หากกรณีตัวอย่างสองกรณีขึ้นไปของปรากฏการณ์ที่กำลังตรวจสอบมีปัจจัยร่วมกันเพียงอย่างเดียว ปัจจัยร่วมนั้นคือสาเหตุ (หรือผลกระทบ) ของปรากฏการณ์นั้น

เพื่อให้คุณสมบัติใด ๆ เป็น เงื่อนไข ที่จำเป็นคุณสมบัตินั้นจะต้องมีอยู่เสมอหากผลลัพธ์นั้นเกิดขึ้น เนื่องจากเป็นเช่นนั้น เราจึงสนใจที่จะพิจารณากรณีที่ผลลัพธ์เกิดขึ้น และสังเกตว่าคุณสมบัติใดบ้างในบรรดาคุณสมบัติที่ถือว่าเป็น 'เงื่อนไขที่จำเป็นที่เป็นไปได้' นั้นมีอยู่ และคุณสมบัติใดบ้างที่ไม่มีอยู่ เห็นได้ชัดว่า คุณสมบัติใด ๆ ที่ไม่มีอยู่เมื่อผลลัพธ์เกิดขึ้น ย่อมไม่สามารถเป็นเงื่อนไขที่จำเป็นสำหรับผลลัพธ์นั้นได้ วิธีการนี้ยังถูกกล่าวถึงโดยทั่วไปในสาขาวิชารัฐศาสตร์เปรียบเทียบว่าเป็นวิธีการออกแบบระบบที่แตกต่างกันมากที่สุด ในเชิงสัญลักษณ์ วิธีการตกลงสามารถแสดงได้ดังนี้:

ABCD เกิดขึ้นพร้อมกับ wxyz

AEFG เกิดขึ้นพร้อมกับ wtuv

——————————————————

ดังนั้น A จึงเป็นสาเหตุ หรือผลของ w

เพื่ออธิบายแนวคิดนี้ให้ชัดเจนยิ่งขึ้น ลองพิจารณาสองประเทศที่มีโครงสร้างแตกต่างกัน ประเทศ A เป็นอดีตอาณานิคม มีรัฐบาลฝ่ายซ้ายกลาง และมีระบบสหพันธรัฐที่มีรัฐบาลสองระดับ ประเทศ B ไม่เคยเป็นอาณานิคม มีรัฐบาลฝ่ายซ้ายกลาง และเป็นรัฐเดี่ยว ปัจจัยหนึ่งที่ทั้งสองประเทศมีเหมือนกัน ซึ่งเป็นตัวแปรตามในกรณีนี้ คือทั้งสองประเทศมีระบบการดูแลสุขภาพถ้วนหน้าเมื่อเปรียบเทียบปัจจัยต่างๆ ที่ทราบเกี่ยวกับประเทศข้างต้น นักรัฐศาสตร์เชิงเปรียบเทียบจะสรุปได้ว่า รัฐบาลที่อยู่ฝ่ายซ้ายกลางของสเปกตรัมจะเป็นตัวแปรอิสระที่ก่อให้เกิดระบบการดูแลสุขภาพถ้วนหน้า เนื่องจากเป็นปัจจัยเดียวที่ตรวจสอบแล้วคงที่ระหว่างสองประเทศ และการสนับสนุนทางทฤษฎีสำหรับความสัมพันธ์นั้นก็สมเหตุสมผล นโยบายประชาธิปไตยสังคมนิยม (ฝ่ายซ้ายกลาง) มักรวมถึงการดูแลสุขภาพถ้วนหน้าด้วย

หากกรณีหนึ่งที่ปรากฏการณ์ที่กำลังตรวจสอบเกิดขึ้น และอีกกรณีหนึ่งที่ปรากฏการณ์นั้นไม่เกิดขึ้น มีปัจจัยทุกอย่างเหมือนกัน ยกเว้นเพียงปัจจัยเดียว ซึ่งเกิดขึ้นเฉพาะในกรณีแรกเท่านั้น ปัจจัยเดียวที่แตกต่างกันระหว่างสองกรณีนี้ คือ ผล หรือ สาเหตุ หรือส่วนสำคัญที่ขาดไม่ได้ของสาเหตุของปรากฏการณ์นั้น

วิธีการนี้เป็นที่รู้จักกันทั่วไปว่าเป็นวิธีการออกแบบระบบที่มีความคล้ายคลึงกันมากที่สุดในสาขาวิชารัฐศาสตร์เปรียบเทียบ

ABCD เกิดขึ้นพร้อมกับ wxyz

BCD เกิดขึ้นพร้อมกับ xyz

——————————————————

ดังนั้น A จึงเป็นสาเหตุ หรือผลกระทบ หรือเป็นส่วนหนึ่งของสาเหตุของ w

ตัวอย่างของการใช้วิธีความแตกต่าง ลองพิจารณาสองประเทศที่คล้ายคลึงกัน ประเทศ A มีรัฐบาลฝ่ายขวาจัด ระบบการปกครองแบบรวมศูนย์ และเคยเป็นอาณานิคมมาก่อน ประเทศ B มีรัฐบาลฝ่ายขวาจัด ระบบการปกครองแบบรวมศูนย์ แต่ไม่เคยเป็นอาณานิคมมาก่อน ความแตกต่างระหว่างประเทศทั้งสองคือ ประเทศ A สนับสนุนการต่อต้านอาณานิคมอย่างเต็มที่ ในขณะที่ประเทศ B ไม่สนับสนุน วิธีความแตกต่างจะระบุสถานะของแต่ละประเทศว่าเป็นอดีตอาณานิคมหรือไม่เป็นตัวแปรอิสระ โดยมีตัวแปรตามคือการสนับสนุนการต่อต้านอาณานิคม ทั้งนี้เพราะว่า ในบรรดาสองประเทศที่คล้ายคลึงกันที่นำมาเปรียบเทียบกัน ความแตกต่างระหว่างสองประเทศนี้คือว่าเคยเป็นอาณานิคมมาก่อนหรือไม่ ซึ่งอธิบายถึงความแตกต่างของค่าตัวแปรตาม โดยประเทศที่เคยเป็นอาณานิคมมีแนวโน้มที่จะสนับสนุนการปลดปล่อยจากอาณานิคมมากกว่าประเทศที่ไม่มีประวัติเป็นอาณานิคม

หากกรณีสองกรณีขึ้นไปที่เกิดปรากฏการณ์ดังกล่าวมีเพียงสถานการณ์เดียวที่เหมือนกัน ในขณะที่กรณีสองกรณีขึ้นไปที่ปรากฏการณ์ดังกล่าวไม่เกิดขึ้นนั้นไม่มีอะไรเหมือนกันเลยนอกจากขาดสถานการณ์นั้น สถานการณ์เดียวที่แตกต่างกันระหว่างสองชุดกรณีนี้ก็คือผลหรือสาเหตุ หรือส่วนที่จำเป็นของสาเหตุของปรากฏการณ์นั้น

หลักการนี้เรียกอีกอย่างว่า "วิธีการตกลงและหาความแตกต่างร่วมกัน" ซึ่งเป็นการผสมผสานวิธีการตกลงสองวิธีเข้าด้วยกัน แม้จะมีชื่อเช่นนั้น แต่หลักการนี้อ่อนกว่าวิธีการหาความแตกต่างโดยตรงและไม่รวมถึงวิธีการหาความแตกต่างโดยตรงด้วย

ในเชิงสัญลักษณ์ วิธีการตกลงและหาความแตกต่างร่วมกันสามารถแสดงได้ดังนี้:

ABC เกิดขึ้นพร้อมกับ xyz

ADE เกิดขึ้นพร้อมกับ xvw

FG เกิดขึ้นพร้อมกับ yw

——————————————————

ดังนั้น A จึงเป็นสาเหตุ หรือผลกระทบ หรือเป็นส่วนหนึ่งของสาเหตุของ x

หักลบ^{[ 3 ]}จากปรากฏการณ์ใดๆ ส่วนที่ทราบจากการเหนี่ยวนำก่อนหน้านี้ว่าเป็นผลจากปัจจัยก่อนหน้าบางอย่าง และส่วนที่เหลือของปรากฏการณ์เป็นผลจากปัจจัยก่อนหน้าที่เหลืออยู่

หากเชื่อว่าปัจจัยหลายอย่างเป็นสาเหตุของปรากฏการณ์หลายอย่าง และเราได้จับคู่ปัจจัยทั้งหมด ยกเว้นปัจจัยเดียว กับปรากฏการณ์ทั้งหมด ยกเว้นปรากฏการณ์เดียวแล้ว ปรากฏการณ์ที่เหลืออยู่ก็สามารถระบุได้ว่าเป็นผลมาจากปัจจัยที่เหลืออยู่นั้น

ในเชิงสัญลักษณ์ วิธีการหาค่าตกค้างสามารถแสดงได้ดังนี้:

ABC เกิดขึ้นพร้อมกับ xyz

เป็นที่ทราบกันว่า B เป็นสาเหตุของ y

C เป็นที่ทราบกันว่าเป็นสาเหตุของ z

——————————————————

ดังนั้น A จึงเป็นสาเหตุหรือผลของ x

ไม่ว่าปรากฏการณ์ใดจะเปลี่ยนแปลงไปในลักษณะใดก็ตาม เมื่อใดก็ตามที่ปรากฏการณ์อื่นเปลี่ยนแปลงไปในลักษณะใดลักษณะหนึ่ง ปรากฏการณ์นั้นก็จะเป็นสาเหตุหรือผลของปรากฏการณ์ที่สอง หรือมีความเชื่อมโยงกันผ่านข้อเท็จจริงเชิงสาเหตุบางประการ

หากในสถานการณ์ต่างๆ ที่นำไปสู่ปรากฏการณ์หนึ่ง คุณสมบัติบางอย่างของปรากฏการณ์นั้นเปลี่ยนแปลงไปพร้อมกับปัจจัยบางอย่างที่มีอยู่ในสถานการณ์นั้น ปรากฏการณ์นั้นก็สามารถเชื่อมโยงกับปัจจัยดังกล่าวได้ ตัวอย่างเช่น สมมติว่าตัวอย่างน้ำหลายๆ ตัวอย่าง ซึ่งแต่ละตัวอย่างมีทั้งเกลือและตะกั่วพบว่ามีพิษ หากระดับความเป็นพิษเปลี่ยนแปลงไปพร้อมกับระดับของตะกั่ว ก็สามารถระบุได้ว่าความเป็นพิษนั้นเกิดจากการมีอยู่ของตะกั่ว

ในเชิงสัญลักษณ์ วิธีการเปลี่ยนแปลงพร้อมกันสามารถแสดงได้ดังนี้ (โดย ± แทนการเลื่อน):

ABC เกิดขึ้นพร้อมกับ xyz

ผลลัพธ์ A± BC คือ x± y z

—————————————————————

ดังนั้น A และ x จึงมีความเชื่อมโยงกันในเชิงสาเหตุ

แตกต่างจากวิธีการอุปนัยสี่วิธีก่อนหน้านี้ วิธีการเปลี่ยนแปลงพร้อมกันไม่เกี่ยวข้องกับการกำจัดสถานการณ์ใดๆการเปลี่ยนแปลงขนาดของปัจจัยหนึ่งส่งผลให้ขนาดของปัจจัยอื่นเปลี่ยนแปลงไปด้วย