ^{[ 4 ]}ในสัตว์และพืช ไมโครโปรตีนมีอิทธิพลต่อกระบวนการทางชีวภาพหลายอย่าง^{[ 2 ]}เนื่องจากผลเด่นของพวกมันต่อเป้าหมาย ไมโครโปรตีนจึงอยู่ระหว่างการศึกษาเพื่อใช้ในด้านเทคโนโลยีชีวภาพ^{[ 2 ]}ในมนุษย์ พวกมันเกี่ยวข้องกับโรคทางพันธุกรรมและมะเร็ง และเรียกว่าเปปไทดีน^{[ 5 ]}

ไมโครโปรตีนตัวแรกถูกค้นพบในระหว่างการวิจัยในช่วงต้นทศวรรษ 1990 เกี่ยวกับยีนสำหรับปัจจัยการถอดรหัสเบสิกเฮลิกซ์-ลูป-เฮลิกซ์ (bHLH) จากไลบรารี cDNAของเซลล์เม็ดเลือดแดงลูคีเมียของหนู^{[ 3 ]}โปรตีนนี้เป็นตัวยับยั้งการจับกับ DNA (โปรตีน ID) และควบคุมคอมเพล็กซ์ปัจจัยการถอดรหัสในเชิงลบ^{[ 3 ]}โปรตีนนี้มีขนาด 16 kDa และประกอบด้วยโดเมนเฮลิกซ์-ลูป-เฮลิกซ์ (HLH) ^{[ 2 ]}ไมโครโปรตีนนี้สร้างเฮเทอโรไดเมอร์ bHLH/HLH ที่ขัดขวางโฮโมไดเมอร์เบสิกเฮลิกซ์-ลูป-เฮลิกซ์ (bHLH) ที่ทำงานได้^{[ 2 ]}

ไมโครโปรตีนพืชชนิดแรกที่ถูกค้นพบคือโปรตีน LITTLE ZIPPER (ZPR) ^{[ 2 ]}โปรตีน LITTLE ZIPPER ประกอบด้วย โดเมน leucine zipperแต่ขาดโดเมนที่จำเป็นสำหรับการจับกับ DNA และการกระตุ้นการถอดรหัส^{[ 2 ]}ดังนั้น โปรตีน LITTLE ZIPPER จึงคล้ายคลึงกับโปรตีน ID ^{[ 2 ]}แม้ว่าโปรตีนทั้งหมดจะไม่เล็ก แต่ในปี 2011 โปรตีนกลุ่มนี้ได้รับชื่อว่าไมโครโปรตีน เนื่องจากการทำงานควบคุมเชิงลบของพวกมันคล้ายคลึงกับการทำงานของ miRNA ^{[ 3 ]}

โปรตีน ID หรือโปรตีนที่คล้ายกับ ID พบได้ในสัตว์ทุกชนิด^{[ 3 ]}ไมโครโปรตีนของพืชพบได้เฉพาะในลำดับที่สูงกว่า^{[ 3 ]}อย่างไรก็ตาม ปัจจัยการถอดรหัส โฮมีโอโดเมนที่อยู่ในตระกูลส่วนขยายลูปสามกรดอะมิโน (TALE) เป็นเป้าหมายของไมโครโปรตีน และโปรตีนโฮมีโอโดเมนเหล่านี้ได้รับการอนุรักษ์ไว้ในสัตว์ พืช และเชื้อรา^{[ 3 ]}

โดยทั่วไปไมโครโปรตีนจะมีโดเมนโปรตีนเพียงโดเมนเดียว^{[ 2 ] [ 4 ]}รูปแบบที่ใช้งานได้จะถูกแปลมาจาก smORF ^{[ 1 ]} smORF อาจมีโคดอนน้อยกว่า 100 โคดอน^{[ 1 ]}อย่างไรก็ตาม ไมโครโปรตีนไม่ได้มีขนาดเล็กทั้งหมด และชื่อนี้ถูกตั้งขึ้นเนื่องจากมีความคล้ายคลึงกับ miRNA ^{[ 3 ]} แม้จะมีขนาดสั้น แต่ไมโครโปรตีนก็แสดงให้เห็นถึงโครงสร้างพับที่จำกัดแต่หลากหลาย (รวมถึงโครงสร้าง α-helical และ transmembrane-helical เป็นหลัก) แต่ผู้สมัครหลายรายยังแสดงให้เห็นถึงความไม่เป็นระเบียบภายในที่สำคัญ โครงสร้างไมโครโปรตีนที่กำหนดโดยการทดลองได้รับการแก้ไขโดยใช้วิธีการต่างๆ เช่น การตกผลึกด้วยรังสีเอกซ์ กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบไครโอ และ NMR ^{[ 6 ]}การสำรวจเชิงคำนวณของโครงสร้างที่คาดการณ์ไว้สำหรับไมโครโปรตีน 44 ตัว รายงานลักษณะโครงสร้างที่คล้ายคลึงกันโดยทั่วไปในชุด และมีไซต์การจับลิแกนด์โมเลกุลขนาดเล็กที่คาดการณ์ไว้ค่อนข้างน้อย^{[ 7 ]}เนื่องจากตัวทำนายโครงสร้าง/ความผิดปกติจำนวนมากได้รับการฝึกฝนโดยใช้โปรตีน "คลาสสิก" ที่ยาวกว่าเป็นหลัก จึงมีการเสนอขั้นตอนการทำงานและข้อควรระวังเฉพาะเพื่อการทำนายโครงสร้างและความผิดปกติที่เชื่อถือได้สำหรับไมโครโปรตีน^{[ 8 ]}

ไมโครโปรตีนทำหน้าที่เป็นตัวควบคุมหลังการแปล [ ^{3 ] ไมโคร}โปรตีนขัดขวางการก่อตัวของคอมเพล็กซ์เฮเทอโรไดเมอริก โฮโมไดเมอริก หรือมัลติเมอริก^{[ 4 ]}นอกจากนี้ ไมโครโปรตีนยังสามารถโต้ตอบกับโปรตีนใดๆ ที่ต้องการไดเมอร์ที่ทำงานได้เพื่อการทำงานตามปกติ^{[ 3 ]}เป้าหมายหลักคือปัจจัยการถอดรหัสที่จับกับ DNA ในรูปของไดเมอร์^{[ 9 ] [ 3 ]}ไมโครโปรตีนควบคุมคอมเพล็กซ์เหล่านี้โดยการสร้างไดเมอร์แบบโฮโมไทป์กับเป้าหมายและยับยั้งการทำงานของคอมเพล็กซ์โปรตีน^{[ 3 ]}การยับยั้ง miP มีสองประเภท ได้แก่ การยับยั้ง miP แบบโฮโมไทป์และการยับยั้ง miP แบบเฮเทอโรไทป์^{[ 4 ]}ในการยับยั้ง miP แบบโฮโมไทป์ ไมโครโปรตีนจะโต้ตอบกับโปรตีนที่มีโดเมนการโต้ตอบระหว่างโปรตีน (PPI) ที่คล้ายกัน^{[ 4 ]}ในการยับยั้ง miP แบบเฮเทอโรไทป์ ไมโครโปรตีนจะโต้ตอบกับโปรตีนที่มีโดเมน PPI ที่แตกต่างกันแต่เข้ากันได้^{[ 4 ]}ในการยับยั้งทั้งสองประเภท ไมโครโปรตีนจะรบกวนและป้องกันไม่ให้โดเมน PPI โต้ตอบกับโปรตีนปกติ^{[ 4 ]}